diff --git a/example.flournoy/readargs.R b/example.flournoy/readargs.R index 2dfebc4..ca2e4c8 100644 --- a/example.flournoy/readargs.R +++ b/example.flournoy/readargs.R @@ -1,13 +1,13 @@ cmdargs <- c("-m","mask.nii.gz", "--set1", "setfilenames1.txt", "--set2", "setfilenames2.txt", "--set3", "setfilenames3.txt", - "--setlabels1", "setlabelsn1.csv", - "--setlabels2", "setlabelsn2.csv", - "--setlabels3", "setlabelsn3.csv", + "--setlabels1", "setlabels1.csv", + "--setlabels2", "setlabels2.csv", + "--setlabels3", "setlabels3.csv", "--covariates", "Flournoy.new.csv", "--model", "longModelLog.R", "--testvoxel", "10000", "--output", "logonly/fl.", "--debugfile", "debugfileoutput", - "--sgeN", "50") + "-p", "6")