¿Es lo mismo decir si que decir sí?
No, no es lo mismo, sí es una palabra que se utiliza como adverbio de afirmación para responder a oraciones interrogativas, como pronombre reflexivo de la tercera persona y como sustantivo con el significado de permiso o consentimiento.
Por ejemplo:

1. Sí, haré ese trabajo, aunque sea tarde.
2. Dice que puede hacerlo por sí solo.
3. La junta le ha dado el sí definitivo a mi propuesta.

Por otro lado, si es una conjunción condicional que se utiliza para indicar condición o suposición. 
Por ejemplo:

1. No llegaré a tiempo si salgo más tarde.
2. Si tiene dinero comprará regalos para todos.
3. Si quieres, puedes cantar como solista.