std_codons_tables.py

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codon_table_std_RNA = {'AAA': 'K',
                       'AAC': 'N',
                       'AAG': 'K',
                       'AAU': 'N',
                       'ACA': 'T',
                       'ACC': 'T',
                       'ACG': 'T',
                       'ACU': 'T',
                       'AGA': 'R',
                       'AGC': 'S',
                       'AGG': 'R',
                       'AGU': 'S',
                       'AUA': 'I',
                       'AUC': 'I',
                       'AUG': 'M',
                       'AUU': 'I',
                       'CAA': 'Q',
                       'CAC': 'H',
                       'CAG': 'Q',
                       'CAU': 'H',
                       'CCA': 'P',
                       'CCC': 'P',
                       'CCG': 'P',
                       'CCU': 'P',
                       'CGA': 'R',
                       'CGC': 'R',
                       'CGG': 'R',
                       'CGU': 'R',
                       'CUA': 'L',
                       'CUC': 'L',
                       'CUG': 'L',
                       'CUU': 'L',
                       'GAA': 'E',
                       'GAC': 'D',
                       'GAG': 'E',
                       'GAU': 'D',
                       'GCA': 'A',
                       'GCC': 'A',
                       'GCG': 'A',
                       'GCU': 'A',
                       'GGA': 'G',
                       'GGC': 'G',
                       'GGG': 'G',
                       'GGU': 'G',
                       'GUA': 'V',
                       'GUC': 'V',
                       'GUG': 'V',
                       'GUU': 'V',
                       'UAA': '*',
                       'UAC': 'Y',
                       'UAG': '*',
                       'UAU': 'Y',
                       'UCA': 'S',
                       'UCC': 'S',
                       'UCG': 'S',
                       'UCU': 'S',
                       'UGA': '*',
                       'UGC': 'C',
                       'UGG': 'W',
                       'UGU': 'C',
                       'UUA': 'L',
                       'UUC': 'F',
                       'UUG': 'L',
                       'UUU': 'F'}


codon_table_std_DNA = {'AAA': 'K',
                       'AAC': 'N',
                       'AAG': 'K',
                       'AAT': 'N',
                       'ACA': 'T',
                       'ACC': 'T',
                       'ACG': 'T',
                       'ACT': 'T',
                       'AGA': 'R',
                       'AGC': 'S',
                       'AGG': 'R',
                       'AGT': 'S',
                       'ATA': 'I',
                       'ATC': 'I',
                       'ATG': 'M',
                       'ATT': 'I',
                       'CAA': 'Q',
                       'CAC': 'H',
                       'CAG': 'Q',
                       'CAT': 'H',
                       'CCA': 'P',
                       'CCC': 'P',
                       'CCG': 'P',
                       'CCT': 'P',
                       'CGA': 'R',
                       'CGC': 'R',
                       'CGG': 'R',
                       'CGT': 'R',
                       'CTA': 'L',
                       'CTC': 'L',
                       'CTG': 'L',
                       'CTT': 'L',
                       'GAA': 'E',
                       'GAC': 'D',
                       'GAG': 'E',
                       'GAT': 'D',
                       'GCA': 'A',
                       'GCC': 'A',
                       'GCG': 'A',
                       'GCT': 'A',
                       'GGA': 'G',
                       'GGC': 'G',
                       'GGG': 'G',
                       'GGT': 'G',
                       'GTA': 'V',
                       'GTC': 'V',
                       'GTG': 'V',
                       'GTT': 'V',
                       'TAA': '*',
                       'TAC': 'Y',
                       'TAG': '*',
                       'TAT': 'Y',
                       'TCA': 'S',
                       'TCC': 'S',
                       'TCG': 'S',
                       'TCT': 'S',
                       'TGA': '*',
                       'TGC': 'C',
                       'TGG': 'W',
                       'TGT': 'C',
                       'TTA': 'L',
                       'TTC': 'F',
                       'TTG': 'L',
                       'TTT': 'F'}


stop_codons_std = ['TGA', 'UGA', 'TAG', 'UAG', 'TAA', 'UAA']