文件窗口由文件列表、文件夹标签、状态栏、工具栏、文件夹树和其它窗格组成。除了必须保留一个文件列表外，文件窗口中的所有其它组件都可移除。
见 单窗口模式。
在配置窗口中勾选 文件夹标签/选项/关闭最后的标签页时同时关闭窗口。或者也可以使用脚本实现：IbDOpusScripts/CloseTabOrLister。
在资源管理器中，文件窗口的任务栏图标会随当前文件夹的图标而变化。与资源管理器不同，DOpus 文件窗口的任务栏图标默认固定为 
。推荐在配置中改为使用当前文件夹的图标，便于区分：
图标：
当前文件夹图标：
另外，当前文件夹图标只会在 DOpus 的任务栏按钮未被合并时生效，在按钮被合并时仍会显示为 。
DOpus 支持对文件窗口进行“安全截屏”，即在截屏时自动对文件名进行打码。默认的安全截屏按钮位于 操作工具栏 → 帮助 → 安全截图：
效果图：
该按钮的相应命令为：
Clipboard SCREENSHOT=secure该命令会在截屏时播放快门声，同时弹窗进行提示。如果不希望弹出提示，可以将按钮的命令改为：
Clipboard SCREENSHOT=secure,quiet另外，也可以添加截屏倒计时，便于截取菜单之类的弹出式界面：
Clipboard SCREENSHOT=secure,time:5如果只希望对文件窗口进行截屏而不进行打码，可以去掉以上命令中的 secure 参数。