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ichthya/WorkshopPythonBiol2020_SimulationsScripts

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WorkshopPythonBiol_SimulationsScripts

Scripts utilizados para gerar as simulações apresentadas durante o seminário sobre simulações em evolução.
Arquivos/pastas:
#covid example: repositório clonado de git clone https://github.com/youyanggu/yyg-seir-simulator.git
#01_Drift: script simplificado do autor Tom Booker, disponível aqui https://github.com/TBooker/GlobalAdaptation/tree/master/SteppingStone
#02_msprime_timeMRCA.py: script utilizado para fazer simulações coalescentes usando o pacote msprime
#Python_simulations_commandLines.ipynb: jupyter notebook com os exemplos de linhas de comando e os scripts para gerar os gráficos
#Python_palestraEvolucaoATT_Sept2020.pdf: pdf do seminário apresentado

About

Scripts used to generate the simulations used for the seminar during the III Python Workshop for Biologists in Brazil - September 2020

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