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data files

Nick Steinmetz edited this page Oct 8, 2019 · 14 revisions

Data format and notes about files

Files are named using the "ALF" naming convention, which you can read about in detail here.

Behavioral data

  • lickPiezo.
    • raw.npy :
    • timestamps.npy :
  • licks.
    • times.npy :
  • spontaneous.
    • intervals.npy :
  • wheel.
    • position.npy :
    • timestamps.npy :
  • wheelMoves.
    • intervals.npy :
    • type.npy :

Visual discrimination task

  • trials.
    • feedbackType.npy :
    • feedback_times.npy :
    • goCue_times.npy :
    • included.npy :
    • intervals.npy :
    • repNum.npy :
    • response_choice.npy :
    • response_times.npy :
    • visualStim_contrastLeft.npy :
    • visualStim_contrastRight.npy :
    • visualStim_times.npy :

Receptive field mapping task

  • sparseNoise.
    • positions.npy :
    • times.npy :

Passive stimulus replay task

  • passiveBeeps.
    • times.npy :
  • passiveValveClick.
    • times.npy :
  • passiveVisual.
    • contrastLeft.npy :
    • contrastRight.npy :
    • times.npy :
  • passiveWhiteNoise. :
    • times.npy :

Neural data

  • channels.
    • brainLocation.tsv :
    • probe.npy :
    • rawRow.npy :
    • site.npy :
    • sitePositions.npy :
  • clusters.
    • _phy_annotation.npy :
    • depths.npy :
    • originalIDs.npy :
    • peakChannel.npy :
    • probes.npy :
    • templateWaveformChans.npy :
    • templateWaveforms.npy :
    • waveformDuration.npy :
  • probes.
    • description.tsv :
    • insertion.tsv :
    • rawFilename.tsv :
    • sitePositions.npy :
  • spikes.
    • amps.npy :
    • clusters.npy :
    • depths.npy :
    • times.npy :
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