diff --git a/lineage_notes.txt b/lineage_notes.txt index 9778be59..8e110566 100644 --- a/lineage_notes.txt +++ b/lineage_notes.txt @@ -1114,6 +1114,7 @@ JN.1.29 Alias of B.1.1.529.2.86.1.1.29, ORF1a:T3224A, after C2644T, Brazil JN.1.30 Alias of B.1.1.529.2.86.1.1.30, G21255T JN.1.31 Alias of B.1.1.529.2.86.1.1.31, ORF3a:V13L, C19186T JN.1.32 Alias of B.1.1.529.2.86.1.1.32, S:T572I, directly on JN.1 polytomy +JN.1.33 Alias of B.1.1.529.2.86.1.1.33, S:A67V, G2782T, C5512T, China JN.2 Alias of B.1.1.529.2.86.1.2, ORF1a:Y621C, Europe/North America, from #2284 JN.2.1 Alias of B.1.1.529.2.86.1.2.1, S:S31F, Sweden/Australia JN.2.2 Alias of B.1.1.529.2.86.1.2.2, S:T572I, N:G25C, ORF1a:L3644F, Netherlands, from #2433 diff --git a/lineages.csv b/lineages.csv index 310ffeed..b3f27789 100644 --- a/lineages.csv +++ b/lineages.csv @@ -2526800,3 +2526800,105 @@ England/CLIMB-CM7YJ41I/2024,KP.3 USA/NJ-GBW-H20-362-0218/2024,KP.3 USA/CA-GBW-H10-020-4047/2024,KP.3 USA/CA-GBW-H20-360-1307/2024,KP.3 +England/WSI-331C9AF9/2024,JN.1.33 +Singapore/R91MR100/2023,JN.1.33 +Indonesia/JK-OUCRU-GSILab-1156349/2024,JN.1.33 +India/DL-DEC-MAMC-LNHD-02/2023,JN.1.33 +CHN/HB-Shiyan-3892/2024,JN.1.33 +Hubei/HCDC-SY3892/2024,JN.1.33 +CHN/YBCDC-2024XGCX014/2024,JN.1.33 +Sichuan/YBCDC-XGCX014/2024,JN.1.33 +China/YBCDC-S6720/2024,JN.1.33 +SouthKorea/KDCA286976/2024,JN.1.33 +China/YBCDC-S6725/2024,JN.1.33 +China/YBCDC-S6714/2024,JN.1.33 +China/YBCDC-S6715/2024,JN.1.33 +China/YBCDC-S6721/2024,JN.1.33 +USA/SC-CDC-LC1097651/2024,JN.1.33 +Chongqing/YBCDC-0061/2024,JN.1.33 +USA/CA-KP001671/2024,JN.1.33 +Chongqing/YBCDC-S6711/2024,JN.1.33 +Chongqing/YBCDC-S6703/2024,JN.1.33 +Chongqing/YBCDC-S6708/2024,JN.1.33 +CHN/SH-HG20240127-263/2024,JN.1.33 +Chongqing/YBCDC-0067/2024,JN.1.33 +Chongqing/YBCDC-0094/2024,JN.1.33 +Poland/Kce-138/2024,JN.1.33 +Oman/CPHL_724209/2024,JN.1.33 +USA/MD-HP50122-PIDGGARFLF/2023,JN.1.33 +Chongqing/YBCDC-S6702/2024,JN.1.33 +Russia/SPE-RII-MH167345S/2024,JN.1.33 +Denmark/DCGC-670185/2024,JN.1.33 +Sichuan/YBCDC-XGCX021/2024,JN.1.33 +Chongqing/YBCDC-S6705/2024,JN.1.33 +Chongqing/YBCDC-S6704/2024,JN.1.33 +CHN/YBCDC-2024XGCX021/2024,JN.1.33 +CHN/XZCDC_0009/2024,JN.1.33 +China/YBCDC-S6718/2024,JN.1.33 +China/YBCDC-S6724/2024,JN.1.33 +China/YBCDC-S6719/2024,JN.1.33 +Shanghai/SCDC-dsyy-013002/2024,JN.1.33 +CHN/HB-Jingmen-4007/2024,JN.1.33 +China/YBCDC-S6723/2024,JN.1.33 +Japan/PG-586817/2023,JN.1.33 +CHN/SH-dsyy-2024013002/2024,JN.1.33 +CHN/PLCDC-0020/2024,JN.1.33 +Singapore/R12MQ64/2024,JN.1.33 +CHN/BD-VIR-SPE-3/2024,JN.1.33 +Fujian/FCDC-BD-VIR-SPE-3/2024,JN.1.33 +Chongqing/YBCDC-S6707/2024,JN.1.33 +Chongqing/YBCDC-0095/2024,JN.1.33 +CHN/YBCDC-2024XGCX061/2024,JN.1.33 +Sichuan/YBCDC-XGCX061/2024,JN.1.33 +Henan//XCCDC021712/2024,JN.1.33 +CHN/XCCDC2024021712/2024,JN.1.33 +CHN/HB-Qianjiang-3918/2024,JN.1.33 +Hubei/HCDC-QJ3918/2024,JN.1.33 +China/YBCDC-S6713/2024,JN.1.33 +Chongqing/YBCDC-S6712/2024,JN.1.33 +CHN/HB-Wuhan-4049/2024,JN.1.33 +China/YBCDC-S6722/2024,JN.1.33 +Chongqing/YBCDC-S6701/2024,JN.1.33 +Chongqing/YBCDC-0069/2024,JN.1.33 +CHN/YBCDC-2024XGCX053/2024,JN.1.33 +Sichuan/YBCDC-XGCX053/2024,JN.1.33 +CHN/YBCDC-2024XGCX030/2024,JN.1.33 +Sichuan/YBCDC-XGCX030/2024,JN.1.33 +Sichuan/YBCDC-XGCX039/2024,JN.1.33 +CHN/YBCDC-2024XGCX044/2024,JN.1.33 +CHN/YBCDC-2024XGCX039/2024,JN.1.33 +Sichuan/YBCDC-XGCX044/2024,JN.1.33 +CHN/YBCDC-2024XGCX051/2024,JN.1.33 +Sichuan/YBCDC-XGCX051/2024,JN.1.33 +Thailand/NIC_BKK_725/2024,JN.1.33 +USA/CA-HLX-STM-JKNVBH3BK/2024,JN.1.33 +Henan//XCCDC021703/2024,JN.1.33 +CHN/XCCDC2024021703/2024,JN.1.33 +Japan/TKYnat16524/2024,JN.1.33 +USA/NY-CDC-QDX91310324/2024,JN.1.33 +USA/CA-GBW-H10-019-4006/2024,JN.1.33 +USA/CA-GBW-H20-355-2093/2024,JN.1.33 +Sichuan/ZGSCDC-zgxg011/2024,JN.1.33 +CHN/ZGSCDC-zgxg_2024011/2024,JN.1.33 +Chongqing/YBCDC-S6706/2024,JN.1.33 +China/YBCDC-S6716/2024,JN.1.33 +CHN/LNCDC-052-2/2024,JN.1.33 +CHN/ZYCDC-XG2024019/2024,JN.1.33 +Sichuan/ZYCDC-XG019/2024,JN.1.33 +Chongqing/YBCDC-S6709/2024,JN.1.33 +Chongqing/YBCDC-0092/2024,JN.1.33 +CHN/HB-Enshi-3875/2024,JN.1.33 +Hubei/HCDC-ES3875/2024,JN.1.33 +USA/CO-CDPHE-41699860/2024,JN.1.33 +USA/CO-CDPHE-41709471/2024,JN.1.33 +USA/CO-CDPHE-41645870/2024,JN.1.33 +USA/CO-CDPHE-41731727/2024,JN.1.33 +USA/CO-CDPHE-41709327/2024,JN.1.33 +USA/NJ-CDC-LC1098800/2024,JN.1.33 +USA/CO-CDPHE-41699695/2024,JN.1.33 +France/BFC-IPP02995/2024,JN.1.33 +France/BFC-IPP02325/2024,JN.1.33 +DEU/BY-USAFSAM-S22333/2024,JN.1.33 +DEU/BY-USAFSAM-S22332/2024,JN.1.33 +DEU/BY-USAFSAM-S22330/2024,JN.1.33 +DEU/BY-USAFSAM-S22329/2024,JN.1.33