Java: update top jdk apis test case

Author: Jami Cogswell

java/ql/test/query-tests/Metrics/GeneratedVsManualCoverage/TopJdkApisTest/TopJdkApisTest.expected

@@ -1,23 +1,23 @@
 | java.awt | 0 | 0 | 2 | 1 | 3 | 0.6666666666666666 | 0.0 | 0.6666666666666666 | 0.0 | NaN | 0.3333333333333333 |
-| java.io | 0 | 0 | 22 | 15 | 37 | 0.5945945945945946 | 0.0 | 0.5945945945945946 | 0.0 | NaN | 0.40540540540540543 |
-| java.lang | 0 | 0 | 62 | 94 | 156 | 0.3974358974358974 | 0.0 | 0.3974358974358974 | 0.0 | NaN | 0.6025641025641025 |
+| java.io | 1 | 21 | 1 | 14 | 37 | 0.6216216216216216 | 0.5945945945945946 | 0.5945945945945946 | 0.9545454545454546 | 0.9545454545454546 | 0.9459459459459459 |
+| java.lang | 7 | 54 | 8 | 87 | 156 | 0.4423076923076923 | 0.391025641025641 | 0.3974358974358974 | 0.8709677419354839 | 0.8852459016393442 | 0.9038461538461539 |
 | java.lang.invoke | 0 | 0 | 0 | 1 | 1 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | NaN | NaN | 1.0 |
 | java.lang.reflect | 0 | 0 | 0 | 4 | 4 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | NaN | NaN | 1.0 |
 | java.math | 0 | 0 | 0 | 16 | 16 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | NaN | NaN | 1.0 |
-| java.net | 0 | 0 | 5 | 0 | 5 | 1.0 | 0.0 | 1.0 | 0.0 | NaN | 0.0 |
-| java.nio | 0 | 0 | 2 | 3 | 5 | 0.4 | 0.0 | 0.4 | 0.0 | NaN | 0.6 |
+| java.net | 0 | 4 | 1 | 0 | 5 | 1.0 | 0.8 | 1.0 | 0.8 | 1.0 | 0.8 |
+| java.nio | 0 | 1 | 1 | 3 | 5 | 0.4 | 0.2 | 0.4 | 0.5 | 1.0 | 0.8 |
 | java.nio.charset | 0 | 0 | 0 | 1 | 1 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | NaN | NaN | 1.0 |
-| java.nio.file | 0 | 0 | 7 | 1 | 8 | 0.875 | 0.0 | 0.875 | 0.0 | NaN | 0.125 |
+| java.nio.file | 0 | 3 | 4 | 1 | 8 | 0.875 | 0.375 | 0.875 | 0.42857142857142855 | 1.0 | 0.5 |
 | java.sql | 0 | 0 | 1 | 15 | 16 | 0.0625 | 0.0 | 0.0625 | 0.0 | NaN | 0.9375 |
-| java.text | 0 | 0 | 0 | 5 | 5 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | NaN | NaN | 1.0 |
-| java.time | 0 | 0 | 0 | 17 | 17 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | NaN | NaN | 1.0 |
+| java.text | 4 | 0 | 0 | 1 | 5 | 0.8 | 0.8 | 0.0 | NaN | 0.0 | 0.2 |
+| java.time | 2 | 0 | 0 | 15 | 17 | 0.11764705882352941 | 0.11764705882352941 | 0.0 | NaN | 0.0 | 0.8823529411764706 |
 | java.time.chrono | 0 | 0 | 0 | 1 | 1 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | NaN | NaN | 1.0 |
-| java.time.format | 0 | 0 | 0 | 2 | 2 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | NaN | NaN | 1.0 |
-| java.util | 0 | 0 | 86 | 66 | 152 | 0.5657894736842105 | 0.0 | 0.5657894736842105 | 0.0 | NaN | 0.4342105263157895 |
-| java.util.concurrent | 0 | 0 | 9 | 9 | 18 | 0.5 | 0.0 | 0.5 | 0.0 | NaN | 0.5 |
-| java.util.concurrent.atomic | 0 | 0 | 2 | 11 | 13 | 0.15384615384615385 | 0.0 | 0.15384615384615385 | 0.0 | NaN | 0.8461538461538461 |
+| java.time.format | 1 | 0 | 0 | 1 | 2 | 0.5 | 0.5 | 0.0 | NaN | 0.0 | 0.5 |
+| java.util | 3 | 43 | 43 | 63 | 152 | 0.5855263157894737 | 0.3026315789473684 | 0.5657894736842105 | 0.5 | 0.9347826086956522 | 0.6973684210526315 |
+| java.util.concurrent | 1 | 2 | 7 | 8 | 18 | 0.5555555555555556 | 0.16666666666666666 | 0.5 | 0.2222222222222222 | 0.6666666666666666 | 0.5555555555555556 |
+| java.util.concurrent.atomic | 0 | 2 | 0 | 11 | 13 | 0.15384615384615385 | 0.15384615384615385 | 0.15384615384615385 | 1.0 | 1.0 | 1.0 |
 | java.util.concurrent.locks | 0 | 0 | 0 | 2 | 2 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | NaN | NaN | 1.0 |
 | java.util.function | 0 | 0 | 0 | 6 | 6 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | NaN | NaN | 1.0 |
-| java.util.logging | 0 | 0 | 1 | 1 | 2 | 0.5 | 0.0 | 0.5 | 0.0 | NaN | 0.5 |
-| java.util.regex | 0 | 0 | 3 | 1 | 4 | 0.75 | 0.0 | 0.75 | 0.0 | NaN | 0.25 |
-| java.util.stream | 0 | 0 | 18 | 8 | 26 | 0.6923076923076923 | 0.0 | 0.6923076923076923 | 0.0 | NaN | 0.3076923076923077 |
+| java.util.logging | 0 | 1 | 0 | 1 | 2 | 0.5 | 0.5 | 0.5 | 1.0 | 1.0 | 1.0 |
+| java.util.regex | 0 | 2 | 1 | 1 | 4 | 0.75 | 0.5 | 0.75 | 0.6666666666666666 | 1.0 | 0.75 |
+| java.util.stream | 1 | 4 | 14 | 7 | 26 | 0.7307692307692307 | 0.19230769230769232 | 0.6923076923076923 | 0.2222222222222222 | 0.8 | 0.4230769230769231 |