Workshop 1 & 2: Geometric Morphometrics (GMM) and Archaeology

（日本語版は下にあります）

Organisers: Dr Christian Steven Hoggard and Atsushi Noguchi

Location: Online (through Slack/Zoom/GitHub/Twitter)

About the workshops

This workshop is designed to provide an introduction into the application and potential of geometric morphometric (GMM) methodologies for Japanese archaeologists, researchers and enthusiasts. The first workshop introduces participants to the mathematical underpinnings of statistical shape and form, before detailing the fundamentals of geometric morphometrics, emphasising its statistical power and converage in comparison to traditional morphometrics. The second workshop will be an R-based introduction to geometric morphometrics through the Momocs package.

Software

Software: All data input, manipulation and analyses will be performed in the R Environment through Momocs. Please ensure R/RStudio and all files are downloaded onto your computer/laptop before or at the beginning of workshop two. Other digitisation methods including tpsDig2 (https://life.bio.sunysb.edu/morph/soft-dataacq.html) and GUImorph (https://github.com/GUImorph/GUImorph) will also be showcased.

Suggested Reading

Adams, D.C. and Otárola-Castillo, E. (2013). Geomorph: an r package for the collection and analysis of geometric morphometric shape data. Methods of Ecology and Evolution 4, 393-399.

Adams, D.C., Rohlf, F.J. and Slice, D.E. (2004). Geometric morphometrics: ten years of progress following the ‘revolution’. Italian Journal of Zoology, 71, 5–16.

Bonhomme, V., Picq, S., Gaucherel, C., and Claude, J. (2014). Momocs: Outline analysis using R. Journal of Statistical Software, 56, 1–24.

Bookstein, F.L. (1991). Morphometric Tools for Landmark Data: Geometry and Biology. New York: Cambridge University Press.

Kovarovic, K., Aiello, L. C., Cardini, A. and Lockwood, C. A. (2011). Discriminant function analyses in archaeology: Are classification rates too good to be true? Journal of Archaeological Science, 38(11), 3006–3018.

MacLeod, N. (1999). Generalizing and extending the Eigenshape method of shape space visualization and analysis. Paleobiology, 25 (1), 107–138.

Slice, D.E. (2007). Geometric Morphometrics, Annual Review of Anthropology 36(1), 261–281.

Yoshioka, Y. (2004). Analysis of petal shape variation of Primula sieboldii by elliptic fourier descriptors and principal component analysis. Annals of Botany, 94(5), 657–664.

Zelditch, M.L., Swiderski D.L., Sheets H.D. and Fink, W.L. (2004). Geometric morphometrics for biologists: a primer. San Diego (CA): Elsevier Academic Press.

Japanese

ワークショップ1&2 幾何形態測定学(GMM)と考古学

オーガナイザー: Dr Christian Steven Hoggard、野口　淳

開催場所: オンライン (Slack/Zoom/GitHub/Twitter)

このワークショップについて

このワークショップは、GMMの方法論の応用と可能性を、日本の考古学者、研究者、一般の愛好者に紹介するために構成しました。第1回は、統計的にシェイプ（shape:かたち）とフォーム（form:形態）を扱う数学的基礎の導入を、わかりやすいダイジェスト版で行ないます。GMMの基盤を詳細に解説する前に、従来の形態測定学と比較した際のGMMの効果と応用範囲を提示します。第2回は、考古学資料のシェイプを検討する代表的な方法：RのMomocsパッケージを利用したアウトライン分析を紹介します。

ソフトウェア

全てのデータの入力、操作、および分析は、統計解析向けのプログラミング言語・開発環境であるRのMomocsパッケージで行ないます. 第2回ワークショップの前に、各自でRおよびRStudioのインストールとデータファイルのダウンロードを行なってください （RStudioはRのための統合開発環境ソフトウェアです）（RおよびRStudioのインストールガイドは別途提供します）. データ（分析対象資料）のデジタル化の方法として tpsDig2 (https://life.bio.sunysb.edu/morph/soft-dataacq.html) と GUImorph (https://github.com/GUImorph/GUImorph) も紹介します.

参考文献・ウェブサイト（日本語リソース）

理論・方法 小森政嗣ほか2012「楕円フーリエ記述子を用いたボディソープボトル形状の分析と評価」日本包装学会誌21-6（http://www.spstj.jp/publication/thesis/vol21/Vol21No6-3.pdf ） 田村光平2020「5.7幾何学的形態測定学の文化への応用」『文化進化の数理』森北出版 野下浩司・田村光平2017「補遺　幾何学的形態測定学とRを使った解析例」『文化進化の考古学』中尾・松木・三中編、勁草書房 高橋鉄美：ランドマーク法（幾何学的形態測定学）の簡単な使い方（http://tetsumi.raindrop.jp/Landmarks.html ）

考古学的応用 金田明大2013「うつわの形をわける－EFDを利用した土器形態の分類の試行－」『奈良文化財研究所創立60周年記念論文集　文化財論叢IV』奈良文化財研究所 田村光平・有松唯・山口雄治・松本直子2017「第2章　遠賀川式土器の楕円フーリエ解析」『文化進化の考古学』（前掲） 田村光平・松木武彦2017「第3章　幾何学的形態測定学による前方後円墳の墳丘形態の定量的解析」『文化進化の考古学』（前掲）