-
Notifications
You must be signed in to change notification settings - Fork 0
/
kernel.c
86 lines (77 loc) · 1.45 KB
/
kernel.c
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
28
29
30
31
32
33
34
35
36
37
38
39
40
41
42
43
44
45
46
47
48
49
50
51
52
53
54
55
56
57
58
59
60
61
62
63
64
65
66
67
68
69
70
71
72
73
74
75
76
77
78
79
80
81
82
83
84
85
86
#include "global.h"
void kernel(int ind_X[], int ind_y[], int len_ind_x, int len_ind_y, double ** K,struct parameter * pm)
{
int num_feature = (*pm).data_row;
int i,j,k;
double sum = 0;
for(i=0; i<len_ind_x; i++)
{
for(j=0; j<len_ind_y; j++)
{
for(k=0; k<num_feature; k++)
{
sum += (*pm).X[k][ind_X[i]] * (*pm).X[k][ind_y[j]];
}
K[i][j] = sum;
sum = 0;
}
}
double * tmp_x = (double *)malloc(sizeof(double)*len_ind_x);
double * tmp_y = (double *)malloc(sizeof(double)*len_ind_y);
for(i=0; i<len_ind_x; i++) tmp_x[i] = 0;
for(i=0; i<len_ind_y; i++) tmp_y[i] = 0;
if(((*pm).type > 1) && ((*pm).type < 5))
{
//not yet
}
else if((*pm).type == 5)
{
for(i=0; i<len_ind_x; i++)
{
for(j=0; j<len_ind_y; j++)
{
K[i][j] *= 2;
}
}
for(i=0; i<len_ind_x; i++)
{
for(j=0; j<num_feature; j++)
{
tmp_x[i] += (*pm).X[j][ind_X[i]] * (*pm).X[j][ind_X[i]];
}
}
for(i=0; i<len_ind_x; i++)
{
for(j=0; j<len_ind_y; j++)
{
K[i][j] -= tmp_x[i];
}
}
for(i=0; i<len_ind_y; i++)
{
for(j=0; j<num_feature; j++)
{
tmp_y[i] += (*pm).X[j][ind_y[i]] * (*pm).X[j][ind_y[i]];
}
}
for(i=0; i<len_ind_x; i++)
{
for(j=0; j<len_ind_y; j++)
{
K[i][j] -= tmp_y[j];
}
}
for(i=0; i<len_ind_x; i++)
{
for(j=0; j<len_ind_y; j++)
{
K[i][j] = exp(K[i][j] / (2* (*pm).scale));
}
}
}
else
{
//type error
}
(*pm).kernel_evals += len_ind_x * len_ind_y;
}