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第26回オープンバイオ研究会

第26回オープンバイオ研究会を2022年3月12日(土)に開催します。今回は現地とオンラインのハイブリッド開催になります。

• 日時: 2022年3月12日(土) 10:00〜昼くらい？
• 場所: ハイブリッド
  • 現地開催: 金沢大学サテライト・プラザ （金沢市）
  • オンライン: 下記Zoom参加方法を参照
• 宿泊予約: 各自で金沢市内のホテル等を手配ください

3月10日(木)〜11日(金)の第69回SIGBIO、 3月11日(金)の分子ロボット倫理研究会と連続開催となります。

参加方法

現地参加 または オンライン参加

オンライン参加の方は、当日になりましたら下記リンクからご参加ください（万が一荒らされたりした場合はURL等が変更となる可能性があります）。

• トピック: OpenBio26
• 時間: 2022年3月12日 08:00 AM
  • 実際の開催時間は演題数によりますが 10:00〜昼過ぎくらいまでを想定しています
• Zoom URL https://us04web.zoom.us/j/74430443401?pwd=MPtG0pMbXDcxq-UsGA3mevM703rEks.1
  • ミーティングID: 744 3044 3401
  • パスコード: YsJ4yS

発表演題

各自、最近の研究開発テーマについて5〜10分程度の発表をお願いできればと思います。

発表希望者は下記の形式でタイトル、名前（所属）をご記入下さい。

• 発表タイトル
  • 名前（所属）

• TogoDX: 統合データの俯瞰と高速化
  • 片山 俊明 (ライフサイエンス統合データベースセンター)
• 疾患ゲノムデータ基盤の構築
  • 鎌田　真由美 (京都大学大学院　医学研究科)
• ランク学習を用いた化合物スクリーニングにおける多様なアッセイデータの統合戦略
  • 古井 海里，大上 雅史（東京工業大学 情報理工学院）
• タンパク質間相互作用阻害剤設計のための分子生成手法の開発
  • 兒嶋 佑季，小杉 孝嗣，大上 雅史（東京工業大学 情報理工学院）
• BioRuby の最近の更新状況について
  • 後藤 直久 (大阪大学)
• GGGenome
  • 内藤 雄樹 (DBCLS)
• 高次元の前向きコホートデータの健康状態空間による構造化
  • 荻島 創一 (東北大学高等研究機構未来型医療創成センター/東北メディカル・メガバンク機構)

なお、発表タイトルにスライドへのリンクを付けていただけると幸いです。第26回オープンバイオ研究会のスライドに追記いただいても構いません。

情報管理の課題とノウハウ

昨年オンライン開催した第25回オープンバイオ研究会のスライドで簡潔な総括をしましたが、オープンバイオ研究会はこれまでも様々な企画セッションを試してきました。

今回は研究開発だけでなく、皆さんの情報管理のノウハウをお聞きするのも面白いかなと思いつきましたので、こちらのトピックでの発表演題も歓迎です。

• 研究データのマネージメント
• プロジェクトごとの予算や情報管理
• プロジェクトや外注のTODOや進捗管理
• 発表・講演のたびに組み直さなければいけないスライド
• 溜まっていくファイルやメールや写真や荒れがちなデスクトップ
• ついつい増えてしまうブラウザのタブやダウンロードフォルダのファイル
• いろんなところからのメモやアイデア

などなど、みなさんDX時代に（タグ付けやクラウド利用も含め）様々な創意工夫をされていると思いますが、ウェットのラボノートとは違ってわりと個人的な営みになっているかと思います。こういう工夫をしている、ここで困っているといった話を共有できれば新しい気付きがありそうな予感がしています。

総合討論

現状における課題（国の政策〜研究室レベルの問題などなんでも）やオープンバイオならではの開発テーマなど、 みなさんでざっくばらんに議論したいトピックを挙げてください。

適当にトピックを取捨選択しながら、Google docsかslidesにメモをとりながらお話できればと思います。

その他

講演や討論の枠に収まらない持ち込み企画（デモ、ライブコーディングなど？）も歓迎です。 アイデアがある方は Issues もしくは幹事の片山 (ktym @ dbcls.jp) までご連絡ください。