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<!-- README.md is generated from README.Rmd. Please edit that file -->
```{r, include = FALSE}
knitr::opts_chunk$set(
collapse = TRUE,
comment = "#>",
fig.path = "man/figures/README-",
out.width = "100%"
)
```
# BioDataScienceData
<!-- badges: start -->
[](https://www.tidyverse.org/lifecycle/#experimental)
<!-- badges: end -->
## English version
The goal of BioDataScienceData is to provide several datasets obtained with the quizzes learnr at BioDataScience package. The collected data with the quizzes are stocked in a MongoDB database. This data are extracted and anonymised before to become available in this package.
### Biological Data Science – UMONS Course projects.
The goal of this organisation to offer data science courses for biologists in French at the University of Mons (Belgium). Several repositories are led to produce coherent materials. All resources are centralised at <http://biodatascience-course.org>.
You can find the following repositories:
- [sdd-umons](https://github.com/BioDataScience-Course/sdd-umons) : the book online to help the students for their self-learning.
- [BioDataScience](https://github.com/BioDataScience-Course/BioDataScience) : package with all quizzes used by students for their self-assessment.
- [BioDataScienceData](https://github.com/BioDataScience-Course/BioDataScienceData) : package with anonymised datasets that are collected with BioDataScience quizzes.
- [bds_analyse](https://github.com/BioDataScience-Course/bdsd_analyse) : A shiny app to visualise the data of BioDataScienceData that provides useful and detailed information on the learning process. this app draws from the [sdd_problem_detection](https://github.com/BioDataScience-Course/sdd_problem_detection)
### Installation
You can install the released version of BioDataScienceData from GitHub with:
``` r
remotes::install_github("BioDataScience-Course/BioDataScienceData@v0.1.0")
```
And the development version from [GitHub](https://github.com/) with:
``` r
# install.packages("remotes")
remotes::install_github("BioDataScience-Course/BioDataScienceData")
```
### Example
```{r}
library("BioDataScienceData")
data("biodatascience")
```
The dataset contains`r nrow(biodatascience)`. It is the activities and answers of `r length(levels(biodatascience$user_name))` students on `r length(levels(biodatascience$tutorial))` quizzes.
### Note
<img src="https://filedn.com/lzGVgfOGxb6mHFQcRn9ueUb/logo/biodatascience.png" width="60" height="60" align="left"/> This package is developped for the Biological data science .
To learn more, please visit <https://biodatascience-course.sciviews.org/>
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<img src="https://filedn.com/lzGVgfOGxb6mHFQcRn9ueUb/logo/site-title.png" width="130" height="50" align="left"/> This package is developped with the SciViews Box 2019.
To learn more, please visit <http://www.sciviews.org>
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<img src="https://filedn.com/lzGVgfOGxb6mHFQcRn9ueUb/logo/EcoNum-logo.png" width="60" height="60" align="left"/> This package is developped for the Numerical Ecology of Aquatic Systems.
To learn more, please visit <https://econum.github.io>
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## Version Française
L'objectif de BioDataScienceData est de recenser plusieurs jeux de données provenant de la récupération de l'activité et des réponses proposées par des étudiants lors de la réalisation de questionnaires interactifs de type 'learnr' provenant du package BioDataScience.
Les données collectées avec les questionnaires sont récupérées dans une base de données MongoDB. Ces dernières sont extraites et anonymisées avant d'être mises à disposition au sein de ce package.
### Le projet [Biological Data Science - UMONS Course](https://github.com/BioDataScience-Course)
L'objectif de cette organisation est de proposer des cours de science des données biologiques à l' [Université de Mons](https://web.umons.ac.be/fr/) (Belgique) pour ce faire différent projet sont mené dont certains mène à la création de package le tout etant centralisé via le site web suivant <https://biodatascience-course.sciviews.org>.
Parmi les dépot de cette organisation, on peut retrouver les dépot suivant:
- [sdd-umons](https://github.com/BioDataScience-Course/sdd-umons) : dépot hébergeant le livre en ligne support de l'apprentissage.
- [BioDataScience](https://github.com/BioDataScience-Course/BioDataScience) : package comprennant l'ensemble des quiz proposés aux étudiants
- [BioDataScienceData](https://github.com/BioDataScience-Course/BioDataScienceData) : package comprennant les données anonymisées des quiz de BioDataScience
- [bds_analyse](https://github.com/BioDataScience-Course/bdsd_analyse) : dépot contenant une shiny app permettant de visualiser les données du package BioDataScienceData. ce projet s'inspire du travail de fin d'étude suivant : [sdd_problem_detection](https://github.com/BioDataScience-Course/sdd_problem_detection)
### Installation
Vous pouvez installer la dernière version stable de BioDataScienceData depuis [GitHub](https://github.com/) avec :
``` r
remotes::install_github("BioDataScience-Course/BioDataScienceData@v0.1.0")
```
et la version en développement depuis And the development version from [GitHub](https://github.com/) avec :
``` r
# install.packages("remotes")
remotes::install_github("BioDataScience-Course/BioDataScienceData")
```
### Exemple
```{r}
library(BioDataScienceData)
data("biodatascience")
```
Ce jeu de données comprend `r nrow(biodatascience)` venant du suivi de l'activité de `r length(levels(biodatascience$user_name))` étudiants ayant appris par eux même avec `r length(levels(biodatascience$tutorial))` questionnaires.
### Note
<img src="https://filedn.com/lzGVgfOGxb6mHFQcRn9ueUb/logo/biodatascience.png" width="60" height="60" align="left"/> Ce package est développé dans le cadre du projet sur l'enseignement de la science des données biologique à l'Université de Mons.
Pour en apprendre plus, visitez le site suivant: <https://biodatascience-course.sciviews.org/>
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<img src="https://filedn.com/lzGVgfOGxb6mHFQcRn9ueUb/logo/site-title.png" width="130" height="50" align="left"/> Ce package est développé avec la SciViews Box 2019.
Pour en apprendre plus, visitez le site suivant: <http://www.sciviews.org>
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<img src="https://filedn.com/lzGVgfOGxb6mHFQcRn9ueUb/logo/EcoNum-logo.png" width="60" height="60" align="left"/> Ce package est développé dans le cadre des recherches du service d'écologie numérique des milieux aquatiques.
Pour en apprendre plus, visitez le site suivant: <https://econum.github.io>
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