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kenor5/Minik8s

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minik8s

一、项目总体架构

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Minik8s主要包括如下组件:

Etcd: 运行在master节点上,记录集群中的所有持久化数据,记录集群中的各种状态 (States)。

Kubectl: 运行在master节点,主要负责接受并解析用户指令,发送给Apiserver;获得Apiserver响应后输出到控制台;主要支持apply、delete、get、describe指令,此外还支持add、update指令。

Apiserver: 运行在Master节点,是minik8s的中心组件,只有Apiserver可以读写Etcd,集群中的所有通信都依赖于Apiserver暴露的API。

Scheduler(NodeController): 运行在Master节点,管理所有的Node,监控Node的状态,完成调度功能。

ControllerManager:

运行在master节点,负责管理对应的Api对象,监控对应的Api对象的状态并且确保其与期望状态一致。包含的Controller如下所示:

  • PodController
  • ServiceController
  • DeploymenyController
  • FunctionController
  • JobController
  • ScaleController

KubeProxy

运行在每个Node节点上,接受Apiserver创建/删除/更新Service的请求,修改节点上的iptable

Kubelet

运行在Node节点,接受Apiserver的请求,管理和创建Pod;监控本地Pod内部运行状态,在Pod状态更新时通知Apiserver更新etcd中Pod状态信息。

二、项目开发管理

gitee仓库目录

https://gitee.com/minik8s-group/minik8s.git

项目目录

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项目分支介绍 项目中maser为主分支,每个阶段不同的功能在新的对应分支如serverless、autoscale、Deployment等分支开发。

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三、相关依赖和库

主要使用的库

  • 操作Docker使用的库: github.com/docker/docker
  • 操作Etcd使用的库: go.etcd.io/etcd/client/v3
  • 解析yaml使用的库: github.com/spf13/cobra github.com/spf13/viper
  • 组件通讯的库: google.golang.org/grpc google.golang.org/grpc/credentials/insecure net/http
  • 配置iptable使用的库: github.com/coreos/go-iptables/iptables
  • 资源监控使用的库: github.com/Prometheus github.com/docker/go-connections/nat
  • 一些其它go基础库: "context" "encoding/json" "fmt" "strings" "strconv" "time" "os" "sync" "regexp" "testing"

四、各功能实现原理

Node注册、管理和调度策略

node演示视频

1.Node的配置文件

每个节点上的Kubelet在启动时,会读取对应的Node配置文件,如下所示:

Name: master
Labels :
  hostName: master
  os: linux

除了该Node的名字外,配置文件主要使用Label字段标识节点的一些特点,如os等,这个Label在调度时会用到,如果Pod的NodeSelector字段不为空,则会将该Pod调度到Label符合该Pod要求的Node上。

2.Node的加入

当Kubelet启动后,会向ApiServer发消息进行注册,此时运行命令: kubectl get node 可以看到pending状态的Node:

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运行命令:

kubectl add node [NodeName]

可以将指定的状态为Pending的Node加入集群中(下图一),如果NodeName为空,则将所有的状态为Pending的Node加入集群中(下图二)。加入集群后,Node的状态变为Running并且NodeController会定期向Node发送心跳监控Node的状态:

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3.Node的删除

运行命令:

kubectl delete node [NodeName]

会将指定Node删除,将Node的状态变为Pending,并且调度也不会再考虑该Node:

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4.Node的监控

运行在master节点的NodeController每隔30s会向状态为Running的Node发送心跳,如果没有回应,会将Node的状态标记为dead,不再将Pod调度到该节点上:

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5.调度策略

NodeController还负责调度功能的实现,我们的Minik8s支持两种调度策略:

  • RoundRobin:如果待创建的Pod对于运行在哪个Node没有特殊要求,即NodeSelector字段为空,则会采用RoundRobin的方式调度到状态为Runnning的Node上。
  • NodeSelector:如果带创建的Pod的NodeSelector字段不为空,则在调度时会将该字段与Node的Label进行匹配,选出所有符合条件的Node,再使用RoundRobin进行调度。

Pod创建、管理和内部通信

演示视频

Pod演示视频

Pod的创建和删除

Pod的创建分情况处理:

  • Kubectl执行apply pod创建,写入Pod元数据信息到etcd,状态标记为Pending,使用对应调度策略,通知Node创建pod。
  • 若是动态扩缩或者replicaset创建的新的Pod,则由Apiserver将Pod信息写入etcd,状态标记为Pending,待Apiserver的watch监控Pod机制检测到其状态为Pending,则使用对应调度策略,通知Node创建pod,并更新状态。 在Kubelete中维护一个Podmanager数据结构,存储着Pod的元数据信息和其中的container信息。在Kubelete创建后更新Podmanager中的信息并通知master更新Pod状态为Running,容器命名方式为pod名称与yaml中指定的容器名组合而成:podName_ContainerName。

Pod的删除分情况处理:

  • Kubectl直接执行del pod指令,Apiserver更新etcd中Pod信息,通知相应Node的Kubelete删除Pod相关容器;
  • 如果是动态扩缩而减少的Pod,Autoscale程序更新etcd中相关Pod信息,标记状态为Succeed,之后Apiserver的watch监控Pod 机制检测到其状态为Succeed,则根据Pod的HostIP信息通知Node实际删除Pod,删除成功后删除etcd中Pod的hostip信息。

Pod的监控和管理

  • Node上的监控:Kubelete会运行一个监控程序,根据Podmanager中的Pod列表遍历检查当前Pod中的容器是否存活,若有Container容器exited状态,则通知master更新Pod状态信息,删除该Pod剩下的存活Container,重启该Pod,重启成功后通知master更新Pod状态;
  • Maseter上的监控:运行一个Pod监控,通过etcd watch监控信息,当由于扩缩策略增加新的Pod时,watch机制检测到变化,其etcd中写入pod状态标记为Pending,需要根据Node策略选择一个Node启动管理该Pod;当watch监测到etcd中Pod标记为Succeed且存在HostIP,则需要根据Hostip通知该Node删除Pod。

Pod的内部通信

每个Pod都创建一个pause的容器,pod内其它容器都通过network=pauseContainer的网络模式共享pause容器的网络地址空间,实现Pod内部容器通过localhost互相通信

Pod间(同Node、不同Node)、service通信

Pod-Pod

我们使用Flannel插件并修改Docker的配置完成Pod的全局唯一IP分配以及Pod之间的通信。 每台机器的相关环境如下所示:

节点名称 IP地址 安装软件
master 192.168.1.5 etcd、flannel、docker
node1 192.168.1.4 flannel、docker
node2 192.168.1.6 flannel、docker

master节点的etcd中存放flannel的配置,并且暴露和监听端口:

// 启动Etcd时暴露端口
etcd -name etcd1 -data-dir /root/Tools/etcd/data --advertise-client-urls http://192.168.1.5:2379,http://127.0.0.1:2379 --listen-client-urls http://192.168.1.5:2379,http://127.0.0.1:2379
// 存放flannel配置信息
etcdctl put /coreos.com/network/config '{"Network": "10.0.0.0/16", "SubnetLen": 24, "SubnetMin": "10.0.1.0", "SubnetMax": "10.0.20.0", "Backend": {"Type": "vxlan"}}'

node节点的flannel连上master的etcd取得flannel的配置,被分配一个全局不冲突的子网:

sudo flanneld --etcd-endpoints=http://192.168.163.132:2379

每个节点上使用flannel.1作为docker的启动网桥而不是docker0这个默认的网桥:

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这样就实现了全局唯一的IP分配和不同节点上Pod的互相通信。

Service-Pod

service-pod通信演示视频

Service 启动时,会根据 labels 选择所有符合条件的 Pod,然后修改机器的 iptable,将流量导航到对应的 pod上

kind: Service
metadata:
  name: fileserver-service1
spec:
  selector:
    app: myApp
  ports:
  - name: http
    port: 8080
    targetPort: 8080
  
  type: ClusterIP
  clusterIP: "10.20.0.2"

具体实现:对于 service yaml 文件中 ports 字段中的每一个 port,在 iptable 中创建一条 svc-chain,每一条 svc-chain 对应若干条 sep-chain,sep-chain再导航到对应的 PodIp 和端口。当一条流量到来,会依次经过这几条链,到达对应的 pod,当然这里的 pod 访问支持是由上面 pod 间通信保障的。

Deployment的创建和管理

Deployment演示视频

Deployment创建

当Apiserver收Kubectl的创建指令,根据yaml中的template 创建Pod元数据写入etcd,etcdwatch监测到etcd中Pod信息更新,就会根据Scheduler策略调度选择Node启动Pod并管理,注意事项为yaml文件中metadata.name命名需要为xxx-deployment,以便生成唯一的Deployment name标识;

Deployment管理

master节点DeploymentController运行一个WatchMonitorDeployment 程序,通过Watch监听"Deployment/"前缀的etcd中key,当新建Deploym或者HPA更新了Deployment的信息,监听程序就根据 Spec.replicas和Status.replicas的差异判断需要增加还是删除多余的replica,更新和deployment相关的Pod元数据,通过Pod的watch监听机制间接更新到指定的replica数。

DeployMent replica更新策略

Deployment的yaml文件中可以通过spec.update字段指定删除多余replica的策略,当spec.update=newer 或为空时,优先删除后创建的较新的replica;当spec.update=older时优先删除创建时间更早的较旧的replica Pod。

Autoscale的管理和动态扩缩容策略

HPA演示视频

基于cAdvisor和promtheus实现对CPU和Memory资源进行使用情况监控,默认每30s通过master的promtheus查询、计算过去一分钟的CPU或Memory使用情况,监控时间间隔可以通过scaleInterval字段指定,不能低于promtheus采集数据的间隔15s。

执行HPA流程:

  • Node节点会在kubelet启动时启动一个cAdvisor容器服务,Master节点会在启动Apiserver后启动一个Promtheus容器服务,当Node注册加入Master时,会更新Promtheus的配置文件将Node的IP和8080端口加入Promtheus监控的一个Target中开启对Node中container的监控。
  • 通过yaml配置文件启用扩缩策略,yaml中配置策略主要限制 minReplicas、maxReplicas、metrics中监控对象可以选择CPU或Memory,在behavior字段可以设置扩缩速率的不同策略,详细配置文件见附录中HPA.yaml文件。
  • 在每个scaleInterval时间段内,控制器管理器都会根据每个 HorizontalPodAutoscaler 定义中指定的指标查询资源利用率。 选择扩缩策略对应的 Pod, 并从资源指标 API(针对每个 Pod 的资源指标)。对于按 Pod 统计的资源指标(如 CPU),控制器从资源指标 API 中获取每一个 HorizontalPodAutoscaler 指定的 Pod 的度量值,如果设置了目标使用率,控制器获取每个 Pod 中的容器资源使用情况, 并计算资源使用率。如果设置了 target 值,将直接使用原始数据,不再计算百分比。
  • 接下来,控制器根据平均的资源使用率或原始值计算出扩缩的比例,进而计算出目标副本。当目标副本和当前副本数相差倍数较大时会成倍(乘除)扩缩,当数量较接近时会缓慢(加减)扩缩,replica数量增加时不会超过maxReplica,数量减少时不会低于minReplica。

HPA限制扩缩速率策略配置与选择:

behavior:
  scaleDown:
    policies:
    - type: Percent
      value: 10
      periodSeconds: 60
    - type: Pods
      value: 5
      periodSeconds: 60
    selectPolicy: Min

支持在HPA的yaml通过scaleDown和scaleUp指定不同的扩缩容策略,将上面的 behavior 配置添加到 HPA 中,可限制 Pod 被 HPA 删除速率为每分钟 10%,为了确保每分钟删除的 Pod 数不超过 5 个,可以添加第二个缩容策略,大小固定为 5,并将 selectPolicy 设置为最小值Min。 将 selectPolicy 设置为 Min 意味着 autoscaler 会选择影响 Pod 数量最小的策略。 若未指定上面的behavior策略则默认策略为:当期望的replica数和当前replica相差多倍时,倍数扩缩到接近预期的replica数,当较接近replica时则使用加减策略微调整replica数量。

DNS与转发

DNS演示视频

使用 nginx 容器作为反向代理,当一个请求来到时, 会先在 hosts 文件中解析到 nginx 的IP,通过 nginx 的IP和80端口访问到 nginx 容器,nginx容器会将对应的流量导航到对应的 service ip 上。

kind: Dns
metadata:
  name: dns-test1
spec: 
  host: example2.com 
  paths:
  - path: /path1
    serviceName: fileserver-service1
    servicePort: 8080
  - path: /path2
    serviceName: fileserver-service2
    servicePort: 8080

具体实现

当部署一个 dns 后,会根据 serviceName 在 etcd 中找到对应的 service ip,然后修改 nginx 的配置文件(这个文件是通过挂载卷的方式挂载在容器内的),再执行 nginx reload,这样就可以使 nginx 更新转发目录。

流程:

先按照正常情况启动pod和service

kubectl apply -f ./test/pod3.yaml
kubectl apply -f ./test/service_test.yaml

启动nginx容器

./script/dns/dns_start.sh

启动dns

./cmd/kubectl/kubectl/go apply -f ./test/dns1.yaml

这样就能通过域名访问到服务了

curl dns-example:80/path1

会返回hello world。具体流程为

-> 通过/etc/hosts文件解析dns-example 为127.0.0.1

-> 再通过nginx后台将127.0.0.1:80/a 转发到10.20.0.2:8080 这里的10.20.0.2是service 的clusterIP

-> 然后经过iptable 的nat 表的转换,就访问到pod Ip

因此如果在dns的yaml文件中修改了 dns 的server_name, 需要到/etc/hosts文件中 添加一条解析 127.0.0.1 server_name

容错和控制面重启

容错演示视频

master节点容错和重启

maseter中所有controller管理为无状态,所有元数据信息在apply之前都会写入到etcd,重启后所有信息都可以直接从etcd中恢复,当删除workload时也不会删除etcd中的信息,保证可以恢复到重启前的master控制面状态;

Node节点容错和重启

Pod元数据未持久化到硬盘,存储在内存中。主要由Podmanager存储和管理Node上运行的Pod相关的Container信息,在Kubelet重启后注册到maseter和Apiserver建立连接时,maseter会通过Pod中存储的HosIP信息返回给Node和该Node相关的Pod信息,Podmanager会利用该信息重新初始化Podmanager中的内容,建立本地Pod到container的映射关系。

GPU功能实现

GPU演示视频

整个GPU功能的核心是用Python写了一个Flask架构的Http服务器并打包成镜像,该服务器运行在8090端口,提供两个服务:

  • 上传并执行任务:访问8090/sbatch,接受一个参数“module_name”,该函数会把运行服务器的容器目录下的“./Data/{module_name}.cu”文件与“./Data/{module_name}.slurm”文件上传至交我算平台,并且提交任务,使用一个全局变量记录job_id,如果任务成功提交,返回成功信息和job_id,否则返回失败信息。
  • 查询任务状态:访问8090/query,为了保证任务之间的隔离性,每次提交任务使用不同的Pod,所以全局变量job_id记录的是该pod对应任务的id,故查询不需要参数。该函数会通过记录的job_id查询任务的状态,如果为pending则返回pending;如果正在计算但还没有结果(判断方式为.out和.err文件是否产生)则返回Running;如果计算结束,则根据.err文件是否为空来判断任务成功或失败,并将.out和.err文件拉到本地。 将该flask程序打包成镜像,每当GPU相关的请求到来时,对应的Job抽象会创建一个使用该镜像容器的Pod,并将yaml文件中的cuda程序和slurm脚本的路径挂载到容器的./Data目录下。 JobController发现该Pod创建成功后,首先会发送8090:/sbatch,提交任务;然后启动一个go routine,每隔5s向该Pod发送/query请求,并将状态同步到Etcd中。当监控线程发现任务执行完毕后,会将结果拉到本地,并且删除对应的Pod。 因为这个涉及到与集群外的应用进行交互,有时候因为网络问题,使用交我算的人多等问题,可能出现连不上的情况,因此我们采用了Retry的机制,如果连接交我算/上传文件/提交任务/查询任务的请求失败或超时会重试3次。

Serverless功能实现

serverless演示视频

镜像的动态创建

每个函数的镜像都包含一个相同的flask架构的服务器,如下所示:

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该服务器接收到请求后会动态导入当前目录下名为<module_name>的模块,并且执行该模块中的名为<module_name>的函数,返回该函数的执行结果。 用户编写好函数以及在requirement.txt中写好自己函数需要pip install的依赖后,在function.yaml中填写路径(functionPath和requirementPath)即可。 ApiServer在接收到创建函数的请求时,首先会动态的创建镜像,根据创建好的镜像写好Function对象的PodTemplate字段存入Etcd中,并且添加路由(http:浮动IP:8070/function/function_name)。

HTTP请求的处理

当用户通过postman等当时向http://浮动IP:8070/function/function_name 发送请求时,对应的FunctionHandler首先会判断当前有没有Pod正在运行,如果没有,则进入冷启动流程;否则,将请求负载均衡到正在运行的Pod上。

Scale-to-0的实现

每访问一次函数,FunctionController都会记录下来并且持久化到Etcd中。每30s,FunctionController会检查当前函数在这30s内被访问了多少次,并根据访问次数调整运行的Pod的数量。比如,如果用户写明一个Pod为10次/30s,当前有一个Pod正在运行,且在过去30s内有18个请求,则FunctionController就会增加一个Pod以达到用户的要求。同样,如果30s内没有请求到来,则FunctionController会关闭所有的Pod,实现Scale-to-0。

函数的更新

修改了functionPath对应的函数内容后,运行kubectl update function [functionName]更新对应的function。 在function更新时,首先会更新镜像,然后判断该function有无正在运行的Pod,如果没有则结束;如果该function有正在运行的Pod,则会删除旧的Pod,并重新创建相同数量的使用新镜像的Pod。

函数的删除

首先会判断该函数有没有正在运行的Pod,如果有的话会首先删除该函数所有运行的Pod,然后在Etcd中标记该函数的状态为已删除,当函数删除后再次访问路由则会转入默认的路由,不返回任何值,更不会创建Pod。

WorkFlow的实现

总的来说,WorkFlow的实现是建立在Function的实现之上的,核心在于如何处理Choice以及如何衔接Function(即将上一个函数的返回值作为参数传递给下一个参数)。核心代码如下所示:

image

使用一个For循环,如果workflowNode的类型为“Task”则调用SendFunction函数交由对应的函数处理,获取JSON形式的返回值,并且判断Workflow是否结束。如果workflowNode的类型为“Choice”,则将上一个函数的返回值data和workflowNode.Choices作为参数传入SelectChoice函数选择下一个节点。 因为Workflow是基于Function的进一步抽象,所以其扩容以及Scale-to-0与Function相同,不再赘述。

附录和补充

Etcd中数据存储格式

不同的数据使用不同的Kind前缀加其资源名字作为key存储,value为其结构体中的完整内容序列化转化为字符串,以Pod/和Deployment/为例:

Pod/nginx-deployment-9594276-320b7
{"kind":"Pod","metadata":{"name":"nginx-deployment-9594276-320b7","labels":{"app":"nginx"},"uid":"93e5d72f-0661-49b9-a722-24f14a2cf41c"},"spec":{"volumes":null,"containers":[{"name":"nginx","image":"nginx:1.14.2","ports":[{"containerPort":"80"}],"resources":{}}]},"status":{"host_ip":"127.0.0.1","phase":"Failed","pod_ip":"172.17.0.2"}}
Deployment/nginx-deployment
{"kind":"Deployment","metadata":{"name":"nginx-deployment","labels":{"app":"nginx"}},"spec":{"selector":{"matchLabels":{"app":"nginx"}},"template":{"metadata":{"name":"","labels":{"app":"nginx"}},"spec":{"volumes":null,"containers":[{"name":"nginx","image":"nginx:1.14.2","ports":[{"containerPort":"80"}],"resources":{}}]}},"replicas":3},"status":{"StartTime":"2023-05-19T19:56:07.506025657-07:00","replicas":0}}

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