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Toshiaki Katayama edited this page Mar 25, 2017 · 2 revisions

As of Jan 24 2011

第0回オープンバイオ研究会 アナウンス

来たる 2004/12/13-15 にパシフィコ横浜で開催される GIW2004 にてオープンバイオの BoF を開催します。BoF (Birds-Of-A-Feather) とは、特定のトピックに興味のある人たちで行なう小規模のミーティングです。この「オープンバイオ BoF(仮)」では、オープンソースで開発されているバイオインフォマティクス用のソフトウェアをテーマに、ユーザと開発者が一緒になって情報交換をするための場を作りたいと思います。BioRuby や KNOB, JAMBO をはじめとする国内のプロジェクトの紹介や、国内に限らず BioPerl や BioConductor など様々なプロジェクトのユーザによる紹介などを通じ、バイオインフォマティクスで利用できるオープンソースなソフトウェアにどのようなものがあるか情報交換します。また、今後もこのような交流会を開くための打ち合わせを兼ねて、パネルディスカッションを開催したいと思います。今回は、あまりオープンソースにこだわることは避け、広くバイオインフォマティクス関連のソフトウェアについて交流できればと考えています。

日程

  • 日時:
    • 2004年12月13日 16:00-18:00
  • 場所:
    • パシフィコ横浜3階 315 号室
  • 参加:
    • 無料(GIW には別途参加して頂く必要があると思います:)
  • 言語:
    • 日本語(GIW 自体は英語で行なわれる国際会議ですが、日本国内でのオープンバイオ推進という趣旨から BoF は日本語で行ないます)
  • 連絡先
  • スタッフ
    • 中尾@BioRuby、二階堂@KNOB、後藤@BioRuby、片山@BioRuby

事前登録制ではありませんが、部屋の定員が20名とのことなので、満席の場合は、早く来られた方を優先したいと思います。発表者だけでかなり埋まりそうですが、遠慮なく入れるだけ入ってください。

プログラム

はじめに

開催の趣旨など

プロジェクト紹介

確定

  • BioRuby, RRb, Ruby-RMathLib
    • 中尾さん
  • KNOB
    • 二階堂さん
  • JAMBO, EMBOSS
    • 多賀谷さん
  • BioConductor
    • 田崎さん
  • Ensembl
    • 癸生川さん
  • BioJava
    • 篠山さん
  • Omic Space の Web サービスをラップする Java API
    • 豊田さん
  • G-language, E-cell
    • 荒川さん
  • SOKOS
    • 金さん
  • BioPython
    • 増田さん
  • GBrowse
    • 川路さん
  • 日本のバイオインフォコミュニティ
    • 坊農さん
  • Xgrid
    • 荻島さん
  • SO (Sequence Ontology)
    • 粕川さん
  • ChemRuby
    • 田中さん

打診中

  • BioCAML
    • 坂内さん
  • BioPerl, BioMOBY, BioMart, BioMake, Taverna
    • 誰かいませんか:)

パネルディスカッション

テーマ:日本でのオープンバイオの推進にむけて

海外ではオープンバイオの成果が広く使われており、すでに大きなコミュニティが形成されているが、日本ではそれらのリソースが有効に利用されていないだけでなく、開発に関わっている人も少ない。まずは、ユーザ同士の情報交換を含めた定期的な交流をはかり、利用者と開発者双方のコミュニティを拡大したい。将来的には、取り組みの遅れを取り返し、国内での普及に貢献し、国際的にもフィードバックできるような人材が増えることを期待したい。そのために、まずは定期的に交流を図るための研究会を開催できるようにしたい。

トピック

  • オープンバイオの世界と日本における状況
  • 普及に向けてできること(情報交換、チュートリアル?)
  • コマーシャルにおけるオープンバイオ
  • 定期的な「オープンバイオ研究会(仮)」開催のプラン
  • 次回(第1回)は SIGBMK と共催?

懇親会

近くで懇親会を兼ねた飲み会を開きたいと思います。

発表者の皆さんへ

  • 発表者が多くなったので一人5分〜8分+質疑応答とします。
  • プロジェクターを用意していますのでプレゼンはPCでお願いします。書画カメラ付きのプロジェクターも用意していますので印刷物や手書きのプレゼンも可能です。
  • 無線 LAN が使える予定です。
  • できるだけカタグルシクない方向でお願いします:)

TODO

  • 夜の部の予約など
  • アナウンス第2弾 12/6 -k
  • A3 程度のビラ(ポスター作成) -k
  • ロガー、タイムキーパー、場内係 fix
  • プロジェクタ−2台必要?
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