Skip to content
View M-Pimienta's full-sized avatar
🎯
Focusing
🎯
Focusing
  • Badajoz

Block or report M-Pimienta

Block user

Prevent this user from interacting with your repositories and sending you notifications. Learn more about blocking users.

You must be logged in to block users.

Please don't include any personal information such as legal names or email addresses. Maximum 100 characters, markdown supported. This note will be visible to only you.
Report abuse

Contact GitHub support about this user’s behavior. Learn more about reporting abuse.

Report abuse
M-Pimienta/README.md

🧬 Mario Pimienta Calderón - Bioinformático/Analista de Datos 🧬

Bienvenido a mi perfil de GitHub! Aquí iré publicando y actualizando la información relacionada con el desarrollo de mi trabajo (forks, scripts propios, etc). Como analista de datos y bioinformático soy una persona muy acostumbrada a entornos LINUX/UNIX, utilizando lenguajes de programación como Python, Bash y R para desarrollar algoritmos de tratamiento de datos, integración de software y automatización de tareas.

Hasta hoy mi trabajo ha sido fundamentalmente diseñar, evaluar e implementar pipelines para el tratamiento e interpretación de datos generados por secuenciación masiva. Integración de software en scripts para análisis downstream automatizado.

Formación

  • Máster en Bioinformática. Universidad de Murcia. (2021)

    Competencia Herramienta Paquetes específicos Lenguaje
    Bioestadística avanzada RStudio Dependiendo del proyecto R
    Machine Learning / Big Data RStudio Caret. Keras R
    Análisis de datos NGS Entornos LINUX Dependiendo del proyecto Bash. Python. R.
    Bases de Datos relacionales LINUX/WorkBench Dependiendo del proyecto MySQL
  • Máster en Programación Informática. ESNECA Business School. (2020)

    • Java
    • C++ (en desuso)
    • PHP (en desuso)
  • Grado en Biotecnología. Universidad de Extremadura.

Experiencia profesional

  • Analista de datos NGS. Laboratorios Larrasa. 4/2022-Actualmente

Pipelines diseñados

  • Análisis de muestras metagenómicas. Ver más
  • Análisis DNASeq Variant Calling. (En desarrollo)

Algoritmos para tratamiento de secuencias

Implementación y uso de BBDD MySQL Ver más

  • Script de generación básico.
  • Consultas.
  • Vistas.

Popular repositories Loading

  1. M-Pimienta M-Pimienta Public

    Config files for my GitHub profile.

    Python

  2. ensembl-vep ensembl-vep Public

    Forked from Ensembl/ensembl-vep

    The Ensembl Variant Effect Predictor predicts the functional effects of genomic variants

    Perl

  3. vcftools vcftools Public

    Forked from vcftools/vcftools

    A set of tools written in Perl and C++ for working with VCF files, such as those generated by the 1000 Genomes Project.

    C++