Import Error in python when built from source for cuda #50

shukob · 2018-06-06T00:26:43Z

Update(9/26/2018)
Please visit Installation at sqaod wiki and follow installation instructions.

This issue was caused by version mismatch between 'self-built native libraries' and 'python package installed by pip'.
Discussion in this issue and resolutions have been already reflected to Installation.

(shinmorino)

Do I have to build also for CPU?

ubuntu@ip-172-31-6-165:~$ g++ --version
g++ (Ubuntu 5.4.0-6ubuntu1~16.04.9) 5.4.0 20160609
Copyright (C) 2015 Free Software Foundation, Inc.
This is free software; see the source for copying conditions.  There is NO
warranty; not even for MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.

ubuntu@ip-172-31-6-165:~$ nvcc --version
nvcc: NVIDIA (R) Cuda compiler driver
Copyright (c) 2005-2018 NVIDIA Corporation
Built on Wed_Apr_11_23:16:29_CDT_2018
Cuda compilation tools, release 9.2, V9.2.88

ubuntu@ip-172-31-6-165:~$ nvidia-smi
Wed Jun  6 09:24:09 2018       
+-----------------------------------------------------------------------------+
| NVIDIA-SMI 396.26                 Driver Version: 396.26                    |
|-------------------------------+----------------------+----------------------+
| GPU  Name        Persistence-M| Bus-Id        Disp.A | Volatile Uncorr. ECC |
| Fan  Temp  Perf  Pwr:Usage/Cap|         Memory-Usage | GPU-Util  Compute M. |
|===============================+======================+======================|
|   0  Tesla K80           On   | 00000000:00:1E.0 Off |                    0 |
| N/A   39C    P8    30W / 149W |      0MiB / 11441MiB |      0%      Default |
+-------------------------------+----------------------+----------------------+
                                                                               
+-----------------------------------------------------------------------------+
| Processes:                                                       GPU Memory |
|  GPU       PID   Type   Process name                             Usage      |
|=============================================================================|
|  No running processes found                                                 |
+-----------------------------------------------------------------------------+

Python 3.6.4 |Anaconda, Inc.| (default, Jan 16 2018, 18:10:19) 
[GCC 7.2.0] on linux
Type "help", "copyright", "credits" or "license" for more information.
>>> import sqaod
Traceback (most recent call last):
  File "<stdin>", line 1, in <module>
  File "/home/ubuntu/anaconda3/lib/python3.6/site-packages/sqaod/__init__.py", line 10, in <module>
    from . import cpu
  File "/home/ubuntu/anaconda3/lib/python3.6/site-packages/sqaod/cpu/__init__.py", line 1, in <module>
    from . import formulas
  File "/home/ubuntu/anaconda3/lib/python3.6/site-packages/sqaod/cpu/formulas.py", line 4, in <module>
    from . import cpu_formulas as cext
ImportError: /home/ubuntu/anaconda3/lib/python3.6/site-packages/sqaod/cpu/cpu_formulas.so: undefined symbol: _ZN5sqaod12aligned_freeEPv

The text was updated successfully, but these errors were encountered:

shukob · 2018-06-06T08:19:34Z

Thanks yes.

shinmorino · 2018-06-06T10:16:13Z

You don't have to specify any options to get CPU builds.

Please check where libs are installed, and check LD_LIBRARY_PATH is correctly specified.
I guess python extension (cpu_formulas.so) cannot link to libsqaod.so.

shukob · 2018-06-06T10:18:14Z

Thanks! I'll check.

shukob · 2018-06-06T14:09:44Z

squad is installed on /usr/lib.
I already run sudo ldconfig.

locate sqaod only finds these

/etc/alternatives/libsqaodc.so.0
/etc/apt/sources.list.d/sqaod.list
/usr/lib/libsqaodc-avx2
/usr/lib/libsqaodc-sse2
/usr/lib/libsqaodc.so.0
/usr/lib/libsqaodc-avx2/libsqaodc.so.0
/usr/lib/libsqaodc-avx2/libsqaodc.so.0.0.0
/usr/lib/libsqaodc-sse2/libsqaodc.so.0
/usr/lib/libsqaodc-sse2/libsqaodc.so.0.0.0
/usr/share/doc/libsqaodc
/usr/share/doc/libsqaodc-avx2
/usr/share/doc/libsqaodc-sse2
/usr/share/doc/libsqaodc/changelog.Debian.gz
/usr/share/doc/libsqaodc/copyright
/usr/share/doc/libsqaodc-avx2/changelog.Debian.gz
/usr/share/doc/libsqaodc-avx2/copyright
/usr/share/doc/libsqaodc-sse2/changelog.Debian.gz
/usr/share/doc/libsqaodc-sse2/copyright
/var/cache/apt/archives/libsqaodc-avx2_0.2.0-0~xenial_amd64.deb
/var/cache/apt/archives/libsqaodc-sse2_0.2.0-0~xenial_amd64.deb
/var/cache/apt/archives/libsqaodc_0.2.0-0~xenial_amd64.deb
/var/lib/apt/lists/shinmorino.github.io_sqaod_ubuntu_dists_xenial_InRelease
/var/lib/apt/lists/shinmorino.github.io_sqaod_ubuntu_dists_xenial_multiverse_binary-amd64_Packages
/var/lib/dpkg/alternatives/libsqaodc.so.0
/var/lib/dpkg/info/libsqaodc-avx2.list
/var/lib/dpkg/info/libsqaodc-avx2.md5sums
/var/lib/dpkg/info/libsqaodc-avx2.postinst
/var/lib/dpkg/info/libsqaodc-avx2.prerm
/var/lib/dpkg/info/libsqaodc-avx2.shlibs
/var/lib/dpkg/info/libsqaodc-avx2.triggers
/var/lib/dpkg/info/libsqaodc-sse2.list
/var/lib/dpkg/info/libsqaodc-sse2.md5sums
/var/lib/dpkg/info/libsqaodc-sse2.postinst
/var/lib/dpkg/info/libsqaodc-sse2.prerm
/var/lib/dpkg/info/libsqaodc-sse2.shlibs
/var/lib/dpkg/info/libsqaodc-sse2.triggers
/var/lib/dpkg/info/libsqaodc.list
/var/lib/dpkg/info/libsqaodc.md5sums

Is this a problem?

ubuntu@ip-172-31-6-165:~$ echo $LD_LIBRARY_PATH
/usr/lib64/openmpi/lib/:/usr/local/cuda/lib64:/usr/local/lib:/usr/lib:/usr/local/cuda/extras/CUPTI/lib64:/usr/local/mpi/lib:/lib/:/home/ubuntu/src/cntk/bindings/python/cntk/libs:/usr/local/cuda/lib64:/usr/local/lib:/usr/lib:/usr/local/cuda/extras/CUPTI/lib64:/usr/local/mpi/lib:/usr/lib64/openmpi/lib/:/usr/local/cuda/lib64:/usr/local/lib:/usr/lib:/usr/local/cuda/extras/CUPTI/lib64:/usr/local/mpi/lib:/lib/:

What I did is here:

  122  git clone https://github.com/shinmorino/sqaod.git
  123  cd squ
  124  cd sqaod/
  125  ./clone_3rdparty.sh 
  126  ./autogen.sh 
  127  ./configure --with-blas --enable-cuda
  128  make
  129  sudo make install
  130  sudo apt-get install python-dev
  131  pip --version
  132  pip install pip --upgrade
  133  pip install numpy setuptools
  134  ./build_py.sh 
  135  pip install sqaodpy/dist/sqaod-0.1.dev0-cp27-cp27mu-manylinux1_x86_64.whl
  136  pip install sqaodpy/dist/sqaod-0.2.0b1-cp36-cp36m-manylinux1_x86_64.whl

Added whole logs below:

Mac-b8f6b110a75b-5:~ shunpeik$ ssh KernelP2
The authenticity of host '[ec2-13-59-31-191.us-east-2.compute.amazonaws.com]:2211 ([13.59.31.191]:2211)' can't be established.
ECDSA key fingerprint is SHA256:+ssKf4t39LRjfvxmWZolpJyytjEMdbfBYsOAYSP8ULg.
Are you sure you want to continue connecting (yes/no)? yes
Warning: Permanently added '[ec2-13-59-31-191.us-east-2.compute.amazonaws.com]:2211,[13.59.31.191]:2211' (ECDSA) to the list of known hosts.
ubuntu@ec2-13-59-31-191.us-east-2.compute.amazonaws.com's password: 
=============================================================================
       __|  __|_  )
       _|  (     /   Deep Learning AMI  (Ubuntu)
      ___|\___|___|
=============================================================================

Welcome to Ubuntu 16.04.4 LTS (GNU/Linux 4.4.0-1055-aws x86_64v)

Please use one of the following commands to start the required environment with the framework of your choice:
for MXNet(+Keras1) with Python3 (CUDA 9/MKL) _________________ source activate mxnet_p36
for MXNet(+Keras1) with Python2 (CUDA 9/MKL) _________________ source activate mxnet_p27
for TensorFlow(+Keras2) with Python3 (CUDA 9/MKL) ____________ source activate tensorflow_p36
for TensorFlow(+Keras2) with Python2 (CUDA 9/MKL) ____________ source activate tensorflow_p27
for Theano(+Keras2) with Python3 (CUDA 9) ____________________ source activate theano_p36
for Theano(+Keras2) with Python2 (CUDA 9) ____________________ source activate theano_p27
for PyTorch with Python3 (CUDA 9) ____________________________ source activate pytorch_p36
for PyTorch with Python2 (CUDA 9) ____________________________ source activate pytorch_p27
for CNTK(+Keras2) with Python3 (CUDA 9) ______________________ source activate cntk_p36
for CNTK(+Keras2) with Python2 (CUDA 9) ______________________ source activate cntk_p27
for Caffe2 with Python2 (CUDA 9) _____________________________ source activate caffe2_p27
for Caffe with Python2 (CUDA 8) ______________________________ source activate caffe_p27
for Caffe with Python3 (CUDA 8) ______________________________ source activate caffe_p35
for Chainer with Python2 (CUDA 9) ____________________________ source activate chainer_p27
for Chainer with Python3 (CUDA 9) ____________________________ source activate chainer_p36
for base Python2 (CUDA 9) ____________________________________ source activate python2
for base Python3 (CUDA 9) ____________________________________ source activate python3

Official Conda User Guide: https://conda.io/docs/user-guide/index.html
AWS Deep Learning AMI Homepage: https://aws.amazon.com/machine-learning/amis/
Developer Guide and Release Notes: https://docs.aws.amazon.com/dlami/latest/devguide/what-is-dlami.html
Support: https://forums.aws.amazon.com/forum.jspa?forumID=263

 * Documentation:  https://help.ubuntu.com
 * Management:     https://landscape.canonical.com
 * Support:        https://ubuntu.com/advantage

  Get cloud support with Ubuntu Advantage Cloud Guest:
    http://www.ubuntu.com/business/services/cloud

3 個のパッケージがアップデート可能です。
0 個のアップデートはセキュリティアップデートです。


*** システムの再起動が必要です ***
ubuntu@ip-172-31-6-165:~$ sudo apt-get dist-upgrade
パッケージリストを読み込んでいます... 完了
依存関係ツリーを作成しています                
状態情報を読み取っています... 完了
アップグレードパッケージを検出しています... 完了
以下のパッケージが自動でインストールされましたが、もう必要とされていません:
  libaio1 librados2 librbd1 librdmacm1 linux-aws-headers-4.4.0-1054 linux-headers-4.4.0-1054-aws linux-image-4.4.0-1054-aws
これを削除するには 'sudo apt autoremove' を利用してください。
以下のパッケージが新たにインストールされます:
  libxmlsec1 libxmlsec1-openssl
以下のパッケージはアップグレードされます:
  open-vm-tools
アップグレード: 1 個、新規インストール: 2 個、削除: 0 個、保留: 0 個。
721 kB のアーカイブを取得する必要があります。
この操作後に追加で 1,170 kB のディスク容量が消費されます。
続行しますか? [Y/n] 
取得:1 http://us-east-2.ec2.archive.ubuntu.com/ubuntu xenial/main amd64 libxmlsec1 amd64 1.2.20-2ubuntu4 [118 kB]
取得:2 http://us-east-2.ec2.archive.ubuntu.com/ubuntu xenial/main amd64 libxmlsec1-openssl amd64 1.2.20-2ubuntu4 [65.0 kB]
取得:3 http://us-east-2.ec2.archive.ubuntu.com/ubuntu xenial-updates/main amd64 open-vm-tools amd64 2:10.2.0-3~ubuntu0.16.04.1 [538 kB]
721 kB を 0秒 で取得しました (25.9 MB/s)
以前に未選択のパッケージ libxmlsec1 を選択しています。
(データベースを読み込んでいます ... 現在 386898 個のファイルとディレクトリがインストールされています。)
.../libxmlsec1_1.2.20-2ubuntu4_amd64.deb を展開する準備をしています ...
libxmlsec1 (1.2.20-2ubuntu4) を展開しています...
以前に未選択のパッケージ libxmlsec1-openssl を選択しています。
.../libxmlsec1-openssl_1.2.20-2ubuntu4_amd64.deb を展開する準備をしています ...
libxmlsec1-openssl (1.2.20-2ubuntu4) を展開しています...
.../open-vm-tools_2%3a10.2.0-3~ubuntu0.16.04.1_amd64.deb を展開する準備をしています ...
open-vm-tools (2:10.2.0-3~ubuntu0.16.04.1) で (2:10.0.7-3227872-5ubuntu1~16.04.2 に) 上書き展開しています ...
libc-bin (2.23-0ubuntu10) のトリガを処理しています ...
systemd (229-4ubuntu21.2) のトリガを処理しています ...
ureadahead (0.100.0-19) のトリガを処理しています ...
man-db (2.7.5-1) のトリガを処理しています ...
libxmlsec1 (1.2.20-2ubuntu4) を設定しています ...
libxmlsec1-openssl (1.2.20-2ubuntu4) を設定しています ...
open-vm-tools (2:10.2.0-3~ubuntu0.16.04.1) を設定しています ...
新バージョンの設定ファイル /etc/init.d/open-vm-tools をインストールしています ...
新バージョンの設定ファイル /etc/pam.d/vmtoolsd をインストールしています ...
新バージョンの設定ファイル /etc/vmware-tools/poweroff-vm-default をインストールしています ...
新バージョンの設定ファイル /etc/vmware-tools/poweron-vm-default をインストールしています ...
新バージョンの設定ファイル /etc/vmware-tools/resume-vm-default をインストールしています ...
新バージョンの設定ファイル /etc/vmware-tools/scripts/vmware/network をインストールしています ...
新バージョンの設定ファイル /etc/vmware-tools/statechange.subr をインストールしています ...
新バージョンの設定ファイル /etc/vmware-tools/suspend-vm-default をインストールしています ...
新バージョンの設定ファイル /etc/vmware-tools/vm-support をインストールしています ...
insserv: warning: script 'K01S100AMI' missing LSB tags and overrides
insserv: warning: script 'S100AMI' missing LSB tags and overrides
libc-bin (2.23-0ubuntu10) のトリガを処理しています ...
systemd (229-4ubuntu21.2) のトリガを処理しています ...
ureadahead (0.100.0-19) のトリガを処理しています ...
ubuntu@ip-172-31-6-165:~$ ログアウト
Connection to ec2-13-59-31-191.us-east-2.compute.amazonaws.com closed.
Mac-b8f6b110a75b-5:~ shunpeik$ scp ~/Downloads/cuda-repo-ubuntu1604-9-2-local
cuda-repo-ubuntu1604-9-2-local-cublas-update-1_1.0-1_amd64.deb  cuda-repo-ubuntu1604-9-2-local_9.2.88-1_amd64.deb               
Mac-b8f6b110a75b-5:~ shunpeik$ scp ~/Downloads/cuda-repo-ubuntu1604-9-2-local_9.2.88-1_amd64.deb KernelP2:
ubuntu@ec2-13-59-31-191.us-east-2.compute.amazonaws.com's password: 
cuda-repo-ubuntu1604-9-2-local_9.2.88-1_amd64.deb                                                                                                              100% 1209MB   2.6MB/s   07:47    
Mac-b8f6b110a75b-5:~ shunpeik$ scp ~/Downloads/cuda-repo-ubuntu1604-9-2-local
cuda-repo-ubuntu1604-9-2-local-cublas-update-1_1.0-1_amd64.deb  cuda-repo-ubuntu1604-9-2-local_9.2.88-1_amd64.deb               
Mac-b8f6b110a75b-5:~ shunpeik$ scp ~/Downloads/cuda-repo-ubuntu1604-9-2-local-cublas-update-1_1.0-1_amd64.deb 
usage: scp [-346BCpqrv] [-c cipher] [-F ssh_config] [-i identity_file]
           [-l limit] [-o ssh_option] [-P port] [-S program]
           [[user@]host1:]file1 ... [[user@]host2:]file2
Mac-b8f6b110a75b-5:~ shunpeik$ scp ~/Downloads/cuda-repo-ubuntu1604-9-2-local-cublas-update-1_1.0-1_amd64.deb  KernelP2:
ubuntu@ec2-13-59-31-191.us-east-2.compute.amazonaws.com's password: 
cuda-repo-ubuntu1604-9-2-local-cublas-update-1_1.0-1_amd64.deb                                                                                                 100%   94MB   2.3MB/s   00:41    
Mac-b8f6b110a75b-5:~ shunpeik$ ssh KernelP2
ubuntu@ec2-13-59-31-191.us-east-2.compute.amazonaws.com's password: 
Permission denied, please try again.
ubuntu@ec2-13-59-31-191.us-east-2.compute.amazonaws.com's password: 
=============================================================================
       __|  __|_  )
       _|  (     /   Deep Learning AMI  (Ubuntu)
      ___|\___|___|
=============================================================================

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Please use one of the following commands to start the required environment with the framework of your choice:
for MXNet(+Keras1) with Python3 (CUDA 9/MKL) _________________ source activate mxnet_p36
for MXNet(+Keras1) with Python2 (CUDA 9/MKL) _________________ source activate mxnet_p27
for TensorFlow(+Keras2) with Python3 (CUDA 9/MKL) ____________ source activate tensorflow_p36
for TensorFlow(+Keras2) with Python2 (CUDA 9/MKL) ____________ source activate tensorflow_p27
for Theano(+Keras2) with Python3 (CUDA 9) ____________________ source activate theano_p36
for Theano(+Keras2) with Python2 (CUDA 9) ____________________ source activate theano_p27
for PyTorch with Python3 (CUDA 9) ____________________________ source activate pytorch_p36
for PyTorch with Python2 (CUDA 9) ____________________________ source activate pytorch_p27
for CNTK(+Keras2) with Python3 (CUDA 9) ______________________ source activate cntk_p36
for CNTK(+Keras2) with Python2 (CUDA 9) ______________________ source activate cntk_p27
for Caffe2 with Python2 (CUDA 9) _____________________________ source activate caffe2_p27
for Caffe with Python2 (CUDA 8) ______________________________ source activate caffe_p27
for Caffe with Python3 (CUDA 8) ______________________________ source activate caffe_p35
for Chainer with Python2 (CUDA 9) ____________________________ source activate chainer_p27
for Chainer with Python3 (CUDA 9) ____________________________ source activate chainer_p36
for base Python2 (CUDA 9) ____________________________________ source activate python2
for base Python3 (CUDA 9) ____________________________________ source activate python3

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Support: https://forums.aws.amazon.com/forum.jspa?forumID=263

 * Documentation:  https://help.ubuntu.com
 * Management:     https://landscape.canonical.com
 * Support:        https://ubuntu.com/advantage

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    http://www.ubuntu.com/business/services/cloud

0 個のパッケージがアップデート可能です。
0 個のアップデートはセキュリティアップデートです。


*** システムの再起動が必要です ***
ubuntu@ip-172-31-6-165:~$ ls
Nvidia_Cloud_EULA.pdf  cuda-repo-ubuntu1604-9-2-local-cublas-update-1_1.0-1_amd64.deb  src        ダウンロード  デスクトップ  ビデオ    ミュージック
anaconda3              cuda-repo-ubuntu1604-9-2-local_9.2.88-1_amd64.deb               tutorials  テンプレート  ドキュメント  ピクチャ  公開
ubuntu@ip-172-31-6-165:~$ sudo dpkg -i cuda-repo-ubuntu1604-9-2-local_9.2.88-1_amd64.deb 
以前に未選択のパッケージ cuda-repo-ubuntu1604-9-2-local を選択しています。
(データベースを読み込んでいます ... 現在 386968 個のファイルとディレクトリがインストールされています。)
cuda-repo-ubuntu1604-9-2-local_9.2.88-1_amd64.deb を展開する準備をしています ...
cuda-repo-ubuntu1604-9-2-local (9.2.88-1) を展開しています...
cuda-repo-ubuntu1604-9-2-local (9.2.88-1) を設定しています ...

The public CUDA GPG key does not appear to be installed.
To install the key, run this command:
sudo apt-key add /var/cuda-repo-9-2-local/7fa2af80.pub

ubuntu@ip-172-31-6-165:~$ sudo apt-key adv --fetch-keys http://developer.download.nvidia.com/compute/cuda/repos/ubuntu1604/x86_64/7fa2af80.pub
Executing: /tmp/tmp.LKDxA5ozeP/gpg.1.sh --fetch-keys
http://developer.download.nvidia.com/compute/cuda/repos/ubuntu1604/x86_64/7fa2af80.pub
gpg: 鍵7FA2AF80: 公開鍵"cudatools <cudatools@nvidia.com>"をインポートしました
gpg: 処理数の合計: 1
gpg:               インポート: 1  (RSA: 1)
ubuntu@ip-172-31-6-165:~$ sudo apt-key add /var/cuda-repo-9-2-local/7fa2af80.pub
OK
ubuntu@ip-172-31-6-165:~$ 
ubuntu@ip-172-31-6-165:~$ sudo apt update
取得:1 file:/var/cuda-repo-9-2-local  InRelease
無視:1 file:/var/cuda-repo-9-2-local  InRelease
取得:2 file:/var/cuda-repo-9-2-local  Release [574 B]
ヒット:3 http://us-east-2.ec2.archive.ubuntu.com/ubuntu xenial InRelease
取得:2 file:/var/cuda-repo-9-2-local  Release [574 B]                                                                        
取得:4 http://us-east-2.ec2.archive.ubuntu.com/ubuntu xenial-updates InRelease [109 kB]                                      
取得:5 http://us-east-2.ec2.archive.ubuntu.com/ubuntu xenial-backports InRelease [107 kB]                                    
取得:6 file:/var/cuda-repo-9-2-local  Release.gpg [819 B]                                                                                                     
取得:6 file:/var/cuda-repo-9-2-local  Release.gpg [819 B]                                                                                              
取得:7 http://us-east-2.ec2.archive.ubuntu.com/ubuntu xenial-updates/main Sources [307 kB]                                                             
取得:8 http://us-east-2.ec2.archive.ubuntu.com/ubuntu xenial-updates/main amd64 Packages [785 kB]                                           
取得:9 http://security.ubuntu.com/ubuntu xenial-security InRelease [107 kB]                                                                  
取得:10 http://us-east-2.ec2.archive.ubuntu.com/ubuntu xenial-updates/main Translation-en [325 kB]                                             
取得:11 http://us-east-2.ec2.archive.ubuntu.com/ubuntu xenial-updates/main amd64 DEP-11 Metadata [319 kB]                                          
取得:12 http://us-east-2.ec2.archive.ubuntu.com/ubuntu xenial-updates/main DEP-11 64x64 Icons [224 kB]                                                   
ヒット:13 http://ppa.launchpad.net/openjdk-r/ppa/ubuntu xenial InRelease                                                                        
取得:14 http://us-east-2.ec2.archive.ubuntu.com/ubuntu xenial-updates/universe amd64 Packages [632 kB]           
取得:15 http://us-east-2.ec2.archive.ubuntu.com/ubuntu xenial-updates/universe Translation-en [254 kB]           
取得:16 http://us-east-2.ec2.archive.ubuntu.com/ubuntu xenial-updates/universe amd64 DEP-11 Metadata [246 kB]            
取得:17 http://us-east-2.ec2.archive.ubuntu.com/ubuntu xenial-updates/universe DEP-11 64x64 Icons [326 kB]                 
取得:18 http://us-east-2.ec2.archive.ubuntu.com/ubuntu xenial-updates/multiverse amd64 DEP-11 Metadata [5,964 B]        
取得:19 http://us-east-2.ec2.archive.ubuntu.com/ubuntu xenial-backports/main amd64 DEP-11 Metadata [3,328 B]       
取得:20 http://us-east-2.ec2.archive.ubuntu.com/ubuntu xenial-backports/universe amd64 DEP-11 Metadata [5,100 B]                
取得:21 file:/var/cuda-repo-9-2-local  Packages [18.7 kB]                                                                       
ヒット:22 https://shinmorino.github.io/sqaod/ubuntu xenial InRelease                                               
取得:23 http://security.ubuntu.com/ubuntu xenial-security/main Sources [124 kB]              
取得:24 http://security.ubuntu.com/ubuntu xenial-security/main amd64 Packages [501 kB]
取得:25 http://security.ubuntu.com/ubuntu xenial-security/main Translation-en [216 kB]
取得:26 http://security.ubuntu.com/ubuntu xenial-security/main amd64 DEP-11 Metadata [67.7 kB]
取得:27 http://security.ubuntu.com/ubuntu xenial-security/main DEP-11 64x64 Icons [68.0 kB]
取得:28 http://security.ubuntu.com/ubuntu xenial-security/universe amd64 Packages [352 kB]
取得:29 http://security.ubuntu.com/ubuntu xenial-security/universe Translation-en [131 kB]
取得:30 http://security.ubuntu.com/ubuntu xenial-security/universe amd64 DEP-11 Metadata [107 kB]
取得:31 http://security.ubuntu.com/ubuntu xenial-security/universe DEP-11 64x64 Icons [142 kB]
5,463 kB を 1秒 で取得しました (3,077 kB/s)
パッケージリストを読み込んでいます... 完了
依存関係ツリーを作成しています       
状態情報を読み取っています... 完了
アップグレードできるパッケージが 3 個あります。表示するには 'apt list --upgradable' を実行してください。
ubuntu@ip-172-31-6-165:~$ sudo dpkg -i cuda-repo-ubuntu1604-9-2-local-cublas-update-1_1.0-1_amd64.deb 
以前に未選択のパッケージ cuda-repo-ubuntu1604-9-2-local-cublas-update-1 を選択しています。
(データベースを読み込んでいます ... 現在 387041 個のファイルとディレクトリがインストールされています。)
cuda-repo-ubuntu1604-9-2-local-cublas-update-1_1.0-1_amd64.deb を展開する準備をしています ...
cuda-repo-ubuntu1604-9-2-local-cublas-update-1 (1.0-1) を展開しています...
cuda-repo-ubuntu1604-9-2-local-cublas-update-1 (1.0-1) を設定しています ...
ubuntu@ip-172-31-6-165:~$ sudo apt update
取得:1 file:/var/cuda-repo-9-2-local-cublas-update-1  InRelease
無視:1 file:/var/cuda-repo-9-2-local-cublas-update-1  InRelease
取得:2 file:/var/cuda-repo-9-2-local  InRelease                                                              
無視:2 file:/var/cuda-repo-9-2-local  InRelease                                                                                
取得:3 file:/var/cuda-repo-9-2-local-cublas-update-1  Release [574 B]                                                          
ヒット:4 http://us-east-2.ec2.archive.ubuntu.com/ubuntu xenial InRelease                                                                                                  
取得:3 file:/var/cuda-repo-9-2-local-cublas-update-1  Release [574 B]                                                                                                     
ヒット:5 http://us-east-2.ec2.archive.ubuntu.com/ubuntu xenial-updates InRelease                                                                           
ヒット:6 http://us-east-2.ec2.archive.ubuntu.com/ubuntu xenial-backports InRelease                                                                         
取得:7 file:/var/cuda-repo-9-2-local  Release [574 B]                                                                                                      
取得:7 file:/var/cuda-repo-9-2-local  Release [574 B]                                                                        
取得:8 file:/var/cuda-repo-9-2-local-cublas-update-1  Release.gpg [801 B]                                                                                 
取得:8 file:/var/cuda-repo-9-2-local-cublas-update-1  Release.gpg [801 B]                                                                                 
ヒット:9 http://ppa.launchpad.net/openjdk-r/ppa/ubuntu xenial InRelease                                                                                                             
ヒット:10 https://shinmorino.github.io/sqaod/ubuntu xenial InRelease                    
ヒット:11 http://security.ubuntu.com/ubuntu xenial-security InRelease
取得:13 file:/var/cuda-repo-9-2-local-cublas-update-1  Packages [690 B]
パッケージリストを読み込んでいます... 完了           
依存関係ツリーを作成しています       
状態情報を読み取っています... 完了
アップグレードできるパッケージが 3 個あります。表示するには 'apt list --upgradable' を実行してください。
ubuntu@ip-172-31-6-165:~$ sudo apt install cuda cuda-drivers
パッケージリストを読み込んでいます... 完了
依存関係ツリーを作成しています                
状態情報を読み取っています... 完了
以下のパッケージが自動でインストールされましたが、もう必要とされていません:
  libaio1 librados2 librbd1 librdmacm1 linux-aws-headers-4.4.0-1054 linux-headers-4.4.0-1054-aws linux-image-4.4.0-1054-aws
これを削除するには 'sudo apt autoremove' を利用してください。
以下の追加パッケージがインストールされます:
  bbswitch-dkms cuda-9-2 cuda-command-line-tools-9-2 cuda-compiler-9-2 cuda-cublas-9-2 cuda-cublas-dev-9-2 cuda-cudart-9-2 cuda-cudart-dev-9-2 cuda-cufft-9-2 cuda-cufft-dev-9-2
  cuda-cuobjdump-9-2 cuda-cupti-9-2 cuda-curand-9-2 cuda-curand-dev-9-2 cuda-cusolver-9-2 cuda-cusolver-dev-9-2 cuda-cusparse-9-2 cuda-cusparse-dev-9-2 cuda-demo-suite-9-2
  cuda-documentation-9-2 cuda-driver-dev-9-2 cuda-gdb-9-2 cuda-gpu-library-advisor-9-2 cuda-libraries-9-2 cuda-libraries-dev-9-2 cuda-license-9-2 cuda-memcheck-9-2 cuda-misc-headers-9-2
  cuda-npp-9-2 cuda-npp-dev-9-2 cuda-nsight-9-2 cuda-nvcc-9-2 cuda-nvdisasm-9-2 cuda-nvgraph-9-2 cuda-nvgraph-dev-9-2 cuda-nvml-dev-9-2 cuda-nvprof-9-2 cuda-nvprune-9-2 cuda-nvrtc-9-2
  cuda-nvrtc-dev-9-2 cuda-nvtx-9-2 cuda-nvvp-9-2 cuda-runtime-9-2 cuda-samples-9-2 cuda-toolkit-9-2 cuda-tools-9-2 cuda-visual-tools-9-2 default-jre default-jre-headless freeglut3
  freeglut3-dev lib32gcc1 libc6-i386 libcuda1-396 libdrm-dev libgl1-mesa-dev libglu1-mesa-dev libjansson4 libvdpau1 libx11-xcb-dev libxcb-dri2-0-dev libxcb-dri3-dev libxcb-glx0-dev
  libxcb-present-dev libxcb-randr0-dev libxcb-shape0-dev libxcb-sync-dev libxcb-xfixes0-dev libxmu-dev libxmu-headers libxnvctrl0 libxshmfence-dev libxxf86vm-dev mesa-common-dev
  mesa-vdpau-drivers nvidia-396 nvidia-396-dev nvidia-modprobe nvidia-opencl-icd-396 nvidia-prime nvidia-settings screen-resolution-extra vdpau-driver-all x11proto-dri2-dev x11proto-gl-dev
  x11proto-xf86vidmode-dev xserver-xorg-legacy
提案パッケージ:
  bumblebee default-java-plugin libvdpau-va-gl1 nvidia-vdpau-driver nvidia-legacy-340xx-vdpau-driver
以下のパッケージが新たにインストールされます:
  bbswitch-dkms cuda cuda-9-2 cuda-command-line-tools-9-2 cuda-compiler-9-2 cuda-cublas-9-2 cuda-cublas-dev-9-2 cuda-cudart-9-2 cuda-cudart-dev-9-2 cuda-cufft-9-2 cuda-cufft-dev-9-2
  cuda-cuobjdump-9-2 cuda-cupti-9-2 cuda-curand-9-2 cuda-curand-dev-9-2 cuda-cusolver-9-2 cuda-cusolver-dev-9-2 cuda-cusparse-9-2 cuda-cusparse-dev-9-2 cuda-demo-suite-9-2
  cuda-documentation-9-2 cuda-driver-dev-9-2 cuda-drivers cuda-gdb-9-2 cuda-gpu-library-advisor-9-2 cuda-libraries-9-2 cuda-libraries-dev-9-2 cuda-license-9-2 cuda-memcheck-9-2
  cuda-misc-headers-9-2 cuda-npp-9-2 cuda-npp-dev-9-2 cuda-nsight-9-2 cuda-nvcc-9-2 cuda-nvdisasm-9-2 cuda-nvgraph-9-2 cuda-nvgraph-dev-9-2 cuda-nvml-dev-9-2 cuda-nvprof-9-2 cuda-nvprune-9-2
  cuda-nvrtc-9-2 cuda-nvrtc-dev-9-2 cuda-nvtx-9-2 cuda-nvvp-9-2 cuda-runtime-9-2 cuda-samples-9-2 cuda-toolkit-9-2 cuda-tools-9-2 cuda-visual-tools-9-2 default-jre default-jre-headless
  freeglut3 freeglut3-dev lib32gcc1 libc6-i386 libcuda1-396 libdrm-dev libgl1-mesa-dev libglu1-mesa-dev libjansson4 libvdpau1 libx11-xcb-dev libxcb-dri2-0-dev libxcb-dri3-dev libxcb-glx0-dev
  libxcb-present-dev libxcb-randr0-dev libxcb-shape0-dev libxcb-sync-dev libxcb-xfixes0-dev libxmu-dev libxmu-headers libxnvctrl0 libxshmfence-dev libxxf86vm-dev mesa-common-dev
  mesa-vdpau-drivers nvidia-396 nvidia-396-dev nvidia-modprobe nvidia-opencl-icd-396 nvidia-prime nvidia-settings screen-resolution-extra vdpau-driver-all x11proto-dri2-dev x11proto-gl-dev
  x11proto-xf86vidmode-dev xserver-xorg-legacy
アップグレード: 0 個、新規インストール: 89 個、削除: 0 個、保留: 3 個。

1,262 MB 中 5,651 kB のアーカイブを取得する必要があります。
この操作後に追加で 3,148 MB のディスク容量が消費されます。
取得:1 file:/var/cuda-repo-9-2-local  cuda-license-9-2 9.2.88-1 [22.0 kB]
取得:2 file:/var/cuda-repo-9-2-local  cuda-misc-headers-9-2 9.2.88-1 [640 kB]
取得:3 http://us-east-2.ec2.archive.ubuntu.com/ubuntu xenial/universe amd64 freeglut3 amd64 2.8.1-2 [73.4 kB]
取得:4 http://us-east-2.ec2.archive.ubuntu.com/ubuntu xenial/main amd64 default-jre-headless amd64 2:1.8-56ubuntu2 [4,380 B]
取得:5 http://us-east-2.ec2.archive.ubuntu.com/ubuntu xenial/main amd64 default-jre amd64 2:1.8-56ubuntu2 [980 B]
取得:6 http://us-east-2.ec2.archive.ubuntu.com/ubuntu xenial-updates/main amd64 libdrm-dev amd64 2.4.83-1~16.04.1 [229 kB]
取得:7 http://us-east-2.ec2.archive.ubuntu.com/ubuntu xenial-updates/main amd64 mesa-common-dev amd64 17.2.8-0ubuntu0~16.04.1 [525 kB]
取得:8 http://us-east-2.ec2.archive.ubuntu.com/ubuntu xenial/main amd64 libx11-xcb-dev amd64 2:1.6.3-1ubuntu2 [9,730 B]
取得:9 http://us-east-2.ec2.archive.ubuntu.com/ubuntu xenial/main amd64 libxcb-dri3-dev amd64 1.11.1-1ubuntu1 [5,752 B]
取得:10 http://us-east-2.ec2.archive.ubuntu.com/ubuntu xenial/main amd64 libxcb-randr0-dev amd64 1.11.1-1ubuntu1 [18.2 kB]
取得:11 file:/var/cuda-repo-9-2-local  cuda-nvcc-9-2 9.2.88-1 [15.4 MB]
取得:12 http://us-east-2.ec2.archive.ubuntu.com/ubuntu xenial/main amd64 libxcb-shape0-dev amd64 1.11.1-1ubuntu1 [6,900 B]
取得:13 file:/var/cuda-repo-9-2-local  cuda-cuobjdump-9-2 9.2.88-1 [129 kB]
取得:14 file:/var/cuda-repo-9-2-local  cuda-nvprune-9-2 9.2.88-1 [36.7 kB]
取得:15 file:/var/cuda-repo-9-2-local  cuda-compiler-9-2 9.2.88-1 [2,518 B]
取得:16 http://us-east-2.ec2.archive.ubuntu.com/ubuntu xenial/main amd64 libxcb-xfixes0-dev amd64 1.11.1-1ubuntu1 [11.2 kB]
取得:17 http://us-east-2.ec2.archive.ubuntu.com/ubuntu xenial/main amd64 libxcb-sync-dev amd64 1.11.1-1ubuntu1 [10.1 kB]
取得:18 http://us-east-2.ec2.archive.ubuntu.com/ubuntu xenial/main amd64 libxcb-present-dev amd64 1.11.1-1ubuntu1 [6,618 B]
取得:19 http://us-east-2.ec2.archive.ubuntu.com/ubuntu xenial/main amd64 libxshmfence-dev amd64 1.2-1 [3,676 B]
取得:20 http://us-east-2.ec2.archive.ubuntu.com/ubuntu xenial/main amd64 libxcb-dri2-0-dev amd64 1.11.1-1ubuntu1 [8,384 B]
取得:21 http://us-east-2.ec2.archive.ubuntu.com/ubuntu xenial/main amd64 libxcb-glx0-dev amd64 1.11.1-1ubuntu1 [26.9 kB]
取得:22 http://us-east-2.ec2.archive.ubuntu.com/ubuntu xenial/main amd64 x11proto-xf86vidmode-dev all 2.3.1-2 [6,116 B]
取得:23 http://us-east-2.ec2.archive.ubuntu.com/ubuntu xenial/main amd64 libxxf86vm-dev amd64 1:1.1.4-1 [13.3 kB]
取得:24 http://us-east-2.ec2.archive.ubuntu.com/ubuntu xenial/main amd64 x11proto-dri2-dev all 2.8-2 [12.6 kB]
取得:25 http://us-east-2.ec2.archive.ubuntu.com/ubuntu xenial/main amd64 x11proto-gl-dev all 1.4.17-1 [17.9 kB]
取得:26 http://us-east-2.ec2.archive.ubuntu.com/ubuntu xenial-updates/main amd64 libgl1-mesa-dev amd64 17.2.8-0ubuntu0~16.04.1 [4,456 B]
取得:27 http://us-east-2.ec2.archive.ubuntu.com/ubuntu xenial/main amd64 libglu1-mesa-dev amd64 9.0.0-2.1 [202 kB]
取得:28 http://us-east-2.ec2.archive.ubuntu.com/ubuntu xenial/universe amd64 freeglut3-dev amd64 2.8.1-2 [123 kB]
取得:29 http://us-east-2.ec2.archive.ubuntu.com/ubuntu xenial/main amd64 libxmu-headers all 2:1.1.2-2 [54.3 kB]
取得:30 http://us-east-2.ec2.archive.ubuntu.com/ubuntu xenial/main amd64 libxmu-dev amd64 2:1.1.2-2 [49.0 kB]
取得:31 http://us-east-2.ec2.archive.ubuntu.com/ubuntu xenial-updates/main amd64 libc6-i386 amd64 2.23-0ubuntu10 [2,336 kB]
取得:32 file:/var/cuda-repo-9-2-local  cuda-nvdisasm-9-2 9.2.88-1 [17.4 MB]
取得:33 http://us-east-2.ec2.archive.ubuntu.com/ubuntu xenial/main amd64 lib32gcc1 amd64 1:6.0.1-0ubuntu1 [46.6 kB]
取得:34 http://us-east-2.ec2.archive.ubuntu.com/ubuntu xenial-updates/main amd64 xserver-xorg-legacy amd64 2:1.18.4-0ubuntu0.7 [35.9 kB]
取得:35 http://us-east-2.ec2.archive.ubuntu.com/ubuntu xenial-updates/main amd64 screen-resolution-extra all 0.17.1.1~16.04.1 [11.7 kB]
取得:36 http://us-east-2.ec2.archive.ubuntu.com/ubuntu xenial/main amd64 libvdpau1 amd64 1.1.1-3ubuntu1 [25.5 kB]
取得:37 http://us-east-2.ec2.archive.ubuntu.com/ubuntu xenial/main amd64 libjansson4 amd64 2.7-3 [26.9 kB]
取得:38 http://us-east-2.ec2.archive.ubuntu.com/ubuntu xenial-updates/main amd64 mesa-vdpau-drivers amd64 17.2.8-0ubuntu0~16.04.1 [1,719 kB]
取得:39 file:/var/cuda-repo-9-2-local  cuda-gdb-9-2 9.2.88-1 [2,765 kB]
取得:40 file:/var/cuda-repo-9-2-local  cuda-nvprof-9-2 9.2.88-1 [4,737 kB]
取得:41 file:/var/cuda-repo-9-2-local  cuda-memcheck-9-2 9.2.88-1 [137 kB]
取得:42 file:/var/cuda-repo-9-2-local  cuda-cudart-9-2 9.2.88-1 [97.8 kB]
取得:43 file:/var/cuda-repo-9-2-local  cuda-driver-dev-9-2 9.2.88-1 [11.1 kB]
取得:44 file:/var/cuda-repo-9-2-local  cuda-cudart-dev-9-2 9.2.88-1 [718 kB]
取得:45 file:/var/cuda-repo-9-2-local  cuda-cupti-9-2 9.2.88-1 [1,537 kB]
取得:46 file:/var/cuda-repo-9-2-local  cuda-gpu-library-advisor-9-2 9.2.88-1 [1,002 kB]
取得:47 file:/var/cuda-repo-9-2-local  cuda-nvtx-9-2 9.2.88-1 [24.3 kB]
取得:48 file:/var/cuda-repo-9-2-local  cuda-command-line-tools-9-2 9.2.88-1 [26.3 kB]
取得:49 file:/var/cuda-repo-9-2-local  cuda-nsight-9-2 9.2.88-1 [2,580 B]
取得:50 file:/var/cuda-repo-9-2-local  cuda-nvvp-9-2 9.2.88-1 [2,528 B]
取得:51 http://us-east-2.ec2.archive.ubuntu.com/ubuntu xenial/main amd64 bbswitch-dkms amd64 0.8-3ubuntu1 [11.6 kB]
取得:52 http://us-east-2.ec2.archive.ubuntu.com/ubuntu xenial/main amd64 nvidia-prime amd64 0.8.2 [11.1 kB]
取得:53 file:/var/cuda-repo-9-2-local  cuda-nvrtc-9-2 9.2.88-1 [5,908 kB]
取得:54 file:/var/cuda-repo-9-2-local  cuda-nvrtc-dev-9-2 9.2.88-1 [9,318 B]
取得:55 http://us-east-2.ec2.archive.ubuntu.com/ubuntu xenial/main amd64 vdpau-driver-all amd64 1.1.1-3ubuntu1 [4,674 B]
取得:56 file:/var/cuda-repo-9-2-local  cuda-cusolver-9-2 9.2.88-1 [31.1 MB]
取得:57 file:/var/cuda-repo-9-2-local  cuda-cusolver-dev-9-2 9.2.88-1 [8,184 kB]
取得:58 file:/var/cuda-repo-9-2-local-cublas-update-1  cuda-cublas-9-2 9.2.88.1-1 [49.6 MB]
取得:59 file:/var/cuda-repo-9-2-local-cublas-update-1  cuda-cublas-dev-9-2 9.2.88.1-1 [49.0 MB]
取得:60 file:/var/cuda-repo-9-2-local  cuda-cufft-9-2 9.2.88-1 [51.5 MB]
取得:61 file:/var/cuda-repo-9-2-local  cuda-cufft-dev-9-2 9.2.88-1 [106 MB]
取得:62 file:/var/cuda-repo-9-2-local  cuda-curand-9-2 9.2.88-1 [38.8 MB]
取得:63 file:/var/cuda-repo-9-2-local  cuda-curand-dev-9-2 9.2.88-1 [57.8 MB]                                                                                                                   
取得:64 file:/var/cuda-repo-9-2-local  cuda-cusparse-9-2 9.2.88-1 [27.6 MB]                                                                                                                     
取得:65 file:/var/cuda-repo-9-2-local  cuda-cusparse-dev-9-2 9.2.88-1 [27.8 MB]                                                                                                                 
取得:66 file:/var/cuda-repo-9-2-local  cuda-npp-9-2 9.2.88-1 [52.1 MB]                                                                                                                          
取得:67 file:/var/cuda-repo-9-2-local  cuda-npp-dev-9-2 9.2.88-1 [52.0 MB]                                                                                                                      
取得:68 file:/var/cuda-repo-9-2-local  cuda-nvml-dev-9-2 9.2.88-1 [49.4 kB]                                                                                                                     
取得:69 file:/var/cuda-repo-9-2-local  cuda-nvgraph-9-2 9.2.88-1 [11.7 MB]                                                                                                                      
取得:70 file:/var/cuda-repo-9-2-local  cuda-nvgraph-dev-9-2 9.2.88-1 [30.0 MB]                                                                                                                  
取得:71 file:/var/cuda-repo-9-2-local  cuda-visual-tools-9-2 9.2.88-1 [396 MB]                                                                                                                  
取得:72 file:/var/cuda-repo-9-2-local  cuda-tools-9-2 9.2.88-1 [2,486 B]                                                                                                                        
取得:73 file:/var/cuda-repo-9-2-local  cuda-samples-9-2 9.2.88-1 [76.3 MB]                                                                                                                      
取得:74 file:/var/cuda-repo-9-2-local  cuda-documentation-9-2 9.2.88-1 [50.4 MB]                                                                                                                
取得:75 file:/var/cuda-repo-9-2-local  cuda-libraries-dev-9-2 9.2.88-1 [2,598 B]                                                                                                                
取得:76 file:/var/cuda-repo-9-2-local  cuda-toolkit-9-2 9.2.88-1 [2,828 B]                                                                                                                      
取得:77 file:/var/cuda-repo-9-2-local  nvidia-396 396.26-0ubuntu1 [78.3 MB]                                                                                                                     
取得:78 file:/var/cuda-repo-9-2-local  nvidia-396-dev 396.26-0ubuntu1 [81.5 kB]                                                                                                                 
取得:79 file:/var/cuda-repo-9-2-local  libcuda1-396 396.26-0ubuntu1 [3,457 kB]                                                                                                                  
取得:80 file:/var/cuda-repo-9-2-local  nvidia-modprobe 396.26-0ubuntu1 [18.6 kB]                                                                                                                
取得:81 file:/var/cuda-repo-9-2-local  libxnvctrl0 396.26-0ubuntu1 [19.3 kB]                                                                                                                    
取得:82 file:/var/cuda-repo-9-2-local  nvidia-settings 396.26-0ubuntu1 [957 kB]                                                                                                                 
取得:83 file:/var/cuda-repo-9-2-local  nvidia-opencl-icd-396 396.26-0ubuntu1 [3,554 kB]                                                                                                         
取得:84 file:/var/cuda-repo-9-2-local  cuda-drivers 396.26-1 [2,402 B]                                                                                                                          
取得:85 file:/var/cuda-repo-9-2-local  cuda-libraries-9-2 9.2.88-1 [2,568 B]                                                                                                                    
取得:86 file:/var/cuda-repo-9-2-local  cuda-runtime-9-2 9.2.88-1 [2,530 B]                                                                                                                      
取得:87 file:/var/cuda-repo-9-2-local  cuda-demo-suite-9-2 9.2.88-1 [3,889 kB]                                                                                                                  
取得:88 file:/var/cuda-repo-9-2-local  cuda-9-2 9.2.88-1 [2,560 B]                                                                                                                              
取得:89 file:/var/cuda-repo-9-2-local  cuda 9.2.88-1 [2,508 B]                                                                                                                                  
5,651 kB を 18秒 で取得しました (300 kB/s)                                                                                                                                                      
パッケージからテンプレートを展開しています: 100%
パッケージを事前設定しています ...
以前に未選択のパッケージ freeglut3:amd64 を選択しています。
(データベースを読み込んでいます ... 現在 387051 個のファイルとディレクトリがインストールされています。)
.../freeglut3_2.8.1-2_amd64.deb を展開する準備をしています ...
freeglut3:amd64 (2.8.1-2) を展開しています...
以前に未選択のパッケージ cuda-license-9-2 を選択しています。
.../cuda-license-9-2_9.2.88-1_amd64.deb を展開する準備をしています ...
cuda-license-9-2 (9.2.88-1) を展開しています...
以前に未選択のパッケージ cuda-misc-headers-9-2 を選択しています。
.../cuda-misc-headers-9-2_9.2.88-1_amd64.deb を展開する準備をしています ...
cuda-misc-headers-9-2 (9.2.88-1) を展開しています...
以前に未選択のパッケージ cuda-nvcc-9-2 を選択しています。
.../cuda-nvcc-9-2_9.2.88-1_amd64.deb を展開する準備をしています ...
cuda-nvcc-9-2 (9.2.88-1) を展開しています...
以前に未選択のパッケージ cuda-cuobjdump-9-2 を選択しています。
.../cuda-cuobjdump-9-2_9.2.88-1_amd64.deb を展開する準備をしています ...
cuda-cuobjdump-9-2 (9.2.88-1) を展開しています...
以前に未選択のパッケージ cuda-nvprune-9-2 を選択しています。
.../cuda-nvprune-9-2_9.2.88-1_amd64.deb を展開する準備をしています ...
cuda-nvprune-9-2 (9.2.88-1) を展開しています...
以前に未選択のパッケージ cuda-compiler-9-2 を選択しています。
.../cuda-compiler-9-2_9.2.88-1_amd64.deb を展開する準備をしています ...
cuda-compiler-9-2 (9.2.88-1) を展開しています...
以前に未選択のパッケージ cuda-nvdisasm-9-2 を選択しています。
.../cuda-nvdisasm-9-2_9.2.88-1_amd64.deb を展開する準備をしています ...
cuda-nvdisasm-9-2 (9.2.88-1) を展開しています...
以前に未選択のパッケージ cuda-gdb-9-2 を選択しています。
.../cuda-gdb-9-2_9.2.88-1_amd64.deb を展開する準備をしています ...
cuda-gdb-9-2 (9.2.88-1) を展開しています...
以前に未選択のパッケージ cuda-nvprof-9-2 を選択しています。
.../cuda-nvprof-9-2_9.2.88-1_amd64.deb を展開する準備をしています ...
cuda-nvprof-9-2 (9.2.88-1) を展開しています...
以前に未選択のパッケージ cuda-memcheck-9-2 を選択しています。
.../cuda-memcheck-9-2_9.2.88-1_amd64.deb を展開する準備をしています ...
cuda-memcheck-9-2 (9.2.88-1) を展開しています...
以前に未選択のパッケージ cuda-cudart-9-2 を選択しています。
.../cuda-cudart-9-2_9.2.88-1_amd64.deb を展開する準備をしています ...
cuda-cudart-9-2 (9.2.88-1) を展開しています...
以前に未選択のパッケージ cuda-driver-dev-9-2 を選択しています。
.../cuda-driver-dev-9-2_9.2.88-1_amd64.deb を展開する準備をしています ...
cuda-driver-dev-9-2 (9.2.88-1) を展開しています...
以前に未選択のパッケージ cuda-cudart-dev-9-2 を選択しています。
.../cuda-cudart-dev-9-2_9.2.88-1_amd64.deb を展開する準備をしています ...
cuda-cudart-dev-9-2 (9.2.88-1) を展開しています...
以前に未選択のパッケージ cuda-cupti-9-2 を選択しています。
.../cuda-cupti-9-2_9.2.88-1_amd64.deb を展開する準備をしています ...
cuda-cupti-9-2 (9.2.88-1) を展開しています...
以前に未選択のパッケージ cuda-gpu-library-advisor-9-2 を選択しています。
.../cuda-gpu-library-advisor-9-2_9.2.88-1_amd64.deb を展開する準備をしています ...
cuda-gpu-library-advisor-9-2 (9.2.88-1) を展開しています...
以前に未選択のパッケージ cuda-nvtx-9-2 を選択しています。
.../cuda-nvtx-9-2_9.2.88-1_amd64.deb を展開する準備をしています ...
cuda-nvtx-9-2 (9.2.88-1) を展開しています...
以前に未選択のパッケージ cuda-command-line-tools-9-2 を選択しています。
.../cuda-command-line-tools-9-2_9.2.88-1_amd64.deb を展開する準備をしています ...
cuda-command-line-tools-9-2 (9.2.88-1) を展開しています...
以前に未選択のパッケージ default-jre-headless を選択しています。
.../default-jre-headless_2%3a1.8-56ubuntu2_amd64.deb を展開する準備をしています ...
default-jre-headless (2:1.8-56ubuntu2) を展開しています...
以前に未選択のパッケージ default-jre を選択しています。
.../default-jre_2%3a1.8-56ubuntu2_amd64.deb を展開する準備をしています ...
default-jre (2:1.8-56ubuntu2) を展開しています...
以前に未選択のパッケージ cuda-nsight-9-2 を選択しています。
.../cuda-nsight-9-2_9.2.88-1_amd64.deb を展開する準備をしています ...
cuda-nsight-9-2 (9.2.88-1) を展開しています...
以前に未選択のパッケージ cuda-nvvp-9-2 を選択しています。
.../cuda-nvvp-9-2_9.2.88-1_amd64.deb を展開する準備をしています ...
cuda-nvvp-9-2 (9.2.88-1) を展開しています...
以前に未選択のパッケージ cuda-nvrtc-9-2 を選択しています。
.../cuda-nvrtc-9-2_9.2.88-1_amd64.deb を展開する準備をしています ...
cuda-nvrtc-9-2 (9.2.88-1) を展開しています...
以前に未選択のパッケージ cuda-nvrtc-dev-9-2 を選択しています。
.../cuda-nvrtc-dev-9-2_9.2.88-1_amd64.deb を展開する準備をしています ...
cuda-nvrtc-dev-9-2 (9.2.88-1) を展開しています...
以前に未選択のパッケージ cuda-cusolver-9-2 を選択しています。
.../cuda-cusolver-9-2_9.2.88-1_amd64.deb を展開する準備をしています ...
cuda-cusolver-9-2 (9.2.88-1) を展開しています...
以前に未選択のパッケージ cuda-cusolver-dev-9-2 を選択しています。
.../cuda-cusolver-dev-9-2_9.2.88-1_amd64.deb を展開する準備をしています ...
cuda-cusolver-dev-9-2 (9.2.88-1) を展開しています...
以前に未選択のパッケージ cuda-cublas-9-2 を選択しています。
.../cuda-cublas-9-2_9.2.88.1-1_amd64.deb を展開する準備をしています ...
cuda-cublas-9-2 (9.2.88.1-1) を展開しています...
以前に未選択のパッケージ cuda-cublas-dev-9-2 を選択しています。
.../cuda-cublas-dev-9-2_9.2.88.1-1_amd64.deb を展開する準備をしています ...
cuda-cublas-dev-9-2 (9.2.88.1-1) を展開しています...
以前に未選択のパッケージ cuda-cufft-9-2 を選択しています。
.../cuda-cufft-9-2_9.2.88-1_amd64.deb を展開する準備をしています ...
cuda-cufft-9-2 (9.2.88-1) を展開しています...
以前に未選択のパッケージ cuda-cufft-dev-9-2 を選択しています。
.../cuda-cufft-dev-9-2_9.2.88-1_amd64.deb を展開する準備をしています ...
cuda-cufft-dev-9-2 (9.2.88-1) を展開しています...
以前に未選択のパッケージ cuda-curand-9-2 を選択しています。
.../cuda-curand-9-2_9.2.88-1_amd64.deb を展開する準備をしています ...
cuda-curand-9-2 (9.2.88-1) を展開しています...
以前に未選択のパッケージ cuda-curand-dev-9-2 を選択しています。
.../cuda-curand-dev-9-2_9.2.88-1_amd64.deb を展開する準備をしています ...
cuda-curand-dev-9-2 (9.2.88-1) を展開しています...
以前に未選択のパッケージ cuda-cusparse-9-2 を選択しています。
.../cuda-cusparse-9-2_9.2.88-1_amd64.deb を展開する準備をしています ...
cuda-cusparse-9-2 (9.2.88-1) を展開しています...
以前に未選択のパッケージ cuda-cusparse-dev-9-2 を選択しています。
.../cuda-cusparse-dev-9-2_9.2.88-1_amd64.deb を展開する準備をしています ...
cuda-cusparse-dev-9-2 (9.2.88-1) を展開しています...
以前に未選択のパッケージ cuda-npp-9-2 を選択しています。
.../cuda-npp-9-2_9.2.88-1_amd64.deb を展開する準備をしています ...
cuda-npp-9-2 (9.2.88-1) を展開しています...
以前に未選択のパッケージ cuda-npp-dev-9-2 を選択しています。
.../cuda-npp-dev-9-2_9.2.88-1_amd64.deb を展開する準備をしています ...
cuda-npp-dev-9-2 (9.2.88-1) を展開しています...
以前に未選択のパッケージ cuda-nvml-dev-9-2 を選択しています。
.../cuda-nvml-dev-9-2_9.2.88-1_amd64.deb を展開する準備をしています ...
cuda-nvml-dev-9-2 (9.2.88-1) を展開しています...
以前に未選択のパッケージ cuda-nvgraph-9-2 を選択しています。
.../cuda-nvgraph-9-2_9.2.88-1_amd64.deb を展開する準備をしています ...
cuda-nvgraph-9-2 (9.2.88-1) を展開しています...
以前に未選択のパッケージ cuda-nvgraph-dev-9-2 を選択しています。
.../cuda-nvgraph-dev-9-2_9.2.88-1_amd64.deb を展開する準備をしています ...
cuda-nvgraph-dev-9-2 (9.2.88-1) を展開しています...
以前に未選択のパッケージ cuda-visual-tools-9-2 を選択しています。
.../cuda-visual-tools-9-2_9.2.88-1_amd64.deb を展開する準備をしています ...
cuda-visual-tools-9-2 (9.2.88-1) を展開しています...
以前に未選択のパッケージ cuda-tools-9-2 を選択しています。
.../cuda-tools-9-2_9.2.88-1_amd64.deb を展開する準備をしています ...
cuda-tools-9-2 (9.2.88-1) を展開しています...
以前に未選択のパッケージ libdrm-dev:amd64 を選択しています。
.../libdrm-dev_2.4.83-1~16.04.1_amd64.deb を展開する準備をしています ...
libdrm-dev:amd64 (2.4.83-1~16.04.1) を展開しています...
以前に未選択のパッケージ mesa-common-dev:amd64 を選択しています。
.../mesa-common-dev_17.2.8-0ubuntu0~16.04.1_amd64.deb を展開する準備をしています ...
mesa-common-dev:amd64 (17.2.8-0ubuntu0~16.04.1) を展開しています...
以前に未選択のパッケージ libx11-xcb-dev:amd64 を選択しています。
.../libx11-xcb-dev_2%3a1.6.3-1ubuntu2_amd64.deb を展開する準備をしています ...
libx11-xcb-dev:amd64 (2:1.6.3-1ubuntu2) を展開しています...
以前に未選択のパッケージ libxcb-dri3-dev:amd64 を選択しています。
.../libxcb-dri3-dev_1.11.1-1ubuntu1_amd64.deb を展開する準備をしています ...
libxcb-dri3-dev:amd64 (1.11.1-1ubuntu1) を展開しています...
以前に未選択のパッケージ libxcb-randr0-dev:amd64 を選択しています。
.../libxcb-randr0-dev_1.11.1-1ubuntu1_amd64.deb を展開する準備をしています ...
libxcb-randr0-dev:amd64 (1.11.1-1ubuntu1) を展開しています...
以前に未選択のパッケージ libxcb-shape0-dev:amd64 を選択しています。
.../libxcb-shape0-dev_1.11.1-1ubuntu1_amd64.deb を展開する準備をしています ...
libxcb-shape0-dev:amd64 (1.11.1-1ubuntu1) を展開しています...
以前に未選択のパッケージ libxcb-xfixes0-dev:amd64 を選択しています。
.../libxcb-xfixes0-dev_1.11.1-1ubuntu1_amd64.deb を展開する準備をしています ...
libxcb-xfixes0-dev:amd64 (1.11.1-1ubuntu1) を展開しています...
以前に未選択のパッケージ libxcb-sync-dev:amd64 を選択しています。
.../libxcb-sync-dev_1.11.1-1ubuntu1_amd64.deb を展開する準備をしています ...
libxcb-sync-dev:amd64 (1.11.1-1ubuntu1) を展開しています...
以前に未選択のパッケージ libxcb-present-dev:amd64 を選択しています。
.../libxcb-present-dev_1.11.1-1ubuntu1_amd64.deb を展開する準備をしています ...
libxcb-present-dev:amd64 (1.11.1-1ubuntu1) を展開しています...
以前に未選択のパッケージ libxshmfence-dev:amd64 を選択しています。
.../libxshmfence-dev_1.2-1_amd64.deb を展開する準備をしています ...
libxshmfence-dev:amd64 (1.2-1) を展開しています...
以前に未選択のパッケージ libxcb-dri2-0-dev:amd64 を選択しています。
.../libxcb-dri2-0-dev_1.11.1-1ubuntu1_amd64.deb を展開する準備をしています ...
libxcb-dri2-0-dev:amd64 (1.11.1-1ubuntu1) を展開しています...
以前に未選択のパッケージ libxcb-glx0-dev:amd64 を選択しています。
.../libxcb-glx0-dev_1.11.1-1ubuntu1_amd64.deb を展開する準備をしています ...
libxcb-glx0-dev:amd64 (1.11.1-1ubuntu1) を展開しています...
以前に未選択のパッケージ x11proto-xf86vidmode-dev を選択しています。
.../x11proto-xf86vidmode-dev_2.3.1-2_all.deb を展開する準備をしています ...
x11proto-xf86vidmode-dev (2.3.1-2) を展開しています...
以前に未選択のパッケージ libxxf86vm-dev:amd64 を選択しています。
.../libxxf86vm-dev_1%3a1.1.4-1_amd64.deb を展開する準備をしています ...
libxxf86vm-dev:amd64 (1:1.1.4-1) を展開しています...
以前に未選択のパッケージ x11proto-dri2-dev を選択しています。
.../x11proto-dri2-dev_2.8-2_all.deb を展開する準備をしています ...
x11proto-dri2-dev (2.8-2) を展開しています...
以前に未選択のパッケージ x11proto-gl-dev を選択しています。
.../x11proto-gl-dev_1.4.17-1_all.deb を展開する準備をしています ...
x11proto-gl-dev (1.4.17-1) を展開しています...
以前に未選択のパッケージ libgl1-mesa-dev:amd64 を選択しています。
.../libgl1-mesa-dev_17.2.8-0ubuntu0~16.04.1_amd64.deb を展開する準備をしています ...
libgl1-mesa-dev:amd64 (17.2.8-0ubuntu0~16.04.1) を展開しています...
以前に未選択のパッケージ libglu1-mesa-dev:amd64 を選択しています。
.../libglu1-mesa-dev_9.0.0-2.1_amd64.deb を展開する準備をしています ...
libglu1-mesa-dev:amd64 (9.0.0-2.1) を展開しています...
以前に未選択のパッケージ freeglut3-dev:amd64 を選択しています。
.../freeglut3-dev_2.8.1-2_amd64.deb を展開する準備をしています ...
freeglut3-dev:amd64 (2.8.1-2) を展開しています...
以前に未選択のパッケージ libxmu-headers を選択しています。
.../libxmu-headers_2%3a1.1.2-2_all.deb を展開する準備をしています ...
libxmu-headers (2:1.1.2-2) を展開しています...
以前に未選択のパッケージ libxmu-dev:amd64 を選択しています。
.../libxmu-dev_2%3a1.1.2-2_amd64.deb を展開する準備をしています ...
libxmu-dev:amd64 (2:1.1.2-2) を展開しています...
以前に未選択のパッケージ cuda-samples-9-2 を選択しています。
.../cuda-samples-9-2_9.2.88-1_amd64.deb を展開する準備をしています ...
cuda-samples-9-2 (9.2.88-1) を展開しています...
以前に未選択のパッケージ cuda-documentation-9-2 を選択しています。
.../cuda-documentation-9-2_9.2.88-1_amd64.deb を展開する準備をしています ...
cuda-documentation-9-2 (9.2.88-1) を展開しています...
以前に未選択のパッケージ cuda-libraries-dev-9-2 を選択しています。
.../cuda-libraries-dev-9-2_9.2.88-1_amd64.deb を展開する準備をしています ...
cuda-libraries-dev-9-2 (9.2.88-1) を展開しています...
以前に未選択のパッケージ cuda-toolkit-9-2 を選択しています。
.../cuda-toolkit-9-2_9.2.88-1_amd64.deb を展開する準備をしています ...
cuda-toolkit-9-2 (9.2.88-1) を展開しています...
以前に未選択のパッケージ libc6-i386 を選択しています。
.../libc6-i386_2.23-0ubuntu10_amd64.deb を展開する準備をしています ...
libc6-i386 (2.23-0ubuntu10) を展開しています...
以前に未選択のパッケージ lib32gcc1 を選択しています。
.../lib32gcc1_1%3a6.0.1-0ubuntu1_amd64.deb を展開する準備をしています ...
lib32gcc1 (1:6.0.1-0ubuntu1) を展開しています...
以前に未選択のパッケージ xserver-xorg-legacy を選択しています。
.../xserver-xorg-legacy_2%3a1.18.4-0ubuntu0.7_amd64.deb を展開する準備をしています ...
xserver-xorg-legacy (2:1.18.4-0ubuntu0.7) を展開しています...
以前に未選択のパッケージ nvidia-396 を選択しています。
.../nvidia-396_396.26-0ubuntu1_amd64.deb を展開する準備をしています ...

ERROR: File '/usr/lib/xorg/modules/extensions/libglx.so' is not a symbolic link.


ERROR: File '/usr/lib/xorg/modules/libwfb.so' is not a symbolic link.


WARNING: Your driver installation has been altered since it was initially installed; this may happen, for example, if you have since installed the NVIDIA driver through a mechanism other than
         nvidia-installer (such as your distribution's native package management system).  nvidia-installer will attempt to uninstall as best it can.  Please see the file
         '/var/log/nvidia-uninstall.log' for details.


WARNING: Failed to delete some directories. See /var/log/nvidia-uninstall.log for details.

nvidia-396 (396.26-0ubuntu1) を展開しています...
以前に未選択のパッケージ nvidia-396-dev を選択しています。
.../nvidia-396-dev_396.26-0ubuntu1_amd64.deb を展開する準備をしています ...
nvidia-396-dev (396.26-0ubuntu1) を展開しています...
以前に未選択のパッケージ libcuda1-396 を選択しています。
.../libcuda1-396_396.26-0ubuntu1_amd64.deb を展開する準備をしています ...
libcuda1-396 (396.26-0ubuntu1) を展開しています...
以前に未選択のパッケージ nvidia-modprobe を選択しています。
.../nvidia-modprobe_396.26-0ubuntu1_amd64.deb を展開する準備をしています ...
nvidia-modprobe (396.26-0ubuntu1) を展開しています...
以前に未選択のパッケージ screen-resolution-extra を選択しています。
.../screen-resolution-extra_0.17.1.1~16.04.1_all.deb を展開する準備をしています ...
screen-resolution-extra (0.17.1.1~16.04.1) を展開しています...
以前に未選択のパッケージ libvdpau1:amd64 を選択しています。
.../libvdpau1_1.1.1-3ubuntu1_amd64.deb を展開する準備をしています ...
libvdpau1:amd64 (1.1.1-3ubuntu1) を展開しています...
以前に未選択のパッケージ libjansson4:amd64 を選択しています。
.../libjansson4_2.7-3_amd64.deb を展開する準備をしています ...
libjansson4:amd64 (2.7-3) を展開しています...
以前に未選択のパッケージ libxnvctrl0 を選択しています。
.../libxnvctrl0_396.26-0ubuntu1_amd64.deb を展開する準備をしています ...
libxnvctrl0 (396.26-0ubuntu1) を展開しています...
以前に未選択のパッケージ nvidia-settings を選択しています。
.../nvidia-settings_396.26-0ubuntu1_amd64.deb を展開する準備をしています ...
nvidia-settings (396.26-0ubuntu1) を展開しています...
以前に未選択のパッケージ nvidia-opencl-icd-396 を選択しています。
.../nvidia-opencl-icd-396_396.26-0ubuntu1_amd64.deb を展開する準備をしています ...
nvidia-opencl-icd-396 (396.26-0ubuntu1) を展開しています...
以前に未選択のパッケージ cuda-drivers を選択しています。
.../cuda-drivers_396.26-1_amd64.deb を展開する準備をしています ...
cuda-drivers (396.26-1) を展開しています...
以前に未選択のパッケージ cuda-libraries-9-2 を選択しています。
.../cuda-libraries-9-2_9.2.88-1_amd64.deb を展開する準備をしています ...
cuda-libraries-9-2 (9.2.88-1) を展開しています...
以前に未選択のパッケージ cuda-runtime-9-2 を選択しています。
.../cuda-runtime-9-2_9.2.88-1_amd64.deb を展開する準備をしています ...
cuda-runtime-9-2 (9.2.88-1) を展開しています...
以前に未選択のパッケージ cuda-demo-suite-9-2 を選択しています。
.../cuda-demo-suite-9-2_9.2.88-1_amd64.deb を展開する準備をしています ...
cuda-demo-suite-9-2 (9.2.88-1) を展開しています...
以前に未選択のパッケージ cuda-9-2 を選択しています。
..././cuda-9-2_9.2.88-1_amd64.deb を展開する準備をしています ...
cuda-9-2 (9.2.88-1) を展開しています...
以前に未選択のパッケージ cuda を選択しています。
..././cuda_9.2.88-1_amd64.deb を展開する準備をしています ...
cuda (9.2.88-1) を展開しています...
以前に未選択のパッケージ mesa-vdpau-drivers:amd64 を選択しています。
.../mesa-vdpau-drivers_17.2.8-0ubuntu0~16.04.1_amd64.deb を展開する準備をしています ...
mesa-vdpau-drivers:amd64 (17.2.8-0ubuntu0~16.04.1) を展開しています...
以前に未選択のパッケージ bbswitch-dkms を選択しています。
.../bbswitch-dkms_0.8-3ubuntu1_amd64.deb を展開する準備をしています ...
bbswitch-dkms (0.8-3ubuntu1) を展開しています...
以前に未選択のパッケージ nvidia-prime を選択しています。
.../nvidia-prime_0.8.2_amd64.deb を展開する準備をしています ...
nvidia-prime (0.8.2) を展開しています...
以前に未選択のパッケージ vdpau-driver-all:amd64 を選択しています。
.../vdpau-driver-all_1.1.1-3ubuntu1_amd64.deb を展開する準備をしています ...
vdpau-driver-all:amd64 (1.1.1-3ubuntu1) を展開しています...
man-db (2.7.5-1) のトリガを処理しています ...
libc-bin (2.23-0ubuntu10) のトリガを処理しています ...
ureadahead (0.100.0-19) のトリガを処理しています ...
dbus (1.10.6-1ubuntu3.3) のトリガを処理しています ...
gnome-menus (3.13.3-6ubuntu3.1) のトリガを処理しています ...
desktop-file-utils (0.22-1ubuntu5.1) のトリガを処理しています ...
bamfdaemon (0.5.3~bzr0+16.04.20180209-0ubuntu1) のトリガを処理しています ...
Rebuilding /usr/share/applications/bamf-2.index...
mime-support (3.59ubuntu1) のトリガを処理しています ...
freeglut3:amd64 (2.8.1-2) を設定しています ...
cuda-license-9-2 (9.2.88-1) を設定しています ...
*** LICENSE AGREEMENT ***
By using this software you agree to fully comply with the terms and 
conditions of the EULA (End User License Agreement). The EULA is located
at /usr/local/cuda-9.2/doc/EULA.txt. The EULA can also be found at
http://docs.nvidia.com/cuda/eula/index.html. If you do not agree to the
terms and conditions of the EULA, do not use the software.

cuda-misc-headers-9-2 (9.2.88-1) を設定しています ...
cuda-nvcc-9-2 (9.2.88-1) を設定しています ...
cuda-cuobjdump-9-2 (9.2.88-1) を設定しています ...
cuda-nvprune-9-2 (9.2.88-1) を設定しています ...
cuda-compiler-9-2 (9.2.88-1) を設定しています ...
cuda-nvdisasm-9-2 (9.2.88-1) を設定しています ...
cuda-gdb-9-2 (9.2.88-1) を設定しています ...
cuda-nvprof-9-2 (9.2.88-1) を設定しています ...
cuda-memcheck-9-2 (9.2.88-1) を設定しています ...
cuda-cudart-9-2 (9.2.88-1) を設定しています ...
cuda-driver-dev-9-2 (9.2.88-1) を設定しています ...
cuda-cudart-dev-9-2 (9.2.88-1) を設定しています ...
cuda-cupti-9-2 (9.2.88-1) を設定しています ...
cuda-gpu-library-advisor-9-2 (9.2.88-1) を設定しています ...
cuda-nvtx-9-2 (9.2.88-1) を設定しています ...
cuda-command-line-tools-9-2 (9.2.88-1) を設定しています ...
default-jre-headless (2:1.8-56ubuntu2) を設定しています ...
default-jre (2:1.8-56ubuntu2) を設定しています ...
cuda-nsight-9-2 (9.2.88-1) を設定しています ...
cuda-nvvp-9-2 (9.2.88-1) を設定しています ...
cuda-nvrtc-9-2 (9.2.88-1) を設定しています ...
cuda-nvrtc-dev-9-2 (9.2.88-1) を設定しています ...
cuda-cusolver-9-2 (9.2.88-1) を設定しています ...
cuda-cusolver-dev-9-2 (9.2.88-1) を設定しています ...
cuda-cublas-9-2 (9.2.88.1-1) を設定しています ...
cuda-cublas-dev-9-2 (9.2.88.1-1) を設定しています ...
cuda-cufft-9-2 (9.2.88-1) を設定しています ...
cuda-cufft-dev-9-2 (9.2.88-1) を設定しています ...
cuda-curand-9-2 (9.2.88-1) を設定しています ...
cuda-curand-dev-9-2 (9.2.88-1) を設定しています ...
cuda-cusparse-9-2 (9.2.88-1) を設定しています ...
cuda-cusparse-dev-9-2 (9.2.88-1) を設定しています ...
cuda-npp-9-2 (9.2.88-1) を設定しています ...
cuda-npp-dev-9-2 (9.2.88-1) を設定しています ...
cuda-nvml-dev-9-2 (9.2.88-1) を設定しています ...
cuda-nvgraph-9-2 (9.2.88-1) を設定しています ...
cuda-nvgraph-dev-9-2 (9.2.88-1) を設定しています ...
cuda-visual-tools-9-2 (9.2.88-1) を設定しています ...
cuda-tools-9-2 (9.2.88-1) を設定しています ...
libdrm-dev:amd64 (2.4.83-1~16.04.1) を設定しています ...
mesa-common-dev:amd64 (17.2.8-0ubuntu0~16.04.1) を設定しています ...
libx11-xcb-dev:amd64 (2:1.6.3-1ubuntu2) を設定しています ...
libxcb-dri3-dev:amd64 (1.11.1-1ubuntu1) を設定しています ...
libxcb-randr0-dev:amd64 (1.11.1-1ubuntu1) を設定しています ...
libxcb-shape0-dev:amd64 (1.11.1-1ubuntu1) を設定しています ...
libxcb-xfixes0-dev:amd64 (1.11.1-1ubuntu1) を設定しています ...
libxcb-sync-dev:amd64 (1.11.1-1ubuntu1) を設定しています ...
libxcb-present-dev:amd64 (1.11.1-1ubuntu1) を設定しています ...
libxshmfence-dev:amd64 (1.2-1) を設定しています ...
libxcb-dri2-0-dev:amd64 (1.11.1-1ubuntu1) を設定しています ...
libxcb-glx0-dev:amd64 (1.11.1-1ubuntu1) を設定しています ...
x11proto-xf86vidmode-dev (2.3.1-2) を設定しています ...
libxxf86vm-dev:amd64 (1:1.1.4-1) を設定しています ...
x11proto-dri2-dev (2.8-2) を設定しています ...
x11proto-gl-dev (1.4.17-1) を設定しています ...
libgl1-mesa-dev:amd64 (17.2.8-0ubuntu0~16.04.1) を設定しています ...
libglu1-mesa-dev:amd64 (9.0.0-2.1) を設定しています ...
freeglut3-dev:amd64 (2.8.1-2) を設定しています ...
libxmu-headers (2:1.1.2-2) を設定しています ...
libxmu-dev:amd64 (2:1.1.2-2) を設定しています ...
cuda-samples-9-2 (9.2.88-1) を設定しています ...
cuda-documentation-9-2 (9.2.88-1) を設定しています ...
cuda-libraries-dev-9-2 (9.2.88-1) を設定しています ...
cuda-toolkit-9-2 (9.2.88-1) を設定しています ...
libc6-i386 (2.23-0ubuntu10) を設定しています ...
lib32gcc1 (1:6.0.1-0ubuntu1) を設定しています ...
xserver-xorg-legacy (2:1.18.4-0ubuntu0.7) を設定しています ...
nvidia-396 (396.26-0ubuntu1) を設定しています ...
update-alternatives: /etc/ld.so.conf.d/x86_64-linux-gnu_GL.conf (x86_64-linux-gnu_gl_conf) を提供するために自動モードで /usr/lib/nvidia-396/ld.so.conf を使います
update-alternatives: 警告: 関連する (リンクグループ x86_64-linux-gnu_gl_conf の) ファイル /usr/share/nvidia-396/nvidia-396.grub-gfxpayload が存在しないので、/usr/share/grub-gfxpayload-lists/blacklist/10_proprietary-graphics-drivers の作成をスキップします
update-alternatives: /etc/ld.so.conf.d/x86_64-linux-gnu_EGL.conf (x86_64-linux-gnu_egl_conf) を提供するために自動モードで /usr/lib/nvidia-396/ld.so.conf を使います
update-alternatives: /etc/ld.so.conf.d/i386-linux-gnu_GL.conf (i386-linux-gnu_gl_conf) を提供するために自動モードで /usr/lib/nvidia-396/alt_ld.so.conf を使います
update-alternatives: /etc/ld.so.conf.d/i386-linux-gnu_EGL.conf (i386-linux-gnu_egl_conf) を提供するために自動モードで /usr/lib/nvidia-396/alt_ld.so.conf を使います
update-alternatives: /usr/share/X11/xorg.conf.d/glamoregl.conf (glamor_conf) を提供するために自動モードで /usr/share/nvidia-396/glamor.conf を使います
update-initramfs: deferring update (trigger activated)
update-initramfs: Generating /boot/initrd.img-4.4.0-1055-aws
W: mdadm: /etc/mdadm/mdadm.conf defines no arrays.

A modprobe blacklist file has been created at /etc/modprobe.d to prevent Nouveau from loading. This can be reverted by deleting /etc/modprobe.d/nvidia-graphics-drivers.conf.
A new initrd image has also been created. To revert, please replace /boot/initrd-4.4.0-1055-aws with /boot/initrd-$(uname -r)-backup.

*****************************************************************************
*** Reboot your computer and verify that the NVIDIA graphics driver can   ***
*** be loaded.                                                            ***
*****************************************************************************

INFO:Enable nvidia-396
DEBUG:Parsing /usr/share/ubuntu-drivers-common/quirks/dell_latitude
DEBUG:Parsing /usr/share/ubuntu-drivers-common/quirks/put_your_quirks_here
DEBUG:Parsing /usr/share/ubuntu-drivers-common/quirks/lenovo_thinkpad
システムユーザー `nvidia-persistenced' (UID 126) を追加しています...
新しいグループ `nvidia-persistenced' (GID 131) を追加しています...
新しいユーザー `nvidia-persistenced' (UID 126) をグループ `nvidia-persistenced' に追加しています...
ホームディレクトリ `/' を作成しません。
Loading new nvidia-396-396.26 DKMS files...
First Installation: checking all kernels...
Building for 4.4.0-1055-aws and 4.4.0-1060-aws
Building for architecture x86_64
Building initial module for 4.4.0-1055-aws
Done.

nvidia_396:
Running module version sanity check.
 - Original module
   - No original module exists within this kernel
 - Installation
   - Installing to /lib/modules/4.4.0-1055-aws/updates/dkms/

nvidia_396_modeset.ko:
Running module version sanity check.
 - Original module
   - No original module exists within this kernel
 - Installation
   - Installing to /lib/modules/4.4.0-1055-aws/updates/dkms/

nvidia_396_drm.ko:
Running module version sanity check.
 - Original module
   - No original module exists within this kernel
 - Installation
   - Installing to /lib/modules/4.4.0-1055-aws/updates/dkms/

nvidia_396_uvm.ko:
Running module version sanity check.
 - Original module
   - No original module exists within this kernel
 - Installation
   - Installing to /lib/modules/4.4.0-1055-aws/updates/dkms/

depmod....

DKMS: install completed.
Building initial module for 4.4.0-1060-aws
Done.

nvidia_396:
Running module version sanity check.
 - Original module
   - No original module exists within this kernel
 - Installation
   - Installing to /lib/modules/4.4.0-1060-aws/updates/dkms/

nvidia_396_modeset.ko:
Running module version sanity check.
 - Original module
   - No original module exists within this kernel
 - Installation
   - Installing to /lib/modules/4.4.0-1060-aws/updates/dkms/

nvidia_396_drm.ko:
Running module version sanity check.
 - Original module
   - No original module exists within this kernel
 - Installation
   - Installing to /lib/modules/4.4.0-1060-aws/updates/dkms/

nvidia_396_uvm.ko:
Running module version sanity check.
 - Original module
   - No original module exists within this kernel
 - Installation
   - Installing to /lib/modules/4.4.0-1060-aws/updates/dkms/

depmod....

DKMS: install completed.
nvidia-396-dev (396.26-0ubuntu1) を設定しています ...
libcuda1-396 (396.26-0ubuntu1) を設定しています ...
nvidia-modprobe (396.26-0ubuntu1) を設定しています ...
screen-resolution-extra (0.17.1.1~16.04.1) を設定しています ...
libvdpau1:amd64 (1.1.1-3ubuntu1) を設定しています ...
libjansson4:amd64 (2.7-3) を設定しています ...
libxnvctrl0 (396.26-0ubuntu1) を設定しています ...
nvidia-settings (396.26-0ubuntu1) を設定しています ...
nvidia-opencl-icd-396 (396.26-0ubuntu1) を設定しています ...
cuda-drivers (396.26-1) を設定しています ...
cuda-libraries-9-2 (9.2.88-1) を設定しています ...
cuda-runtime-9-2 (9.2.88-1) を設定しています ...
cuda-demo-suite-9-2 (9.2.88-1) を設定しています ...
cuda-9-2 (9.2.88-1) を設定しています ...
cuda (9.2.88-1) を設定しています ...
mesa-vdpau-drivers:amd64 (17.2.8-0ubuntu0~16.04.1) を設定しています ...
bbswitch-dkms (0.8-3ubuntu1) を設定しています ...
Loading new bbswitch-0.8 DKMS files...
First Installation: checking all kernels...
Building for 4.4.0-1055-aws and 4.4.0-1060-aws
Building initial module for 4.4.0-1055-aws
Done.

bbswitch:
Running module version sanity check.
 - Original module
   - No original module exists within this kernel
 - Installation
   - Installing to /lib/modules/4.4.0-1055-aws/updates/dkms/

depmod....

DKMS: install completed.
Building initial module for 4.4.0-1060-aws
Done.

bbswitch:
Running module version sanity check.
 - Original module
   - No original module exists within this kernel
 - Installation
   - Installing to /lib/modules/4.4.0-1060-aws/updates/dkms/

depmod....

DKMS: install completed.
nvidia-prime (0.8.2) を設定しています ...
vdpau-driver-all:amd64 (1.1.1-3ubuntu1) を設定しています ...
libc-bin (2.23-0ubuntu10) のトリガを処理しています ...
initramfs-tools (0.122ubuntu8.11) のトリガを処理しています ...
update-initramfs: Generating /boot/initrd.img-4.4.0-1060-aws
W: mdadm: /etc/mdadm/mdadm.conf defines no arrays.
dbus (1.10.6-1ubuntu3.3) のトリガを処理しています ...
ureadahead (0.100.0-19) のトリガを処理しています ...
ubuntu@ip-172-31-6-165:~$ sudo reboot
Connection to ec2-13-59-31-191.us-east-2.compute.amazonaws.com closed by remote host.
Connection to ec2-13-59-31-191.us-east-2.compute.amazonaws.com closed.
Mac-b8f6b110a75b-5:~ shunpeik$ ssh KernelP2
ubuntu@ec2-13-59-31-191.us-east-2.compute.amazonaws.com's password: 
galkn4i023bbhp9sgow378hiPermission denied, please try again.
ubuntu@ec2-13-59-31-191.us-east-2.compute.amazonaws.com's password: 
=============================================================================
       __|  __|_  )
       _|  (     /   Deep Learning AMI  (Ubuntu)
      ___|\___|___|
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Please use one of the following commands to start the required environment with the framework of your choice:
for MXNet(+Keras1) with Python3 (CUDA 9/MKL) _________________ source activate mxnet_p36
for MXNet(+Keras1) with Python2 (CUDA 9/MKL) _________________ source activate mxnet_p27
for TensorFlow(+Keras2) with Python3 (CUDA 9/MKL) ____________ source activate tensorflow_p36
for TensorFlow(+Keras2) with Python2 (CUDA 9/MKL) ____________ source activate tensorflow_p27
for Theano(+Keras2) with Python3 (CUDA 9) ____________________ source activate theano_p36
for Theano(+Keras2) with Python2 (CUDA 9) ____________________ source activate theano_p27
for PyTorch with Python3 (CUDA 9) ____________________________ source activate pytorch_p36
for PyTorch with Python2 (CUDA 9) ____________________________ source activate pytorch_p27
for CNTK(+Keras2) with Python3 (CUDA 9) ______________________ source activate cntk_p36
for CNTK(+Keras2) with Python2 (CUDA 9) ______________________ source activate cntk_p27
for Caffe2 with Python2 (CUDA 9) _____________________________ source activate caffe2_p27
for Caffe with Python2 (CUDA 8) ______________________________ source activate caffe_p27
for Caffe with Python3 (CUDA 8) ______________________________ source activate caffe_p35
for Chainer with Python2 (CUDA 9) ____________________________ source activate chainer_p27
for Chainer with Python3 (CUDA 9) ____________________________ source activate chainer_p36
for base Python2 (CUDA 9) ____________________________________ source activate python2
for base Python3 (CUDA 9) ____________________________________ source activate python3

Official Conda User Guide: https://conda.io/docs/user-guide/index.html
AWS Deep Learning AMI Homepage: https://aws.amazon.com/machine-learning/amis/
Developer Guide and Release Notes: https://docs.aws.amazon.com/dlami/latest/devguide/what-is-dlami.html
Support: https://forums.aws.amazon.com/forum.jspa?forumID=263

 * Documentation:  https://help.ubuntu.com
 * Management:     https://landscape.canonical.com
 * Support:        https://ubuntu.com/advantage

  Get cloud support with Ubuntu Advantage Cloud Guest:
    http://www.ubuntu.com/business/services/cloud

3 個のパッケージがアップデート可能です。
3 個のアップデートはセキュリティアップデートです。


ubuntu@ip-172-31-6-165:~$ sudo apt dist-upgrade
パッケージリストを読み込んでいます... 完了
依存関係ツリーを作成しています                
状態情報を読み取っています... 完了
アップグレードパッケージを検出しています... 完了
以下のパッケージが自動でインストールされましたが、もう必要とされていません:
  libaio1 librados2 librbd1 librdmacm1 linux-aws-headers-4.4.0-1054 linux-headers-4.4.0-1054-aws linux-image-4.4.0-1054-aws
これを削除するには 'sudo apt autoremove' を利用してください。
以下のパッケージはアップグレードされます:
  git git-man libelf1
アップグレード: 3 個、新規インストール: 0 個、削除: 0 個、保留: 0 個。
3,937 kB のアーカイブを取得する必要があります。
この操作後に追加で 46.1 kB のディスク容量が消費されます。
続行しますか? [Y/n] 
取得:1 http://us-east-2.ec2.archive.ubuntu.com/ubuntu xenial-updates/main amd64 libelf1 amd64 0.165-3ubuntu1.1 [43.0 kB]
取得:2 http://security.ubuntu.com/ubuntu xenial-security/main amd64 git-man all 1:2.7.4-0ubuntu1.4 [736 kB]
取得:3 http://security.ubuntu.com/ubuntu xenial-security/main amd64 git amd64 1:2.7.4-0ubuntu1.4 [3,158 kB]
3,937 kB を 0秒 で取得しました (11.3 MB/s)
(データベースを読み込んでいます ... 現在 398784 個のファイルとディレクトリがインストールされています。)
.../libelf1_0.165-3ubuntu1.1_amd64.deb を展開する準備をしています ...
libelf1:amd64 (0.165-3ubuntu1.1) で (0.165-3ubuntu1 に) 上書き展開しています ...
.../git-man_1%3a2.7.4-0ubuntu1.4_all.deb を展開する準備をしています ...
git-man (1:2.7.4-0ubuntu1.4) で (1:2.7.4-0ubuntu1.3 に) 上書き展開しています ...
.../git_1%3a2.7.4-0ubuntu1.4_amd64.deb を展開する準備をしています ...
git (1:2.7.4-0ubuntu1.4) で (1:2.7.4-0ubuntu1.3 に) 上書き展開しています ...
libc-bin (2.23-0ubuntu10) のトリガを処理しています ...
man-db (2.7.5-1) のトリガを処理しています ...
libelf1:amd64 (0.165-3ubuntu1.1) を設定しています ...
git-man (1:2.7.4-0ubuntu1.4) を設定しています ...
git (1:2.7.4-0ubuntu1.4) を設定しています ...
libc-bin (2.23-0ubuntu10) のトリガを処理しています ...
ubuntu@ip-172-31-6-165:~$ nvcc --version
nvcc: NVIDIA (R) Cuda compiler driver
Copyright (c) 2005-2018 NVIDIA Corporation
Built on Wed_Apr_11_23:16:29_CDT_2018
Cuda compilation tools, release 9.2, V9.2.88
ubuntu@ip-172-31-6-165:~$ vim ~/.bashrc 
ubuntu@ip-172-31-6-165:~$ wget http://developer.download.nvidia.com/compute/redist/cudnn/v7.1.4/cudnn-9.2-linux-x64-v7.1.tgz
--2018-06-06 07:51:29--  http://developer.download.nvidia.com/compute/redist/cudnn/v7.1.4/cudnn-9.2-linux-x64-v7.1.tgz
developer.download.nvidia.com (developer.download.nvidia.com) をDNSに問いあわせています... 192.229.211.70, 2606:2800:21f:3aa:dcf:37b:1ed6:1fb
developer.download.nvidia.com (developer.download.nvidia.com)|192.229.211.70|:80 に接続しています... 接続しました。
HTTP による接続要求を送信しました、応答を待っています... 200 OK
長さ: 421083972 (402M) [application/x-compressed]
`cudnn-9.2-linux-x64-v7.1.tgz' に保存中

cudnn-9.2-linux-x64-v7.1.tgz                     100%[=======================================================================================================>] 401.58M   136MB/s    時間 3.0s  

2018-06-06 07:51:32 (136 MB/s) - `cudnn-9.2-linux-x64-v7.1.tgz' へ保存完了 [421083972/421083972]

ubuntu@ip-172-31-6-165:~$ tar xzf cudnn-9.2-linux-x64-v7.1.tgz
ubuntu@ip-172-31-6-165:~$ sudo cp -a cuda/lib64/* /usr/local/lib/
ubuntu@ip-172-31-6-165:~$ sudo cp -a cuda/include/* /usr/local/include/
ubuntu@ip-172-31-6-165:~$ sudo ldconfig
ubuntu@ip-172-31-6-165:~$ rm -R -f cuda cudnn-9.2-linux-x64-v7.1.tgz
ubuntu@ip-172-31-6-165:~$ ls
Nvidia_Cloud_EULA.pdf  cuda-repo-ubuntu1604-9-2-local-cublas-update-1_1.0-1_amd64.deb  src        ダウンロード  デスクトップ  ビデオ    ミュージック
anaconda3              cuda-repo-ubuntu1604-9-2-local_9.2.88-1_amd64.deb               tutorials  テンプレート  ドキュメント  ピクチャ  公開
ubuntu@ip-172-31-6-165:~$ rm cuda-*
ubuntu@ip-172-31-6-165:~$ ls
Nvidia_Cloud_EULA.pdf  anaconda3  src  tutorials  ダウンロード  テンプレート  デスクトップ  ドキュメント  ビデオ  ピクチャ  ミュージック  公開
ubuntu@ip-172-31-6-165:~$ vim /etc/default/grub
ubuntu@ip-172-31-6-165:~$ sudo vim /etc/default/grub
ubuntu@ip-172-31-6-165:~$ sudo update-grub
Generating grub configuration file ...
Found linux image: /boot/vmlinuz-4.4.0-1060-aws
Found initrd image: /boot/initrd.img-4.4.0-1060-aws
Found linux image: /boot/vmlinuz-4.4.0-1055-aws
Found initrd image: /boot/initrd.img-4.4.0-1055-aws
Found linux image: /boot/vmlinuz-4.4.0-1054-aws
Found initrd image: /boot/initrd.img-4.4.0-1054-aws
Found linux image: /boot/vmlinuz-4.4.0-1049-aws
Found initrd image: /boot/initrd.img-4.4.0-1049-aws
Found memtest86+ image: /boot/memtest86+.elf
Found memtest86+ image: /boot/memtest86+.bin

done
ubuntu@ip-172-31-6-165:~$ 
ubuntu@ip-172-31-6-165:~$ sudo reboot
Connection to ec2-13-59-31-191.us-east-2.compute.amazonaws.com closed by remote host.
Connection to ec2-13-59-31-191.us-east-2.compute.amazonaws.com closed.
Mac-b8f6b110a75b-5:~ shunpeik$ sudo apt autoremove
Password:
^Csudo: 1 incorrect password attempt
Mac-b8f6b110a75b-5:~ shunpeik$ ssh KernelP2
ubuntu@ec2-13-59-31-191.us-east-2.compute.amazonaws.com's password: 
=============================================================================
       __|  __|_  )
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for MXNet(+Keras1) with Python3 (CUDA 9/MKL) _________________ source activate mxnet_p36
for MXNet(+Keras1) with Python2 (CUDA 9/MKL) _________________ source activate mxnet_p27
for TensorFlow(+Keras2) with Python3 (CUDA 9/MKL) ____________ source activate tensorflow_p36
for TensorFlow(+Keras2) with Python2 (CUDA 9/MKL) ____________ source activate tensorflow_p27
for Theano(+Keras2) with Python3 (CUDA 9) ____________________ source activate theano_p36
for Theano(+Keras2) with Python2 (CUDA 9) ____________________ source activate theano_p27
for PyTorch with Python3 (CUDA 9) ____________________________ source activate pytorch_p36
for PyTorch with Python2 (CUDA 9) ____________________________ source activate pytorch_p27
for CNTK(+Keras2) with Python3 (CUDA 9) ______________________ source activate cntk_p36
for CNTK(+Keras2) with Python2 (CUDA 9) ______________________ source activate cntk_p27
for Caffe2 with Python2 (CUDA 9) _____________________________ source activate caffe2_p27
for Caffe with Python2 (CUDA 8) ______________________________ source activate caffe_p27
for Caffe with Python3 (CUDA 8) ______________________________ source activate caffe_p35
for Chainer with Python2 (CUDA 9) ____________________________ source activate chainer_p27
for Chainer with Python3 (CUDA 9) ____________________________ source activate chainer_p36
for base Python2 (CUDA 9) ____________________________________ source activate python2
for base Python3 (CUDA 9) ____________________________________ source activate python3

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0 個のパッケージがアップデート可能です。
0 個のアップデートはセキュリティアップデートです。


ubuntu@ip-172-31-6-165:~$ sudo reboot
Connection to ec2-13-59-31-191.us-east-2.compute.amazonaws.com closed by remote host.
Connection to ec2-13-59-31-191.us-east-2.compute.amazonaws.com closed.
Mac-b8f6b110a75b-5:~ shunpeik$ ssh KernelP2
ubuntu@ec2-13-59-31-191.us-east-2.compute.amazonaws.com's password: 
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for MXNet(+Keras1) with Python3 (CUDA 9/MKL) _________________ source activate mxnet_p36
for MXNet(+Keras1) with Python2 (CUDA 9/MKL) _________________ source activate mxnet_p27
for TensorFlow(+Keras2) with Python3 (CUDA 9/MKL) ____________ source activate tensorflow_p36
for TensorFlow(+Keras2) with Python2 (CUDA 9/MKL) ____________ source activate tensorflow_p27
for Theano(+Keras2) with Python3 (CUDA 9) ____________________ source activate theano_p36
for Theano(+Keras2) with Python2 (CUDA 9) ____________________ source activate theano_p27
for PyTorch with Python3 (CUDA 9) ____________________________ source activate pytorch_p36
for PyTorch with Python2 (CUDA 9) ____________________________ source activate pytorch_p27
for CNTK(+Keras2) with Python3 (CUDA 9) ______________________ source activate cntk_p36
for CNTK(+Keras2) with Python2 (CUDA 9) ______________________ source activate cntk_p27
for Caffe2 with Python2 (CUDA 9) _____________________________ source activate caffe2_p27
for Caffe with Python2 (CUDA 8) ______________________________ source activate caffe_p27
for Caffe with Python3 (CUDA 8) ______________________________ source activate caffe_p35
for Chainer with Python2 (CUDA 9) ____________________________ source activate chainer_p27
for Chainer with Python3 (CUDA 9) ____________________________ source activate chainer_p36
for base Python2 (CUDA 9) ____________________________________ source activate python2
for base Python3 (CUDA 9) ____________________________________ source activate python3

Official Conda User Guide: https://conda.io/docs/user-guide/index.html
AWS Deep Learning AMI Homepage: https://aws.amazon.com/machine-learning/amis/
Developer Guide and Release Notes: https://docs.aws.amazon.com/dlami/latest/devguide/what-is-dlami.html
Support: https://forums.aws.amazon.com/forum.jspa?forumID=263

 * Documentation:  https://help.ubuntu.com
 * Management:     https://landscape.canonical.com
 * Support:        https://ubuntu.com/advantage

  Get cloud support with Ubuntu Advantage Cloud Guest:
    http://www.ubuntu.com/business/services/cloud

0 個のパッケージがアップデート可能です。
0 個のアップデートはセキュリティアップデートです。


ubuntu@ip-172-31-6-165:~$ sudo apt-get install apt-transport-https apt-utils
パッケージリストを読み込んでいます... 完了
依存関係ツリーを作成しています                
状態情報を読み取っています... 完了
apt-transport-https はすでに最新バージョン (1.2.26) です。
apt-utils はすでに最新バージョン (1.2.26) です。
以下のパッケージが自動でインストールされましたが、もう必要とされていません:
  libaio1 librados2 librbd1 librdmacm1 linux-aws-headers-4.4.0-1054 linux-headers-4.4.0-1054-aws linux-image-4.4.0-1054-aws
これを削除するには 'sudo apt autoremove' を利用してください。
アップグレード: 0 個、新規インストール: 0 個、削除: 0 個、保留: 0 個。
ubuntu@ip-172-31-6-165:~$ sudo apt-get install libsqaodc
パッケージリストを読み込んでいます... 完了
依存関係ツリーを作成しています                
状態情報を読み取っています... 完了
libsqaodc はすでに最新バージョン (0.2.0-0~xenial) です。
以下のパッケージが自動でインストールされましたが、もう必要とされていません:
  libaio1 librados2 librbd1 librdmacm1 linux-aws-headers-4.4.0-1054 linux-headers-4.4.0-1054-aws linux-image-4.4.0-1054-aws
これを削除するには 'sudo apt autoremove' を利用してください。
アップグレード: 0 個、新規インストール: 0 個、削除: 0 個、保留: 0 個。
ubuntu@ip-172-31-6-165:~$ sudo apt autoremove
パッケージリストを読み込んでいます... 完了
依存関係ツリーを作成しています                
状態情報を読み取っています... 完了
以下のパッケージは「削除」されます:
  libaio1 librados2 librbd1 librdmacm1 linux-aws-headers-4.4.0-1054 linux-headers-4.4.0-1054-aws linux-image-4.4.0-1054-aws
アップグレード: 0 個、新規インストール: 0 個、削除: 7 個、保留: 0 個。
この操作後に 147 MB のディスク容量が解放されます。
続行しますか? [Y/n] Y 
(データベースを読み込んでいます ... 現在 398783 個のファイルとディレクトリがインストールされています。)
libaio1:amd64 (0.3.110-2) を削除しています ...
librbd1 (10.2.9-0ubuntu0.16.04.1) を削除しています ...
librados2 (10.2.9-0ubuntu0.16.04.1) を削除しています ...
librdmacm1 (1.0.21-1) を削除しています ...
linux-headers-4.4.0-1054-aws (4.4.0-1054.63) を削除しています ...
linux-aws-headers-4.4.0-1054 (4.4.0-1054.63) を削除しています ...
linux-image-4.4.0-1054-aws (4.4.0-1054.63) を削除しています ...
Examining /etc/kernel/prerm.d.
run-parts: executing /etc/kernel/prerm.d/dkms 4.4.0-1054-aws /boot/vmlinuz-4.4.0-1054-aws
Examining /etc/kernel/postrm.d .
run-parts: executing /etc/kernel/postrm.d/initramfs-tools 4.4.0-1054-aws /boot/vmlinuz-4.4.0-1054-aws
update-initramfs: Deleting /boot/initrd.img-4.4.0-1054-aws
run-parts: executing /etc/kernel/postrm.d/x-grub-legacy-ec2 4.4.0-1054-aws /boot/vmlinuz-4.4.0-1054-aws
Searching for GRUB installation directory ... found: /boot/grub
Searching for default file ... found: /boot/grub/default
Testing for an existing GRUB menu.lst file ... found: /boot/grub/menu.lst
Searching for splash image ... none found, skipping ...
Found kernel: /boot/vmlinuz-4.4.0-1060-aws
Found kernel: /boot/vmlinuz-4.4.0-1055-aws
Found kernel: /boot/vmlinuz-4.4.0-1054-aws
Found kernel: /boot/vmlinuz-4.4.0-1049-aws
Found kernel: /boot/memtest86+.bin
Replacing config file /run/grub/menu.lst with new version
Found kernel: /boot/vmlinuz-4.4.0-1060-aws
Found kernel: /boot/vmlinuz-4.4.0-1055-aws
Found kernel: /boot/vmlinuz-4.4.0-1049-aws
Found kernel: /boot/memtest86+.bin
Replacing config file /run/grub/menu.lst with new version
Updating /boot/grub/menu.lst ... done

run-parts: executing /etc/kernel/postrm.d/zz-update-grub 4.4.0-1054-aws /boot/vmlinuz-4.4.0-1054-aws
Generating grub configuration file ...
Found linux image: /boot/vmlinuz-4.4.0-1060-aws
Found initrd image: /boot/initrd.img-4.4.0-1060-aws
Found linux image: /boot/vmlinuz-4.4.0-1055-aws
Found initrd image: /boot/initrd.img-4.4.0-1055-aws
Found linux image: /boot/vmlinuz-4.4.0-1049-aws
Found initrd image: /boot/initrd.img-4.4.0-1049-aws
Found memtest86+ image: /boot/memtest86+.elf
Found memtest86+ image: /boot/memtest86+.bin
done
libc-bin (2.23-0ubuntu10) のトリガを処理しています ...
ubuntu@ip-172-31-6-165:~$ sudo apt clean
ubuntu@ip-172-31-6-165:~$ sudo apt-get install libsqaodc
パッケージリストを読み込んでいます... 完了
依存関係ツリーを作成しています                
状態情報を読み取っています... 完了
libsqaodc はすでに最新バージョン (0.2.0-0~xenial) です。
アップグレード: 0 個、新規インストール: 0 個、削除: 0 個、保留: 0 個。
ubuntu@ip-172-31-6-165:~$ sudo apt-get install libsqaodc-cuda-9-2
パッケージリストを読み込んでいます... 完了
依存関係ツリーを作成しています                
状態情報を読み取っています... 完了
E: パッケージ libsqaodc-cuda-9-2 が見つかりません
ubuntu@ip-172-31-6-165:~$ sudo apt-get install libsqaodc-cuda-9-0
パッケージリストを読み込んでいます... 完了
依存関係ツリーを作成しています                
状態情報を読み取っています... 完了
インストールすることができないパッケージがありました。おそらく、あり得
ない状況を要求したか、(不安定版ディストリビューションを使用しているの
であれば) 必要なパッケージがまだ作成されていなかったり Incoming から移
動されていないことが考えられます。
以下の情報がこの問題を解決するために役立つかもしれません:

以下のパッケージには満たせない依存関係があります:
 libsqaodc-cuda-9-0 : 依存: cuda-cublas-9-0:amd64 しかし、インストールすることができません
                      依存: cuda-cudart-9-0:amd64 しかし、インストールすることができません
                      依存: cuda-curand-9-0:amd64 しかし、インストールすることができません
                      依存: cuda-cublas-9-0 しかし、インストールすることができません
                      依存: cuda-cudart-9-0 しかし、インストールすることができません
                      依存: cuda-curand-9-0 しかし、インストールすることができません
E: 問題を解決することができません。壊れた変更禁止パッケージがあります。
ubuntu@ip-172-31-6-165:~$ apt-get install automake autoconf libtool libblas-dev
E: ロックファイル /var/lib/dpkg/lock をオープンできません - open (13: 許可がありません)
E: 管理用ディレクトリ (/var/lib/dpkg/) をロックできません。root 権限で実行していますか?
ubuntu@ip-172-31-6-165:~$ sudo apt-get install automake autoconf libtool libblas-dev
パッケージリストを読み込んでいます... 完了
依存関係ツリーを作成しています                
状態情報を読み取っています... 完了
autoconf はすでに最新バージョン (2.69-9) です。
automake はすでに最新バージョン (1:1.15-4ubuntu1) です。
automake は手動でインストールしたと設定されました。
libblas-dev はすでに最新バージョン (3.6.0-2ubuntu2) です。
libblas-dev は手動でインストールしたと設定されました。
libtool はすでに最新バージョン (2.4.6-0.1) です。
アップグレード: 0 個、新規インストール: 0 個、削除: 0 個、保留: 0 個。
ubuntu@ip-172-31-6-165:~$ git clone https://shinmorino.github.com/sqaod.git
Cloning into 'sqaod'...
fatal: repository 'https://shinmorino.github.com/sqaod.git/' not found
ubuntu@ip-172-31-6-165:~$ git clone https://github.com/shinmorino/sqaod.git
Cloning into 'sqaod'...
remote: Counting objects: 6514, done.
remote: Compressing objects: 100% (144/144), done.
remote: Total 6514 (delta 156), reused 182 (delta 109), pack-reused 6261
Receiving objects: 100% (6514/6514), 13.83 MiB | 0 bytes/s, done.
Resolving deltas: 100% (4813/4813), done.
Checking connectivity... done.
ubuntu@ip-172-31-6-165:~$ cd squ
-bash: cd: squ: そのようなファイルやディレクトリはありません
ubuntu@ip-172-31-6-165:~$ cd sqaod/
ubuntu@ip-172-31-6-165:~/sqaod$ ./clone_3rdparty.sh 
Cloning into 'eigen'...
remote: Counting objects: 92276, done.
remote: Compressing objects: 100% (31/31), done.
remote: Total 92276 (delta 5), reused 10 (delta 4), pack-reused 92240
Receiving objects: 100% (92276/92276), 90.07 MiB | 34.16 MiB/s, done.
Resolving deltas: 100% (70618/70618), done.
Checking connectivity... done.
Already on 'master'
Your branch is up-to-date with 'origin/master'.
Already up-to-date.
Note: checking out '3.3.4'.

You are in 'detached HEAD' state. You can look around, make experimental
changes and commit them, and you can discard any commits you make in this
state without impacting any branches by performing another checkout.

If you want to create a new branch to retain commits you create, you may
do so (now or later) by using -b with the checkout command again. Example:

  git checkout -b <new-branch-name>

HEAD is now at dde02fc... bump to 3.3.4
Cloning into 'cub'...
remote: Counting objects: 32642, done.
remote: Total 32642 (delta 0), reused 0 (delta 0), pack-reused 32642
Receiving objects: 100% (32642/32642), 16.49 MiB | 0 bytes/s, done.
Resolving deltas: 100% (28621/28621), done.
Checking connectivity... done.
Branch master set up to track remote branch master from origin.
Switched to a new branch 'master'
Already up-to-date.
Note: checking out 'v1.8.0'.

You are in 'detached HEAD' state. You can look around, make experimental
changes and commit them, and you can discard any commits you make in this
state without impacting any branches by performing another checkout.

If you want to create a new branch to retain commits you create, you may
do so (now or later) by using -b with the checkout command again. Example:

  git checkout -b <new-branch-name>

HEAD is now at c3cceac... update readme to 1.8.0
ubuntu@ip-172-31-6-165:~/sqaod$ ./autogen.sh 
libtoolize: putting auxiliary files in AC_CONFIG_AUX_DIR, 'config'.
libtoolize: linking file 'config/ltmain.sh'
libtoolize: putting macros in AC_CONFIG_MACRO_DIRS, 'm4'.
libtoolize: linking file 'm4/libtool.m4'
libtoolize: linking file 'm4/ltoptions.m4'
libtoolize: linking file 'm4/ltsugar.m4'
libtoolize: linking file 'm4/ltversion.m4'
libtoolize: linking file 'm4/lt~obsolete.m4'
configure.ac:7: installing 'config/compile'
configure.ac:7: installing 'config/config.guess'
configure.ac:7: installing 'config/config.sub'
configure.ac:4: installing 'config/install-sh'
configure.ac:4: installing 'config/missing'
sqaodc/common/Makefile.am: installing 'config/depcomp'
sqaodc/cuda/Makefile.am:41: warning: '%'-style pattern rules are a GNU make extension
sqaodc/cuda/Makefile.am:43: warning: '%'-style pattern rules are a GNU make extension
sqaodc/tests/Makefile.am:47: warning: '%'-style pattern rules are a GNU make extension
sqaodc/tests/Makefile.am:49: warning: '%'-style pattern rules are a GNU make extension
sqaodc/tests/Makefile.am:7: warning: 'LDFLAGS' is a user variable, you should not override it;
sqaodc/tests/Makefile.am:7: use 'AM_LDFLAGS' instead
ubuntu@ip-172-31-6-165:~/sqaod$ ./configure --with-blas --enable-cuda
checking for a BSD-compatible install... /usr/bin/install -c
checking whether build environment is sane... yes
checking for a thread-safe mkdir -p... /bin/mkdir -p
checking for gawk... gawk
checking whether make sets $(MAKE)... yes
checking whether make supports nested variables... yes
checking build system type... x86_64-pc-linux-gnu
checking host system type... x86_64-pc-linux-gnu
checking how to print strings... printf
checking for style of include used by make... GNU
checking for gcc... gcc
checking whether the C compiler works... yes
checking for C compiler default output file name... a.out
checking for suffix of executables... 
checking whether we are cross compiling... no
checking for suffix of object files... o
checking whether we are using the GNU C compiler... yes
checking whether gcc accepts -g... yes
checking for gcc option to accept ISO C89... none needed
checking whether gcc understands -c and -o together... yes
checking dependency style of gcc... gcc3
checking for a sed that does not truncate output... /bin/sed
checking for grep that handles long lines and -e... /bin/grep
checking for egrep... /bin/grep -E
checking for fgrep... /bin/grep -F
checking for ld used by gcc... /usr/bin/ld
checking if the linker (/usr/bin/ld) is GNU ld... yes
checking for BSD- or MS-compatible name lister (nm)... /usr/bin/nm -B
checking the name lister (/usr/bin/nm -B) interface... BSD nm
checking whether ln -s works... yes
checking the maximum length of command line arguments... 1572864
checking how to convert x86_64-pc-linux-gnu file names to x86_64-pc-linux-gnu format... func_convert_file_noop
checking how to convert x86_64-pc-linux-gnu file names to toolchain format... func_convert_file_noop
checking for /usr/bin/ld option to reload object files... -r
checking for objdump... objdump
checking how to recognize dependent libraries... pass_all
checking for dlltool... no
checking how to associate runtime and link libraries... printf %s\n
checking for ar... ar
checking for archiver @FILE support... @
checking for strip... strip
checking for ranlib... ranlib
checking command to parse /usr/bin/nm -B output from gcc object... ok
checking for sysroot... no
checking for a working dd... /bin/dd
checking how to truncate binary pipes... /bin/dd bs=4096 count=1
checking for mt... mt
checking if mt is a manifest tool... no
checking how to run the C preprocessor... gcc -E
checking for ANSI C header files... yes
checking for sys/types.h... yes
checking for sys/stat.h... yes
checking for stdlib.h... yes
checking for string.h... yes
checking for memory.h... yes
checking for strings.h... yes
checking for inttypes.h... yes
checking for stdint.h... yes
checking for unistd.h... yes
checking for dlfcn.h... yes
checking for objdir... .libs
checking if gcc supports -fno-rtti -fno-exceptions... no
checking for gcc option to produce PIC... -fPIC -DPIC
checking if gcc PIC flag -fPIC -DPIC works... yes
checking if gcc static flag -static works... yes
checking if gcc supports -c -o file.o... yes
checking if gcc supports -c -o file.o... (cached) yes
checking whether the gcc linker (/usr/bin/ld -m elf_x86_64) supports shared libraries... yes
checking whether -lc should be explicitly linked in... no
checking dynamic linker characteristics... GNU/Linux ld.so
checking how to hardcode library paths into programs... immediate
checking whether stripping libraries is possible... yes
checking if libtool supports shared libraries... yes
checking whether to build shared libraries... yes
checking whether to build static libraries... no
CUDA Prefix : /usr/local/cuda-9.2
CUDA Version : 9.2
NVCC options :  -gencode arch=compute_35,code=sm_35 -gencode arch=compute_50,code=sm_50 -gencode arch=compute_60,code=sm_60 -gencode arch=compute_61,code=sm_61 -gencode arch=compute_70,code=sm_70 -gencode arch=compute_70,code=compute_70
checking for gcc... (cached) gcc
checking whether we are using the GNU C compiler... (cached) yes
checking whether gcc accepts -g... (cached) yes
checking for gcc option to accept ISO C89... (cached) none needed
checking whether gcc understands -c and -o together... (cached) yes
checking dependency style of gcc... (cached) gcc3
checking for g++... g++
checking whether we are using the GNU C++ compiler... yes
checking whether g++ accepts -g... yes
checking dependency style of g++... gcc3
checking how to run the C++ preprocessor... g++ -E
checking for ld used by g++... /usr/bin/ld -m elf_x86_64
checking if the linker (/usr/bin/ld -m elf_x86_64) is GNU ld... yes
checking whether the g++ linker (/usr/bin/ld -m elf_x86_64) supports shared libraries... yes
checking for g++ option to produce PIC... -fPIC -DPIC
checking if g++ PIC flag -fPIC -DPIC works... yes
checking if g++ static flag -static works... yes
checking if g++ supports -c -o file.o... yes
checking if g++ supports -c -o file.o... (cached) yes
checking whether the g++ linker (/usr/bin/ld -m elf_x86_64) supports shared libraries... yes
checking dynamic linker characteristics... (cached) GNU/Linux ld.so
checking how to hardcode library paths into programs... immediate
checking that generated files are newer than configure... done
configure: creating ./config.status
ijpconfig.status: creating Makefile
config.status: creating sqaodc/Makefile
config.status: creating config/sqaod_config.h
config.status: creating sqaodc/common/Makefile
config.status: creating sqaodc/cpu/Makefile
config.status: creating sqaodc/cuda/Makefile
config.status: creating sqaodc/tests/Makefile
config.status: creating sqaodpy/sqaod/cuda/src/Makefile
config.status: creating sqaodpy/sqaod/cpu/src/Makefile
config.status: creating config/config.h
config.status: executing depfiles commands
config.status: executing libtool commands
sqaod_config.h updated.
ubuntu@ip-172-31-6-165:~/sqaod$ make
Making all in sqaodc
make[1]: ディレクトリ '/home/ubuntu/sqaod/sqaodc' に入ります
Making all in common
make[2]: ディレクトリ '/home/ubuntu/sqaod/sqaodc/common' に入ります
/bin/bash ../../libtool  --tag=CXX   --mode=compile g++ -DHAVE_CONFIG_H -I. -I../../config  -I../.. -I../../sqaodc -I../../3rdparty/eigen   -std=c++11 -g -O2 -msse2 -Wall -ggdb -Wno-format-security -I/home/ubuntu/sqaod -fopenmp -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/eigen -I/usr/local/cuda-9.2/include -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/cub -MT defines.lo -MD -MP -MF .deps/defines.Tpo -c -o defines.lo defines.cpp
libtool: compile:  g++ -DHAVE_CONFIG_H -I. -I../../config -I../.. -I../../sqaodc -I../../3rdparty/eigen -std=c++11 -g -O2 -msse2 -Wall -ggdb -Wno-format-security -I/home/ubuntu/sqaod -fopenmp -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/eigen -I/usr/local/cuda-9.2/include -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/cub -MT defines.lo -MD -MP -MF .deps/defines.Tpo -c defines.cpp  -fPIC -DPIC -o .libs/defines.o
mv -f .deps/defines.Tpo .deps/defines.Plo
/bin/bash ../../libtool  --tag=CXX   --mode=compile g++ -DHAVE_CONFIG_H -I. -I../../config  -I../.. -I../../sqaodc -I../../3rdparty/eigen   -std=c++11 -g -O2 -msse2 -Wall -ggdb -Wno-format-security -I/home/ubuntu/sqaod -fopenmp -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/eigen -I/usr/local/cuda-9.2/include -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/cub -MT Matrix.lo -MD -MP -MF .deps/Matrix.Tpo -c -o Matrix.lo Matrix.cpp
libtool: compile:  g++ -DHAVE_CONFIG_H -I. -I../../config -I../.. -I../../sqaodc -I../../3rdparty/eigen -std=c++11 -g -O2 -msse2 -Wall -ggdb -Wno-format-security -I/home/ubuntu/sqaod -fopenmp -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/eigen -I/usr/local/cuda-9.2/include -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/cub -MT Matrix.lo -MD -MP -MF .deps/Matrix.Tpo -c Matrix.cpp  -fPIC -DPIC -o .libs/Matrix.o
mv -f .deps/Matrix.Tpo .deps/Matrix.Plo
/bin/bash ../../libtool  --tag=CXX   --mode=compile g++ -DHAVE_CONFIG_H -I. -I../../config  -I../.. -I../../sqaodc -I../../3rdparty/eigen   -std=c++11 -g -O2 -msse2 -Wall -ggdb -Wno-format-security -I/home/ubuntu/sqaod -fopenmp -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/eigen -I/usr/local/cuda-9.2/include -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/cub -MT Common.lo -MD -MP -MF .deps/Common.Tpo -c -o Common.lo Common.cpp
libtool: compile:  g++ -DHAVE_CONFIG_H -I. -I../../config -I../.. -I../../sqaodc -I../../3rdparty/eigen -std=c++11 -g -O2 -msse2 -Wall -ggdb -Wno-format-security -I/home/ubuntu/sqaod -fopenmp -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/eigen -I/usr/local/cuda-9.2/include -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/cub -MT Common.lo -MD -MP -MF .deps/Common.Tpo -c Common.cpp  -fPIC -DPIC -o .libs/Common.o
mv -f .deps/Common.Tpo .deps/Common.Plo
/bin/bash ../../libtool  --tag=CXX   --mode=compile g++ -DHAVE_CONFIG_H -I. -I../../config  -I../.. -I../../sqaodc -I../../3rdparty/eigen   -std=c++11 -g -O2 -msse2 -Wall -ggdb -Wno-format-security -I/home/ubuntu/sqaod -fopenmp -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/eigen -I/usr/local/cuda-9.2/include -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/cub -MT Random.lo -MD -MP -MF .deps/Random.Tpo -c -o Random.lo Random.cpp
libtool: compile:  g++ -DHAVE_CONFIG_H -I. -I../../config -I../.. -I../../sqaodc -I../../3rdparty/eigen -std=c++11 -g -O2 -msse2 -Wall -ggdb -Wno-format-security -I/home/ubuntu/sqaod -fopenmp -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/eigen -I/usr/local/cuda-9.2/include -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/cub -MT Random.lo -MD -MP -MF .deps/Random.Tpo -c Random.cpp  -fPIC -DPIC -o .libs/Random.o
mv -f .deps/Random.Tpo .deps/Random.Plo
/bin/bash ../../libtool  --tag=CXX   --mode=compile g++ -DHAVE_CONFIG_H -I. -I../../config  -I../.. -I../../sqaodc -I../../3rdparty/eigen   -std=c++11 -g -O2 -msse2 -Wall -ggdb -Wno-format-security -I/home/ubuntu/sqaod -fopenmp -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/eigen -I/usr/local/cuda-9.2/include -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/cub -MT Preference.lo -MD -MP -MF .deps/Preference.Tpo -c -o Preference.lo Preference.cpp
libtool: compile:  g++ -DHAVE_CONFIG_H -I. -I../../config -I../.. -I../../sqaodc -I../../3rdparty/eigen -std=c++11 -g -O2 -msse2 -Wall -ggdb -Wno-format-security -I/home/ubuntu/sqaod -fopenmp -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/eigen -I/usr/local/cuda-9.2/include -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/cub -MT Preference.lo -MD -MP -MF .deps/Preference.Tpo -c Preference.cpp  -fPIC -DPIC -o .libs/Preference.o
mv -f .deps/Preference.Tpo .deps/Preference.Plo
/bin/bash ../../libtool  --tag=CXX   --mode=compile g++ -DHAVE_CONFIG_H -I. -I../../config  -I../.. -I../../sqaodc -I../../3rdparty/eigen   -std=c++11 -g -O2 -msse2 -Wall -ggdb -Wno-format-security -I/home/ubuntu/sqaod -fopenmp -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/eigen -I/usr/local/cuda-9.2/include -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/cub -MT Solver.lo -MD -MP -MF .deps/Solver.Tpo -c -o Solver.lo Solver.cpp
libtool: compile:  g++ -DHAVE_CONFIG_H -I. -I../../config -I../.. -I../../sqaodc -I../../3rdparty/eigen -std=c++11 -g -O2 -msse2 -Wall -ggdb -Wno-format-security -I/home/ubuntu/sqaod -fopenmp -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/eigen -I/usr/local/cuda-9.2/include -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/cub -MT Solver.lo -MD -MP -MF .deps/Solver.Tpo -c Solver.cpp  -fPIC -DPIC -o .libs/Solver.o
mv -f .deps/Solver.Tpo .deps/Solver.Plo
/bin/bash ../../libtool  --tag=CXX   --mode=compile g++ -DHAVE_CONFIG_H -I. -I../../config  -I../.. -I../../sqaodc -I../../3rdparty/eigen   -std=c++11 -g -O2 -msse2 -Wall -ggdb -Wno-format-security -I/home/ubuntu/sqaod -fopenmp -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/eigen -I/usr/local/cuda-9.2/include -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/cub -MT os_dependent_linux.lo -MD -MP -MF .deps/os_dependent_linux.Tpo -c -o os_dependent_linux.lo os_dependent_linux.cpp
libtool: compile:  g++ -DHAVE_CONFIG_H -I. -I../../config -I../.. -I../../sqaodc -I../../3rdparty/eigen -std=c++11 -g -O2 -msse2 -Wall -ggdb -Wno-format-security -I/home/ubuntu/sqaod -fopenmp -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/eigen -I/usr/local/cuda-9.2/include -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/cub -MT os_dependent_linux.lo -MD -MP -MF .deps/os_dependent_linux.Tpo -c os_dependent_linux.cpp  -fPIC -DPIC -o .libs/os_dependent_linux.o
mv -f .deps/os_dependent_linux.Tpo .deps/os_dependent_linux.Plo
/bin/bash ../../libtool  --tag=CXX   --mode=link g++  -std=c++11 -g -O2 -msse2 -Wall -ggdb -Wno-format-security -I/home/ubuntu/sqaod -fopenmp -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/eigen -I/usr/local/cuda-9.2/include -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/cub   -o libcommon.la  defines.lo Matrix.lo Common.lo Random.lo Preference.lo Solver.lo os_dependent_linux.lo  
libtool: link: ar cru .libs/libcommon.a .libs/defines.o .libs/Matrix.o .libs/Common.o .libs/Random.o .libs/Preference.o .libs/Solver.o .libs/os_dependent_linux.o 
ar: `u' modifier ignored since `D' is the default (see `U')
libtool: link: ranlib .libs/libcommon.a
libtool: link: ( cd ".libs" && rm -f "libcommon.la" && ln -s "../libcommon.la" "libcommon.la" )
make[2]: ディレクトリ '/home/ubuntu/sqaod/sqaodc/common' から出ます
Making all in cpu
make[2]: ディレクトリ '/home/ubuntu/sqaod/sqaodc/cpu' に入ります
/bin/bash ../../libtool  --tag=CXX   --mode=compile g++ -DHAVE_CONFIG_H -I. -I../../config  -I../.. -I../../sqaodc -I../../3rdparty/eigen   -std=c++11 -g -O2 -msse2 -Wall -ggdb -Wno-format-security -I/home/ubuntu/sqaod -fopenmp -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/eigen -I/usr/local/cuda-9.2/include -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/cub -MT CPUFormulas.lo -MD -MP -MF .deps/CPUFormulas.Tpo -c -o CPUFormulas.lo CPUFormulas.cpp
libtool: compile:  g++ -DHAVE_CONFIG_H -I. -I../../config -I../.. -I../../sqaodc -I../../3rdparty/eigen -std=c++11 -g -O2 -msse2 -Wall -ggdb -Wno-format-security -I/home/ubuntu/sqaod -fopenmp -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/eigen -I/usr/local/cuda-9.2/include -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/cub -MT CPUFormulas.lo -MD -MP -MF .deps/CPUFormulas.Tpo -c CPUFormulas.cpp  -fPIC -DPIC -o .libs/CPUFormulas.o
mv -f .deps/CPUFormulas.Tpo .deps/CPUFormulas.Plo
/bin/bash ../../libtool  --tag=CXX   --mode=compile g++ -DHAVE_CONFIG_H -I. -I../../config  -I../.. -I../../sqaodc -I../../3rdparty/eigen   -std=c++11 -g -O2 -msse2 -Wall -ggdb -Wno-format-security -I/home/ubuntu/sqaod -fopenmp -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/eigen -I/usr/local/cuda-9.2/include -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/cub -MT CPUDenseGraphBFSearcher.lo -MD -MP -MF .deps/CPUDenseGraphBFSearcher.Tpo -c -o CPUDenseGraphBFSearcher.lo CPUDenseGraphBFSearcher.cpp
libtool: compile:  g++ -DHAVE_CONFIG_H -I. -I../../config -I../.. -I../../sqaodc -I../../3rdparty/eigen -std=c++11 -g -O2 -msse2 -Wall -ggdb -Wno-format-security -I/home/ubuntu/sqaod -fopenmp -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/eigen -I/usr/local/cuda-9.2/include -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/cub -MT CPUDenseGraphBFSearcher.lo -MD -MP -MF .deps/CPUDenseGraphBFSearcher.Tpo -c CPUDenseGraphBFSearcher.cpp  -fPIC -DPIC -o .libs/CPUDenseGraphBFSearcher.o
mv -f .deps/CPUDenseGraphBFSearcher.Tpo .deps/CPUDenseGraphBFSearcher.Plo
/bin/bash ../../libtool  --tag=CXX   --mode=compile g++ -DHAVE_CONFIG_H -I. -I../../config  -I../.. -I../../sqaodc -I../../3rdparty/eigen   -std=c++11 -g -O2 -msse2 -Wall -ggdb -Wno-format-security -I/home/ubuntu/sqaod -fopenmp -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/eigen -I/usr/local/cuda-9.2/include -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/cub -MT CPUDenseGraphBatchSearch.lo -MD -MP -MF .deps/CPUDenseGraphBatchSearch.Tpo -c -o CPUDenseGraphBatchSearch.lo CPUDenseGraphBatchSearch.cpp
libtool: compile:  g++ -DHAVE_CONFIG_H -I. -I../../config -I../.. -I../../sqaodc -I../../3rdparty/eigen -std=c++11 -g -O2 -msse2 -Wall -ggdb -Wno-format-security -I/home/ubuntu/sqaod -fopenmp -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/eigen -I/usr/local/cuda-9.2/include -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/cub -MT CPUDenseGraphBatchSearch.lo -MD -MP -MF .deps/CPUDenseGraphBatchSearch.Tpo -c CPUDenseGraphBatchSearch.cpp  -fPIC -DPIC -o .libs/CPUDenseGraphBatchSearch.o
mv -f .deps/CPUDenseGraphBatchSearch.Tpo .deps/CPUDenseGraphBatchSearch.Plo
/bin/bash ../../libtool  --tag=CXX   --mode=compile g++ -DHAVE_CONFIG_H -I. -I../../config  -I../.. -I../../sqaodc -I../../3rdparty/eigen   -std=c++11 -g -O2 -msse2 -Wall -ggdb -Wno-format-security -I/home/ubuntu/sqaod -fopenmp -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/eigen -I/usr/local/cuda-9.2/include -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/cub -MT CPUDenseGraphAnnealer.lo -MD -MP -MF .deps/CPUDenseGraphAnnealer.Tpo -c -o CPUDenseGraphAnnealer.lo CPUDenseGraphAnnealer.cpp
libtool: compile:  g++ -DHAVE_CONFIG_H -I. -I../../config -I../.. -I../../sqaodc -I../../3rdparty/eigen -std=c++11 -g -O2 -msse2 -Wall -ggdb -Wno-format-security -I/home/ubuntu/sqaod -fopenmp -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/eigen -I/usr/local/cuda-9.2/include -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/cub -MT CPUDenseGraphAnnealer.lo -MD -MP -MF .deps/CPUDenseGraphAnnealer.Tpo -c CPUDenseGraphAnnealer.cpp  -fPIC -DPIC -o .libs/CPUDenseGraphAnnealer.o
mv -f .deps/CPUDenseGraphAnnealer.Tpo .deps/CPUDenseGraphAnnealer.Plo
/bin/bash ../../libtool  --tag=CXX   --mode=compile g++ -DHAVE_CONFIG_H -I. -I../../config  -I../.. -I../../sqaodc -I../../3rdparty/eigen   -std=c++11 -g -O2 -msse2 -Wall -ggdb -Wno-format-security -I/home/ubuntu/sqaod -fopenmp -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/eigen -I/usr/local/cuda-9.2/include -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/cub -MT CPUBipartiteGraphBFSearcher.lo -MD -MP -MF .deps/CPUBipartiteGraphBFSearcher.Tpo -c -o CPUBipartiteGraphBFSearcher.lo CPUBipartiteGraphBFSearcher.cpp
libtool: compile:  g++ -DHAVE_CONFIG_H -I. -I../../config -I../.. -I../../sqaodc -I../../3rdparty/eigen -std=c++11 -g -O2 -msse2 -Wall -ggdb -Wno-format-security -I/home/ubuntu/sqaod -fopenmp -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/eigen -I/usr/local/cuda-9.2/include -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/cub -MT CPUBipartiteGraphBFSearcher.lo -MD -MP -MF .deps/CPUBipartiteGraphBFSearcher.Tpo -c CPUBipartiteGraphBFSearcher.cpp  -fPIC -DPIC -o .libs/CPUBipartiteGraphBFSearcher.o
mv -f .deps/CPUBipartiteGraphBFSearcher.Tpo .deps/CPUBipartiteGraphBFSearcher.Plo
/bin/bash ../../libtool  --tag=CXX   --mode=compile g++ -DHAVE_CONFIG_H -I. -I../../config  -I../.. -I../../sqaodc -I../../3rdparty/eigen   -std=c++11 -g -O2 -msse2 -Wall -ggdb -Wno-format-security -I/home/ubuntu/sqaod -fopenmp -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/eigen -I/usr/local/cuda-9.2/include -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/cub -MT CPUBipartiteGraphBatchSearch.lo -MD -MP -MF .deps/CPUBipartiteGraphBatchSearch.Tpo -c -o CPUBipartiteGraphBatchSearch.lo CPUBipartiteGraphBatchSearch.cpp
libtool: compile:  g++ -DHAVE_CONFIG_H -I. -I../../config -I../.. -I../../sqaodc -I../../3rdparty/eigen -std=c++11 -g -O2 -msse2 -Wall -ggdb -Wno-format-security -I/home/ubuntu/sqaod -fopenmp -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/eigen -I/usr/local/cuda-9.2/include -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/cub -MT CPUBipartiteGraphBatchSearch.lo -MD -MP -MF .deps/CPUBipartiteGraphBatchSearch.Tpo -c CPUBipartiteGraphBatchSearch.cpp  -fPIC -DPIC -o .libs/CPUBipartiteGraphBatchSearch.o
mv -f .deps/CPUBipartiteGraphBatchSearch.Tpo .deps/CPUBipartiteGraphBatchSearch.Plo
/bin/bash ../../libtool  --tag=CXX   --mode=compile g++ -DHAVE_CONFIG_H -I. -I../../config  -I../.. -I../../sqaodc -I../../3rdparty/eigen   -std=c++11 -g -O2 -msse2 -Wall -ggdb -Wno-format-security -I/home/ubuntu/sqaod -fopenmp -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/eigen -I/usr/local/cuda-9.2/include -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/cub -MT CPUBipartiteGraphAnnealer.lo -MD -MP -MF .deps/CPUBipartiteGraphAnnealer.Tpo -c -o CPUBipartiteGraphAnnealer.lo CPUBipartiteGraphAnnealer.cpp
libtool: compile:  g++ -DHAVE_CONFIG_H -I. -I../../config -I../.. -I../../sqaodc -I../../3rdparty/eigen -std=c++11 -g -O2 -msse2 -Wall -ggdb -Wno-format-security -I/home/ubuntu/sqaod -fopenmp -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/eigen -I/usr/local/cuda-9.2/include -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/cub -MT CPUBipartiteGraphAnnealer.lo -MD -MP -MF .deps/CPUBipartiteGraphAnnealer.Tpo -c CPUBipartiteGraphAnnealer.cpp  -fPIC -DPIC -o .libs/CPUBipartiteGraphAnnealer.o
mv -f .deps/CPUBipartiteGraphAnnealer.Tpo .deps/CPUBipartiteGraphAnnealer.Plo
/bin/bash ../../libtool  --tag=CXX   --mode=compile g++ -DHAVE_CONFIG_H -I. -I../../config  -I../.. -I../../sqaodc -I../../3rdparty/eigen   -std=c++11 -g -O2 -msse2 -Wall -ggdb -Wno-format-security -I/home/ubuntu/sqaod -fopenmp -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/eigen -I/usr/local/cuda-9.2/include -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/cub -MT SharedFormulas.lo -MD -MP -MF .deps/SharedFormulas.Tpo -c -o SharedFormulas.lo SharedFormulas.cpp
libtool: compile:  g++ -DHAVE_CONFIG_H -I. -I../../config -I../.. -I../../sqaodc -I../../3rdparty/eigen -std=c++11 -g -O2 -msse2 -Wall -ggdb -Wno-format-security -I/home/ubuntu/sqaod -fopenmp -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/eigen -I/usr/local/cuda-9.2/include -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/cub -MT SharedFormulas.lo -MD -MP -MF .deps/SharedFormulas.Tpo -c SharedFormulas.cpp  -fPIC -DPIC -o .libs/SharedFormulas.o
mv -f .deps/SharedFormulas.Tpo .deps/SharedFormulas.Plo
/bin/bash ../../libtool  --tag=CXX   --mode=compile g++ -DHAVE_CONFIG_H -I. -I../../config  -I../.. -I../../sqaodc -I../../3rdparty/eigen   -std=c++11 -g -O2 -msse2 -Wall -ggdb -Wno-format-security -I/home/ubuntu/sqaod -fopenmp -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/eigen -I/usr/local/cuda-9.2/include -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/cub -MT api_cpu.lo -MD -MP -MF .deps/api_cpu.Tpo -c -o api_cpu.lo api_cpu.cpp
libtool: compile:  g++ -DHAVE_CONFIG_H -I. -I../../config -I../.. -I../../sqaodc -I../../3rdparty/eigen -std=c++11 -g -O2 -msse2 -Wall -ggdb -Wno-format-security -I/home/ubuntu/sqaod -fopenmp -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/eigen -I/usr/local/cuda-9.2/include -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/cub -MT api_cpu.lo -MD -MP -MF .deps/api_cpu.Tpo -c api_cpu.cpp  -fPIC -DPIC -o .libs/api_cpu.o
mv -f .deps/api_cpu.Tpo .deps/api_cpu.Plo
/bin/bash ../../libtool  --tag=CXX   --mode=compile g++ -DHAVE_CONFIG_H -I. -I../../config  -I../.. -I../../sqaodc -I../../3rdparty/eigen   -std=c++11 -g -O2 -msse2 -Wall -ggdb -Wno-format-security -I/home/ubuntu/sqaod -fopenmp -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/eigen -I/usr/local/cuda-9.2/include -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/cub -MT Dot_SIMD.lo -MD -MP -MF .deps/Dot_SIMD.Tpo -c -o Dot_SIMD.lo Dot_SIMD.cpp
libtool: compile:  g++ -DHAVE_CONFIG_H -I. -I../../config -I../.. -I../../sqaodc -I../../3rdparty/eigen -std=c++11 -g -O2 -msse2 -Wall -ggdb -Wno-format-security -I/home/ubuntu/sqaod -fopenmp -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/eigen -I/usr/local/cuda-9.2/include -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/cub -MT Dot_SIMD.lo -MD -MP -MF .deps/Dot_SIMD.Tpo -c Dot_SIMD.cpp  -fPIC -DPIC -o .libs/Dot_SIMD.o
mv -f .deps/Dot_SIMD.Tpo .deps/Dot_SIMD.Plo
/bin/bash ../../libtool  --tag=CXX   --mode=link g++  -std=c++11 -g -O2 -msse2 -Wall -ggdb -Wno-format-security -I/home/ubuntu/sqaod -fopenmp -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/eigen -I/usr/local/cuda-9.2/include -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/cub   -o libcpu.la  CPUFormulas.lo CPUDenseGraphBFSearcher.lo CPUDenseGraphBatchSearch.lo CPUDenseGraphAnnealer.lo CPUBipartiteGraphBFSearcher.lo CPUBipartiteGraphBatchSearch.lo CPUBipartiteGraphAnnealer.lo SharedFormulas.lo api_cpu.lo Dot_SIMD.lo  
libtool: link: ar cru .libs/libcpu.a .libs/CPUFormulas.o .libs/CPUDenseGraphBFSearcher.o .libs/CPUDenseGraphBatchSearch.o .libs/CPUDenseGraphAnnealer.o .libs/CPUBipartiteGraphBFSearcher.o .libs/CPUBipartiteGraphBatchSearch.o .libs/CPUBipartiteGraphAnnealer.o .libs/SharedFormulas.o .libs/api_cpu.o .libs/Dot_SIMD.o 
ar: `u' modifier ignored since `D' is the default (see `U')
libtool: link: ranlib .libs/libcpu.a
libtool: link: ( cd ".libs" && rm -f "libcpu.la" && ln -s "../libcpu.la" "libcpu.la" )
make[2]: ディレクトリ '/home/ubuntu/sqaod/sqaodc/cpu' から出ます
Making all in cuda
make[2]: ディレクトリ '/home/ubuntu/sqaod/sqaodc/cuda' に入ります
/bin/bash ../../libtool  --tag=CXX   --mode=compile g++ -DHAVE_CONFIG_H -I. -I../../config  -I../.. -I../../sqaodc -I../../3rdparty/cub   -std=c++11 -g -O2 -msse2 -Wall -ggdb -Wno-format-security -I/home/ubuntu/sqaod -fopenmp -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/eigen -I/usr/local/cuda-9.2/include -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/cub -MT cudafuncs.lo -MD -MP -MF .deps/cudafuncs.Tpo -c -o cudafuncs.lo cudafuncs.cpp
libtool: compile:  g++ -DHAVE_CONFIG_H -I. -I../../config -I../.. -I../../sqaodc -I../../3rdparty/cub -std=c++11 -g -O2 -msse2 -Wall -ggdb -Wno-format-security -I/home/ubuntu/sqaod -fopenmp -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/eigen -I/usr/local/cuda-9.2/include -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/cub -MT cudafuncs.lo -MD -MP -MF .deps/cudafuncs.Tpo -c cudafuncs.cpp  -fPIC -DPIC -o .libs/cudafuncs.o
mv -f .deps/cudafuncs.Tpo .deps/cudafuncs.Plo
/bin/bash ../../libtool  --tag=CXX   --mode=compile g++ -DHAVE_CONFIG_H -I. -I../../config  -I../.. -I../../sqaodc -I../../3rdparty/cub   -std=c++11 -g -O2 -msse2 -Wall -ggdb -Wno-format-security -I/home/ubuntu/sqaod -fopenmp -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/eigen -I/usr/local/cuda-9.2/include -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/cub -MT DeviceMemoryStore.lo -MD -MP -MF .deps/DeviceMemoryStore.Tpo -c -o DeviceMemoryStore.lo DeviceMemoryStore.cpp
libtool: compile:  g++ -DHAVE_CONFIG_H -I. -I../../config -I../.. -I../../sqaodc -I../../3rdparty/cub -std=c++11 -g -O2 -msse2 -Wall -ggdb -Wno-format-security -I/home/ubuntu/sqaod -fopenmp -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/eigen -I/usr/local/cuda-9.2/include -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/cub -MT DeviceMemoryStore.lo -MD -MP -MF .deps/DeviceMemoryStore.Tpo -c DeviceMemoryStore.cpp  -fPIC -DPIC -o .libs/DeviceMemoryStore.o
mv -f .deps/DeviceMemoryStore.Tpo .deps/DeviceMemoryStore.Plo
/bin/bash ../../libtool  --tag=CXX   --mode=compile g++ -DHAVE_CONFIG_H -I. -I../../config  -I../.. -I../../sqaodc -I../../3rdparty/cub   -std=c++11 -g -O2 -msse2 -Wall -ggdb -Wno-format-security -I/home/ubuntu/sqaod -fopenmp -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/eigen -I/usr/local/cuda-9.2/include -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/cub -MT Device.lo -MD -MP -MF .deps/Device.Tpo -c -o Device.lo Device.cpp
libtool: compile:  g++ -DHAVE_CONFIG_H -I. -I../../config -I../.. -I../../sqaodc -I../../3rdparty/cub -std=c++11 -g -O2 -msse2 -Wall -ggdb -Wno-format-security -I/home/ubuntu/sqaod -fopenmp -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/eigen -I/usr/local/cuda-9.2/include -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/cub -MT Device.lo -MD -MP -MF .deps/Device.Tpo -c Device.cpp  -fPIC -DPIC -o .libs/Device.o
mv -f .deps/Device.Tpo .deps/Device.Plo
/bin/bash ../../libtool  --tag=CXX   --mode=compile g++ -DHAVE_CONFIG_H -I. -I../../config  -I../.. -I../../sqaodc -I../../3rdparty/cub   -std=c++11 -g -O2 -msse2 -Wall -ggdb -Wno-format-security -I/home/ubuntu/sqaod -fopenmp -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/eigen -I/usr/local/cuda-9.2/include -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/cub -MT DeviceStream.lo -MD -MP -MF .deps/DeviceStream.Tpo -c -o DeviceStream.lo DeviceStream.cpp
libtool: compile:  g++ -DHAVE_CONFIG_H -I. -I../../config -I../.. -I../../sqaodc -I../../3rdparty/cub -std=c++11 -g -O2 -msse2 -Wall -ggdb -Wno-format-security -I/home/ubuntu/sqaod -fopenmp -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/eigen -I/usr/local/cuda-9.2/include -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/cub -MT DeviceStream.lo -MD -MP -MF .deps/DeviceStream.Tpo -c DeviceStream.cpp  -fPIC -DPIC -o .libs/DeviceStream.o
mv -f .deps/DeviceStream.Tpo .deps/DeviceStream.Plo
/bin/bash ../../libtool  --tag=CXX   --mode=compile g++ -DHAVE_CONFIG_H -I. -I../../config  -I../.. -I../../sqaodc -I../../3rdparty/cub   -std=c++11 -g -O2 -msse2 -Wall -ggdb -Wno-format-security -I/home/ubuntu/sqaod -fopenmp -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/eigen -I/usr/local/cuda-9.2/include -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/cub -MT DeviceCopy.lo -MD -MP -MF .deps/DeviceCopy.Tpo -c -o DeviceCopy.lo DeviceCopy.cpp
libtool: compile:  g++ -DHAVE_CONFIG_H -I. -I../../config -I../.. -I../../sqaodc -I../../3rdparty/cub -std=c++11 -g -O2 -msse2 -Wall -ggdb -Wno-format-security -I/home/ubuntu/sqaod -fopenmp -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/eigen -I/usr/local/cuda-9.2/include -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/cub -MT DeviceCopy.lo -MD -MP -MF .deps/DeviceCopy.Tpo -c DeviceCopy.cpp  -fPIC -DPIC -o .libs/DeviceCopy.o
mv -f .deps/DeviceCopy.Tpo .deps/DeviceCopy.Plo
/bin/bash ../../libtool  --tag=CXX   --mode=compile g++ -DHAVE_CONFIG_H -I. -I../../config  -I../.. -I../../sqaodc -I../../3rdparty/cub   -std=c++11 -g -O2 -msse2 -Wall -ggdb -Wno-format-security -I/home/ubuntu/sqaod -fopenmp -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/eigen -I/usr/local/cuda-9.2/include -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/cub -MT DeviceObjectAllocator.lo -MD -MP -MF .deps/DeviceObjectAllocator.Tpo -c -o DeviceObjectAllocator.lo DeviceObjectAllocator.cpp
libtool: compile:  g++ -DHAVE_CONFIG_H -I. -I../../config -I../.. -I../../sqaodc -I../../3rdparty/cub -std=c++11 -g -O2 -msse2 -Wall -ggdb -Wno-format-security -I/home/ubuntu/sqaod -fopenmp -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/eigen -I/usr/local/cuda-9.2/include -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/cub -MT DeviceObjectAllocator.lo -MD -MP -MF .deps/DeviceObjectAllocator.Tpo -c DeviceObjectAllocator.cpp  -fPIC -DPIC -o .libs/DeviceObjectAllocator.o
mv -f .deps/DeviceObjectAllocator.Tpo .deps/DeviceObjectAllocator.Plo
/bin/bash ../../libtool  --tag=CXX   --mode=compile g++ -DHAVE_CONFIG_H -I. -I../../config  -I../.. -I../../sqaodc -I../../3rdparty/cub   -std=c++11 -g -O2 -msse2 -Wall -ggdb -Wno-format-security -I/home/ubuntu/sqaod -fopenmp -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/eigen -I/usr/local/cuda-9.2/include -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/cub -MT HostObjectAllocator.lo -MD -MP -MF .deps/HostObjectAllocator.Tpo -c -o HostObjectAllocator.lo HostObjectAllocator.cpp
libtool: compile:  g++ -DHAVE_CONFIG_H -I. -I../../config -I../.. -I../../sqaodc -I../../3rdparty/cub -std=c++11 -g -O2 -msse2 -Wall -ggdb -Wno-format-security -I/home/ubuntu/sqaod -fopenmp -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/eigen -I/usr/local/cuda-9.2/include -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/cub -MT HostObjectAllocator.lo -MD -MP -MF .deps/HostObjectAllocator.Tpo -c HostObjectAllocator.cpp  -fPIC -DPIC -o .libs/HostObjectAllocator.o
mv -f .deps/HostObjectAllocator.Tpo .deps/HostObjectAllocator.Plo
/bin/bash ../../libtool  --tag=CXX   --mode=compile g++ -DHAVE_CONFIG_H -I. -I../../config  -I../.. -I../../sqaodc -I../../3rdparty/cub   -std=c++11 -g -O2 -msse2 -Wall -ggdb -Wno-format-security -I/home/ubuntu/sqaod -fopenmp -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/eigen -I/usr/local/cuda-9.2/include -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/cub -MT DeviceConstScalars.lo -MD -MP -MF .deps/DeviceConstScalars.Tpo -c -o DeviceConstScalars.lo DeviceConstScalars.cpp
libtool: compile:  g++ -DHAVE_CONFIG_H -I. -I../../config -I../.. -I../../sqaodc -I../../3rdparty/cub -std=c++11 -g -O2 -msse2 -Wall -ggdb -Wno-format-security -I/home/ubuntu/sqaod -fopenmp -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/eigen -I/usr/local/cuda-9.2/include -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/cub -MT DeviceConstScalars.lo -MD -MP -MF .deps/DeviceConstScalars.Tpo -c DeviceConstScalars.cpp  -fPIC -DPIC -o .libs/DeviceConstScalars.o
mv -f .deps/DeviceConstScalars.Tpo .deps/DeviceConstScalars.Plo
/bin/bash ../../libtool  --tag=CXX   --mode=compile g++ -DHAVE_CONFIG_H -I. -I../../config  -I../.. -I../../sqaodc -I../../3rdparty/cub   -std=c++11 -g -O2 -msse2 -Wall -ggdb -Wno-format-security -I/home/ubuntu/sqaod -fopenmp -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/eigen -I/usr/local/cuda-9.2/include -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/cub -MT DeviceMath.lo -MD -MP -MF .deps/DeviceMath.Tpo -c -o DeviceMath.lo DeviceMath.cpp
libtool: compile:  g++ -DHAVE_CONFIG_H -I. -I../../config -I../.. -I../../sqaodc -I../../3rdparty/cub -std=c++11 -g -O2 -msse2 -Wall -ggdb -Wno-format-security -I/home/ubuntu/sqaod -fopenmp -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/eigen -I/usr/local/cuda-9.2/include -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/cub -MT DeviceMath.lo -MD -MP -MF .deps/DeviceMath.Tpo -c DeviceMath.cpp  -fPIC -DPIC -o .libs/DeviceMath.o
mv -f .deps/DeviceMath.Tpo .deps/DeviceMath.Plo
mkdir -p .libs
/usr/local/cuda-9.2/bin/nvcc -M -std=c++11 -gencode arch=compute_35,code=sm_35 -gencode arch=compute_50,code=sm_50 -gencode arch=compute_60,code=sm_60 -gencode arch=compute_61,code=sm_61 -gencode arch=compute_70,code=sm_70 -gencode arch=compute_70,code=compute_70 --expt-extended-lambda -Xcompiler "-DHAVE_CONFIG_H -I. -I../../config  -I../.. -I../../sqaodc -I../../3rdparty/cub   -std=c++11 -g -O2 -msse2 -Wall -ggdb -Wno-format-security -I/home/ubuntu/sqaod -fopenmp -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/eigen -I/usr/local/cuda-9.2/include -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/cub" DeviceKernels.cu  -o .deps/DeviceKernels.Tpo
/usr/local/cuda-9.2/bin/nvcc -c -std=c++11 -gencode arch=compute_35,code=sm_35 -gencode arch=compute_50,code=sm_50 -gencode arch=compute_60,code=sm_60 -gencode arch=compute_61,code=sm_61 -gencode arch=compute_70,code=sm_70 -gencode arch=compute_70,code=compute_70 --expt-extended-lambda -Xcompiler "-DHAVE_CONFIG_H -I. -I../../config  -I../.. -I../../sqaodc -I../../3rdparty/cub   -std=c++11 -g -O2 -msse2 -Wall -ggdb -Wno-format-security -I/home/ubuntu/sqaod -fopenmp -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/eigen -I/usr/local/cuda-9.2/include -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/cub -fPIC"  DeviceKernels.cu  -o .libs/DeviceKernels.o
sed s/DeviceKernels.o/DeviceKernels.lo/ .deps/DeviceKernels.Tpo > .deps/DeviceKernels.Plo
rm -f .deps/DeviceKernels.Tpo
/bin/bash ../../libtool  --tag=CXX   --mode=compile g++ -DHAVE_CONFIG_H -I. -I../../config  -I../.. -I../../sqaodc -I../../3rdparty/cub   -std=c++11 -g -O2 -msse2 -Wall -ggdb -Wno-format-security -I/home/ubuntu/sqaod -fopenmp -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/eigen -I/usr/local/cuda-9.2/include -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/cub -MT DeviceFormulas.lo -MD -MP -MF .deps/DeviceFormulas.Tpo -c -o DeviceFormulas.lo DeviceFormulas.cpp
libtool: compile:  g++ -DHAVE_CONFIG_H -I. -I../../config -I../.. -I../../sqaodc -I../../3rdparty/cub -std=c++11 -g -O2 -msse2 -Wall -ggdb -Wno-format-security -I/home/ubuntu/sqaod -fopenmp -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/eigen -I/usr/local/cuda-9.2/include -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/cub -MT DeviceFormulas.lo -MD -MP -MF .deps/DeviceFormulas.Tpo -c DeviceFormulas.cpp  -fPIC -DPIC -o .libs/DeviceFormulas.o
mv -f .deps/DeviceFormulas.Tpo .deps/DeviceFormulas.Plo
/bin/bash ../../libtool  --tag=CXX   --mode=compile g++ -DHAVE_CONFIG_H -I. -I../../config  -I../.. -I../../sqaodc -I../../3rdparty/cub   -std=c++11 -g -O2 -msse2 -Wall -ggdb -Wno-format-security -I/home/ubuntu/sqaod -fopenmp -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/eigen -I/usr/local/cuda-9.2/include -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/cub -MT CUDADenseGraphBFSearcher.lo -MD -MP -MF .deps/CUDADenseGraphBFSearcher.Tpo -c -o CUDADenseGraphBFSearcher.lo CUDADenseGraphBFSearcher.cpp
libtool: compile:  g++ -DHAVE_CONFIG_H -I. -I../../config -I../.. -I../../sqaodc -I../../3rdparty/cub -std=c++11 -g -O2 -msse2 -Wall -ggdb -Wno-format-security -I/home/ubuntu/sqaod -fopenmp -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/eigen -I/usr/local/cuda-9.2/include -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/cub -MT CUDADenseGraphBFSearcher.lo -MD -MP -MF .deps/CUDADenseGraphBFSearcher.Tpo -c CUDADenseGraphBFSearcher.cpp  -fPIC -DPIC -o .libs/CUDADenseGraphBFSearcher.o
mv -f .deps/CUDADenseGraphBFSearcher.Tpo .deps/CUDADenseGraphBFSearcher.Plo
mkdir -p .libs
/usr/local/cuda-9.2/bin/nvcc -M -std=c++11 -gencode arch=compute_35,code=sm_35 -gencode arch=compute_50,code=sm_50 -gencode arch=compute_60,code=sm_60 -gencode arch=compute_61,code=sm_61 -gencode arch=compute_70,code=sm_70 -gencode arch=compute_70,code=compute_70 --expt-extended-lambda -Xcompiler "-DHAVE_CONFIG_H -I. -I../../config  -I../.. -I../../sqaodc -I../../3rdparty/cub   -std=c++11 -g -O2 -msse2 -Wall -ggdb -Wno-format-security -I/home/ubuntu/sqaod -fopenmp -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/eigen -I/usr/local/cuda-9.2/include -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/cub" DeviceDenseGraphBatchSearch.cu  -o .deps/DeviceDenseGraphBatchSearch.Tpo
/usr/local/cuda-9.2/bin/nvcc -c -std=c++11 -gencode arch=compute_35,code=sm_35 -gencode arch=compute_50,code=sm_50 -gencode arch=compute_60,code=sm_60 -gencode arch=compute_61,code=sm_61 -gencode arch=compute_70,code=sm_70 -gencode arch=compute_70,code=compute_70 --expt-extended-lambda -Xcompiler "-DHAVE_CONFIG_H -I. -I../../config  -I../.. -I../../sqaodc -I../../3rdparty/cub   -std=c++11 -g -O2 -msse2 -Wall -ggdb -Wno-format-security -I/home/ubuntu/sqaod -fopenmp -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/eigen -I/usr/local/cuda-9.2/include -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/cub -fPIC"  DeviceDenseGraphBatchSearch.cu  -o .libs/DeviceDenseGraphBatchSearch.o
sed s/DeviceDenseGraphBatchSearch.o/DeviceDenseGraphBatchSearch.lo/ .deps/DeviceDenseGraphBatchSearch.Tpo > .deps/DeviceDenseGraphBatchSearch.Plo
rm -f .deps/DeviceDenseGraphBatchSearch.Tpo
mkdir -p .libs
/usr/local/cuda-9.2/bin/nvcc -M -std=c++11 -gencode arch=compute_35,code=sm_35 -gencode arch=compute_50,code=sm_50 -gencode arch=compute_60,code=sm_60 -gencode arch=compute_61,code=sm_61 -gencode arch=compute_70,code=sm_70 -gencode arch=compute_70,code=compute_70 --expt-extended-lambda -Xcompiler "-DHAVE_CONFIG_H -I. -I../../config  -I../.. -I../../sqaodc -I../../3rdparty/cub   -std=c++11 -g -O2 -msse2 -Wall -ggdb -Wno-format-security -I/home/ubuntu/sqaod -fopenmp -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/eigen -I/usr/local/cuda-9.2/include -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/cub" DeviceRandomMTGP32.cu  -o .deps/DeviceRandomMTGP32.Tpo
/usr/local/cuda-9.2/bin/nvcc -c -std=c++11 -gencode arch=compute_35,code=sm_35 -gencode arch=compute_50,code=sm_50 -gencode arch=compute_60,code=sm_60 -gencode arch=compute_61,code=sm_61 -gencode arch=compute_70,code=sm_70 -gencode arch=compute_70,code=compute_70 --expt-extended-lambda -Xcompiler "-DHAVE_CONFIG_H -I. -I../../config  -I../.. -I../../sqaodc -I../../3rdparty/cub   -std=c++11 -g -O2 -msse2 -Wall -ggdb -Wno-format-security -I/home/ubuntu/sqaod -fopenmp -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/eigen -I/usr/local/cuda-9.2/include -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/cub -fPIC"  DeviceRandomMTGP32.cu  -o .libs/DeviceRandomMTGP32.o
sed s/DeviceRandomMTGP32.o/DeviceRandomMTGP32.lo/ .deps/DeviceRandomMTGP32.Tpo > .deps/DeviceRandomMTGP32.Plo
rm -f .deps/DeviceRandomMTGP32.Tpo
/bin/bash ../../libtool  --tag=CXX   --mode=compile g++ -DHAVE_CONFIG_H -I. -I../../config  -I../.. -I../../sqaodc -I../../3rdparty/cub   -std=c++11 -g -O2 -msse2 -Wall -ggdb -Wno-format-security -I/home/ubuntu/sqaod -fopenmp -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/eigen -I/usr/local/cuda-9.2/include -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/cub -MT DeviceRandomMT19937.lo -MD -MP -MF .deps/DeviceRandomMT19937.Tpo -c -o DeviceRandomMT19937.lo DeviceRandomMT19937.cpp
libtool: compile:  g++ -DHAVE_CONFIG_H -I. -I../../config -I../.. -I../../sqaodc -I../../3rdparty/cub -std=c++11 -g -O2 -msse2 -Wall -ggdb -Wno-format-security -I/home/ubuntu/sqaod -fopenmp -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/eigen -I/usr/local/cuda-9.2/include -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/cub -MT DeviceRandomMT19937.lo -MD -MP -MF .deps/DeviceRandomMT19937.Tpo -c DeviceRandomMT19937.cpp  -fPIC -DPIC -o .libs/DeviceRandomMT19937.o
mv -f .deps/DeviceRandomMT19937.Tpo .deps/DeviceRandomMT19937.Plo
mkdir -p .libs
/usr/local/cuda-9.2/bin/nvcc -M -std=c++11 -gencode arch=compute_35,code=sm_35 -gencode arch=compute_50,code=sm_50 -gencode arch=compute_60,code=sm_60 -gencode arch=compute_61,code=sm_61 -gencode arch=compute_70,code=sm_70 -gencode arch=compute_70,code=compute_70 --expt-extended-lambda -Xcompiler "-DHAVE_CONFIG_H -I. -I../../config  -I../.. -I../../sqaodc -I../../3rdparty/cub   -std=c++11 -g -O2 -msse2 -Wall -ggdb -Wno-format-security -I/home/ubuntu/sqaod -fopenmp -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/eigen -I/usr/local/cuda-9.2/include -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/cub" CUDADenseGraphAnnealer.cu  -o .deps/CUDADenseGraphAnnealer.Tpo
/usr/local/cuda-9.2/bin/nvcc -c -std=c++11 -gencode arch=compute_35,code=sm_35 -gencode arch=compute_50,code=sm_50 -gencode arch=compute_60,code=sm_60 -gencode arch=compute_61,code=sm_61 -gencode arch=compute_70,code=sm_70 -gencode arch=compute_70,code=compute_70 --expt-extended-lambda -Xcompiler "-DHAVE_CONFIG_H -I. -I../../config  -I../.. -I../../sqaodc -I../../3rdparty/cub   -std=c++11 -g -O2 -msse2 -Wall -ggdb -Wno-format-security -I/home/ubuntu/sqaod -fopenmp -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/eigen -I/usr/local/cuda-9.2/include -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/cub -fPIC"  CUDADenseGraphAnnealer.cu  -o .libs/CUDADenseGraphAnnealer.o
sed s/CUDADenseGraphAnnealer.o/CUDADenseGraphAnnealer.lo/ .deps/CUDADenseGraphAnnealer.Tpo > .deps/CUDADenseGraphAnnealer.Plo
rm -f .deps/CUDADenseGraphAnnealer.Tpo
mkdir -p .libs
/usr/local/cuda-9.2/bin/nvcc -M -std=c++11 -gencode arch=compute_35,code=sm_35 -gencode arch=compute_50,code=sm_50 -gencode arch=compute_60,code=sm_60 -gencode arch=compute_61,code=sm_61 -gencode arch=compute_70,code=sm_70 -gencode arch=compute_70,code=compute_70 --expt-extended-lambda -Xcompiler "-DHAVE_CONFIG_H -I. -I../../config  -I../.. -I../../sqaodc -I../../3rdparty/cub   -std=c++11 -g -O2 -msse2 -Wall -ggdb -Wno-format-security -I/home/ubuntu/sqaod -fopenmp -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/eigen -I/usr/local/cuda-9.2/include -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/cub" DeviceRandomBuffer.cu  -o .deps/DeviceRandomBuffer.Tpo
/usr/local/cuda-9.2/bin/nvcc -c -std=c++11 -gencode arch=compute_35,code=sm_35 -gencode arch=compute_50,code=sm_50 -gencode arch=compute_60,code=sm_60 -gencode arch=compute_61,code=sm_61 -gencode arch=compute_70,code=sm_70 -gencode arch=compute_70,code=compute_70 --expt-extended-lambda -Xcompiler "-DHAVE_CONFIG_H -I. -I../../config  -I../.. -I../../sqaodc -I../../3rdparty/cub   -std=c++11 -g -O2 -msse2 -Wall -ggdb -Wno-format-security -I/home/ubuntu/sqaod -fopenmp -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/eigen -I/usr/local/cuda-9.2/include -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/cub -fPIC"  DeviceRandomBuffer.cu  -o .libs/DeviceRandomBuffer.o
sed s/DeviceRandomBuffer.o/DeviceRandomBuffer.lo/ .deps/DeviceRandomBuffer.Tpo > .deps/DeviceRandomBuffer.Plo
rm -f .deps/DeviceRandomBuffer.Tpo
/bin/bash ../../libtool  --tag=CXX   --mode=compile g++ -DHAVE_CONFIG_H -I. -I../../config  -I../.. -I../../sqaodc -I../../3rdparty/cub   -std=c++11 -g -O2 -msse2 -Wall -ggdb -Wno-format-security -I/home/ubuntu/sqaod -fopenmp -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/eigen -I/usr/local/cuda-9.2/include -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/cub -MT CUDABipartiteGraphBFSearcher.lo -MD -MP -MF .deps/CUDABipartiteGraphBFSearcher.Tpo -c -o CUDABipartiteGraphBFSearcher.lo CUDABipartiteGraphBFSearcher.cpp
libtool: compile:  g++ -DHAVE_CONFIG_H -I. -I../../config -I../.. -I../../sqaodc -I../../3rdparty/cub -std=c++11 -g -O2 -msse2 -Wall -ggdb -Wno-format-security -I/home/ubuntu/sqaod -fopenmp -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/eigen -I/usr/local/cuda-9.2/include -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/cub -MT CUDABipartiteGraphBFSearcher.lo -MD -MP -MF .deps/CUDABipartiteGraphBFSearcher.Tpo -c CUDABipartiteGraphBFSearcher.cpp  -fPIC -DPIC -o .libs/CUDABipartiteGraphBFSearcher.o
mv -f .deps/CUDABipartiteGraphBFSearcher.Tpo .deps/CUDABipartiteGraphBFSearcher.Plo
mkdir -p .libs
/usr/local/cuda-9.2/bin/nvcc -M -std=c++11 -gencode arch=compute_35,code=sm_35 -gencode arch=compute_50,code=sm_50 -gencode arch=compute_60,code=sm_60 -gencode arch=compute_61,code=sm_61 -gencode arch=compute_70,code=sm_70 -gencode arch=compute_70,code=compute_70 --expt-extended-lambda -Xcompiler "-DHAVE_CONFIG_H -I. -I../../config  -I../.. -I../../sqaodc -I../../3rdparty/cub   -std=c++11 -g -O2 -msse2 -Wall -ggdb -Wno-format-security -I/home/ubuntu/sqaod -fopenmp -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/eigen -I/usr/local/cuda-9.2/include -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/cub" DeviceBipartiteGraphBatchSearch.cu  -o .deps/DeviceBipartiteGraphBatchSearch.Tpo
/usr/local/cuda-9.2/bin/nvcc -c -std=c++11 -gencode arch=compute_35,code=sm_35 -gencode arch=compute_50,code=sm_50 -gencode arch=compute_60,code=sm_60 -gencode arch=compute_61,code=sm_61 -gencode arch=compute_70,code=sm_70 -gencode arch=compute_70,code=compute_70 --expt-extended-lambda -Xcompiler "-DHAVE_CONFIG_H -I. -I../../config  -I../.. -I../../sqaodc -I../../3rdparty/cub   -std=c++11 -g -O2 -msse2 -Wall -ggdb -Wno-format-security -I/home/ubuntu/sqaod -fopenmp -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/eigen -I/usr/local/cuda-9.2/include -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/cub -fPIC"  DeviceBipartiteGraphBatchSearch.cu  -o .libs/DeviceBipartiteGraphBatchSearch.o
sed s/DeviceBipartiteGraphBatchSearch.o/DeviceBipartiteGraphBatchSearch.lo/ .deps/DeviceBipartiteGraphBatchSearch.Tpo > .deps/DeviceBipartiteGraphBatchSearch.Plo
rm -f .deps/DeviceBipartiteGraphBatchSearch.Tpo
mkdir -p .libs
/usr/local/cuda-9.2/bin/nvcc -M -std=c++11 -gencode arch=compute_35,code=sm_35 -gencode arch=compute_50,code=sm_50 -gencode arch=compute_60,code=sm_60 -gencode arch=compute_61,code=sm_61 -gencode arch=compute_70,code=sm_70 -gencode arch=compute_70,code=compute_70 --expt-extended-lambda -Xcompiler "-DHAVE_CONFIG_H -I. -I../../config  -I../.. -I../../sqaodc -I../../3rdparty/cub   -std=c++11 -g -O2 -msse2 -Wall -ggdb -Wno-format-security -I/home/ubuntu/sqaod -fopenmp -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/eigen -I/usr/local/cuda-9.2/include -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/cub" CUDABipartiteGraphAnnealer.cu  -o .deps/CUDABipartiteGraphAnnealer.Tpo
/usr/local/cuda-9.2/bin/nvcc -c -std=c++11 -gencode arch=compute_35,code=sm_35 -gencode arch=compute_50,code=sm_50 -gencode arch=compute_60,code=sm_60 -gencode arch=compute_61,code=sm_61 -gencode arch=compute_70,code=sm_70 -gencode arch=compute_70,code=compute_70 --expt-extended-lambda -Xcompiler "-DHAVE_CONFIG_H -I. -I../../config  -I../.. -I../../sqaodc -I../../3rdparty/cub   -std=c++11 -g -O2 -msse2 -Wall -ggdb -Wno-format-security -I/home/ubuntu/sqaod -fopenmp -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/eigen -I/usr/local/cuda-9.2/include -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/cub -fPIC"  CUDABipartiteGraphAnnealer.cu  -o .libs/CUDABipartiteGraphAnnealer.o
sed s/CUDABipartiteGraphAnnealer.o/CUDABipartiteGraphAnnealer.lo/ .deps/CUDABipartiteGraphAnnealer.Tpo > .deps/CUDABipartiteGraphAnnealer.Plo
rm -f .deps/CUDABipartiteGraphAnnealer.Tpo
/bin/bash ../../libtool  --tag=CXX   --mode=compile g++ -DHAVE_CONFIG_H -I. -I../../config  -I../.. -I../../sqaodc -I../../3rdparty/cub   -std=c++11 -g -O2 -msse2 -Wall -ggdb -Wno-format-security -I/home/ubuntu/sqaod -fopenmp -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/eigen -I/usr/local/cuda-9.2/include -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/cub -MT CUDAFormulas.lo -MD -MP -MF .deps/CUDAFormulas.Tpo -c -o CUDAFormulas.lo CUDAFormulas.cpp
libtool: compile:  g++ -DHAVE_CONFIG_H -I. -I../../config -I../.. -I../../sqaodc -I../../3rdparty/cub -std=c++11 -g -O2 -msse2 -Wall -ggdb -Wno-format-security -I/home/ubuntu/sqaod -fopenmp -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/eigen -I/usr/local/cuda-9.2/include -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/cub -MT CUDAFormulas.lo -MD -MP -MF .deps/CUDAFormulas.Tpo -c CUDAFormulas.cpp  -fPIC -DPIC -o .libs/CUDAFormulas.o
mv -f .deps/CUDAFormulas.Tpo .deps/CUDAFormulas.Plo
/bin/bash ../../libtool  --tag=CXX   --mode=compile g++ -DHAVE_CONFIG_H -I. -I../../config  -I../.. -I../../sqaodc -I../../3rdparty/cub   -std=c++11 -g -O2 -msse2 -Wall -ggdb -Wno-format-security -I/home/ubuntu/sqaod -fopenmp -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/eigen -I/usr/local/cuda-9.2/include -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/cub -MT api_cuda.lo -MD -MP -MF .deps/api_cuda.Tpo -c -o api_cuda.lo api_cuda.cpp
libtool: compile:  g++ -DHAVE_CONFIG_H -I. -I../../config -I../.. -I../../sqaodc -I../../3rdparty/cub -std=c++11 -g -O2 -msse2 -Wall -ggdb -Wno-format-security -I/home/ubuntu/sqaod -fopenmp -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/eigen -I/usr/local/cuda-9.2/include -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/cub -MT api_cuda.lo -MD -MP -MF .deps/api_cuda.Tpo -c api_cuda.cpp  -fPIC -DPIC -o .libs/api_cuda.o
mv -f .deps/api_cuda.Tpo .deps/api_cuda.Plo
/bin/bash ../../libtool  --tag=CXX   --mode=link g++  -std=c++11 -g -O2 -msse2 -Wall -ggdb -Wno-format-security -I/home/ubuntu/sqaod -fopenmp -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/eigen -I/usr/local/cuda-9.2/include -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/cub   -o libcuda.la  cudafuncs.lo DeviceMemoryStore.lo Device.lo DeviceStream.lo DeviceCopy.lo DeviceObjectAllocator.lo HostObjectAllocator.lo DeviceConstScalars.lo DeviceMath.lo DeviceKernels.lo DeviceFormulas.lo CUDADenseGraphBFSearcher.lo DeviceDenseGraphBatchSearch.lo DeviceRandomMTGP32.lo DeviceRandomMT19937.lo CUDADenseGraphAnnealer.lo DeviceRandomBuffer.lo CUDABipartiteGraphBFSearcher.lo DeviceBipartiteGraphBatchSearch.lo CUDABipartiteGraphAnnealer.lo CUDAFormulas.lo api_cuda.lo  
libtool: link: ar cru .libs/libcuda.a .libs/cudafuncs.o .libs/DeviceMemoryStore.o .libs/Device.o .libs/DeviceStream.o .libs/DeviceCopy.o .libs/DeviceObjectAllocator.o .libs/HostObjectAllocator.o .libs/DeviceConstScalars.o .libs/DeviceMath.o .libs/DeviceKernels.o .libs/DeviceFormulas.o .libs/CUDADenseGraphBFSearcher.o .libs/DeviceDenseGraphBatchSearch.o .libs/DeviceRandomMTGP32.o .libs/DeviceRandomMT19937.o .libs/CUDADenseGraphAnnealer.o .libs/DeviceRandomBuffer.o .libs/CUDABipartiteGraphBFSearcher.o .libs/DeviceBipartiteGraphBatchSearch.o .libs/CUDABipartiteGraphAnnealer.o .libs/CUDAFormulas.o .libs/api_cuda.o 
ar: `u' modifier ignored since `D' is the default (see `U')
libtool: link: ranlib .libs/libcuda.a
libtool: link: ( cd ".libs" && rm -f "libcuda.la" && ln -s "../libcuda.la" "libcuda.la" )
make[2]: ディレクトリ '/home/ubuntu/sqaod/sqaodc/cuda' から出ます
Making all in tests
make[2]: ディレクトリ '/home/ubuntu/sqaod/sqaodc/tests' に入ります
make[2]: 'all' に対して行うべき事はありません.
make[2]: ディレクトリ '/home/ubuntu/sqaod/sqaodc/tests' から出ます
make[2]: ディレクトリ '/home/ubuntu/sqaod/sqaodc' に入ります
/bin/bash ../libtool  --tag=CC   --mode=link gcc  -g -O2 -msse2 -Wall -ggdb -Wno-format-security -I/home/ubuntu/sqaod -fopenmp   -o libsqaodc.la -rpath /usr/local/lib/x86_64-linux-gnu  ../sqaodc/common/libcommon.la ../sqaodc/cpu/libcpu.la -lblas -ldl 
libtool: link: gcc -shared  -fPIC -DPIC  -Wl,--whole-archive ../sqaodc/common/.libs/libcommon.a ../sqaodc/cpu/.libs/libcpu.a -Wl,--no-whole-archive  -lblas -ldl  -g -O2 -msse2 -ggdb -fopenmp   -fopenmp -Wl,-soname -Wl,libsqaodc.so.0 -o .libs/libsqaodc.so.0.0.0
libtool: link: (cd ".libs" && rm -f "libsqaodc.so.0" && ln -s "libsqaodc.so.0.0.0" "libsqaodc.so.0")
libtool: link: (cd ".libs" && rm -f "libsqaodc.so" && ln -s "libsqaodc.so.0.0.0" "libsqaodc.so")
libtool: link: ( cd ".libs" && rm -f "libsqaodc.la" && ln -s "../libsqaodc.la" "libsqaodc.la" )
/bin/bash ../libtool  --tag=CC   --mode=link gcc  -g -O2 -msse2 -Wall -ggdb -Wno-format-security -I/home/ubuntu/sqaod -fopenmp -version-info 0:0:0 -L/usr/local/cuda-9.2/lib64 -lcublas -lcurand -lcudart  -o libsqaodc_cuda.la -rpath /usr/local/lib/x86_64-linux-gnu  cuda/libcuda.la libsqaodc.la 
libtool: link: gcc -shared  -fPIC -DPIC  -Wl,--whole-archive cuda/.libs/libcuda.a -Wl,--no-whole-archive  -Wl,-rpath -Wl,/home/ubuntu/sqaod/sqaodc/.libs -Wl,-rpath -Wl,/usr/local/lib/x86_64-linux-gnu -L/usr/local/cuda-9.2/lib64 -lcublas -lcurand -lcudart ./.libs/libsqaodc.so -lblas -ldl  -g -O2 -msse2 -ggdb -fopenmp   -fopenmp -Wl,-soname -Wl,libsqaodc_cuda.so.0 -o .libs/libsqaodc_cuda.so.0.0.0
libtool: link: (cd ".libs" && rm -f "libsqaodc_cuda.so.0" && ln -s "libsqaodc_cuda.so.0.0.0" "libsqaodc_cuda.so.0")
libtool: link: (cd ".libs" && rm -f "libsqaodc_cuda.so" && ln -s "libsqaodc_cuda.so.0.0.0" "libsqaodc_cuda.so")
libtool: link: ( cd ".libs" && rm -f "libsqaodc_cuda.la" && ln -s "../libsqaodc_cuda.la" "libsqaodc_cuda.la" )
make[2]: ディレクトリ '/home/ubuntu/sqaod/sqaodc' から出ます
make[1]: ディレクトリ '/home/ubuntu/sqaod/sqaodc' から出ます
make[1]: ディレクトリ '/home/ubuntu/sqaod' に入ります
make[1]: 'all-am' に対して行うべき事はありません.
make[1]: ディレクトリ '/home/ubuntu/sqaod' から出ます
ubuntu@ip-172-31-6-165:~/sqaod$ sudo make install
Making install in sqaodc
make[1]: ディレクトリ '/home/ubuntu/sqaod/sqaodc' に入ります
Making install in common
make[2]: ディレクトリ '/home/ubuntu/sqaod/sqaodc/common' に入ります
make[3]: ディレクトリ '/home/ubuntu/sqaod/sqaodc/common' に入ります
make[3]: 'install-exec-am' に対して行うべき事はありません.
make[3]: 'install-data-am' に対して行うべき事はありません.
make[3]: ディレクトリ '/home/ubuntu/sqaod/sqaodc/common' から出ます
make[2]: ディレクトリ '/home/ubuntu/sqaod/sqaodc/common' から出ます
Making install in cpu
make[2]: ディレクトリ '/home/ubuntu/sqaod/sqaodc/cpu' に入ります
make[3]: ディレクトリ '/home/ubuntu/sqaod/sqaodc/cpu' に入ります
make[3]: 'install-exec-am' に対して行うべき事はありません.
make[3]: 'install-data-am' に対して行うべき事はありません.
make[3]: ディレクトリ '/home/ubuntu/sqaod/sqaodc/cpu' から出ます
make[2]: ディレクトリ '/home/ubuntu/sqaod/sqaodc/cpu' から出ます
Making install in cuda
make[2]: ディレクトリ '/home/ubuntu/sqaod/sqaodc/cuda' に入ります
make[3]: ディレクトリ '/home/ubuntu/sqaod/sqaodc/cuda' に入ります
make[3]: 'install-exec-am' に対して行うべき事はありません.
make[3]: 'install-data-am' に対して行うべき事はありません.
make[3]: ディレクトリ '/home/ubuntu/sqaod/sqaodc/cuda' から出ます
make[2]: ディレクトリ '/home/ubuntu/sqaod/sqaodc/cuda' から出ます
Making install in tests
make[2]: ディレクトリ '/home/ubuntu/sqaod/sqaodc/tests' に入ります
make[3]: ディレクトリ '/home/ubuntu/sqaod/sqaodc/tests' に入ります
make[3]: 'install-exec-am' に対して行うべき事はありません.
make[3]: 'install-data-am' に対して行うべき事はありません.
make[3]: ディレクトリ '/home/ubuntu/sqaod/sqaodc/tests' から出ます
make[2]: ディレクトリ '/home/ubuntu/sqaod/sqaodc/tests' から出ます
make[2]: ディレクトリ '/home/ubuntu/sqaod/sqaodc' に入ります
make[3]: ディレクトリ '/home/ubuntu/sqaod/sqaodc' に入ります
 /bin/mkdir -p '/usr/local/lib/x86_64-linux-gnu'
 /bin/bash ../libtool   --mode=install /usr/bin/install -c   libsqaodc.la libsqaodc_cuda.la '/usr/local/lib/x86_64-linux-gnu'
libtool: install: /usr/bin/install -c .libs/libsqaodc.so.0.0.0 /usr/local/lib/x86_64-linux-gnu/libsqaodc.so.0.0.0
libtool: install: (cd /usr/local/lib/x86_64-linux-gnu && { ln -s -f libsqaodc.so.0.0.0 libsqaodc.so.0 || { rm -f libsqaodc.so.0 && ln -s libsqaodc.so.0.0.0 libsqaodc.so.0; }; })
libtool: install: (cd /usr/local/lib/x86_64-linux-gnu && { ln -s -f libsqaodc.so.0.0.0 libsqaodc.so || { rm -f libsqaodc.so && ln -s libsqaodc.so.0.0.0 libsqaodc.so; }; })
libtool: install: /usr/bin/install -c .libs/libsqaodc.lai /usr/local/lib/x86_64-linux-gnu/libsqaodc.la
libtool: warning: relinking 'libsqaodc_cuda.la'
libtool: install: (cd /home/ubuntu/sqaod/sqaodc; /bin/bash "/home/ubuntu/sqaod/libtool"  --tag CC --mode=relink gcc -g -O2 -msse2 -Wall -ggdb -Wno-format-security -I/home/ubuntu/sqaod -fopenmp -version-info 0:0:0 -L/usr/local/cuda-9.2/lib64 -lcublas -lcurand -lcudart -o libsqaodc_cuda.la -rpath /usr/local/lib/x86_64-linux-gnu cuda/libcuda.la libsqaodc.la )
libtool: relink: gcc -shared  -fPIC -DPIC  -Wl,--whole-archive cuda/.libs/libcuda.a -Wl,--no-whole-archive  -Wl,-rpath -Wl,/usr/local/lib/x86_64-linux-gnu -L/usr/local/cuda-9.2/lib64 -lcublas -lcurand -lcudart -L/usr/local/lib/x86_64-linux-gnu -lsqaodc -lblas -ldl  -g -O2 -msse2 -ggdb -fopenmp   -fopenmp -Wl,-soname -Wl,libsqaodc_cuda.so.0 -o .libs/libsqaodc_cuda.so.0.0.0
libtool: install: /usr/bin/install -c .libs/libsqaodc_cuda.so.0.0.0T /usr/local/lib/x86_64-linux-gnu/libsqaodc_cuda.so.0.0.0
libtool: install: (cd /usr/local/lib/x86_64-linux-gnu && { ln -s -f libsqaodc_cuda.so.0.0.0 libsqaodc_cuda.so.0 || { rm -f libsqaodc_cuda.so.0 && ln -s libsqaodc_cuda.so.0.0.0 libsqaodc_cuda.so.0; }; })
libtool: install: (cd /usr/local/lib/x86_64-linux-gnu && { ln -s -f libsqaodc_cuda.so.0.0.0 libsqaodc_cuda.so || { rm -f libsqaodc_cuda.so && ln -s libsqaodc_cuda.so.0.0.0 libsqaodc_cuda.so; }; })
libtool: install: /usr/bin/install -c .libs/libsqaodc_cuda.lai /usr/local/lib/x86_64-linux-gnu/libsqaodc_cuda.la
libtool: finish: PATH="/usr/local/sbin:/usr/local/bin:/usr/sbin:/usr/bin:/sbin:/bin:/snap/bin:/sbin" ldconfig -n /usr/local/lib/x86_64-linux-gnu
----------------------------------------------------------------------
Libraries have been installed in:
   /usr/local/lib/x86_64-linux-gnu

If you ever happen to want to link against installed libraries
in a given directory, LIBDIR, you must either use libtool, and
specify the full pathname of the library, or use the '-LLIBDIR'
flag during linking and do at least one of the following:
   - add LIBDIR to the 'LD_LIBRARY_PATH' environment variable
     during execution
   - add LIBDIR to the 'LD_RUN_PATH' environment variable
     during linking
   - use the '-Wl,-rpath -Wl,LIBDIR' linker flag
   - have your system administrator add LIBDIR to '/etc/ld.so.conf'

See any operating system documentation about shared libraries for
more information, such as the ld(1) and ld.so(8) manual pages.
----------------------------------------------------------------------
make[3]: 'install-data-am' に対して行うべき事はありません.
make[3]: ディレクトリ '/home/ubuntu/sqaod/sqaodc' から出ます
make[2]: ディレクトリ '/home/ubuntu/sqaod/sqaodc' から出ます
make[1]: ディレクトリ '/home/ubuntu/sqaod/sqaodc' から出ます
make[1]: ディレクトリ '/home/ubuntu/sqaod' に入ります
make[2]: ディレクトリ '/home/ubuntu/sqaod' に入ります
make[2]: 'install-exec-am' に対して行うべき事はありません.
make[2]: 'install-data-am' に対して行うべき事はありません.
make[2]: ディレクトリ '/home/ubuntu/sqaod' から出ます
make[1]: ディレクトリ '/home/ubuntu/sqaod' から出ます
ubuntu@ip-172-31-6-165:~/sqaod$ sudo apt-get install python-dev
パッケージリストを読み込んでいます... 完了
依存関係ツリーを作成しています                
状態情報を読み取っています... 完了
python-dev はすでに最新バージョン (2.7.12-1~16.04) です。
アップグレード: 0 個、新規インストール: 0 個、削除: 0 個、保留: 0 個。
ubuntu@ip-172-31-6-165:~/sqaod$ pip --version
pip 9.0.1 from /home/ubuntu/anaconda3/lib/python3.6/site-packages (python 3.6)
ubuntu@ip-172-31-6-165:~/sqaod$ pip install pip --upgrade
Collecting pip
  Downloading https://files.pythonhosted.org/packages/0f/74/ecd13431bcc456ed390b44c8a6e917c1820365cbebcb6a8974d1cd045ab4/pip-10.0.1-py2.py3-none-any.whl (1.3MB)
    100% |████████████████████████████████| 1.3MB 957kB/s 
Installing collected packages: pip
  Found existing installation: pip 9.0.1
    Uninstalling pip-9.0.1:
      Successfully uninstalled pip-9.0.1
Successfully installed pip-10.0.1
ubuntu@ip-172-31-6-165:~/sqaod$ pip install numpy setuptools
Requirement already satisfied: numpy in /home/ubuntu/anaconda3/lib/python3.6/site-packages (1.14.2)
Requirement already satisfied: setuptools in /home/ubuntu/anaconda3/lib/python3.6/site-packages (39.0.1)
ubuntu@ip-172-31-6-165:~/sqaod$ ./build_py.sh 
rm -f ../cpu_dg_annealer.so ../cpu_dg_bf_searcher.so ../cpu_bg_annealer.so ../cpu_bg_bf_searcher.so ../cpu_formulas.so cpu_formulas.o cpu_dg_annealer.o cpu_bg_annealer.o cpu_dg_bf_searcher.o cpu_bg_bf_searcher.o
g++ -c -I/home/ubuntu/anaconda3/include/python3.6m -I/home/ubuntu/anaconda3/lib/python3.6/site-packages/numpy/core/include -std=c++11 -g -O2 -msse2 -Wall -ggdb -Wno-format-security -I/home/ubuntu/sqaod -fopenmp -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/eigen -I/usr/local/cuda-9.2/include -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/cub -fPIC cpu_dg_annealer.cpp -o cpu_dg_annealer.o
g++ -shared -std=c++11 -g -O2 -msse2 -Wall -ggdb -Wno-format-security -I/home/ubuntu/sqaod -fopenmp -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/eigen -I/usr/local/cuda-9.2/include -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/cub -fPIC cpu_dg_annealer.o -L/home/ubuntu/sqaod/sqaodc/.libs -lsqaodc  -o ../cpu_dg_annealer.so
g++ -c -I/home/ubuntu/anaconda3/include/python3.6m -I/home/ubuntu/anaconda3/lib/python3.6/site-packages/numpy/core/include -std=c++11 -g -O2 -msse2 -Wall -ggdb -Wno-format-security -I/home/ubuntu/sqaod -fopenmp -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/eigen -I/usr/local/cuda-9.2/include -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/cub -fPIC cpu_dg_bf_searcher.cpp -o cpu_dg_bf_searcher.o
g++ -shared -std=c++11 -g -O2 -msse2 -Wall -ggdb -Wno-format-security -I/home/ubuntu/sqaod -fopenmp -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/eigen -I/usr/local/cuda-9.2/include -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/cub -fPIC cpu_dg_bf_searcher.o -L/home/ubuntu/sqaod/sqaodc/.libs -lsqaodc  -o ../cpu_dg_bf_searcher.so
g++ -c -I/home/ubuntu/anaconda3/include/python3.6m -I/home/ubuntu/anaconda3/lib/python3.6/site-packages/numpy/core/include -std=c++11 -g -O2 -msse2 -Wall -ggdb -Wno-format-security -I/home/ubuntu/sqaod -fopenmp -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/eigen -I/usr/local/cuda-9.2/include -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/cub -fPIC cpu_bg_annealer.cpp -o cpu_bg_annealer.o
g++ -shared -std=c++11 -g -O2 -msse2 -Wall -ggdb -Wno-format-security -I/home/ubuntu/sqaod -fopenmp -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/eigen -I/usr/local/cuda-9.2/include -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/cub -fPIC cpu_bg_annealer.o -L/home/ubuntu/sqaod/sqaodc/.libs -lsqaodc  -o ../cpu_bg_annealer.so
g++ -c -I/home/ubuntu/anaconda3/include/python3.6m -I/home/ubuntu/anaconda3/lib/python3.6/site-packages/numpy/core/include -std=c++11 -g -O2 -msse2 -Wall -ggdb -Wno-format-security -I/home/ubuntu/sqaod -fopenmp -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/eigen -I/usr/local/cuda-9.2/include -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/cub -fPIC cpu_bg_bf_searcher.cpp -o cpu_bg_bf_searcher.o
g++ -shared -std=c++11 -g -O2 -msse2 -Wall -ggdb -Wno-format-security -I/home/ubuntu/sqaod -fopenmp -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/eigen -I/usr/local/cuda-9.2/include -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/cub -fPIC cpu_bg_bf_searcher.o -L/home/ubuntu/sqaod/sqaodc/.libs -lsqaodc  -o ../cpu_bg_bf_searcher.so
g++ -c -I/home/ubuntu/anaconda3/include/python3.6m -I/home/ubuntu/anaconda3/lib/python3.6/site-packages/numpy/core/include -std=c++11 -g -O2 -msse2 -Wall -ggdb -Wno-format-security -I/home/ubuntu/sqaod -fopenmp -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/eigen -I/usr/local/cuda-9.2/include -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/cub -fPIC cpu_formulas.cpp -o cpu_formulas.o
g++ -shared -std=c++11 -g -O2 -msse2 -Wall -ggdb -Wno-format-security -I/home/ubuntu/sqaod -fopenmp -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/eigen -I/usr/local/cuda-9.2/include -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/cub -fPIC cpu_formulas.o -L/home/ubuntu/sqaod/sqaodc/.libs -lsqaodc  -o ../cpu_formulas.so
rm -f ../cuda_dg_annealer.so ../cuda_dg_bf_searcher.so ../cuda_bg_annealer.so ../cuda_bg_bf_searcher.so ../cuda_formulas.so ../cuda_device.so cuda_formulas.o cuda_dg_annealer.o cuda_bg_annealer.o cuda_dg_bf_searcher.o cuda_bg_bf_searcher.o cuda_device.o
g++ -c -I/home/ubuntu/anaconda3/include/python3.6m -I/home/ubuntu/anaconda3/lib/python3.6/site-packages/numpy/core/include -std=c++11 -g -O2 -msse2 -Wall -ggdb -Wno-format-security -I/home/ubuntu/sqaod -fopenmp -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/eigen -I/usr/local/cuda-9.2/include -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/cub -fPIC cuda_dg_annealer.cpp -o cuda_dg_annealer.o
g++ -shared -std=c++11 -g -O2 -msse2 -Wall -ggdb -Wno-format-security -I/home/ubuntu/sqaod -fopenmp -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/eigen -I/usr/local/cuda-9.2/include -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/cub -fPIC cuda_dg_annealer.o -L/home/ubuntu/sqaod/sqaodc/.libs -lsqaodc_cuda -lsqaodc  -o ../cuda_dg_annealer.so
g++ -c -I/home/ubuntu/anaconda3/include/python3.6m -I/home/ubuntu/anaconda3/lib/python3.6/site-packages/numpy/core/include -std=c++11 -g -O2 -msse2 -Wall -ggdb -Wno-format-security -I/home/ubuntu/sqaod -fopenmp -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/eigen -I/usr/local/cuda-9.2/include -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/cub -fPIC cuda_dg_bf_searcher.cpp -o cuda_dg_bf_searcher.o
g++ -shared -std=c++11 -g -O2 -msse2 -Wall -ggdb -Wno-format-security -I/home/ubuntu/sqaod -fopenmp -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/eigen -I/usr/local/cuda-9.2/include -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/cub -fPIC cuda_dg_bf_searcher.o -L/home/ubuntu/sqaod/sqaodc/.libs -lsqaodc_cuda -lsqaodc  -o ../cuda_dg_bf_searcher.so
g++ -c -I/home/ubuntu/anaconda3/include/python3.6m -I/home/ubuntu/anaconda3/lib/python3.6/site-packages/numpy/core/include -std=c++11 -g -O2 -msse2 -Wall -ggdb -Wno-format-security -I/home/ubuntu/sqaod -fopenmp -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/eigen -I/usr/local/cuda-9.2/include -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/cub -fPIC cuda_bg_annealer.cpp -o cuda_bg_annealer.o
g++ -shared -std=c++11 -g -O2 -msse2 -Wall -ggdb -Wno-format-security -I/home/ubuntu/sqaod -fopenmp -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/eigen -I/usr/local/cuda-9.2/include -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/cub -fPIC cuda_bg_annealer.o -L/home/ubuntu/sqaod/sqaodc/.libs -lsqaodc_cuda -lsqaodc  -o ../cuda_bg_annealer.so
g++ -c -I/home/ubuntu/anaconda3/include/python3.6m -I/home/ubuntu/anaconda3/lib/python3.6/site-packages/numpy/core/include -std=c++11 -g -O2 -msse2 -Wall -ggdb -Wno-format-security -I/home/ubuntu/sqaod -fopenmp -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/eigen -I/usr/local/cuda-9.2/include -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/cub -fPIC cuda_bg_bf_searcher.cpp -o cuda_bg_bf_searcher.o
g++ -shared -std=c++11 -g -O2 -msse2 -Wall -ggdb -Wno-format-security -I/home/ubuntu/sqaod -fopenmp -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/eigen -I/usr/local/cuda-9.2/include -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/cub -fPIC cuda_bg_bf_searcher.o -L/home/ubuntu/sqaod/sqaodc/.libs -lsqaodc_cuda -lsqaodc  -o ../cuda_bg_bf_searcher.so
g++ -c -I/home/ubuntu/anaconda3/include/python3.6m -I/home/ubuntu/anaconda3/lib/python3.6/site-packages/numpy/core/include -std=c++11 -g -O2 -msse2 -Wall -ggdb -Wno-format-security -I/home/ubuntu/sqaod -fopenmp -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/eigen -I/usr/local/cuda-9.2/include -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/cub -fPIC cuda_formulas.cpp -o cuda_formulas.o
g++ -shared -std=c++11 -g -O2 -msse2 -Wall -ggdb -Wno-format-security -I/home/ubuntu/sqaod -fopenmp -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/eigen -I/usr/local/cuda-9.2/include -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/cub -fPIC cuda_formulas.o -L/home/ubuntu/sqaod/sqaodc/.libs -lsqaodc_cuda -lsqaodc  -o ../cuda_formulas.so
g++ -c -I/home/ubuntu/anaconda3/include/python3.6m -I/home/ubuntu/anaconda3/lib/python3.6/site-packages/numpy/core/include -std=c++11 -g -O2 -msse2 -Wall -ggdb -Wno-format-security -I/home/ubuntu/sqaod -fopenmp -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/eigen -I/usr/local/cuda-9.2/include -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/cub -fPIC cuda_device.cpp -o cuda_device.o
g++ -shared -std=c++11 -g -O2 -msse2 -Wall -ggdb -Wno-format-security -I/home/ubuntu/sqaod -fopenmp -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/eigen -I/usr/local/cuda-9.2/include -I/home/ubuntu/sqaod/3rdparty/cub -fPIC cuda_device.o -L/home/ubuntu/sqaod/sqaodc/.libs -lsqaodc_cuda -lsqaodc  -o ../cuda_device.so
running bdist_wheel
running build
running build_py
creating build
creating build/lib
creating build/lib/sqaod
copying sqaod/__init__.py -> build/lib/sqaod
creating build/lib/sqaod/py
copying sqaod/py/bipartite_graph_bf_searcher.py -> build/lib/sqaod/py
copying sqaod/py/dense_graph_annealer.py -> build/lib/sqaod/py
copying sqaod/py/dense_graph_bf_searcher.py -> build/lib/sqaod/py
copying sqaod/py/formulas.py -> build/lib/sqaod/py
copying sqaod/py/bipartite_graph_annealer.py -> build/lib/sqaod/py
copying sqaod/py/__init__.py -> build/lib/sqaod/py
creating build/lib/sqaod/common
copying sqaod/common/bipartite_graph_annealer_base.py -> build/lib/sqaod/common
copying sqaod/common/dense_graph_bf_searcher_base.py -> build/lib/sqaod/common
copying sqaod/common/formulas_base.py -> build/lib/sqaod/common
copying sqaod/common/preference.py -> build/lib/sqaod/common
copying sqaod/common/solver.py -> build/lib/sqaod/common
copying sqaod/common/cuda_probe.py -> build/lib/sqaod/common
copying sqaod/common/bipartite_graph_bf_searcher_base.py -> build/lib/sqaod/common
copying sqaod/common/summary.py -> build/lib/sqaod/common
copying sqaod/common/checkers.py -> build/lib/sqaod/common
copying sqaod/common/dense_graph_annealer_base.py -> build/lib/sqaod/common
copying sqaod/common/__init__.py -> build/lib/sqaod/common
copying sqaod/common/common.py -> build/lib/sqaod/common
creating build/lib/sqaod/cuda
copying sqaod/cuda/bipartite_graph_bf_searcher.py -> build/lib/sqaod/cuda
copying sqaod/cuda/dense_graph_annealer.py -> build/lib/sqaod/cuda
copying sqaod/cuda/dense_graph_bf_searcher.py -> build/lib/sqaod/cuda
copying sqaod/cuda/formulas.py -> build/lib/sqaod/cuda
copying sqaod/cuda/bipartite_graph_annealer.py -> build/lib/sqaod/cuda
copying sqaod/cuda/__init__.py -> build/lib/sqaod/cuda
copying sqaod/cuda/device.py -> build/lib/sqaod/cuda
creating build/lib/sqaod/cpu
copying sqaod/cpu/bipartite_graph_bf_searcher.py -> build/lib/sqaod/cpu
copying sqaod/cpu/dense_graph_annealer.py -> build/lib/sqaod/cpu
copying sqaod/cpu/dense_graph_bf_searcher.py -> build/lib/sqaod/cpu
copying sqaod/cpu/formulas.py -> build/lib/sqaod/cpu
copying sqaod/cpu/bipartite_graph_annealer.py -> build/lib/sqaod/cpu
copying sqaod/cpu/__init__.py -> build/lib/sqaod/cpu
running egg_info
creating sqaod.egg-info
writing sqaod.egg-info/PKG-INFO
writing dependency_links to sqaod.egg-info/dependency_links.txt
writing requirements to sqaod.egg-info/requires.txt
writing top-level names to sqaod.egg-info/top_level.txt
writing manifest file 'sqaod.egg-info/SOURCES.txt'
reading manifest file 'sqaod.egg-info/SOURCES.txt'
writing manifest file 'sqaod.egg-info/SOURCES.txt'
copying sqaod/cuda/cuda_device.so -> build/lib/sqaod/cuda
copying sqaod/cuda/cuda_formulas.so -> build/lib/sqaod/cuda
copying sqaod/cuda/cuda_bg_annealer.so -> build/lib/sqaod/cuda
copying sqaod/cuda/cuda_dg_annealer.so -> build/lib/sqaod/cuda
copying sqaod/cuda/cuda_dg_bf_searcher.so -> build/lib/sqaod/cuda
copying sqaod/cuda/cuda_bg_bf_searcher.so -> build/lib/sqaod/cuda
copying sqaod/cpu/cpu_bg_annealer.so -> build/lib/sqaod/cpu
copying sqaod/cpu/cpu_dg_annealer.so -> build/lib/sqaod/cpu
copying sqaod/cpu/cpu_formulas.so -> build/lib/sqaod/cpu
copying sqaod/cpu/cpu_dg_bf_searcher.so -> build/lib/sqaod/cpu
copying sqaod/cpu/cpu_bg_bf_searcher.so -> build/lib/sqaod/cpu
running build_ext
installing to build/bdist.linux-x86_64/wheel
running install
running install_lib
creating build/bdist.linux-x86_64
creating build/bdist.linux-x86_64/wheel
creating build/bdist.linux-x86_64/wheel/sqaod-0.2.0b1.data
creating build/bdist.linux-x86_64/wheel/sqaod-0.2.0b1.data/purelib
creating build/bdist.linux-x86_64/wheel/sqaod-0.2.0b1.data/purelib/sqaod
creating build/bdist.linux-x86_64/wheel/sqaod-0.2.0b1.data/purelib/sqaod/py
copying build/lib/sqaod/py/bipartite_graph_bf_searcher.py -> build/bdist.linux-x86_64/wheel/sqaod-0.2.0b1.data/purelib/sqaod/py
copying build/lib/sqaod/py/dense_graph_annealer.py -> build/bdist.linux-x86_64/wheel/sqaod-0.2.0b1.data/purelib/sqaod/py
copying build/lib/sqaod/py/dense_graph_bf_searcher.py -> build/bdist.linux-x86_64/wheel/sqaod-0.2.0b1.data/purelib/sqaod/py
copying build/lib/sqaod/py/formulas.py -> build/bdist.linux-x86_64/wheel/sqaod-0.2.0b1.data/purelib/sqaod/py
copying build/lib/sqaod/py/bipartite_graph_annealer.py -> build/bdist.linux-x86_64/wheel/sqaod-0.2.0b1.data/purelib/sqaod/py
copying build/lib/sqaod/py/__init__.py -> build/bdist.linux-x86_64/wheel/sqaod-0.2.0b1.data/purelib/sqaod/py
creating build/bdist.linux-x86_64/wheel/sqaod-0.2.0b1.data/purelib/sqaod/common
copying build/lib/sqaod/common/bipartite_graph_annealer_base.py -> build/bdist.linux-x86_64/wheel/sqaod-0.2.0b1.data/purelib/sqaod/common
copying build/lib/sqaod/common/dense_graph_bf_searcher_base.py -> build/bdist.linux-x86_64/wheel/sqaod-0.2.0b1.data/purelib/sqaod/common
copying build/lib/sqaod/common/formulas_base.py -> build/bdist.linux-x86_64/wheel/sqaod-0.2.0b1.data/purelib/sqaod/common
copying build/lib/sqaod/common/preference.py -> build/bdist.linux-x86_64/wheel/sqaod-0.2.0b1.data/purelib/sqaod/common
copying build/lib/sqaod/common/solver.py -> build/bdist.linux-x86_64/wheel/sqaod-0.2.0b1.data/purelib/sqaod/common
copying build/lib/sqaod/common/cuda_probe.py -> build/bdist.linux-x86_64/wheel/sqaod-0.2.0b1.data/purelib/sqaod/common
copying build/lib/sqaod/common/bipartite_graph_bf_searcher_base.py -> build/bdist.linux-x86_64/wheel/sqaod-0.2.0b1.data/purelib/sqaod/common
copying build/lib/sqaod/common/summary.py -> build/bdist.linux-x86_64/wheel/sqaod-0.2.0b1.data/purelib/sqaod/common
copying build/lib/sqaod/common/checkers.py -> build/bdist.linux-x86_64/wheel/sqaod-0.2.0b1.data/purelib/sqaod/common
copying build/lib/sqaod/common/dense_graph_annealer_base.py -> build/bdist.linux-x86_64/wheel/sqaod-0.2.0b1.data/purelib/sqaod/common
copying build/lib/sqaod/common/__init__.py -> build/bdist.linux-x86_64/wheel/sqaod-0.2.0b1.data/purelib/sqaod/common
copying build/lib/sqaod/common/common.py -> build/bdist.linux-x86_64/wheel/sqaod-0.2.0b1.data/purelib/sqaod/common
creating build/bdist.linux-x86_64/wheel/sqaod-0.2.0b1.data/purelib/sqaod/cuda
copying build/lib/sqaod/cuda/bipartite_graph_bf_searcher.py -> build/bdist.linux-x86_64/wheel/sqaod-0.2.0b1.data/purelib/sqaod/cuda
copying build/lib/sqaod/cuda/cuda_device.so -> build/bdist.linux-x86_64/wheel/sqaod-0.2.0b1.data/purelib/sqaod/cuda
copying build/lib/sqaod/cuda/dense_graph_annealer.py -> build/bdist.linux-x86_64/wheel/sqaod-0.2.0b1.data/purelib/sqaod/cuda
copying build/lib/sqaod/cuda/dense_graph_bf_searcher.py -> build/bdist.linux-x86_64/wheel/sqaod-0.2.0b1.data/purelib/sqaod/cuda
copying build/lib/sqaod/cuda/cuda_formulas.so -> build/bdist.linux-x86_64/wheel/sqaod-0.2.0b1.data/purelib/sqaod/cuda
copying build/lib/sqaod/cuda/cuda_bg_annealer.so -> build/bdist.linux-x86_64/wheel/sqaod-0.2.0b1.data/purelib/sqaod/cuda
copying build/lib/sqaod/cuda/formulas.py -> build/bdist.linux-x86_64/wheel/sqaod-0.2.0b1.data/purelib/sqaod/cuda
copying build/lib/sqaod/cuda/cuda_dg_annealer.so -> build/bdist.linux-x86_64/wheel/sqaod-0.2.0b1.data/purelib/sqaod/cuda
copying build/lib/sqaod/cuda/cuda_dg_bf_searcher.so -> build/bdist.linux-x86_64/wheel/sqaod-0.2.0b1.data/purelib/sqaod/cuda
copying build/lib/sqaod/cuda/bipartite_graph_annealer.py -> build/bdist.linux-x86_64/wheel/sqaod-0.2.0b1.data/purelib/sqaod/cuda
copying build/lib/sqaod/cuda/cuda_bg_bf_searcher.so -> build/bdist.linux-x86_64/wheel/sqaod-0.2.0b1.data/purelib/sqaod/cuda
copying build/lib/sqaod/cuda/__init__.py -> build/bdist.linux-x86_64/wheel/sqaod-0.2.0b1.data/purelib/sqaod/cuda
copying build/lib/sqaod/cuda/device.py -> build/bdist.linux-x86_64/wheel/sqaod-0.2.0b1.data/purelib/sqaod/cuda
copying build/lib/sqaod/__init__.py -> build/bdist.linux-x86_64/wheel/sqaod-0.2.0b1.data/purelib/sqaod
creating build/bdist.linux-x86_64/wheel/sqaod-0.2.0b1.data/purelib/sqaod/cpu
copying build/lib/sqaod/cpu/bipartite_graph_bf_searcher.py -> build/bdist.linux-x86_64/wheel/sqaod-0.2.0b1.data/purelib/sqaod/cpu
copying build/lib/sqaod/cpu/cpu_bg_annealer.so -> build/bdist.linux-x86_64/wheel/sqaod-0.2.0b1.data/purelib/sqaod/cpu
copying build/lib/sqaod/cpu/cpu_dg_annealer.so -> build/bdist.linux-x86_64/wheel/sqaod-0.2.0b1.data/purelib/sqaod/cpu
copying build/lib/sqaod/cpu/dense_graph_annealer.py -> build/bdist.linux-x86_64/wheel/sqaod-0.2.0b1.data/purelib/sqaod/cpu
copying build/lib/sqaod/cpu/cpu_formulas.so -> build/bdist.linux-x86_64/wheel/sqaod-0.2.0b1.data/purelib/sqaod/cpu
copying build/lib/sqaod/cpu/dense_graph_bf_searcher.py -> build/bdist.linux-x86_64/wheel/sqaod-0.2.0b1.data/purelib/sqaod/cpu
copying build/lib/sqaod/cpu/formulas.py -> build/bdist.linux-x86_64/wheel/sqaod-0.2.0b1.data/purelib/sqaod/cpu
copying build/lib/sqaod/cpu/cpu_dg_bf_searcher.so -> build/bdist.linux-x86_64/wheel/sqaod-0.2.0b1.data/purelib/sqaod/cpu
copying build/lib/sqaod/cpu/cpu_bg_bf_searcher.so -> build/bdist.linux-x86_64/wheel/sqaod-0.2.0b1.data/purelib/sqaod/cpu
copying build/lib/sqaod/cpu/bipartite_graph_annealer.py -> build/bdist.linux-x86_64/wheel/sqaod-0.2.0b1.data/purelib/sqaod/cpu
copying build/lib/sqaod/cpu/__init__.py -> build/bdist.linux-x86_64/wheel/sqaod-0.2.0b1.data/purelib/sqaod/cpu
running install_egg_info
Copying sqaod.egg-info to build/bdist.linux-x86_64/wheel/sqaod-0.2.0b1.data/purelib/sqaod-0.2.0b1-py3.6.egg-info
running install_scripts
creating build/bdist.linux-x86_64/wheel/sqaod-0.2.0b1.dist-info/WHEEL
creating '/home/ubuntu/sqaod/sqaodpy/dist/sqaod-0.2.0b1-cp36-cp36m-manylinux1_x86_64.whl' and adding '.' to it
adding 'sqaod-0.2.0b1.data/purelib/sqaod/__init__.py'
adding 'sqaod-0.2.0b1.data/purelib/sqaod/common/__init__.py'
adding 'sqaod-0.2.0b1.data/purelib/sqaod/common/bipartite_graph_annealer_base.py'
adding 'sqaod-0.2.0b1.data/purelib/sqaod/common/bipartite_graph_bf_searcher_base.py'
adding 'sqaod-0.2.0b1.data/purelib/sqaod/common/checkers.py'
adding 'sqaod-0.2.0b1.data/purelib/sqaod/common/common.py'
adding 'sqaod-0.2.0b1.data/purelib/sqaod/common/cuda_probe.py'
adding 'sqaod-0.2.0b1.data/purelib/sqaod/common/dense_graph_annealer_base.py'
adding 'sqaod-0.2.0b1.data/purelib/sqaod/common/dense_graph_bf_searcher_base.py'
adding 'sqaod-0.2.0b1.data/purelib/sqaod/common/formulas_base.py'
adding 'sqaod-0.2.0b1.data/purelib/sqaod/common/preference.py'
adding 'sqaod-0.2.0b1.data/purelib/sqaod/common/solver.py'
adding 'sqaod-0.2.0b1.data/purelib/sqaod/common/summary.py'
adding 'sqaod-0.2.0b1.data/purelib/sqaod/cpu/__init__.py'
adding 'sqaod-0.2.0b1.data/purelib/sqaod/cpu/bipartite_graph_annealer.py'
adding 'sqaod-0.2.0b1.data/purelib/sqaod/cpu/bipartite_graph_bf_searcher.py'
adding 'sqaod-0.2.0b1.data/purelib/sqaod/cpu/cpu_bg_annealer.so'
adding 'sqaod-0.2.0b1.data/purelib/sqaod/cpu/cpu_bg_bf_searcher.so'
adding 'sqaod-0.2.0b1.data/purelib/sqaod/cpu/cpu_dg_annealer.so'
adding 'sqaod-0.2.0b1.data/purelib/sqaod/cpu/cpu_dg_bf_searcher.so'
adding 'sqaod-0.2.0b1.data/purelib/sqaod/cpu/cpu_formulas.so'
adding 'sqaod-0.2.0b1.data/purelib/sqaod/cpu/dense_graph_annealer.py'
adding 'sqaod-0.2.0b1.data/purelib/sqaod/cpu/dense_graph_bf_searcher.py'
adding 'sqaod-0.2.0b1.data/purelib/sqaod/cpu/formulas.py'
adding 'sqaod-0.2.0b1.data/purelib/sqaod/cuda/__init__.py'
adding 'sqaod-0.2.0b1.data/purelib/sqaod/cuda/bipartite_graph_annealer.py'
adding 'sqaod-0.2.0b1.data/purelib/sqaod/cuda/bipartite_graph_bf_searcher.py'
adding 'sqaod-0.2.0b1.data/purelib/sqaod/cuda/cuda_bg_annealer.so'
adding 'sqaod-0.2.0b1.data/purelib/sqaod/cuda/cuda_bg_bf_searcher.so'
adding 'sqaod-0.2.0b1.data/purelib/sqaod/cuda/cuda_device.so'
adding 'sqaod-0.2.0b1.data/purelib/sqaod/cuda/cuda_dg_annealer.so'
adding 'sqaod-0.2.0b1.data/purelib/sqaod/cuda/cuda_dg_bf_searcher.so'
adding 'sqaod-0.2.0b1.data/purelib/sqaod/cuda/cuda_formulas.so'
adding 'sqaod-0.2.0b1.data/purelib/sqaod/cuda/dense_graph_annealer.py'
adding 'sqaod-0.2.0b1.data/purelib/sqaod/cuda/dense_graph_bf_searcher.py'
adding 'sqaod-0.2.0b1.data/purelib/sqaod/cuda/device.py'
adding 'sqaod-0.2.0b1.data/purelib/sqaod/cuda/formulas.py'
adding 'sqaod-0.2.0b1.data/purelib/sqaod/py/__init__.py'
adding 'sqaod-0.2.0b1.data/purelib/sqaod/py/bipartite_graph_annealer.py'
adding 'sqaod-0.2.0b1.data/purelib/sqaod/py/bipartite_graph_bf_searcher.py'
adding 'sqaod-0.2.0b1.data/purelib/sqaod/py/dense_graph_annealer.py'
adding 'sqaod-0.2.0b1.data/purelib/sqaod/py/dense_graph_bf_searcher.py'
adding 'sqaod-0.2.0b1.data/purelib/sqaod/py/formulas.py'
adding 'sqaod-0.2.0b1.dist-info/DESCRIPTION.rst'
adding 'sqaod-0.2.0b1.dist-info/metadata.json'
adding 'sqaod-0.2.0b1.dist-info/top_level.txt'
adding 'sqaod-0.2.0b1.dist-info/WHEEL'
adding 'sqaod-0.2.0b1.dist-info/METADATA'
adding 'sqaod-0.2.0b1.dist-info/RECORD'
ubuntu@ip-172-31-6-165:~/sqaod$ pip install sqaodpy/dist/sqaod-0.1.dev0-cp27-cp27mu-manylinux1_x86_64.whl
Requirement 'sqaodpy/dist/sqaod-0.1.dev0-cp27-cp27mu-manylinux1_x86_64.whl' looks like a filename, but the file does not exist
sqaod-0.1.dev0-cp27-cp27mu-manylinux1_x86_64.whl is not a supported wheel on this platform.
ubuntu@ip-172-31-6-165:~/sqaod$ pip install sqaodpy/dist/sqaod-0.2.0b1-cp36-cp36m-manylinux1_x86_64.whl 
Processing ./sqaodpy/dist/sqaod-0.2.0b1-cp36-cp36m-manylinux1_x86_64.whl
Requirement already satisfied: numpy>=1.11 in /home/ubuntu/anaconda3/lib/python3.6/site-packages (from sqaod==0.2.0b1) (1.14.2)
Installing collected packages: sqaod
Successfully installed sqaod-0.2.0b1
ubuntu@ip-172-31-6-165:~/sqaod$ python
Python 3.6.4 |Anaconda, Inc.| (default, Jan 16 2018, 18:10:19) 
[GCC 7.2.0] on linux
Type "help", "copyright", "credits" or "license" for more information.
>>> import sqaod
Traceback (most recent call last):
  File "<stdin>", line 1, in <module>
  File "/home/ubuntu/anaconda3/lib/python3.6/site-packages/sqaod/__init__.py", line 10, in <module>
    from . import cpu
  File "/home/ubuntu/anaconda3/lib/python3.6/site-packages/sqaod/cpu/__init__.py", line 1, in <module>
    from . import formulas
  File "/home/ubuntu/anaconda3/lib/python3.6/site-packages/sqaod/cpu/formulas.py", line 4, in <module>
    from . import cpu_formulas as cext
ImportError: /home/ubuntu/anaconda3/lib/python3.6/site-packages/sqaod/cpu/cpu_formulas.so: undefined symbol: _ZN5sqaod12aligned_freeEPv
>>> import sqaod
Segmentation fault (コアダンプ)
ubuntu@ip-172-31-6-165:~/sqaod$ python
Python 3.6.4 |Anaconda, Inc.| (default, Jan 16 2018, 18:10:19) 
[GCC 7.2.0] on linux
Type "help", "copyright", "credits" or "license" for more information.
>>> import sqaod
Traceback (most recent call last):
  File "<stdin>", line 1, in <module>
  File "/home/ubuntu/anaconda3/lib/python3.6/site-packages/sqaod/__init__.py", line 10, in <module>
    from . import cpu
  File "/home/ubuntu/anaconda3/lib/python3.6/site-packages/sqaod/cpu/__init__.py", line 1, in <module>
    from . import formulas
  File "/home/ubuntu/anaconda3/lib/python3.6/site-packages/sqaod/cpu/formulas.py", line 4, in <module>
    from . import cpu_formulas as cext
ImportError: /home/ubuntu/anaconda3/lib/python3.6/site-packages/sqaod/cpu/cpu_formulas.so: undefined symbol: _ZN5sqaod12aligned_freeEPv
>>> 
ubuntu@ip-172-31-6-165:~/sqaod$ ldconfig
^C
ubuntu@ip-172-31-6-165:~/sqaod$ sudo ldconfig
ubuntu@ip-172-31-6-165:~/sqaod$ python
Python 3.6.4 |Anaconda, Inc.| (default, Jan 16 2018, 18:10:19) 
[GCC 7.2.0] on linux
Type "help", "copyright", "credits" or "license" for more information.
>>> import sqaod
Traceback (most recent call last):
  File "<stdin>", line 1, in <module>
  File "/home/ubuntu/anaconda3/lib/python3.6/site-packages/sqaod/__init__.py", line 10, in <module>
    from . import cpu
  File "/home/ubuntu/anaconda3/lib/python3.6/site-packages/sqaod/cpu/__init__.py", line 1, in <module>
    from . import formulas
  File "/home/ubuntu/anaconda3/lib/python3.6/site-packages/sqaod/cpu/formulas.py", line 4, in <module>
    from . import cpu_formulas as cext
ImportError: /home/ubuntu/anaconda3/lib/python3.6/site-packages/sqaod/cpu/cpu_formulas.so: undefined symbol: _ZN5sqaod12aligned_freeEPv
>>>

shinmorino · 2018-06-06T14:35:58Z

Understand. I'll test in my testbench.

shinmorino · 2018-06-07T09:25:48Z

The root cause should be ABI incompatiblity between shared libs and python c-extentions.
Shared libs are installed by apt-get, and their version is beta1. Python c-extensions are compiled with the latest source code. There are some ABI changes at HEAD of the master branch from beta1, resulting in undefined reference.

To fix it, please remove deb packages installed by apt-get.
$ apt-get remove libsqaodc libsqaodc-sse2 libsqaodc-avx2 libsqaodc-cuda-9-0

Next, move to top of the source directory, and run followings:
$ cd sqaod # move to the top directory
$ sudo make install # installing up-to-date libraries.

I believe that it should fix your issue.

shukob · 2018-06-07T20:49:36Z

Thanks!

Exactly what you describe was correct, and it now works.
Sorry for trouble you!

shinmorino · 2018-06-08T04:47:03Z

Good to know. 😄

shukob changed the title ~~Import Error in python when built from source for coda~~ Import Error in python when built from source for cuda Jun 6, 2018

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