meeting25

第25回オープンバイオ研究会

第25回オープンバイオ研究会を、2021年3月13日(土)にオンライン開催します。 3月11日(木)の第65回 SIG BIO、 3月12日(金)のNEDO AIとVRを活用した分子ロボット共創環境の研究開発 キックオフシンポジウムとバーチャルな連続開催となります。

参加方法

Zoom での開催となります。当日になりましたら下記リンクからご参加ください（万が一荒らされたりした場合はURL等が変更となる可能性があります）。

• トピック: OpenBioJapan 25
• 時間: 2021年3月13日 06:00 AM 大阪、札幌、東京
  • 実際の開催時間は演題数によりますが 10:00〜昼過ぎくらいまでを想定しています
• URL: https://us04web.zoom.us/j/76404433751?pwd=aEE1b1lGajNPd0htT2dnS1ZZZnlDQT09
• ミーティングID: 764 0443 3751
• パスコード: 9dEeeX

発表演題

各自、最近の研究開発テーマについて5〜10分程度の発表をお願いできればと思います。

発表希望者は下記の形式でタイトル、名前（所属）をご記入下さい。

• 発表タイトル
  • 名前（所属）

なお、発表タイトルにスライドへのリンクを付けていただけると幸いです。

• イントロダクション データベース統合のその先と課題

  • 片山 俊明（ライフサイエンス統合データベースセンター）

• RDF-configによる複雑なグラフデータの認知

  • 片山 俊明（ライフサイエンス統合データベースセンター）

• TogoIDによるリンク情報の集約と管理

  • 片山 俊明（ライフサイエンス統合データベースセンター）
  • もしくは小野さん、山本さん

• Togoサイトによる統合された情報を利活用するフレームワーク

  • 片山 俊明（ライフサイエンス統合データベースセンター）
  • もしくは川島さん、大田さん、守屋さん

• TogoサイトのためのSPARQList API開発と裏技

  • 守屋 勇樹（ライフサイエンス統合データベースセンター）

• MetaStanzaの開発

  • 片山 俊明（ライフサイエンス統合データベースセンター）
  • もしくは守屋さん

• TogoMedium update 2021

  • 川島　秀一（ライフサイエンス統合データベースセンター）

• Med2RDFによる医科学データベースの情報統合

  • 鎌田 真由美（京都大学医学研究科）

• インタビューフォームの構造化

  • 鎌田 真由美（京都大学医学研究科）

• AIホスピタルの実現にむけて 山口大学の取り組み

  • 中津井 雅彦（山口大学）

• 構造変異を含むバリアント情報のRDFによる標準化

  • 片山 俊明（ライフサイエンス統合データベースセンター）
  • もしくは藤澤さん、川島さん、鎌田さん

• KusakiDB v1.0: a novel approach for assessing the existence and completeness of orthogroups in plant species

  • Andrea Ghelfi（かずさDNA研究所）

• Pajekを使う

  • 太田 潤（岡山大学）

• BioRubyのRuby3.0.0対応状況

  • 後藤 直久（大阪大学）

• オープンな科学の営み

  • 荻島 創一（東北大学高等研究機構）

• 起業することにしました(仮称:ワンワンオミックス)

  • 川島　武士 (国立遺伝学研究所)

総合討論

現状における課題（国の政策〜研究室レベルの問題などなんでも）やオープンバイオならではの開発テーマなど、 みなさんでざっくばらんに議論したいトピックを挙げてください。

適当にトピックを取捨選択しながら、Google docsかslidesにメモをとりながらお話できればと思います。

→ 13:00 を過ぎてしまったため、今回は討論の時間が取れませんでした。

その他

講演や討論の枠に収まらない持ち込み企画（デモ、ライブコーディングなど？）も歓迎です。 アイデアがある方は Issues もしくは幹事の片山 (ktym @ dbcls.jp) までご連絡ください。