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《生信与机器学习兴趣小组》第一次分享讨论贴 | Lianm's Blog #4
Comments
抢 1 楼 沙发 感觉整个一次讨论下来,收获还是很多的。但感觉博主分享的解决办法(比如质控统计报告)还是有点点主观啊,建议博主可以分享一些大佬 对于解决某些问题 提出的建议和想法。 |
感谢博主分享,在直播讨论中提到的通过掺入dUTP实现链特异性建库原理,我根据自己的理解手绘了一张原理图,与大家探讨。 |
谢博主分享,关于polyA+策略建库的问题。 |
会有影响,一般针对这种存在internal poly-A priming较多的物种,会考虑其他的建库方式
会有影响,一般针对这种存在internal poly-A priming较多的物种,会考虑其他的建库方式,如通过移除rRNA的方法……当然这种方法一般更适用于一些样本量较少,mRNA质量较差的样本 |
在分析上现在有一些计算方法可以进行矫正吗?或者是一些具体的评估的文章,就是internal poly(A) priming的现象对RNA-seq表达定量的影响? |
:1:RNA-seq与基因芯片相比有什么优势?除了小明说的以为个人觉得前者检测低丰度的检出率 要高,即动态范围会更广。当然还有大家熟知的就是能检测选择性剪切位点且为的和新的异构体。 |
谢谢博主分享,时差一直参加不了直播没法互动很难过,但是这些已经是帮忙补充了不少生物学背景了,复习了原理,对我自己做的project很有帮助,感谢明哥! |
https://ming-lian.github.io/2019/06/19/Bioinfo-ML-Club-1st/
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