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CodeOcean: automatisch bewertete Übungen für R

Berry Boessenkool, 2020-2022

Setup (nur einmal)

  • Erstelle einen Ordner für alle Übungen
  • Führe den folgenden Code (in R / Rstudio) aus, um das Paket codeoceanR zu installieren:
install.packages("remotes") # ignoriere die Rtools Warnung
remotes::install_github("openHPI/codeoceanR")

Für mögliche Probleme (und Lösungen) bei der Installation, siehe unten.

Vorgehensweise (für jede Übung)

Übung vorbereiten:

  • Gehe über OpenHPI zur CodeOcean-Übung
  • Herunterladen (Abwärtspfeil links im Dateifenster) der gesamten Aufgabe in den o.g Ordner auf dem PC, kein Entpacken erforderlich
  • Schließe den CodeOcean-Browser Tab
  • Führe aus (in R / Rstudio Konsole) codeoceanR::rt_create()
  • Bestätige, die Registerkarte geschlossen zu haben
  • Wähle die Übungsdatei aus. Wenn entpackt (Standard unter Mac OS Safari), irgendeine Datei innerhalb des Aufgabenordners.

Verwende rt_create nur einmal pro Aufgabe. Starte das Aufgabenprojekt später durch öffnen der zz_*.Rproj Datei im Dateibrowser.

Lade mehrere Zip-Dateien runter (ohne entpacken!) und nutze codeoceanR::rt_create_all um alle auf einmal zu verarbeiten.

Übung bearbeiten:

  • Löse Aufgabe 1
  • Speichere und führe das Skript mit CTRL + SHIFT + S aus, dadurch wird codeoceanR::rt_score() ausgeführt
  • Die T1: Meldung (für Test 1) entspricht immer der Aufgabennummer.
  • Löse Aufgabe 2
  • STRG + SHIFT + S
  • ...

codeoceanR::rt_score() überträgt deinen Code zur Bewertung an CodeOcean. Führe dies häufig aus.

Design

rt_create() sollte

  • einen neuen Ordner mit einer .Rproj-Datei erstellen
  • das Projekt in Rstudio öffnen
  • mit den bereits angezeigten Skript_n.R Dateien
  • so, dass rt_score() sofort funktioniert.

Verwende rt_create(deletezip=FALSE), um die Zip-Datei nicht zu löschen, wenn die Aufgabenerstellung erfolgreich war.

codeOcean im Browser

Nicht mehrere Tabs einer Übung öffnen. Die automatische Speicherung könnte alles überschreiben, was du in einem zweiten (unbenutzten=leeren) Tab gemacht hast.
Aus dem gleichen Grund nicht den Zurück-Button des Browsers benutzen.
Dank der automatischen Speicherung kannst du die Registerkarte aktualisieren oder später wieder öffnen, um die Arbeit an den Aufgaben fortzusetzen.
Denke daran, immer von der openHPI-Plattform aus auf die Aufgaben zuzugreifen.

  • Klicke auf AUSFÜHREN, um das Skript zu starten. Lese die Ausgabe, korrigiere deinen Code, wenn er einen Fehler auslöst. Erneut AUSFÜHREN.
  • Klicke auf BEWERTEN, um zu sehen, wie viele der Tests du bestanden hast. Ändere deine Lösungen, falls nötig. Wiederhole BEWERTEN.
    Ignoriere Meldungen für Aufgaben, an denen du noch nicht gearbeitet hast (sie zeigen an, wie viel Arbeit noch übrig ist). Die T1: Meldung (für Test 1) entspricht immer der Aufgabennummer.
  • Führe AUSFÜHREN und BEWERTEN häufig aus, um Fehler leicht zu finden.

Die Aufgaben sind in separate Dateien aufgeteilt. Sie können unabhängig voneinander ausgeführt werden. Die Bewertung erfolgt für alle Dateien auf einmal.
Ich empfehle, immer die gesamte Aufgabe zu lesen, bevor du mit der Arbeit daran beginnst ;-)

Denke daran, ein Objekt explizit aufzurufen, um seinen Wert in der AUSFÜHREN-Ausgabe zu sehen.
head(x) / str(x) / summary(x) funktionieren wie in Rstudio.
plot(x)-Ausgaben werden nur zwischen rt_plot1()/rt_plot2() angezeigt.

Wenn BEWERTEN dir mitteilt, dass 'Skript_x.R' nicht ausgeführt werden kann, können nach dem Fehler keine Punkte für Aufgaben (in diesem Skript) vergeben werden.

Wenn in der obersten Zeile ANZEIGEN anstelle von AUSFÜHREN angezeigt wird, befindest du dich wahrscheinlich in einer Datentextdatei. Klicke einfach auf das gewünschte Skript.R.

Klicke auf den Pfeil oben links (oder Verstecken unten rechts), um die Anweisungen auszublenden, damit du mehr Platz für den Code auf dem Bildschirm hast.

Um eine komplette Übung zurückzusetzen, klicke auf die Schaltfläche mit der rückwärts laufenden Uhr im Dateifenster auf der linken Seite.
Um nur eine einzelne Datei zurückzusetzen, klicke auf die Schaltfläche unten rechts auf dem Bildschirm.

Probleme

Gelegentlich gibt es Probleme bei der Installation des codeoceanR Pakets aus github. Hier sind einige Lösungen, die dir helfen könnten.

  • Auf Windows: Wenn Rtools installiert werden soll (das ist), installiere es zB in C:/Rtools (Compiler Pfade dürfen keine Leerzeichen haben) und führe in R aus: cat('PATH="${RTOOLS40_HOME}\\usr\\bin;${PATH}"', file= "~/.Renviron", append=TRUE)

  • Auf Linux: führe zuerst im Terminal (STRG+ALT+T) aus: sudo add-apt-repository ppa:c2d4u.team/c2d4u4.0+ und sudo apt-get update und sudo apt install libcurl4-openssl-dev libssl-dev r-cran-rjson. Dann in R den Code oben. Wenn das nicht klappt, folge den Anweisungen beim Installieren der einzelnen Abhängigkeiten in R: install.packages("curl") und dann mit "openssl", "httr" und "rjson".

  • Bei "Failed to install ... Permission denied": Schreibrechte setzen (rechtsklick auf Ordner - Eigenschaften - Sicherheit - Bearbeiten - Benutzer auswählen - Vollzugriff setzen - OK). Dazu Virenscanner ausschalten oder Rechner neustarten.

  • Dauerhaft benutzerdefinierten Ordner für Pakete verwenden: in R cat('R_LIBS_USER="C:/Pfad/zum/library"', file= "~/.Renviron", append=TRUE). Sollte nach R Neustart erste Ausgabe von .libPaths() sein.

  • Bei "Failed to R CMD build package": remotes::install_github("openHPI/codeoceanR", build=FALSE)

  • Falls nur eine alte Version von R möglich ist: für rjson install.packages("devtools") und devtools::install_version("rjson", version="0.2.20", repos="http://cran.us.r-project.org")

  • Wenn du einen anderen Editor als Rstudio nutzen willst: verwende unten NICHT rt_create(), sondern entpacke den ZIP Ordner manuell.

  • Bei rt_create() Fehlermeldung "Could not load the Qt platform plugin xcb": VIELLEICHT!! EIGENES RISIKO: sudo apt remove libxcb-xinerama0 und sudo apt install libxcb-xinerama0, siehe hier