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Running examples in ‘covidmx-Ex.R’ failed
The error most likely occurred in:
> ### Encoding: UTF-8
>
> ### Name: descarga_datos_abiertos
> ### Title: Descarga de datos abiertos
> ### Aliases: descarga_datos_abiertos
>
> ### ** Examples
>
> ## No test:
> # Descarga de la base de datos junto con diccionario en duckdb y la guarda en
> # un archivo temporal.
> # Puede cambiarse el dlink por el adecuado o dejarse en blanco.
> # quita la opción de sites.covid para descargar los de la DGE. Esto es sólo un ejemplo.
> file_duck <- tempfile(fileext = ".duckdb")
> dlink <- "https://github.com/RodrigoZepeda/covidmx/raw/main/datos_abiertos_covid19.zip"
> datos_covid <- descarga_datos_abiertos(
+ dbdir = file_duck,
+ sites.covid = dlink, show_warnings = FALSE
+ )
── Hola esto es lo que hare hoy para ti: ───────────────────────────────────────
1. Base de datos de covid-19 de la Direccion General de Epidemiologia:
• Descargar las bases de datos abiertos
• Descomprimir las bases de datos abiertos
• Consolidar en una sola base de datos
2. Diccionario de datos de covid-19 de la Direccion General de Epidemiologia:
• Descargar el diccionario
• Descomprimir el diccionario
• Consolidar todos los diccionarios en una lista
3. Unir datos y diccionario en una sola lista
── Comenzamos (por favor ten paciencia): ───────────────────────────────────────
ℹ Descargando la informacion...
ℹ Descomprimiendo los archivos '.zip'...
ℹ Consolidando los archivos '.csv' en 'duckdb'...
ℹ Cargando los datos en 'duckdb'...
ℹ Conectando a la tabla `covidmx` creada en 'duckdb'...
ℹ Eliminando los archivos '.csv'
✔ Terminado. No olvides desconectar la base con `datos_covid$disconnect()`
al terminar de trabajar.
Error in `descarga_db_datos_abiertos_tbl()`:
! El sitio de dado por:
<http://datosabiertos.salud.gob.mx/gobmx/salud/datos_abiertos/diccionario_datos_covid19.zip>
no existe o no puede ser encontrado. Verifica exista y tu conexion a Internet
sea estable.
Backtrace:
▆
1. └─covidmx::descarga_datos_abiertos(...)
2. └─covidmx::descarga_diccionario(...)
3. ├─base::do.call(descarga_db_diccionario_ssa, descarga_db_diccionario_ssa_args)
4. └─covidmx (local) `<fn>`(...)
5. └─covidmx::descarga_db_datos_abiertos_tbl(...)
6. └─cli::cli_abort("El sitio de {.strong {names(sites.covid)[sitenum]}} dado por:\n {.url {site.covid}}\n no existe o no puede ser encontrado. Verifica exista y tu conexion a Internet sea estable.")
7. └─rlang::abort(...)
Execution halted
Warning: Connection is garbage-collected, use dbDisconnect() to avoid this.
Warning: Database is garbage-collected, use dbDisconnect(con, shutdown=TRUE) or duckdb::duckdb_shutdown(drv) to avoid this.
* checking for unstated dependencies in ‘tests’ ... OK
* checking tests ...
Running ‘testthat.R’ [22s/13s]
[22s/14s] OK
* checking PDF version of manual ... OK
* checking for non-standard things in the check directory ... OK
* checking for detritus in the temp directory ... OK
* checking for new files in some other directories ... OK
* DONE
Status: 1 ERROR
See
‘/data/blackswan/ripley/R/packages/tests-devel/covidmx.Rcheck/00check.log’
for details.
CRAN throws the following error
See here
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