La subclase Copépoda es la más rica en especies, con >11,000 especies descritas y son los animales más abundantes en la Tierra (Jorgensen et al., 2019). Los copépodos son un componente crítico de los ecosistemas marinos y de aguas continentales del mundo, son indicadores sensibles del cambio climático local y mundial, componentes clave de los servicios ecosistémicos, depredadores y parásitos de animales acuáticos económicamente importantes (Bron et al., 2011).
Los copépodos Leptodiaptomus son similares morfológicamente a Leptodiaptomus sicilis (Forbes, 1882) y habita en lagos de agua dulces y salinos que forman parte de la Cuenca Oriental en México.
| Lago | Salinidad | Peces |
|---|---|---|
| Atexcac | Alta | No |
| Carmen | Variable | No |
| Preciosa | Dulce | Si |
| Quechulac | Dulce | Si |
Las condiciones ecológicas de estos lagos en general son contrastantes, se ha estudiado el efecto de la salinidad variable como un probable promotor de la adaptación local de los copépodos Leptodiaptomu. Se ha demostrado que estas poblaciones presentan una divergencia ecológica en tres fenotipos diferentes: dos especializados en los lagos con salinidad alta (L. "Atexcac"), otro a salinidad baja (L. "La Preciosa" y "Quechulac") y un generalista a salinidad variable (L. "El Carmen") que habita un lago temporal con fluctuaciones de salinidad (Barrera et al., 2015).
Aquí se realizo una descripción básica de la estructura genética de estas poblaciones para inferir la divergencia genética de las poblaciones y su correlación con los patrones ecológicamente divergentes.
Se utilizó un conjunto de 109299 SNPs para 23 individuos de cada población, estos SNPs se filtrarón en VCFtools con un maf ≤ 0.5 y un maxing-data = 1.0, y se obtuvo un nuevo conjunto con 11254 SNPs, estos se utilizaron para estimar la estructura genética de las poblaciones.
La divergencia y estructura genética separan a las poblaciones del copépodo Leptodiaptomus en cuatro grupos diferentes cada uno asociado a su condición salina del lago al que pertenecen.
En general las relaciones genéticas entre poblaciones descrita aquí mantienen una correlación empiríca entre laa divergencia ambiental (particularmente con los gradientes de salinidad), y la divergencia genética, sugiriendo una probable adaptación local.