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base fork: dritoshi/search.bioconductor.jp
base: 485aefaa43
...
head fork: dritoshi/search.bioconductor.jp
compare: f5d51fa4de
Checking mergeability… Don't worry, you can still create the pull request.
  • 3 commits
  • 33 files changed
  • 0 commit comments
  • 1 contributor
Showing with 33,511 additions and 94 deletions.
  1. +20 −10 search/app/controllers/codes_controller.rb
  2. +22 −13 search/app/controllers/codes_controller.rb~
  3. +1 −0  search/app/models/code.rb
  4. +6 −0 search/app/views/codes/home.html.erb
  5. +6 −0 search/app/views/codes/home.html.erb~
  6. +50 −20 search/app/views/codes/index.html.erb
  7. +43 −0 search/app/views/codes/index.html.erb.1
  8. +18 −18 search/app/views/codes/index.html.erb~
  9. +0 −29 search/app/views/codes/search.html.erb
  10. +79 −0 search/app/views/layouts/#application.html.erb.org#
  11. +1 −1  search/app/views/layouts/application.html.erb
  12. +1 −1  search/app/views/layouts/application.html.erb~
  13. +2 −1  search/config/routes.rb
  14. +1 −1  search/config/routes.rb~
  15. BIN  search/solr/data/development/index/_2_1.del
  16. BIN  search/solr/data/development/index/_3_1.del
  17. BIN  search/solr/data/development/index/_4.fdt
  18. BIN  search/solr/data/development/index/_4.fdx
  19. +3 −0  search/solr/data/development/index/_4.fnm
  20. +33,253 −0 search/solr/data/development/index/_4.frq
  21. +1 −0  search/solr/data/development/index/_4.nrm
  22. BIN  search/solr/data/development/index/_4.prx
  23. BIN  search/solr/data/development/index/_4.tii
  24. BIN  search/solr/data/development/index/_4.tis
  25. +3 −0  search/solr/data/development/index/_5.fnm
  26. BIN  search/solr/data/development/index/_5.frq
  27. +1 −0  search/solr/data/development/index/_5.nrm
  28. BIN  search/solr/data/development/index/_5.prx
  29. BIN  search/solr/data/development/index/_5.tii
  30. BIN  search/solr/data/development/index/_5.tis
  31. BIN  search/solr/data/development/index/segments.gen
  32. BIN  search/solr/data/development/index/segments_3
  33. BIN  search/solr/data/development/index/segments_4
View
30 search/app/controllers/codes_controller.rb
@@ -2,20 +2,30 @@ class CodesController < ApplicationController
# GET /codes
# GET /codes.json
def index
- @search = Code.search do
- fulltext params[:query] do
- highlight :code
+ if params[:query] != ""
+ @search = Code.search do
+ fulltext params[:query] do
+ highlight :code
+ end
+ facet :package
+ paginate :page => params[:page], :per_page => 30
end
+ else
+ @search = []
end
- @codes = @search.results
+ return @search
=begin
- @codes = Code.paginate(:page => params[:page])
-
- respond_to do |format|
- format.html # index.html.erb
- format.json { render json: @codes }
+ if params[:query] != ""
+ @search = Code.search do
+ fulltext params[:query] do
+ highlight :code
+ end
+ end
+ @codes = @search.results
+ else
+ @codes = []
end
-=end
+=end
end
# GET /codes/1
View
35 search/app/controllers/codes_controller.rb~
@@ -2,12 +2,28 @@ class CodesController < ApplicationController
# GET /codes
# GET /codes.json
def index
- @codes = Code.paginate(:page => params[:page])
-
- respond_to do |format|
- format.html # index.html.erb
- format.json { render json: @codes }
+ if params[:query] != ""
+ @search = Code.search do
+ fulltext params[:query] do
+ highlight :code
+ end
+ end
+ else
+ @search = []
+ end
+
+=begin
+ if params[:query] != ""
+ @search = Code.search do
+ fulltext params[:query] do
+ highlight :code
+ end
+ end
+ @codes = @search.results
+ else
+ @codes = []
end
+=end
end
# GET /codes/1
@@ -20,13 +36,6 @@ class CodesController < ApplicationController
format.json { render json: @code }
end
end
-
- def search
- @code = Code.search do
- fulltext params[:query] do
- highlight :code
- end
- end
- end
+
end
View
1  search/app/models/code.rb
@@ -4,5 +4,6 @@ class Code < ActiveRecord::Base
searchable do
text :code, :stored => true
text :file
+ string :package
end
end
View
6 search/app/views/codes/home.html.erb
@@ -0,0 +1,6 @@
+<%- model_class = Code.new.class -%>
+
+<%= form_tag codes_path, :method => :get do %>
+ <%= text_field_tag :query, params[:query], {:class => "input-xlarge", :placeholder => "Type something…"} %>
+ <%= submit_tag "Search", :name => nil %>
+<% end %>
View
6 search/app/views/codes/home.html.erb~
@@ -0,0 +1,6 @@
+<%- model_class = Code.new.class -%>
+
+<%= form_tag codes_path, :method => :get do %>
+ <%= text_field_tag :query, params[:query], {:class => "input-xlarge", :placeholder => "Type something… (Example: IRanges)"} %>
+ <%= submit_tag "Search", :name => nil %>
+<% end %>
View
70 search/app/views/codes/index.html.erb
@@ -1,31 +1,61 @@
<%- model_class = Code.new.class -%>
-<%= form_tag codes_path, :method => :get do %>
- <p>
- <%= text_field_tag :query, params[:query] %>
- <%= submit_tag "Search", :name => nil %>
+<p>
+<%= form_tag codes_path, :method => :get do %>
+ <%= text_field_tag :query, params[:query], {:class => "input-xlarge", :placeholder => "Type something…"} %>
+ <%= submit_tag "Search", :name => nil %>
<% end %>
-<p>
+<div class="container">
+ <div class="content">
+ <div class="row">
+ <div class="span9">
+
+<% if @search == [] %>
+ <div class="row">
+ Results: 0
+ </div>
+<% else %>
+
<div class="row">
-Results:
+Results: <%= @search.hits.total_entries %>
</div>
<p>
-<% @codes.each_with_index do |code, id| %>
- <div class="row">
- <h2><!--<%= id %>: --><%= link_to code.file, code_path(code) %> - <%= code.file_path %><br/></h2>
- Package: <%= link_to code.package, "http://bioconductor.jp/packages/2.11/bioc/html/#{code.package}.html" %> -
- Version: <%= code.version %> -
- Language: <%= code.language %>
- </div>
-
- <div class="row">
- <% cache do %>
- <%== Pygments.highlight(CGI.unescapeHTML(code.code)) %>
- <% end %>
- </div>
+<% @search.each_hit_with_result do |hit, code| %>
+ <% hit.highlights.each do |highlight| %>
+ <div class="row">
+ <h3>
+ <%= link_to code.file, code_path(code) %> - <%= code.file_path %><br/>
+ </h3>
+ Package: <%= link_to code.package, "http://bioconductor.jp/packages/2.11/bioc/html/#{code.package}.html" %> -
+ Version: <%= code.version %> -
+ Language: <%= code.language %>
+ </div>
+ <div class="row">
+ <% cache do %>
+ <%== Pygments.highlight(CGI.unescapeHTML(highlight.format {|word| word })) %>
+ <% end %>
+ </div>
+ <% end %>
<% end %>
-<%= will_paginate(@codes, :renderer => WillPaginate::ActionView::LinkRenderer) %>
+ </div>
+ <div class="span3">
+ <div class="well sidebar-nav">
+ <h3>Packages</h3>
+ <ul class="nav nav-list">
+ <% @search.facet(:package).rows.each do |facet| %>
+ <li><%= link_to "#{facet.value} (#{facet.count})", "" %></li>
+ <% end %>
+ </ul>
+ </div><!--/.well -->
+ </div><!--/span-->
+ </div><!--/row-->
+ </div><!--/content-->
+</div>
+
+
+<%= will_paginate(@search.hits, :renderer => WillPaginate::ActionView::LinkRenderer) %>
+<% end %>
View
43 search/app/views/codes/index.html.erb.1
@@ -0,0 +1,43 @@
+<%- model_class = Code.new.class -%>
+
+<p>
+<%= form_tag codes_path, :method => :get do %>
+ <%= text_field_tag :query, params[:query], {:class => "input-xlarge", :placeholder => "Type something…"} %>
+ <%= submit_tag "Search", :name => nil %>
+<% end %>
+
+<% if @search == [] %>
+ <div class="row">
+ Results: 0
+ </div>
+<% else %>
+
+<div class="row">
+Results: <%= @search.hits.size %>
+</div>
+
+<p>
+<% @search.hits.each do |hit| %>
+ <% hit.highlights(:code).each do |highlight| %>
+ <% highlight.format do |code| %>
+ <% code %>
+ <div class="row">
+ <h2>
+ <%= link_to code.file, code_path(code) %> - <%= code.file_path %><br/>
+ </h2>
+ Package: <%= link_to code.package, "http://bioconductor.jp/packages/2.11/bioc/html/#{code.package}.html" %> -
+ Version: <%= code.version %> -
+ Language: <%= code.language %>
+ </div>
+
+ <div class="row">
+ <% cache do %>
+ <%== Pygments.highlight(CGI.unescapeHTML(code.code)) %>
+ <% end %>
+ </div>
+ <% end %>
+ <% end %>
+<% end %>
+
+<%= will_paginate(@search.hits, :renderer => WillPaginate::ActionView::LinkRenderer) %>
+<% end %>
View
36 search/app/views/codes/index.html.erb~
@@ -1,15 +1,17 @@
<%- model_class = Code.new.class -%>
-<style>
-<%= Pygments.css('.highlight') %>
-</style>
-<%= form_tag codes_path, :method => :get do %>
- <p>
- <%= text_field_tag :query, params[:query] %>
- <%= submit_tag "Search", :name => nil %>
+<p>
+<%= form_tag codes_path, :method => :get do %>
+ <%= text_field_tag :query, params[:query], {:class => "input-xlarge", :placeholder => "Type something…"} %>
+ <%= submit_tag "Search", :name => nil %>
<% end %>
-<p>
+<% if @codes == [] %>
+ <div class="row">
+ Results: 0
+ </div>
+<% else %>
+
<div class="row">
Results:
</div>
@@ -17,20 +19,18 @@ Results:
<p>
<% @codes.each_with_index do |code, id| %>
<div class="row">
- <%= id %>: <%= link_to code.file, code_path(code) %> - <%= code.file_path %><br/>
- <div class="span7 well">
- Package: <%= link_to code.package, "http://bioconductor.jp/packages/2.11/bioc/html/#{code.package}.html" %>
- Package: <%= code.package %> -
+ <h2><!--<%= id %>: --><%= link_to code.file, code_path(code) %> - <%= code.file_path %><br/></h2>
+ Package: <%= link_to code.package, "http://bioconductor.jp/packages/2.11/bioc/html/#{code.package}.html" %> -
Version: <%= code.version %> -
Language: <%= code.language %>
- </div>
</div>
- <% cache do %>
- <%== Pygments.highlight(CGI.unescapeHTML(code.code)) %>
- <% end %>
-
+ <div class="row">
+ <% cache do %>
+ <%== Pygments.highlight(CGI.unescapeHTML(code.code)) %>
+ <% end %>
+ </div>
<% end %>
-
<%= will_paginate(@codes, :renderer => WillPaginate::ActionView::LinkRenderer) %>
+<% end %>
View
29 search/app/views/codes/search.html.erb
@@ -1,29 +0,0 @@
-<%- model_class = Code.new.class -%>
-<table class="table table-striped">
- <thead>
- <tr>
- <th><%= model_class.human_attribute_name(:id) %></th>
- <th><%= model_class.human_attribute_name(:package) %></th>
- <th><%= model_class.human_attribute_name(:version) %></th>
- <th><%= model_class.human_attribute_name(:file_path) %></th>
- <th><%= model_class.human_attribute_name(:file) %></th>
- <th><%= model_class.human_attribute_name(:language) %></th>
- <th><%= model_class.human_attribute_name(:code) %></th>
- </tr>
- </thead>
- <tbody>
- <% @codes.each do |code| %>
- <tr>
- <td><%= link_to code.id, code_path(code) %></td>
- <td><%= code.package %></td>
- <td><%= code.version %></td>
- <td><%= code.file_path %></td>
- <td><%= code.file %></td>
- <td><%= code.language %></td>
- <td><%= code.code %></td>
- </tr>
- <% end %>
- </tbody>
-</table>
-
-<%= will_paginate(@codes, :renderer => WillPaginate::ActionView::LinkRenderer) %>
View
79 search/app/views/layouts/#application.html.erb.org#
@@ -0,0 +1,79 @@
+ <!DOCTYPE html>
+<html lang="en">
+ <head>
+ <meta charset="utf-8">
+ <meta name="viewport" content="width=device-width, initial-scale=1.0">
+ <title><%= content_for?(:title) ? yield(:title) : "Bioconductor Code Search" %></title>
+ <%= csrf_meta_tags %>
+
+ <!-- Le HTML5 shim, for IE6-8 support of HTML elements -->
+ <!--[if lt IE 9]>
+ <script src="http://html5shim.googlecode.com/svn/trunk/html5.js" type="text/javascript"></script>
+ <![endif]-->
+
+ <%= stylesheet_link_tag "application", :media => "all" %>
+
+ <link href="images/favicon.ico" rel="shortcut icon">
+ <link href="images/apple-touch-icon.png" rel="apple-touch-icon">
+ <link href="images/apple-touch-icon-72x72.png" rel="apple-touch-icon" sizes="72x72">
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+
+ </head>
+ <body>
+ <style>
+ <%= Pygments.css('.highlight') %>
+ </style>
+
+ <div class="navbar navbar-fixed-top">
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+ <div class="container">
+ <a class="btn btn-navbar" data-target=".nav-collapse" data-toggle="collapse">
+ <span class="icon-bar"></span>
+ <span class="icon-bar"></span>
+ <span class="icon-bar"></span>
+ </a>
+ <a class="brand" href="#">Bioconductor Code Search</a>
+ <div class="container nav-collapse">
+ <ul class="nav">
+ <li><%= link_to "About", "https://github.com/dritoshi/search.bioconductor.jp/wiki" %></li>
+ <li><%= link_to "Github", "https://github.com/dritoshi/search.bioconductor.jp" %></li>
+ <li><%= link_to "Bioconductor.org", "http://bioconductor.org/" %></li>
+ </ul>
+ </div><!--/.nav-collapse -->
+ </div>
+ </div>
+ </div>
+
+ <div class="container">
+ <div class="content">
+ <div class="row">
+ <div class="span9">
+ <%= yield %>
+ </div>
+ <div class="span3">
+ <div class="well sidebar-nav">
+ <h3>Sidebar</h3>
+ <ul class="nav nav-list">
+ <li class="nav-header">Sidebar</li>
+ <li><%= link_to "Link1", "/path1" %></li>
+ <li><%= link_to "Link2", "/path2" %></li>
+ <li><%= link_to "Link3", "/path3" %></li>
+ </ul>
+ </div><!--/.well -->
+ </div><!--/span-->
+ </div><!--/row-->
+ </div><!--/content-->
+
+ <footer>
+ <p>&copy; Itoshi NIKAIDO 2012</p>
+ </footer>
+
+ </div> <!-- /container -->
+
+ <!-- Javascripts
+ ================================================== -->
+ <!-- Placed at the end of the document so the pages load faster -->
+ <%= javascript_include_tag "application" %>
+
+ </body>
+</html>
View
2  search/app/views/layouts/application.html.erb
@@ -32,7 +32,7 @@
<span class="icon-bar"></span>
<span class="icon-bar"></span>
</a>
- <a class="brand" href="#">Bioconductor Code Search</a>
+ <a class="brand" href="/">Bioconductor Code Search</a>
<div class="container nav-collapse">
<ul class="nav">
<li><%= link_to "About", "https://github.com/dritoshi/search.bioconductor.jp/wiki" %></li>
View
2  search/app/views/layouts/application.html.erb~
@@ -47,7 +47,7 @@
<div class="container">
<div class="content">
<div class="row">
- <div class="span9">
+ <div class="span12">
<%= yield %>
</div>
</div><!--/row-->
View
3  search/config/routes.rb
@@ -50,7 +50,8 @@
# You can have the root of your site routed with "root"
# just remember to delete public/index.html.
- root :to => 'codes#index'
+ #root :to => 'codes#index'
+ root :to => 'codes#home'
# See how all your routes lay out with "rake routes"
View
2  search/config/routes.rb~
@@ -50,7 +50,7 @@ Search::Application.routes.draw do
# You can have the root of your site routed with "root"
# just remember to delete public/index.html.
- root :to => 'code#index'
+ root :to => 'codes#index'
# See how all your routes lay out with "rake routes"
View
BIN  search/solr/data/development/index/_2_1.del
Binary file not shown
View
BIN  search/solr/data/development/index/_3_1.del
Binary file not shown
View
BIN  search/solr/data/development/index/_4.fdt
Binary file not shown
View
BIN  search/solr/data/development/index/_4.fdx
Binary file not shown
View
3  search/solr/data/development/index/_4.fnm
@@ -0,0 +1,3 @@
+����idtype
+class_name package_s
+code_texts file_text
View
33,253 search/solr/data/development/index/_4.frq
33,253 additions, 0 deletions not shown
View
1  search/solr/data/development/index/_4.nrm
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