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<title>Ines Tej Blog</title>
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<span class="subheading">Publications scientifiques </span>
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<!-- Main Content -->
<hr>
Je suis Maître-Assistante à l'école supérieure de la statistique et de l'analyse de l'information (<a href="http://www.essai.rnu.tn/"> ESSAI </a>) de
l'Université de Carthage (<a href="http://www.ucar.rnu.tn"> UCAR </a>) et membre du laboratoire de bio-informatique, bio-mathématique et bio-statistique (<a href="http://www.pasteur.tn/index.php?option=com_content&view=article&id=346:epidemiologie-et-diversite-genetique-des-virus-hepatiques-et-enteriques-humains-&catid=89"> BIMS </a>)
à l'Institut Pasteur de Tunis (<a href"http://www.pasteur.tn/"> IPT </a>), de l'Université Tunis El Manar (<a href="http://www.utm.rnu.tn"> UMT </a>).
Liens utiles : <a href="https://orcid.org/0000-0002-1796-7897"> ORCID </a>, <a href="http ://www.researcherid.com/rid/T-2183-2018"> ResearchID </a>, <a href="https ://publons.com/author/1598969/ines-abdeljaoued-tej"> Publons </a>, <a href="https ://rpubs.com/inestej"> Rpub</a>.
<br />
<h3> Publications dans des revues avec comité de lecture </h3>
<ol>
<li><p> Applied Machine Learning Towards Drug Discovery Enhancement : Leishmaniases as a Case
Study, E. Harigua-Souiai, O. Souiai, R. Oualha, I. Abdeljaoued-Tej, I.
Guizani. Bioinformatics and biology insights, Avril 2022; 16.
<a href="https://doi.org/10.1177/11779322221090349">DOI: 10.1177/11779322221090349</a></p></li>
<li><p> Deep Learning
Algorithms Achieved Satisfactory Predictions When Trained on a Novel Collection of Anticoronavirus Molecules,
Harigua-Souiai E., Heinhane M.M., Abdelkrim Y.Z., Souiai O., Abdeljaoued-Tej I., Guizani I.
Frontiers in Genetics, section Computational Genomics, 12:744170, Novembre 2021.
<a href="https://doi.org/10.3389/fgene.2021.744170">DOI: 10.3389/fgene.2021.744170</a></p></li>
<li><p> Cancer in Africa: The untold story, Frontiers in Oncology,
Y. Hamdi, I. Abdeljaoued-Tej, A.A. Zatchi, S. Abdelhak, S. Boubaker, J.S. Brown, A. BenKahla,
section Cancer Epidemiology and Prevention, vol 11, page 1011, Avril 2021.
<a href=" https://doi.org/10.3389/fonc.2021.650117">DOI: 10.3389/fonc.2021.650117</a>
</p></li>
<li><p> Contribution of machine learning and text mining to the construction of farmers' information systems,
I. Abdeljaoued-Tej, European Scientific Journal, Vol. 16, No. 12, pages 83-110, Avril 2020.
<a href=" https://doi.org/10.19044/esj.2020.v16n12p83">DOI: 10.19044/esj.2020.v16n12p83</a>
</p></li>
<li><p> Separators for Polynomial Dynamic Systems with Linear Complexity, I. Abdeljaoued-Tej, A. Benkahla, G. Haddad, A. Valibouze,
In: Bortolussi L., Sanguinetti G. (eds) Computational Methods in Systems Biology.
CMSB 2019. Lecture Notes in Computer Science, vol 11773. Springer, Cham, 2019.
<a href=" https://doi.org/10.1007/978- 3-030-31304-3_30">DOI: 10.1007/978- 3-030-31304-3_30</a>
</p>
</li>
<li>
<p>
Corrigendum - Algebraic certification of numerical algorithms computing Lagrange resolvents, I. Abdeljaoued-Tej, F. Bouazizi et A. Valibouze,
Journal of Algebra and Its Application, 2019.
Corrigendum de F. Bouazizi, Algebraic certification of numerical algorithms
computing Lagrange resolvents, Journal of Algebra and Its Application, Vol. 17, No. 1, 2018.
<a href=" https://doi.org/10.1142/S0219498819920014">DOI: 10.1142/S0219498819920014</a>
</p>
</li>
<li>
<p> Systems Biology in Infectious diseases, A. Benkahla, L. Guizani-tabbane, I. Abdeljaoued-Tej, S. Benmiled et K. Dellagi,
In Handbook of Research in Systems Biology Applications in Medicine (chapter 23), Information Science Reference, IGI Global, 2008.
<a href=" https://doi.org/10.4018/978-1-60566-076-9.ch023">DOI: 10.4018/978-1-60566-076-9.ch023</a>
</p>
</li>
<li>
<p>
Computing of the decomposition group of a triangular ideal, I. Abdeljaouad-Tej, S. Orange, G. Renault and A. Valibouze,
Journal of Applicable Algebra in Engineering, Computation and Computing,
Volume 15, Numbers 3-4, pages 279 - 294, Springer-Verlag Heidelberg, November 2004.
<a href=" https://doi.org/10.1007/s00200-004-0160-x">DOI: 10.1007/s00200-004-0160-x</a>
</p>
</li>
<li> <p> Calculs D'invariants Primitifs de Groupes Finis, I. Abdeljaouad,
RAIRO-Informatique Théorique et Applications, Volume 33 n. 1 page 59, Janvier-Février 1999.
<a href=" https://doi.org/10.1051/ita:1999106">DOI: 10.1051/ita:1999106</a>
</p>
</li>
</ol>
<h3>Conférences et séminaires</h3>
<ol>
<li><p> <a href="https://accobams.org/csmc5-article-presentations/">La région tunisienne, un point chaud de mégafaune marine en Méditerranée</a>, M. Dekhil, N. Bejaoui, I. Abdeljaoued-Tej,
A. Virgili et V. Ridoux, ACCOBAMS Conference on Cetacean Conservation in South Mediterranean Countries (CSMC5), 13-15 avril 2021, Liban.
<br /></p></li>
<li><p> <a href="https://accobams.org/csmc5-article-presentations/">Estimation des biais associés à l’évaluation de l’abondance de la mégafaune marine au
cours de la campagne d’observation ASI</a>,
M. Dekhil, N. Bejaoui, I. Abdeljaoued-Tej, A. Virgili et V. Ridoux,
ACCOBAMS Conference on Cetacean Conservation in South Mediterranean Countries (CSMC5), 13-15 avril 2021, Liban.
<br /></p></li>
<li><p>Application of key performance indicators (KPI) forecasting methods for engineering recruitment, M. Houichi,
M. Jannadi, K. Bendriss et I. Abdeljaoued-Tej, MIRDEC International Academic Conference on Global and Contemporary Trends
in Social Science (Global Meeting of Social Science Community), Rome 2020-2 Conference, 6-8 Oct. 2020, Rome, Italy. ISBN 978-605-80074-8-2.<br /></p>
</li>
<li>
<p>*A Linear Algorithm For Computing Polynomial Dynamical Systems,
I. Abdeljaoue-Tej, A. Benkahla, G. Haddad et A. Valibouze, International Conference on Computational Methods in Systems Biology
(CMSB 2019), Trieste, du 18 au 20 Septembre 2019. <br /></p>
</li>
<li>
<p> Mathematical Modelling and Oncology Simulating Solid Tumour Growth, présenté par K. El Matteli et en collaboration avec A. Kebir,
JCC - Institut Pasteur de Tunis, avril 2018. <br /></p>
</li>
<li>
<p> SageMath pour l'enseignement de la biologie théorique, en collaboration avec J. Thièry, K. El Matteli et S. Benmiled,
37ème Colloque de la Société Francophone de Biologie Théorique,
Poitiers Futuroscope, 26-29 juin 2017. <br /></p>
</li>
<li>
<p> Modélisation Booléenne de Réseaux TLR, A. Valibouze, I. Abdeljaouad, A. Benkahla, A. Mouleh,
Workshop "Modèles mathématiques de la dynamique des populations", Tunis, Tunisia, 2011. <br /></p>
</li>
<li>
<p>Modélisation Algébrique dans les Systèmes Biologiques, invitée au séminaire de l’Ecole Polytechnique de Tunis,
15 janvier 2010. </p>
</li>
<li>
<p>Galoisian Separators for Biological Systems, en collaboration avec A. Valibouze et A. Benkahla,
Conférence “Mathematics Algorithms Proofs : Formalization of Mathematics", Monastir, 14-18 décembre 2009. </p>
</li>
<li><p> *In Silico Prediction of Protein-Protein Interactions in MTB Infected Macrophages,
O. Souiai, H. Essid, I. Abdeljaoued, M. Masigh, J. de las Rivas, H. Mardassi,B. Jacq, A. BenKahla, et C. Brun, (2009, May).
In Infection Genetics and Evolution (Vol. 9, No. 3, pp. 384-384), Elsevier Science BV.
<a href="http://doi.org/10.1016/j.meegid.2008.09.003">DOI: 10.1016/j.meegid.2008.09.003</a>
</p></li>
<li><p> Système de régulation de gènes et Bases de Groebner, en collaboration avec S. Benmiled, A. Benkahla, L. Guizani-Tabbane,
Colloque franco-tunisien de Mathématiques, Djerba, 16-20 mars 2009. </p>
</li>
<li>
<p> Application du Calcul Formel aux Systèmes Biologiques, Premier colloque franco-maghrébin de Calcul formel,
Iles de kerkennah, 23-26 mai 2008. </p>
</li>
<li>
<p> The Hacque method and the complete GI-method for computing the Galois group,
A. Valibouze et I. Abdeljaouad, Worshop Calcul Formel, Marrakech, Morocco, 2003. </p>
</li>
<li>
<p> *Computing Galois group, I. Abdeljaouad et A. Valibouze, AAECC13,
13th International Symposium on Applied Algebra, Algebraic Algorithms and Error-Correcting Codes, Hawaii, novembre 1999. </p>
</li>
<li>
<p> Calculs du groupe de Galois, Panorama de Calcul Formel, Marrakech, mai 1999. </p>
</li>
<li>
<p> Calculs de tous les Invariants primitifs de groupes de permutations sous GAP,
Journées nationales du GDR-CNRS AMI, Luminy, septembre 1997. </p>
</li>
<li>
<p> Invariants primitifs minimaux et implantation en GAP,
Exposé au sein du Groupe de Travail du Projet Galois du GDR-CNRS MEDICIS, LIP6, 19 mars 1997. </p>
</li>
</ol>
<h3>Posters en biologie théorique</h3>
<ol>
<li style="line-height: 18px; padding-left: 17px; text-indent: -17px; " class="full-width" value="1">
<p style="text-indent: -17px; " class="paragraph_style_6"><span style="font-size: 15px; " class="Puce"></span><span style="width: 4px; " class="inline-block"></span>A linear algorithm for computing polynomial dynamical systems, I. <span class="style_2">Abdeljaoued</span>-<span class="style_2">Tej</span>, A. <span class="style_2">BenKahla</span>, <span class="style_2">Ghassen</span> Haddad et <span class="style_2">Annick</span> <span class="style_2">Valibouze</span>, International Conference on Computational Methods in Systems Biology (<span class="style_2">CMSB</span> 2019), Trieste, <span class="style_2">du</span> 18 au 20 <span class="style_2">Septembre</span> 2019.<br /></p>
</li>
<li style="line-height: 18px; padding-left: 17px; text-indent: -17px; " class="full-width" value="2">
<p style="text-indent: -17px; " class="paragraph_style_6"><span style="font-size: 15px; " class="Puce"></span><span style="width: 4px; " class="inline-block"></span>Development of algorithm for gene clustering using expression and ontology data : kRCC, Mahmoud Abu Azoum, Adnen Saadaoui, Ines Abdeljaoued-Tej, Dorra Louati, Amira Kebir, Slimane Benmiled, Maher Moakher, Alia Benkahla, ISCB Africa ASBCB Conference on Bioinformatics, Entebbe, Uganda, October 10 - 12, 2017 <br /></p>
</li>
<li style="line-height: 18px; padding-left: 17px; text-indent: -17px; " class="full-width" value="3">
<p style="text-indent: -17px; " class="paragraph_style_6"><span style="font-size: 15px; " class="Puce"></span><span style="width: 4px; " class="inline-block"></span>Application des réseaux polynomiaux aux maladies infectieuses, I. Abdeljaoued-Tej, A. Benkahla, S. Benmiled et L. Guizani-Tabbane, Ecole d’été de Calcul Formel et Théorie des Nombres, Monastir, 27 Août-07 Septembre 2007. <br /></p>
</li>
<li style="line-height: 18px; padding-left: 17px; text-indent: -17px; " class="full-width" value="4">
<p style="text-indent: -17px; " class="paragraph_style_6"><span style="font-size: 15px; " class="Puce"></span><span style="width: 4px; " class="inline-block"></span>In silico prediction of protein-protein interactions in Mycobacterium tuberculosis infected macrophages, O. Souiai, A. Benkahla, J. de las Rivas, H. Mardassi, B. Jacq, C. Brun, M. Mazigh, I. Abdeljaoued and H. Essid, JOBIM07, Marseille, 10-12 July 2007. <br /></p>
</li>
<li style="line-height: 18px; padding-left: 17px; text-indent: -17px; " class="full-width" value="5">
<p style="text-indent: -17px; " class="paragraph_style_6"><span style="font-size: 15px; " class="Puce"></span><span style="width: 4px; " class="inline-block"></span>In silico prediction of protein-protein interactions in MTB infected marcophages, A. Benkahla, J. de las Rivas, H. Mardassi, B. Jacq, C. Brun, H. Essid, M. Mazigh, I. Abdeljaoued and O. Souiai, Conference on the Bioinformatics of African Pathogens and Disease Vectors, Nairobi, Kenya, 28 May 2007-2 June 2007. <br /><br /></p>
</li>
</ol>
<h3> Prépublications </h3>
<ol>
<li>
<p></span>
A pandemic at the Tunisian scale: Mathematical modelling of reported and unreported
COVID-19 cases in Tunisia, Ines Abdeljaoued-Tej, soumis à Mathematical Models in Epidemiology et disponible dans medRxiv.
<a href="https://doi.org/10.1101/2020.05.21.20108621">DOI: 10.1101/2020.05.21.20108621</a>, Mai 2020.<br /></p>
</li>
<li>
<p></span> COVID-19 data analysis and modeling in Palestine, Ines Abdeljaoued-Tej,
disponible sur medRxiv. <a href="https://doi.org/10.1101/2020.04.24.20078279">DOI: 10.1101/2020.04.24.20078279</a>, Avril 2020.<br /></p>
</li>
<li>
<p></span> Estimation of Tunisia COVID-19 infected cases based on mortality rate,
Ines Abdeljaoued-Tej and Marc Dhenain, Cold Spring Harbor Laboratory Press, medRxiv.
<a href="https://doi.org/10.1101/2020.04.15.20065532">DOI: 10.1101/2020.04.15.20065532</a>, Avril 2020. <br /></p>
</li>
<li>
<p></span>Arab sentiment analysis based on attention in deep learning approaches,
Sayf Chagtmi, Aymen Cherif et Ines Abdeljaoued-Tej, Juin 2019. <br /></p>
</li>
<li>
<p></span>Besoins et avantages de la fouille de données textuelles en sciences agronomiques, I. Abdeljaoued-Tej,
<a href="https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02126728v2/document">HAL</a>, Mai 2019. <br /></p>
</li>
<li>
<p></span><span style="width: 13px; " class="inline-block"></span>Pre- and Post- processing of a database of determinants of Heatlh, Rihab El-Fahem, Said Agrebi, Ng Tze Pin, Ines Abdeljaoued-Tej et Anis Larbi, 2019. <br /></p>
</li>
<li>
<p></span>Modelling heterogeneous tumor elimination or its recurrence with ordinary differential equations, K. El Matteli, I. Abdeljaoued-Tej and A. Kebir, Octobre 2018. <br /></p>
</li>
<li>
<p></span>Mathematical modeling and Oncology - Modeling heterogeneous solid tumor growth in its local environment, K. El Matteli, I. Abdeljaoued-Tej et A. Kebir, Mai 2019. <br /></p>
</li>
<li>
<p></span>Parallel Algorithms for computing polynomial dynamical systems, I. Abdeljaoued, A. Benkahla et A. Valibouze, Novembre 2017. <br /></p>
</li>
<li>
<p></span>Algebraic separators and application in regulatory networks, G. Haddad, I. Abdeljaoued, A. Benkahla et A. Valibouze, Juin 2014. <br /></p>
</li>
<li>
<p></span>Computing the Lagrange resolvent by effectiveness of Galois Theorem, I. Abdeljaoued, F. Bouazizi, A. Valibouze, 2010. <br /></p>
</li>
<li>
<p></span><span style="width: 13px; " class="inline-block"></span>Computation of Lagrange resolvants by effectivenesse of Galois theorem, I. Abdeljaoued- Tej, F. Bouazizi et A. Valibouze, Juillet 2010. <br /></p>
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<p></span>Certified Lagrange's numerical algorithm, I. Abdeljaoued-Tej, F. Bouazizi et A. Valibouze, Juin 2010. <br /></p>
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<p></span>Certification algébrique pour le calcul de la résolvante de Lagrange, I. Abdeljaoued-Tej, F. Bouazizi et A. Valibouze,
<a href="http ://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00483257/fr/">HAL</a>, Mai 2010. <br /></p>
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<p></span>Algebraic separators in Systems Biology, A. Valibouze, I. Abdeljaoued-Tej et A. Benkahla, Avril 2010. <br /></p>
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<p></span>Séparateurs algébriques dans la Bio-systémique, A. Valibouze, I. Abdeljaoued et A. Benkahla, Janvier 2010. <br /></p>
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<p></span>Calculs d’invariants primitifs minimaux - Implantations en Axiom, Mémoire de stage, DEA Algorithmique, Ecole polytechnique, Palaiseau, France, Juin 1996. <br /><br /><br /></p>
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