diff --git a/NEWS.md b/NEWS.md index 3157c31b..9f71d92f 100644 --- a/NEWS.md +++ b/NEWS.md @@ -1,5 +1,7 @@ # bayesplot (development version) +* Add `shape` argument to `mcmc_scatter()` by @behramulukir (#375) + # bayesplot 1.14.0 * PPC "avg" functions (`ppc_scatter_avg()`, `ppc_error_scatter_avg()`, etc.) gain a `stat` argument diff --git a/R/mcmc-scatterplots.R b/R/mcmc-scatterplots.R index ccfa4099..4d32391c 100644 --- a/R/mcmc-scatterplots.R +++ b/R/mcmc-scatterplots.R @@ -11,7 +11,7 @@ #' @template args-regex_pars #' @template args-transformations #' @param ... Currently ignored. -#' @param size,alpha For `mcmc_scatter()`, passed to +#' @param shape,size,alpha For `mcmc_scatter()`, passed to #' [ggplot2::geom_point()] to control the appearance of the points. #' @param bins,binwidth For `mcmc_hex()`, an optional numeric vector of #' *length two* passed to [ggplot2::geom_hex()] to override the @@ -129,6 +129,7 @@ mcmc_scatter <- function(x, regex_pars = character(), transformations = list(), ..., + shape = 21, size = 2.5, alpha = 0.8, np = NULL, @@ -139,6 +140,7 @@ mcmc_scatter <- function(x, pars = pars, regex_pars = regex_pars, transformations = transformations, + shape = shape, size = size, alpha = alpha, hex = FALSE, @@ -641,6 +643,7 @@ pairs_condition <- function(chains = NULL, draws = NULL, nuts = NULL) { regex_pars = character(), transformations = list(), hex = FALSE, + shape = 21, size = 2.5, alpha = 0.8, bins = 30, @@ -684,7 +687,7 @@ pairs_condition <- function(chains = NULL, draws = NULL, nuts = NULL) { if (!hex) { # scatterplot graph <- graph + geom_point( - shape = 21, + shape = shape, color = get_color("dh"), fill = get_color("d"), size = size, diff --git a/man/MCMC-scatterplots.Rd b/man/MCMC-scatterplots.Rd index 8a67a9f1..e82f0797 100644 --- a/man/MCMC-scatterplots.Rd +++ b/man/MCMC-scatterplots.Rd @@ -16,6 +16,7 @@ mcmc_scatter( regex_pars = character(), transformations = list(), ..., + shape = 21, size = 2.5, alpha = 0.8, np = NULL, @@ -120,7 +121,7 @@ abbreviated for convenience in interactive use (e.g., \code{transform}).} \item{...}{Currently ignored.} -\item{size, alpha}{For \code{mcmc_scatter()}, passed to +\item{shape, size, alpha}{For \code{mcmc_scatter()}, passed to \code{\link[ggplot2:geom_point]{ggplot2::geom_point()}} to control the appearance of the points.} \item{np}{Optionally, a data frame of NUTS sampler parameters, either created diff --git a/tests/testthat/_snaps/mcmc-scatter-and-parcoord/mcmc-scatter-shape-size-alpha.svg b/tests/testthat/_snaps/mcmc-scatter-and-parcoord/mcmc-scatter-shape-size-alpha.svg new file mode 100644 index 00000000..daf263aa --- /dev/null +++ b/tests/testthat/_snaps/mcmc-scatter-and-parcoord/mcmc-scatter-shape-size-alpha.svg @@ -0,0 +1,4052 @@ + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + 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expect_gg(mcmc_scatter(drawsarr, pars = c("theta[1]", "theta[2]"))) expect_gg(mcmc_scatter(mat, pars = c("sigma", "(Intercept)"))) expect_gg(mcmc_scatter(dframe, regex_pars = "x:[2,4]")) @@ -387,6 +388,14 @@ test_that("mcmc_scatter renders correctly", { ) vdiffr::expect_doppelganger("mcmc_scatter (size, alpha)", p_custom) + p_custom_shape <- mcmc_scatter( + vdiff_dframe_chains, + shape = 3, + size = 2, + alpha = 0.2 + ) + vdiffr::expect_doppelganger("mcmc_scatter (shape, size, alpha)", p_custom_shape) + p_divergences <- mcmc_scatter( vdiff_dframe_chains, np = vdiff_dframe_chains_divergences