From c99c84c7cb1c7bf3ea8e30e68abcf12103eef096 Mon Sep 17 00:00:00 2001
From: gwaygenomics <gregory.way@gmail.com>
Date: Tue, 9 Jul 2019 18:48:53 -0400
Subject: [PATCH] FINAL data update

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 download_data.sh | 14 ++++++++++----
 1 file changed, 10 insertions(+), 4 deletions(-)

diff --git a/download_data.sh b/download_data.sh
index 50917a1..114dbbd 100755
--- a/download_data.sh
+++ b/download_data.sh
@@ -12,14 +12,20 @@ mkdir -p 'data/raw/'
 ####################################
 # RNAseq data
 ####################################
-wget --output-document='data/raw/2018-12-27-PPTC_FPKM_matrix_withModelID-248.RDS' \
-  https://ndownloader.figshare.com/files/14023604
+wget --output-document='data/raw/2019-02-14-PPTC_FPKM_matrix_withModelID-244.rda' \
+  https://ndownloader.figshare.com/files/14452985
 
 ####################################
 # Genomic alterations data
 ####################################
-wget --output-document='data/raw/2019-01-03-muts-fusions.txt' \
-  https://ndownloader.figshare.com/files/14023742
+wget --output-document='data/raw/2019-02-14-ras-tp53-nf1-alterations.txt' \
+  https://ndownloader.figshare.com/files/14372792
+
+####################################
+# Clinical data
+####################################
+wget --output-document='data/raw/pptc-pdx-clinical-web.txt' \
+  https://ndownloader.figshare.com/files/14508536
 
 ####################################
 # Checksums