sub-01
├── label
│   ├── lh.cortex+hipamyg.label
│   ├── lh.cortex.label
│   ├── rh.cortex+hipamyg.label
│   └── rh.cortex.label
├── mri
│   ├── antsdn.brain.mgz
│   ├── aparc.DKTatlas+aseg.deep.mgz
│   ├── aparc.DKTatlas+aseg.deep.withCC.mgz
│   ├── aparc.DKTatlas+aseg.orig.mgz
│   ├── aseg.auto.mgz
│   ├── aseg.auto_noCCseg.mgz
│   ├── aseg.presurf.mgz
│   ├── brain.finalsurfs.mgz
│   ├── brainmask.mgz
│   ├── brain.mgz
│   ├── filled.auto.mgz
│   ├── filled.mgz
│   ├── filled-pretess127.mgz
│   ├── filled-pretess255.mgz
│   ├── lh.surface.defects.mgz
│   ├── mask.mgz
│   ├── norm.mgz
│   ├── nu.mgz
│   ├── orig
│   │   └── 001.mgz
│   ├── orig.mgz
│   ├── orig_nu.mgz
│   ├── rawavg.mgz -> orig.mgz
│   ├── rh.surface.defects.mgz
│   ├── segment.dat
│   ├── T1.mgz
│   ├── tmp
│   ├── transforms
│   │   ├── bak
│   │   ├── cc_up.lta
│   │   ├── talairach.auto.xfm
│   │   ├── talairach.auto.xfm.lta
│   │   ├── talairach_avi.log
│   │   ├── talairach.lta -> talairach.xfm.lta
│   │   ├── talairach_with_skull.lta -> talairach.xfm.lta
│   │   ├── talairach.xfm
│   │   ├── talairach.xfm.lta
│   │   └── talsrcimg_to_711-2C_as_mni_average_305_t4_vox2vox.txt
│   ├── wm.asegedit.mgz
│   ├── wm.mgz
│   └── wm.seg.mgz
├── scripts
│   ├── build-stamp.txt
│   ├── deep-seg.log
│   ├── defect2seg.log
│   ├── lastcall.build-stamp.txt
│   ├── lh.processing.cmdf
│   ├── patchdir.txt
│   ├── ponscc.cut.log
│   ├── recon-all.cmd
│   ├── recon-all.done
│   ├── recon-all.env
│   ├── recon-all.env.bak
│   ├── recon-all.local-copy
│   ├── recon-all.log
│   ├── recon-all-status.log
│   ├── recon-config.yaml
│   ├── recon-surf.log
│   ├── rh.processing.cmdf
│   └── unknown-args.txt
├── stats
├── surf
│   ├── autodet.gw.stats.lh.dat
│   ├── autodet.gw.stats.rh.dat
│   ├── lh.defect_borders
│   ├── lh.defect_chull
│   ├── lh.defect_labels
│   ├── lh.defects.pointset
│   ├── lh.inflated
│   ├── lh.inflated.H
│   ├── lh.inflated.K
│   ├── lh.inflated.nofix
│   ├── lh.orig
│   ├── lh.orig.nofix
│   ├── lh.orig.premesh
│   ├── lh.qsphere.nofix
│   ├── lh.smoothwm
│   ├── lh.smoothwm.nofix
│   ├── lh.sulc
│   ├── lh.white.H -> lh.white.preaparc.H
│   ├── lh.white.K -> lh.white.preaparc.K
│   ├── lh.white.preaparc
│   ├── lh.white.preaparc.H
│   ├── lh.white.preaparc.K
│   ├── rh.defect_borders
│   ├── rh.defect_chull
│   ├── rh.defect_labels
│   ├── rh.defects.pointset
│   ├── rh.inflated
│   ├── rh.inflated.H
│   ├── rh.inflated.K
│   ├── rh.inflated.nofix
│   ├── rh.orig
│   ├── rh.orig.nofix
│   ├── rh.orig.premesh
│   ├── rh.qsphere.nofix
│   ├── rh.smoothwm
│   ├── rh.smoothwm.nofix
│   ├── rh.sulc
│   ├── rh.white.H -> rh.white.preaparc.H
│   ├── rh.white.K -> rh.white.preaparc.K
│   ├── rh.white.preaparc
│   ├── rh.white.preaparc.H
│   └── rh.white.preaparc.K
├── tmp
├── touch
│   ├── asegmerge.touch
│   ├── fill.touch
│   ├── inorm2.touch
│   ├── lh.autodet.gw.stats.touch
│   ├── lh.cortex+hipamyg.touch
│   ├── lh.cortex.touch
│   ├── lh.inflate1.touch
│   ├── lh.inflate2.touch
│   ├── lh.inflate.H.K.touch
│   ├── lh.smoothwm2.touch
│   ├── lh.topofix.touch
│   ├── lh.white.H.K.touch
│   ├── lh.white.preaparc.touch
│   ├── rh.autodet.gw.stats.touch
│   ├── rh.cortex+hipamyg.touch
│   ├── rh.cortex.touch
│   ├── rh.inflate1.touch
│   ├── rh.inflate2.touch
│   ├── rh.inflate.H.K.touch
│   ├── rh.smoothwm2.touch
│   ├── rh.topofix.touch
│   ├── rh.white.H.K.touch
│   ├── rh.white.preaparc.touch
│   └── wmsegment.touch
└── trash

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