.. automodule:: neatseq_flow_modules.GATK_modules.CNV_per_Exon
.. automodule:: neatseq_flow_modules.GATK_modules.GATK_CatVariants
.. automodule:: neatseq_flow_modules.GATK_modules.GATK_gvcf
.. automodule:: neatseq_flow_modules.GATK_modules.GATK_hard_filters
.. automodule:: neatseq_flow_modules.GATK_modules.GATK_merge_gvcf
.. automodule:: neatseq_flow_modules.GATK_modules.GATK_pre_processing
.. automodule:: neatseq_flow_modules.GATK_modules.GATK_SelectVariants
.. automodule:: neatseq_flow_modules.GATK_modules.GATK_VQSR
.. automodule:: neatseq_flow_modules.GATK_modules.GenotypeGVCFs
.. automodule:: neatseq_flow_modules.GATK_modules.Picard_CollectAlignmentSummaryMatrics
.. automodule:: neatseq_flow_modules.GATK_modules.Picard_CollectVariantCalling
.. automodule:: neatseq_flow_modules.GATK_modules.STAT_VEP
.. automodule:: neatseq_flow_modules.GATK_modules.VEP