很多生物或生態背景的人看到「程式設計」都會有點恐懼，其實程式設計並不難，基本上就是了解語法及邏輯。在這節我們會用簡單的例子來介紹 R 的程式設計，尤其是流程控制(flow control)這部份。 相信許多人都會畫簡易的流程圖，這部份的流程控制就是把流程圖轉換成文字來告訴 R 該怎麼執行。流程控制在程式語言中有個專有名詞稱為「控制結構(control structure)」，通常在一般的程式語言中，有循序(sequence)、選擇(selection)以及重複(repitition)三種類別。「循序」就是由上至下一行一行的依照順序執行，我們在寫 R 程式碼時大部分都是循序的執行；「選擇」則是有許多不同的條件，如果符合條件的話， 就會依照條件下來執行；「重複」字面上來看就是不斷地重複執行某些工作。
我們用生活中的例子來說來協助理解，例如使用洗衣機洗衣服，在 R 程式設計中該怎麼用控制結構呢？
控制結構:
- 洗衣機有插電嗎？
有：進行步驟 2
無：插上插頭後，進行步驟 2- 放髒衣服進洗衣槽
在 R 的流程控制中，即使是像洗衣機插上插頭這種細節都必須要寫進去。 所以我們接下來先看一下 R 裡頭的控制結構有哪些，再分別一個一個來仔細說明。
在 R 裡頭的控制結構總覽請參見下表，細節將會在後面的部份解釋
表 2-1. R 的控制總覽表
| R 的控制結構 | 類型 | 解釋 | 語法 |
|---|---|---|---|
| if ... else | 選擇 | 如果 ... 然後 | if ( condition ) expression else expression |
| ifelse | 選擇 | 如果 ... 然後 | ifelse(testCondition, yes, no) |
| switch | 選擇 | 根據條件切換 | switch(expression, ...) |
| for | 重複 | 變數在某序列下，重複執行 | for ( variable in sequence) expression |
| while | 重複 | 根據某些條件下，重複執行 | while ( condition ) expression |
在選擇的控制結構中，簡單來說就是「**如果(if)發生一件事情然後(then)**做些什麼」， 例如：如果今天下雨，然後出門你要記得帶傘。若把它翻譯成 R 可以理解的語言，我們可以這樣寫
如果 ( 下雨了 ) {
出門記得帶傘
}注意，上面的程式碼(code)並非可以直接執行的，只是示意，我們通常稱這樣的程式碼為 虛擬程式碼(pseudocode)。 使用虛擬程式碼可以幫助你先將複雜的演算法(algorithm，或籠統稱為「作法」) 的概念用常人比較容易懂的方式寫出來，之後就可以轉換成該語言之程式碼。
R 的語法如下:
ifelse( testCondition, yes, no)
如果有個變數 val 的數值，我們想判斷這個變數是否大於 10，在 R 可以寫成
ifelse( val > 10, 'Yes', 'No')如果變數 val 大於 10， R 就會顯示 "Yes"，反之則是 "No"
若選擇的控制結構比較複雜，可以用大括號把 expression 包起來，如下：
if ( condition ) {
expression
} else {
expression
}其中 condition 指的是判斷的條件。而 expression 則是要陳述的表示式(字面上有點難理解，不過就是諸如運算式、
印出資料等都是 expression)。你也可以只寫 if 而不用加上 else。若你需要做條件判斷的情形比較複雜，
即超過兩個以上的條件判斷，可以使用 if 加上 elseif ，最後再使用 else來處理，例如：
# 隨機產生一個數值
a = rnorm(1)
# if-elseif-else 選擇
if ( a < 5 ) {
print("a is less than 5")
} else if ( a > 0 ) {
print("a is between 0 to 5")
} else {
print("a is greater than 5")
}重複執行某些動作，在 R 的語法可以使用 for 迴圈(loop)或 while 迴圈。
迴圈代表重複執行某些動作，例如我想在 R console 中印出 1, 2, 3, ... 一直到 100：
# 印出 1, 2, 3
> print(1)
[1] 1
> print(2)
[1] 2
> print(3)
[1] 3
> print(4)
[1] 4
... (以下省略) ...
> print(100)
[1] 100這個時候如果每印出一個數字，就要輸入 print(n)，不就要 100 行 code 才能完成嗎？
所以迴圈就可以解決這類重複執行的動作，同樣印出 1 至 100，使用 for 迴圈可以這樣做：
for ( i in 1:100 ){
print(i)
}for 迴圈的語法如下，括號內包的是執行動作時的序列：
for ( 序列 ){
執行動作
}另外一個迴圈則是 while，如果同樣印出 1 至 100 的數字，while
迴圈則要寫成：
# 先把 i 的起始數值設定為 1
i <- 1
while ( i <= 100 ){
# 印出 i 的數值
print(i)
# 接下來設定 i' = i + 1，也就是每印完一個數字後，
# i 自動加 1
i <- i + 1
}有注意到嗎？在 for 迴圈中，括號內要設定好一個序列，例如 1 至 100 (R 的語法 1:100)，
但 while 則是限定在某個條件下，以本例來說就是 i 小於等於 100 時，
R 才會重複大括號內的執行動作。如果今天寫 while ( 1+1 == 2 ) 時，
這個迴圈就會變成「無窮迴圈」了，R 會一直執行他到天荒地老永遠都不會停！
如果你不幸的沒寫好讓它變成無窮迴圈的話，你只要按 RStudio 的 R console 右上角的 stop 就可以停止執行，
或是在非 RStudio 介面下，按 Ctrl + c 來強迫中斷執行。
