Fedora 23: "LaTeX Warning: There were undefined references"

[KMax]

Клонировал репозиторий до d2398a2 коммита включительно, установил необходимые пакеты (ОС Fedora 23 x64). Но после компиляции остаются неопределенные ссылки.

Шаги (из корня репозитория):

1. make clean
2. make dissertation
3. make dissertation

Вывод обоих make dissertation вызовов: https://gist.github.com/KMax/caac58b80723070b553e

В выводе второго вызова наблюдаю проблему с 52-мя ссылками:

Latexmk: Found biber source file(s) [../biblio/othercites.bib dissertation.bcf]
Latexmk: Summary of warnings:
  Latex failed to resolve 52 citation(s)
Latexmk: All targets (dissertation.pdf) are up-to-date

Может проблема с пакетами, которые я установил для того чтобы шаблон собрался?

[KMax]

Попробовал собрать шаблон в Ubuntu 15.04, чтобы удостовериться, что проблема в моём окружении, а не в шаблоне. В итоге получилось, вот Dockerfile:

FROM ubuntu:15.04

RUN echo "deb http://archive.ubuntu.com/ubuntu vivid multiverse" >> /etc/apt/sources.list

RUN apt-get update -y && apt-get upgrade -y

RUN apt-get install -y texlive-xetex texlive-generic-extra latexmk biber

RUN echo ttf-mscorefonts-installer msttcorefonts/accepted-mscorefonts-eula select true | debconf-set-selections
RUN apt-get install -y ttf-mscorefonts-installer
RUN fc-cache -fv

RUN apt-get install -y git make

RUN git clone https://github.com/AndreyAkinshin/Russian-Phd-LaTeX-Dissertation-Template.git

WORKDIR /Russian-Phd-LaTeX-Dissertation-Template

Попробую под Fedora'у теперь собрать заново.

[KMax]

Этот варнинг о чем-то говорит? Может он быть причиной или подсказкой?

[18.18] [19.19] [20.20]) (./conclusion.tex (../common/concl.tex)) [21.21]
(./references.tex

Package biblatex Warning: Keyword 'bibliofull' not found on input line 7.

LaTeX Warning: Empty bibliography on input line 7.

[Lenchik]

Попробуйте запустить его в bibtex-режиме, хоть что-то исключим как причину.
На Windows компилируется отлично во всех трёх компиляторах.

[KMax]

Как я понимаю, для этого нужно в bibliopreamble.tex закомментировать все строки кроме:

\input{../biblio/predefined}

так?

Но из-за этого появилась ошибка:

! LaTeX Error: Environment refsection undefined.

Пока не понял как исправить.

[Lenchik]

Не так.
Правильный способ - через настроечный файл

[KMax]

Собралось и ссылки заработали! Спасибо @Lenchik!

Теперь бы понять, почему с biber'ом не работает.

[Lenchik]

Biber или biblatex старые слишком (в результате неверно обрабатываются или не обрабатываются вовсе команды из biblatex.tex). Biblatex обновляйте не выше версии 3.0, в 3.1 баг.

[KMax]

В bibliopreamble.tex файле есть такой комментарий % Встроенная реализация с загрузкой файла через движок bibtex8, хотя все равно вызывается bibtex, а не bibtex8.

Есть соответствующие пакеты texlive-bibtex8 и texlive-bibtex. Естественно, работает только с последним. Комментарий неточный или я ошибаюсь?

[Lenchik]

Неточный. На windows выглядит всё, будто это один и тот же файл c разными именами для совместимости. Считается, что bibtex не умеет работать с utf8, а bibtex8 и bibtexu - умеют.