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File metadata and controls

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提交计算

push.py 为要运行的脚本名

直接提交

#程序名 脚本名
zdem push.py
  • 优点：实时查看计算是否正确，使用 ctrl+c 结束计算
  • 缺点：关闭窗口，计算停止

Warning

这种方式只能作简单测试用，长时间使用会被管理员封号。 如果想交互式的提交计算，可采用如下命令 srun -n 1 -c 12 zdem push.py ，即采用1个节点 -n 1 ， 12个核 -c 12 计算。这种方式会正常计费，不会被管理员封号。

Slurm 作业调度系统

并行超算云 安装了该调度系统。

SLURM （Simple Linux Utility for Resource Management）是一种可扩展的工作负载管理器，已被全世界的国家超级计算机中心广泛采用。 它是免费且开源的，根据GPL通用公共许可证发行。

  • sbatch job.sh 提交作业
  • squeue 查看作业状态（可以查看所有作业的id号）
  • scancel id 取消一个作业（id号定位该作业）

Note

  • 优点：同时计算多个，关闭窗口，不影响计算
  • 缺点：不能实时查看计算情况

提交作业 sbatch job.sh

显示

Submitted batch job 134573

说明提交成功。 job.sh 内容如下:

job.sh

Warning

这里配置 module load zdem2.0 ，将使用 2.* 系列的最新版本。

Warning

注意job.sh的行结尾符需采用 Unix 的 \n 格式，否则将产生如下错误信息：

sbatch: error: Batch script contains DOS line breaks (\r\n)
sbatch: error: instead of expected UNIX line breaks (\n).

修改 job.sh 的行结尾符 见 第00课 并行超算云上使用ZDEM 的 10:15

查看作业状态 squeue

显示

JOBID PARTITION NAME USER ST TIME NODES NODELIST(REASON)

134573 v6_384 test sc80502 R 0:30 1 cb0503

从上面的输出可知，该任务的 id 为 134573 。ST 状态为 R 说明正在计算。任务分配给了节点 cb0503。

Tip

squeue -l 可以查看作业细节信息

取消作业 scancel id

要杀死上面的作业， 输入 scancel 134573 即可，134573为上面作业的id号。

再次输入 squeue。显示 :

JOBID PARTITION     NAME     USER ST       TIME  NODES NODELIST(REASON)

说明作业已经取消。