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第27回オープンバイオ研究会

第27回オープンバイオ研究会を2023年3月11日(土)の午前から北陸先端科学技術大学院大学にて開催します。

• 日時: 2023年3月11日(土) 10:00〜最長で16:00くらい
• 場所: 北陸先端科学技術大学院大学 中講義室
• 宿泊予約: まつさき旅館 https://forms.gle/BFdAoDsHYsxKxQEj7

3月9-10日の第73回バイオ情報学(SIGBIO)研究会、第142回数理モデル化と問題解決(MPS)研究会、3月10日の分子ロボット倫理研究会と連続開催になります。

参加方法

現地参加で交流して頂くことを推奨しますが、オンライン参加希望の方は下記Zoomリンクからご参加ください。

• トピック: OpenBio27
• 時間: 2023年3月11日 09:30 AM 大阪、札幌、東京
• Zoom URL: https://us02web.zoom.us/j/88076476155?pwd=amQ1STdJblBPa0dXSXBzenFjdWM2QT09
  • ミーティングID: 880 7647 6155
  • パスコード: 780557

発表演題

各自、最近の研究開発テーマについて5〜20分程度の発表をお願いできればと思います。

発表希望者は下記の形式でタイトル、名前（所属）をご記入下さい。

• Data Management Plan of DDBJ Datasets using Shiny-SurrealDB: a study case
  • Andrea Ghelfi and Takatomo Fujisawa (DDBJ)
• バーチャルスクリーニングに適したAlphaFoldタンパク質立体構造モデルの選択
  • 内河 慶輔（東京工業大学）
• 「潜在空間分子設計」領域の紹介
  • 大上 雅史（東京工業大学）
• タンパク質の立体構造情報の活用：複数の座標条件のそれぞれを満たすタンパク質構成原子の列挙
  • 太田 潤（岡山大学）
• GraphQLによる統合知識グラフの利活用にむけて
  • 片山 俊明(DBCLS)
• BioRuby
  • 後藤 直久（大阪大学）
• 医療情報システムの医療情報の収集
  • 荻島 創一（ToMMo）
• TogoMedium
  • 川島　秀一（DBCLS）
• 発表タイトル
  • 名前（所属）

なお、発表タイトルにスライドへのリンクを付けていただけると幸いです。第27回オープンバイオ研究会のスライドに追記いただいても構いません。

総合討論

マイゲノム研究会？

民間の全ゲノム検査も安価になり、誰でも少しお金を出せば自分のゲノム情報を得られる時代になってきました。 研究者が自分のゲノムを持っているとどういう利活用や課題が考えられるか少し議論したいと思います。

情報管理の課題とノウハウ

オンライン開催した第25回オープンバイオ研究会のスライドで簡潔な総括をしましたが、オープンバイオ研究会はこれまでも様々な企画セッションを試してきました。

今回は研究開発だけでなく、皆さんの情報管理のノウハウをお聞きするのも面白いかなと思いつきましたので、こちらのトピックでの発表演題も歓迎です。

• 研究データのマネージメント
• プロジェクトごとの予算や情報管理
• プロジェクトや外注のTODOや進捗管理
• 発表・講演のたびに組み直さなければいけないスライド
• 溜まっていくファイルやメールや写真や荒れがちなデスクトップ
• ついつい増えてしまうブラウザのタブやダウンロードフォルダのファイル
• いろんなところからのメモやアイデア

などなど、みなさんDX時代に（タグ付けやクラウド利用も含め）様々な創意工夫をされていると思いますが、ウェットのラボノートとは違ってわりと個人的な営みになっているかと思います。こういう工夫をしている、ここで困っているといった話を共有できれば新しい気付きがありそうな予感がしています。

前回の第26回ではこちらのセッションに十分な時間が取れず消化不良だったので、昨年度のスライドに追記していく形で引き続き募集します。

また、現状における課題（国の政策〜研究室レベルの問題などなんでも）やオープンバイオならではの開発テーマなど、みなさんでざっくばらんに議論したいトピックも募集しています。スライドに追記しておいていただければと思います。

その他

講演や討論の枠に収まらない持ち込み企画（デモ、ライブコーディングなど？）も歓迎です。 アイデアがある方は Issues もしくは幹事の片山 (ktym @ dbcls.jp) までご連絡ください。