diff --git a/mmtf-decoder/src/main/java/org/rcsb/mmtf/decoder/DefaultDecoder.java b/mmtf-decoder/src/main/java/org/rcsb/mmtf/decoder/DefaultDecoder.java index 0b60ba6..5ac72f8 100644 --- a/mmtf-decoder/src/main/java/org/rcsb/mmtf/decoder/DefaultDecoder.java +++ b/mmtf-decoder/src/main/java/org/rcsb/mmtf/decoder/DefaultDecoder.java @@ -107,7 +107,7 @@ public DefaultDecoder(MmtfStructure inputData) { releaseDate = inputData.getReleaseDate(); secStructInfo = ArrayConverters.convertByteToIntegers(inputData.getSecStructList()); // Now generate this map - generateChanEntityIndexMap(); + generateChainEntityIndexMap(); } /** The X coordinates */ @@ -501,7 +501,7 @@ public String getReleaseDate() { @Override public String getChainEntityDescription(int chainInd) { if(chainToEntityIndexMap==null){ - generateChanEntityIndexMap(); + generateChainEntityIndexMap(); } Integer entityInd = chainToEntityIndexMap.get(chainInd); if(entityInd==null){ @@ -513,7 +513,7 @@ public String getChainEntityDescription(int chainInd) { @Override public String getChainEntityType(int chainInd) { if(chainToEntityIndexMap==null){ - generateChanEntityIndexMap(); + generateChainEntityIndexMap(); } Integer entityInd = chainToEntityIndexMap.get(chainInd); if(entityInd==null){ @@ -525,7 +525,7 @@ public String getChainEntityType(int chainInd) { @Override public String getChainEntitySequence(int chainInd) { if(chainToEntityIndexMap==null){ - generateChanEntityIndexMap(); + generateChainEntityIndexMap(); } Integer entityInd = chainToEntityIndexMap.get(chainInd); if(entityInd==null){ @@ -538,7 +538,7 @@ public String getChainEntitySequence(int chainInd) { * Utility function to generate a map, mapping chain index to * entity index. */ - private void generateChanEntityIndexMap() { + private void generateChainEntityIndexMap() { chainToEntityIndexMap = new HashMap<>(); for(int i=0; i(); for(int i=0; i