diff --git a/lineage_notes.txt b/lineage_notes.txt index 4d5df1d7..9bf3ef4f 100644 --- a/lineage_notes.txt +++ b/lineage_notes.txt @@ -1060,6 +1060,7 @@ JN.1.3 Alias of B.1.1.529.2.86.1.1.3, ORF8:Q18*, Netherlands JN.1.4 Alias of B.1.1.529.2.86.1.1.4, ORF1a:T170I, Denmark/Singapore, from #2381 JN.1.4.1 Alias of B.1.1.529.2.86.1.1.4.1, S:E654V, Ireland JN.1.4.2 Alias of B.1.1.529.2.86.1.1.4.2, S:N185D, USA, from #2462 +JN.1.4.3 Alias of B.1.1.529.2.86.1.1.4.3, S:T572I, USA, from #2487 JN.1.5 Alias of B.1.1.529.2.86.1.1.5, ORF1b:V1271T, Singapore/Malaysia/Indonesia, from #2419 JN.1.6 Alias of B.1.1.529.2.86.1.1.6, G22627A JN.1.6.1 Alias of B.1.1.529.2.86.1.1.6.1, S:R346T, Sweden, from sars-cov-2-variants/lineage-proposals#1089 diff --git a/lineages.csv b/lineages.csv index 085c66bb..232f387c 100644 --- a/lineages.csv +++ b/lineages.csv @@ -2508948,9 +2508948,6 @@ USA/UT-UPHL-231213104999/2023,JN.1.4 USA/UT-UPHL-231213555195/2023,JN.1.4 USA/UT-UPHL-23120199574/2023,JN.1.4 USA/UT-UPHL-120199574/2023,JN.1.4 -USA/UT-UPHL-231213633988/2023,JN.1.4 -England/CLIMB-CM7YEWEX/2023,JN.1.4 -Austria/AGES-1142534/2023,JN.1.4 Austria/AGES-AZ-1669472/2023,JN.1.4 Austria/AGES-AZ-1670432/2023,JN.1.4 Austria/AGES-AZ-1669027/2023,JN.1.4 @@ -2520965,3 +2520962,49 @@ Canada/ON-PHL-202403468/2024,JN.1.22 Canada/ON-KHS-SC2-00156-v1/2024,JN.1.22 Canada/ON-PHL-202401380/2024,JN.1.22 Canada/ON-PHL-202400536/2023,JN.1.22 +USA/CA-HLX-STM-K6AFSCGMY/2023,JN.1.4.3 +USA/TX-HMH-M-137920/2024,JN.1.4.3 +USA/HI-H2326958/2023,JN.1.4.3 +USA/AZ-ASPHL-00026/2023,JN.1.4.3 +USA/2024CV0026/2023,JN.1.4.3 +USA/NY-CDC-QDX91017547/2024,JN.1.4.3 +USA/PA-CDC-LC1080663/2023,JN.1.4.3 +England/CLIMB-CM7YJJOE/2023,JN.1.4.3 +Austria/AGES-1142534/2023,JN.1.4.3 +USA/HI-H2327016/2024,JN.1.4.3 +England/CLIMB-CM7YEWEX/2023,JN.1.4.3 +England/CLIMB-CM7YGS3Z/2024,JN.1.4.3 +Wales/CLIMB-CM7YGO1D/2023,JN.1.4.3 +Wales/CLIMB-CM7YGSNE/2024,JN.1.4.3 +England/CLIMB-CM7YGB4B/2024,JN.1.4.3 +Scotland/CLIMB-CM7YKD9D/2023,JN.1.4.3 +USA/MI-MDHHS-SC44991/2023,JN.1.4.3 +Scotland/CLIMB-CM7Y8I63/2024,JN.1.4.3 +USA/DE-DHSS-B1289479/2024,JN.1.4.3 +USA/NJ-CDC-QDX91770478/2024,JN.1.4.3 +USA/NY-PRL-240123_81C08/2024,JN.1.4.3 +USA/NJ-CDC-LC1090274/2024,JN.1.4.3 +Scotland/CLIMB-CM7YE6RK/2023,JN.1.4.3 +USA/NC-CDC-LC1091871/2024,JN.1.4.3 +USA/TX-HMH-M-138700/2024,JN.1.4.3 +USA/GA-CDC-LC1091836/2024,JN.1.4.3 +USA/CA-KP000871/2024,JN.1.4.3 +USA/CA-KP000336/2024,JN.1.4.3 +USA/NC-CDC-LC1090384/2024,JN.1.4.3 +USA/GA-GPHL-0018/2024,JN.1.4.3 +USA/MO-CDC-QDX91524997/2024,JN.1.4.3 +USA/GA-CDC-QDX91016786/2024,JN.1.4.3 +USA/NJ-CDC-LC1093477/2024,JN.1.4.3 +USA/CA-CDC-LC1089503/2024,JN.1.4.3 +USA/UT-UPHL-231213633988/2023,JN.1.4.3 +American_Samoa/AS-H2327356/2024,JN.1.4.3 +American_Samoa/AS-H2327311/2024,JN.1.4.3 +USA/TX-HMH-M-138465/2024,JN.1.4.3 +Canada/ON-PHL-202404222/2024,JN.1.4.3 +USA/CA-HLX-STM-9FZCS8SY9/2023,JN.1.4.3 +USA/CA-HLX-STM-PFNEBGJ7Z/2023,JN.1.4.3 +USA/NV-CDC-QDX90730382/2023,JN.1.4.3 +USA/HI-H2327254/2024,JN.1.4.3 +USA/NV-CDC-QDX91833010/2024,JN.1.4.3 +USA/NV-CDC-QDX91407996/2024,JN.1.4.3 +USA/NV-CDC-QDX91125578/2024,JN.1.4.3