Simulação de ensaio de fungicida em soja

Pipeline reprodutível com publicação automática via GitHub Actions e GitHub Pages. A cada push no repositório, o workflow executa a simulação dos dados e publica o relatório atualizado automaticamente.

Estrutura do projeto

soja_actions/
├── .github/
│   └── workflows/
│       └── pipeline.yml
├── R/
│   └── 01_simular_dados.R
├── report/
│   ├── relatorio_simulacao.qmd
│   └── index.html
├── data/
└── README.md

O que o pipeline faz

1. Instala R 4.4.1 e Quarto no Ubuntu
2. Instala os pacotes via Posit Package Manager (binários pré-compilados)
3. Roda o script de simulação e gera os dados
4. Renderiza o relatório Quarto
5. Copia o index.html de redirecionamento para a pasta de publicação
6. Publica o HTML no GitHub Pages automaticamente

Como ativar o GitHub Pages

1. Vá em Settings > Pages no repositório
2. Em Source, selecione GitHub Actions
3. Faça um push qualquer para disparar o primeiro workflow

O relatório estará disponível em:

https://jenniferlopes.github.io/tutorial_github_actions/relatorio_simulacao.html

O index.html redireciona automaticamente para o relatório, então não é necessário digitar o nome do arquivo no link.

Como reproduzir localmente

source("R/01_simular_dados.R")
quarto::quarto_render("report/relatorio_simulacao.qmd")

Pacotes utilizados

Pacote	Função
tidyverse	Manipulação e visualização de dados
ggplot2	Gráficos
knitr	Tabelas no relatório
quarto	Relatório reprodutível

Autora

Jennifer Luz Lopes