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A medical image segmentation software supporting user interventions and user-defined funtion extention

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cyw3/AnatomySketch-Software

 
 

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AnatomySketch-Software

Anatomy Sketch(简称AS)是一款医学影像分割标注与自动化分析处理的科研用软件,主要功能特点包括:

  • 交互性:支持鼠标、触控屏、触控笔操作,方便进行医学图像分割标注。软件界面设计力求简洁并为交互提供便利。

  • 可扩展性:支持用户将自编的C++或Python程序打包成插件集成到软件中(如深度神经网络等),便于在图形化界面中实现个性化功能,弥补了当前深度学习算法缺少交互界面载体的缺陷。软件还自带基本的图像图形处理功能(如裁剪、滤波、基本分割、图形曲面处理、DICOM图像载入),满足基本的图像处理功能。

  • 中文友好:软件主打中文界面,方便国内医生和科研人员操作。

  • 开源免费,包括源代码。

欢迎大家下载试用。您在下载软件后,打开软件,点击“帮助”阅读软件详细介绍。也可以在下载软件后,使用浏览器打开README.html来阅读软件详细介绍。

这不是一款面向临床应用的软件。我们的目的是为国内从事科研工作的工程技术人员和医生群体提供一个便利的雏形算法开发平台,争取在不远的将来以此为基础建立医学图像处理算法交流社区,为科研成果向临床的第一步转化献一份力。

由于软件完全由在校研究生开发,就像第一代iphone一样,难免存在各种缺陷,请您不吝批评。开发团队诚挚邀请有软件开发经验的高手加盟(可以有偿),共同推动这样一个开源平台的进步,实现共赢。

下载软件

如果您想要下载软件试用,需要在Github项目中点击release,并选择版本即可下载。如果想要运行软件,只需下载AnatomySketch-x.x.zip即可,无需下载其余文件。其余文件中dense_vnet_abdominal_ct.zip和vgg19_se_block_model.zip为深度学习插件示例,在软件说明书中有更为详细的介绍,如果您想体验在AS软件中调用深度学习算法,可以下载试用。Source code为软件源代码,用于软件的编译。

在下载解压后您会得到一个文件夹,本软件无需安装,双击AnatomySketch.exe即可运行。在软件中点击帮助按钮可以查看软件的详细使用说明书。

编译软件

如果您想编译本软件的源代码,需要安装cmake,并试用cmake编译得到sln工程,之后使用Visual Studio编译该工程即可。该项目使用c/c++编写,并且只能在windows环境下运行,编译工程需要用到的库有:Qt、VTK、ITK。

About

A medical image segmentation software supporting user interventions and user-defined funtion extention

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  • C++ 88.4%
  • Objective-C 10.4%
  • CMake 1.2%