Skip to content
Lu Lab @ Tsinghua University edited this page May 27, 2018 · 22 revisions

Shared Notes and Scripts - 2018 Spring

Lu Lab Logo

Study Group

Topic Persons Tasks (gitbook)
Basic Siqi: Pre-process and QC
Xupeng: Mapping, Expression Matrix
Jingyi: Diff. Expression (& Clustering?)
Advanced Zhiyu+Xupeng (+Jingyi) Imputation
2 groups -Binbin Normalization
Longchen+Haopu (+Siqi) Cofounder (batch effect etc)
-Li Yang Clustering
Feature Selection
Machine Learning

Advanced Training for PART II

Group Normalization Imputation Control and more... 建议继续第二轮Advanced training
Group I. 李洋 Yes
王思琦 Yes
王红科(旁听) Yes
杨皓璞 Yes
徐隆琛 Yes
Group II.知彧 Yes
曹静怡 Yes
陈旭鹏 Yes

Scores of PART II - Basic Analysis

Group Map Annotation QC Expression Matrix Differential Expression 建议继续第二轮Advanced training
Group I. 李洋 Yes
王思琦 Yes
张闫君
颜峻
杨皓璞 Yes
Group II.昱敏?知彧? Yes
曹静怡 Yes
徐隆琛 Yes
陈旭鹏 Yes

Scores of PART I

Name bash Python R Notes 建议继续第二轮training
王思琦 9 0 7.5 经验分享加分 Yes
曹静怡 9 8.5 6 a brief code of gtf2bed program Yes
徐隆琛 9 9 6 a brief code of gtf2bed program Yes
陈旭鹏 9 8 7 经验分享加分 Yes
王承浩 8 8 8 Yes
颜峻 9 8 0 经验分享加分 Yes
张闫君 8 7 8 Yes
兰宇轩 8 8.5 7.5 a brief code of gtf2bed program Yes
赖方秾 0 7.5 7.5
王红科 6 0 6 No
柯雨曦 7 0 8.5 No
史真 6 0 6 No
王真 6 0 6 No
张刘牧之 6 0 6 No
周立群 5 0 0 No

Before Training

姓名 年级 Linux R/Matlab Perl/Python
李洋 博五 高级 高级 高级
史斌斌 博四 高级 高级 高级
曹静怡 博二 中级 中级 初级
王思琦 博二 中级 中级 初级
徐隆琛 博一 中级 中级 中级
陈旭鹏 大三 初级 中级 中级
王承浩 大三 入门 初级 中级
邢耀光 博一 初级与中级中间 初级与中级中间 初级与中级中间
颜峻 大四 初级 初级 初级
张刘牧之 大三 初级 入门 初级
周立群 大一 初级 从未接触 初级
张闫君 大四 初级 初级 初级
兰宇轩 大三 未接触过 初级 初级
柯雨曦 大四 从未接触 初级 初级
史真 博一 从未接触 从未接触
王真 博三 从未接触 从未接触 从未接触