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ramap #61

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nanls opened this issue Apr 16, 2017 · 0 comments
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ramap #61

nanls opened this issue Apr 16, 2017 · 0 comments
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@nanls
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nanls commented Apr 16, 2017

"
Un graphe de Ramachandran sera généré pour chaque méthode en suivant le code couleur utilisé
précédemment. Pour cela, un répertoire de nom aléatoire est créé dans le repertoire tmp (en utilisant
la fonction random : ex ppii.1242342). Ce répertoire servira à stocker les données temporaires tel que
les scripts R et les graphiques png créés. Ce répertoire sera régulièrement effacé (tous les jours). Une
autre solution serait de réaliser un simple graphe (sans image à générer) en mettant en évidence les
régions sous une structuration particulière. S’agissant du graphe de Ramachandran proprement dit, il
fera correspondre à chaque acide aminé un point de couleur ou le numéro de l’acide aminé entouré
d’un cercle (plus difficile). Les Polyprolines de type II devront être particulièrement mis en valeur.
"

@jecarvaill : ça urge.

-> il faut que ta fonction prenne juste un id de pbd + une unité et qu'elle aille chercher les angle (les convertir au besoin) + les annotations

@NicolasBourassin : donc ya bien un ramap par méthode.

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