Skip to content
New issue

Have a question about this project? Sign up for a free GitHub account to open an issue and contact its maintainers and the community.

By clicking “Sign up for GitHub”, you agree to our terms of service and privacy statement. We’ll occasionally send you account related emails.

Already on GitHub? Sign in to your account

označení portální žíly #7

Closed
mjirik opened this issue Nov 20, 2013 · 4 comments
Closed

označení portální žíly #7

mjirik opened this issue Nov 20, 2013 · 4 comments

Comments

@mjirik
Copy link
Owner

mjirik commented Nov 20, 2013

Ve všech experimentlních datech označte portální žílu. Dále nad ní budeme počítat statistiky

@ghost ghost self-assigned this Nov 20, 2013
@ghost
Copy link

ghost commented Nov 21, 2013

Doplňte prosím nějaké info.

Nová funkce na výběr portální žíly?
Automatické označení portální žíly?
Nějaká rada, jak ji vyhledat (nechat uživatele ji vybrat?)?
Jaká experimentální data? Uložit experimentální data s vybranou portální žílou?

Pokud máte na mysli možnost vybírání více objektů k vrácení, tak tato funkce je naimplementována.

@mjirik
Copy link
Owner Author

mjirik commented Dec 4, 2013

Tohle bude finální úkol - experiment s tím, co už máte hotovo.

  • Nejdříve bude potřeba rozchodit i zbylé balíky pro python, hlavně ITK. Nejsnáze se to udělá tak, že použijete pythonxy, který má již téměř vše potřebné v sobě.
  • Pak budete potřebovat vytvořit funkci pro merge, to máte taky jako issue. Tím si vytvoříte vstupní data. V těch budou již označena játra. Data jsou zde (http://147.228.240.61/queetech/sample-extra-data/training-part1.zip)
  • Dále ve všech játrech označíte portální žílu a výsledky uložíte
  • Nakonec se provede statistika nad daty: vykreslí se histogram souhrnu jater, histogram souhrnu portální žíly atd...

@mjirik
Copy link
Owner Author

mjirik commented Jan 23, 2014

změřit 20 dat
nová adresa s daty
http://147.228.240.61/queetech/sample-extra-data/pvolkovinsky/

vyhodnocení histogramů jater včetně cév
hodnocení histogramů jednotlivých měření vůči průměrnému histogramu
vyhodnocení histogramů cév
vyhodnocení histogramů jater bez cév

@ghost ghost self-assigned this Jan 29, 2014
@ghost ghost removed the in progress label Feb 25, 2014
@ghost
Copy link

ghost commented Mar 31, 2014

V rámci BP už to mám celé změřené.

@ghost ghost closed this as completed May 16, 2014
This issue was closed.
Sign up for free to join this conversation on GitHub. Already have an account? Sign in to comment
Labels
None yet
Projects
None yet
Development

No branches or pull requests

1 participant