This repository has been archived by the owner on May 26, 2020. It is now read-only.
/
yersinia_pestis_snp.txt
101 lines (101 loc) · 5.22 KB
/
yersinia_pestis_snp.txt
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
28
29
30
31
32
33
34
35
36
37
38
39
40
41
42
43
44
45
46
47
48
49
50
51
52
53
54
55
56
57
58
59
60
61
62
63
64
65
66
67
68
69
70
71
72
73
74
75
76
77
78
79
80
81
82
83
84
85
86
87
88
89
90
91
92
93
94
95
96
97
98
99
100
101
#SNP Organism Reference Strain Position Derived_base Ancestral_base
Root Yersinia_pestis Morelli2010 CO92 257340 C T
0.ANT1.a Yersinia_pestis Morelli2010 CO92 2575176 A C
0.ANT1.b Yersinia_pestis Morelli2010 CO92 420995 T C
0.ANT1.c Yersinia_pestis Morelli2010 CO92 4187248 T C
0.ANT2.a Yersinia_pestis Morelli2010 CO92 1523381 T C
0.ANT3.a Yersinia_pestis Morelli2010 CO92 1540754 A G
0.PE2a.a Yersinia_pestis Morelli2010 CO92 3739257 T G
0.PE3.a Yersinia_pestis Morelli2010 CO92 1211343 T C
0.PE4.a Yersinia_pestis Morelli2010 CO92 3327848 T C
0.PE4.b Yersinia_pestis Morelli2010 CO92 155800 T C
0.PE4.c Yersinia_pestis Morelli2010 CO92 3006550 A C
0.PE4.d Yersinia_pestis Morelli2010 CO92 2730783 A G
0.PE7.a Yersinia_pestis Morelli2010 CO92 1027339 G T
1.ANT1.a Yersinia_pestis Morelli2010 CO92 3166303 A G
1.ANT1.b Yersinia_pestis Morelli2010 CO92 1756795 A G
1.ANT1.c Yersinia_pestis Morelli2010 CO92 218072 A G
1.ANT2.a Yersinia_pestis Morelli2010 CO92 935991 A G
1.ANT2.b Yersinia_pestis Morelli2010 CO92 4191752 / A
1.ANT3.a Yersinia_pestis Morelli2010 CO92 155757 A G
1.IN2.a Yersinia_pestis Morelli2010 CO92 2356003 T A
1.IN3.a Yersinia_pestis Morelli2010 CO92 2625399 A C
1.IN3.b Yersinia_pestis Morelli2010 CO92 3414433 A G
1.ORI1.a Yersinia_pestis Morelli2010 CO92 3421335 A G
1.ORI1.b Yersinia_pestis Morelli2010 CO92 2947173 A G
1.ORI1.c Yersinia_pestis Morelli2010 CO92 8800 T C
1.ORI1.d Yersinia_pestis Morelli2010 CO92 877258 T C
1.ORI1.e Yersinia_pestis Morelli2010 CO92 2867382 T G
1.ORI1.f Yersinia_pestis Morelli2010 CO92 3244204 A G
1.ORI1.g Yersinia_pestis Morelli2010 CO92 2022335 A C
1.ORI1.h Yersinia_pestis Morelli2010 CO92 2619611 T G
1.ORI2.a Yersinia_pestis Morelli2010 CO92 3291254 T G
1.ORI2.b Yersinia_pestis Morelli2010 CO92 285653 C T
1.ORI2.c Yersinia_pestis Morelli2010 CO92 2030090 / A
1.ORI2.d Yersinia_pestis Morelli2010 CO92 217822 T G
1.ORI2.e Yersinia_pestis Morelli2010 CO92 420884 T C
1.ORI2.f Yersinia_pestis Morelli2010 CO92 234148 T C
1.ORI2.g Yersinia_pestis Morelli2010 CO92 1012017 G A
1.ORI2.h Yersinia_pestis Morelli2010 CO92 2449460 T C
1.ORI2.i Yersinia_pestis Morelli2010 CO92 36740 T C
1.ORI2.j Yersinia_pestis Morelli2010 CO92 434816 C A
1.ORI2.k Yersinia_pestis Morelli2010 CO92 1017501 G T
1.ORI2.l Yersinia_pestis Morelli2010 CO92 1255662 C A
1.ORI2.m Yersinia_pestis Morelli2010 CO92 1170053 G T
1.ORI2.n Yersinia_pestis Morelli2010 CO92 1170269 G T
1.ORI2.o Yersinia_pestis Morelli2010 CO92 3369097 A G
1.ORI2.p Yersinia_pestis Morelli2010 CO92 2903369 T C
1.ORI2.q Yersinia_pestis Morelli2010 CO92 2729709 A C
1.ORI2.r Yersinia_pestis Morelli2010 CO92 3077177 A T
1.ORI2.s Yersinia_pestis Morelli2010 CO92 569837 T C
1.ORI2.t Yersinia_pestis Morelli2010 CO92 3132060 T C
1.ORI2.u Yersinia_pestis Morelli2010 CO92 3981864 T A
1.ORI3.a Yersinia_pestis Morelli2010 CO92 1942127 T C
1.ORI3.b Yersinia_pestis Morelli2010 CO92 434961 / A
1.ORI3.c Yersinia_pestis Morelli2010 CO92 1284874 A C
1.ORI3.d Yersinia_pestis Morelli2010 CO92 1348724 T C
1.ORI3.e Yersinia_pestis Morelli2010 CO92 3210209 G A
1.ORI3.f Yersinia_pestis Morelli2010 CO92 3361495 A G
1.ORI3.g Yersinia_pestis Morelli2010 CO92 368379 T C
1.ORI3.h Yersinia_pestis Morelli2010 CO92 2871439 C A
1.ORI3.i Yersinia_pestis Morelli2010 CO92 171641 A G
1.ORI3.j Yersinia_pestis Morelli2010 CO92 3210210 T C
1.ORI3.k Yersinia_pestis Morelli2010 CO92 3844040 A G
1.ORI3.l Yersinia_pestis Morelli2010 CO92 559188 T C
1.ORI3.m Yersinia_pestis Morelli2010 CO92 384376 T A
1.ORI3.o Yersinia_pestis Morelli2010 CO92 488508 G T
1.ORI3.p Yersinia_pestis Morelli2010 CO92 99112 T C
1.ORI3.q Yersinia_pestis Morelli2010 CO92 2421153 G T
2.ANT1.a Yersinia_pestis Morelli2010 CO92 1032194 G A
2.ANT1.b Yersinia_pestis Morelli2010 CO92 3739253 A G
2.ANT2.a Yersinia_pestis Morelli2010 CO92 3133952 A C
2.ANT2.b Yersinia_pestis Morelli2010 CO92 4191622 A G
2.ANT2.c Yersinia_pestis Morelli2010 CO92 1055016 T G
2.ANT3.a Yersinia_pestis Morelli2010 CO92 2588247 T C
2.ANT3.b Yersinia_pestis Morelli2010 CO92 2507370 A G
2.MED1.a Yersinia_pestis Morelli2010 CO92 664619 T C
2.MED1.b Yersinia_pestis Morelli2010 CO92 3768583 A C
2.MED1.c Yersinia_pestis Morelli2010 CO92 1152650 T C
2.MED1.d Yersinia_pestis Morelli2010 CO92 461267 A G
2.MED1.e Yersinia_pestis Morelli2010 CO92 1558399 T C
2.MED2.a Yersinia_pestis Morelli2010 CO92 3187147 T A
2.MED2.b Yersinia_pestis Morelli2010 CO92 1428523 A C
2.MED2.c Yersinia_pestis Morelli2010 CO92 1559993 A G
2.MED3.a Yersinia_pestis Morelli2010 CO92 733490 T C
2.MED3.b Yersinia_pestis Morelli2010 CO92 480174 G A
3.ANT.a Yersinia_pestis Morelli2010 CO92 1102174 A G
III Yersinia_pestis Morelli2010 CO92 1965682 G T
IV Yersinia_pestis Morelli2010 CO92 3172573 G C
IX Yersinia_pestis Morelli2010 CO92 2310626 T C
V Yersinia_pestis Morelli2010 CO92 4600959 A G
VI Yersinia_pestis Morelli2010 CO92 4585561 T C
VII Yersinia_pestis Morelli2010 CO92 2655012 C T
VIII Yersinia_pestis Morelli2010 CO92 2934864 T C
X Yersinia_pestis Morelli2010 CO92 2025677 T G
XI Yersinia_pestis Morelli2010 CO92 2934972 C G
XII Yersinia_pestis Morelli2010 CO92 1748342 A G
XIII Yersinia_pestis Morelli2010 CO92 130643 G A
XIV Yersinia_pestis Morelli2010 CO92 3442617 A T
XV Yersinia_pestis Morelli2010 CO92 3645377 C A
XVI Yersinia_pestis Morelli2010 CO92 217924 G T
XVII Yersinia_pestis Morelli2010 CO92 2241101 T A