.. currentmodule:: pydeseq2.dds
.. autoclass:: pydeseq2.dds.DeseqDataSet .. rubric:: Methods .. autosummary:: ~DeseqDataSet.calculate_cooks ~DeseqDataSet.deseq2 ~DeseqDataSet.fit_LFC ~DeseqDataSet.fit_MAP_dispersions ~DeseqDataSet.fit_dispersion_prior ~DeseqDataSet.fit_dispersion_trend ~DeseqDataSet.fit_genewise_dispersions ~DeseqDataSet.fit_size_factors ~DeseqDataSet.plot_dispersions ~DeseqDataSet.refit ~DeseqDataSet.vst