04_sesion4.Rmd

# Proyectos colaborativos

## Propuesta 1

Crea un paquete que implemente el análisis de expresión diferencial.

Evalúa el funcionamiento del paquete en el análisis de placas calcificadas de Aterogénesis.

Puedes descargar los datos de: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE159677

## Propuesta 2

Realiza la anotación de tipos celulares del sistema inmune en una muestra de médula ósea usando los marcadores propuestos por Human Cell Atlas.

Puedes descargar los datos de single-cell de: https://www.10xgenomics.com/resources/datasets/20-k-bone-marrow-mononuclear-cells-bmmn-cs-5-ht-v-2-0-2-high-6-1-0

## Propuesta 3

Realiza el análisis y anotación de tipos celulares en un dataset de cáncer de próstata.

Puedes descargar los datos de:  https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE157703


## Propuesta 4

Crear un paquete que implemente el análisis de enriquecimiento de los genes diferencialmente expresados.

Evalúa el funcionamiento del paquete en el análisis de células neoplásticas en glioblastoma humano.

Puedes descargar los datos de: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE84465

Consulta el artículo original en: https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2211124717314626?via%3Dihub#app3

## Propuesta 5

Desarrolla un paquete para facilitar la visualización de los tipos celulares de alguno de los datasets mencionados previamente.