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nandomaciel/BE3AV

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ObaVina (Beta)

O programa ainda esta sendo desenvolvido, por isso contamos com a colaboração do usuário

Autores:

Importante

O programa até o momento para funcionar corretamente, deve esta no mesmo diretorio que os arquivos de chimera.

Dependencias

Pacotes necessarios para execução

sudo apt-get install python3-tk

É necessario ter os seguintes programas instalados (recomendamos a instalação via o apt)

Para instalar o openBabel execute:

sudo apt install openbabel

ou

tar zxf openbabel-2.4.1.tar.gz
mkdir build
cd build
cmake ../openbabel-2.4.1
make
make -j4
make install

Para instalar o vina execute:

sudo apt install autodock-vina

ou

tar -xzvf autodock_vina_1_1_2_linux_x86.tgz
cd autodock_vina_1_1_2_linux_x86/bin
./vina

Arquivos necessarios para execução:

Depois de obter os arquivos de saida do Chimera o programa pode ser executado

  • afronp.smi
  • dock2.conf
  • dock2.receptor.pdbqt

Execução

Para executar o programa abra o terminal e execute o script graphic_obavina.py Exemplo:

user$ python graphic_obavina.py

Após informar todos os arquivos clique no botão run e aguarde o processamento, quando todos os dados forem processados o botão exit ficara disponivel.

O programa apresenta um interface simples e pratica para a utilização

Obavina Obavina

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docking bioinformatics software

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