forked from nf-core/modules
-
Notifications
You must be signed in to change notification settings - Fork 0
Commit
This commit does not belong to any branch on this repository, and may belong to a fork outside of the repository.
Merge pull request nf-core#372 from avantonder/modules
add genome.paf
- Loading branch information
Showing
1 changed file
with
99 additions
and
0 deletions.
There are no files selected for viewing
This file contains bidirectional Unicode text that may be interpreted or compiled differently than what appears below. To review, open the file in an editor that reveals hidden Unicode characters.
Learn more about bidirectional Unicode characters
| Original file line number | Diff line number | Diff line change |
|---|---|---|
| @@ -0,0 +1,99 @@ | ||
| ERR5069949.2151832 150 6 150 - MT192765.1 29829 17452 17596 144 144 60 tp:A:P cm:i:24 s1:i:144 s2:i:0 dv:f:0.0027 rl:i:0 | ||
| ERR5069949.576388 77 1 76 - MT192765.1 29829 5798 5873 75 75 60 tp:A:P cm:i:12 s1:i:75 s2:i:0 dv:f:0.0053 rl:i:0 | ||
| ERR5069949.501486 146 3 139 - MT192765.1 29829 5429 5565 136 136 60 tp:A:P cm:i:22 s1:i:136 s2:i:0 dv:f:0.0030 rl:i:0 | ||
| ERR5069949.1331889 132 5 124 + MT192765.1 29829 13014 13133 119 119 60 tp:A:P cm:i:23 s1:i:119 s2:i:0 dv:f:0.0028 rl:i:0 | ||
| ERR5069949.2161340 80 0 74 + MT192765.1 29829 17481 17555 74 74 58 tp:A:P cm:i:12 s1:i:74 s2:i:0 dv:f:0.0053 rl:i:0 | ||
| ERR5069949.2417063 150 2 148 + MT192765.1 29829 18650 18796 146 146 60 tp:A:P cm:i:25 s1:i:146 s2:i:0 dv:f:0.0026 rl:i:0 | ||
| ERR5069949.376959 151 4 148 + MT192765.1 29829 4108 4252 144 144 60 tp:A:P cm:i:27 s1:i:144 s2:i:0 dv:f:0.0024 rl:i:0 | ||
| ERR5069949.1088785 149 8 108 + MT192765.1 29829 11871 11971 100 100 60 tp:A:P cm:i:16 s1:i:100 s2:i:0 dv:f:0.0040 rl:i:0 | ||
| ERR5069949.1066259 147 6 142 + MT192765.1 29829 11342 11478 136 136 60 tp:A:P cm:i:23 s1:i:136 s2:i:0 dv:f:0.0028 rl:i:0 | ||
| ERR5069949.2832676 139 8 136 + MT192765.1 29829 24416 24544 128 128 60 tp:A:P cm:i:20 s1:i:128 s2:i:0 dv:f:0.0032 rl:i:0 | ||
| ERR5069949.2953930 151 5 148 + MT192765.1 29829 25349 25492 143 143 60 tp:A:P cm:i:23 s1:i:143 s2:i:0 dv:f:0.0028 rl:i:0 | ||
| ERR5069949.324865 151 16 120 - MT192765.1 29829 3634 3738 54 104 22 tp:A:P cm:i:6 s1:i:54 s2:i:0 dv:f:0.0190 rl:i:0 | ||
| ERR5069949.2185111 150 0 146 - MT192765.1 29829 17540 17686 137 146 60 tp:A:P cm:i:22 s1:i:137 s2:i:0 dv:f:0.0030 rl:i:0 | ||
| ERR5069949.937422 151 3 147 + MT192765.1 29829 10424 10600 144 176 60 tp:A:P cm:i:26 s1:i:138 s2:i:0 dv:f:0.0025 rl:i:0 | ||
| ERR5069949.2431709 150 7 142 + MT192765.1 29829 18755 18891 112 136 60 tp:A:P cm:i:18 s1:i:112 s2:i:0 dv:f:0.0036 rl:i:0 | ||
| ERR5069949.1246538 148 4 142 + MT192765.1 29829 12604 12742 138 138 60 tp:A:P cm:i:25 s1:i:138 s2:i:0 dv:f:0.0026 rl:i:0 | ||
| ERR5069949.1189252 98 6 98 + MT192765.1 29829 12491 12583 92 92 60 tp:A:P cm:i:15 s1:i:92 s2:i:0 dv:f:0.0043 rl:i:0 | ||
| ERR5069949.2216307 147 0 144 - MT192765.1 29829 17603 17747 135 144 60 tp:A:P cm:i:23 s1:i:135 s2:i:0 dv:f:0.0028 rl:i:0 | ||
| ERR5069949.3273002 148 7 139 - MT192765.1 29829 28552 28684 126 132 60 tp:A:P cm:i:21 s1:i:126 s2:i:0 dv:f:0.0031 rl:i:0 | ||
| ERR5069949.3277445 151 0 149 + MT192765.1 29829 28508 28657 149 149 60 tp:A:P cm:i:25 s1:i:149 s2:i:0 dv:f:0.0026 rl:i:0 | ||
| ERR5069949.3022231 147 8 145 + MT192765.1 29829 26235 26372 137 137 60 tp:A:P cm:i:21 s1:i:137 s2:i:0 dv:f:0.0031 rl:i:0 | ||
| ERR5069949.184542 151 5 149 + MT192765.1 29829 1059 1203 125 144 60 tp:A:P cm:i:16 s1:i:125 s2:i:0 dv:f:0.0040 rl:i:0 | ||
| ERR5069949.540529 149 4 149 - MT192765.1 29829 5658 5803 145 145 60 tp:A:P cm:i:28 s1:i:145 s2:i:0 dv:f:0.0023 rl:i:0 | ||
| ERR5069949.686090 150 19 145 - MT192765.1 29829 8101 8227 126 126 60 tp:A:P cm:i:21 s1:i:126 s2:i:0 dv:f:0.0060 rl:i:0 | ||
| ERR5069949.2787556 106 19 105 + MT192765.1 29829 24106 24192 86 86 60 tp:A:P cm:i:15 s1:i:86 s2:i:0 dv:f:0.0083 rl:i:0 | ||
| ERR5069949.2650879 150 2 141 - MT192765.1 29829 22718 22857 139 139 60 tp:A:P cm:i:21 s1:i:139 s2:i:0 dv:f:0.0031 rl:i:0 | ||
| ERR5069949.2064910 149 6 147 + MT192765.1 29829 17128 17269 137 141 60 tp:A:P cm:i:25 s1:i:137 s2:i:0 dv:f:0.0026 rl:i:0 | ||
| ERR5069949.2328704 150 1 148 - MT192765.1 29829 18413 18560 147 147 60 tp:A:P cm:i:29 s1:i:147 s2:i:0 dv:f:0.0023 rl:i:0 | ||
| ERR5069949.1067032 150 4 144 - MT192765.1 29829 11486 11626 131 140 60 tp:A:P cm:i:19 s1:i:131 s2:i:0 dv:f:0.0034 rl:i:0 | ||
| ERR5069949.3338256 151 8 148 - MT192765.1 29829 29454 29594 140 140 60 tp:A:P cm:i:19 s1:i:140 s2:i:0 dv:f:0.0034 rl:i:0 | ||
| ERR5069949.1412839 147 6 143 - MT192765.1 29829 13190 13327 137 137 60 tp:A:P cm:i:22 s1:i:137 s2:i:0 dv:f:0.0030 rl:i:0 | ||
| ERR5069949.1538968 150 0 150 - MT192765.1 29829 13816 13966 150 150 60 tp:A:P cm:i:26 s1:i:150 s2:i:0 dv:f:0.0025 rl:i:0 | ||
| ERR5069949.147998 94 2 93 - MT192765.1 29829 919 1010 91 91 60 tp:A:P cm:i:18 s1:i:91 s2:i:0 dv:f:0.0036 rl:i:0 | ||
| ERR5069949.366975 106 5 102 - MT192765.1 29829 4169 4266 97 97 60 tp:A:P cm:i:18 s1:i:97 s2:i:0 dv:f:0.0036 rl:i:0 | ||
| ERR5069949.1372331 151 4 151 - MT192765.1 29829 13131 13278 147 147 60 tp:A:P cm:i:26 s1:i:147 s2:i:0 dv:f:0.0025 rl:i:0 | ||
| ERR5069949.1709367 129 10 129 - MT192765.1 29829 14885 15004 119 119 60 tp:A:P cm:i:23 s1:i:119 s2:i:0 dv:f:0.0028 rl:i:0 | ||
| ERR5069949.2388984 150 6 143 + MT192765.1 29829 18659 18796 137 137 60 tp:A:P cm:i:22 s1:i:137 s2:i:0 dv:f:0.0030 rl:i:0 | ||
| ERR5069949.1132353 150 2 142 - MT192765.1 29829 12082 12222 140 140 60 tp:A:P cm:i:27 s1:i:140 s2:i:0 dv:f:0.0024 rl:i:0 | ||
| ERR5069949.1151736 151 0 149 - MT192765.1 29829 12223 12372 149 149 60 tp:A:P cm:i:29 s1:i:149 s2:i:0 dv:f:0.0023 rl:i:0 | ||
| ERR5069949.479807 150 8 146 - MT192765.1 29829 5126 5264 138 138 60 tp:A:P cm:i:24 s1:i:138 s2:i:0 dv:f:0.0027 rl:i:0 | ||
| ERR5069949.2176303 151 1 142 + MT192765.1 29829 17442 17583 141 141 60 tp:A:P cm:i:23 s1:i:141 s2:i:0 dv:f:0.0028 rl:i:0 | ||
| ERR5069949.2772897 151 8 144 - MT192765.1 29829 23882 24018 136 136 60 tp:A:P cm:i:24 s1:i:136 s2:i:0 dv:f:0.0027 rl:i:0 | ||
| ERR5069949.1020777 122 8 116 - MT192765.1 29829 11222 11330 108 108 60 tp:A:P cm:i:22 s1:i:108 s2:i:0 dv:f:0.0030 rl:i:0 | ||
| ERR5069949.465452 151 6 148 + MT192765.1 29829 4700 4842 128 142 60 tp:A:P cm:i:20 s1:i:128 s2:i:0 dv:f:0.0032 rl:i:0 | ||
| ERR5069949.1704586 149 2 142 + MT192765.1 29829 14602 14742 140 140 60 tp:A:P cm:i:25 s1:i:140 s2:i:0 dv:f:0.0026 rl:i:0 | ||
| ERR5069949.1258508 151 9 142 - MT192765.1 29829 12646 12779 133 133 60 tp:A:P cm:i:26 s1:i:133 s2:i:0 dv:f:0.0025 rl:i:0 | ||
| ERR5069949.986441 119 6 119 + MT192765.1 29829 11012 11125 104 113 60 tp:A:P cm:i:16 s1:i:104 s2:i:0 dv:f:0.0040 rl:i:0 | ||
| ERR5069949.2674295 148 0 141 - MT192765.1 29829 23210 23351 141 141 60 tp:A:P cm:i:25 s1:i:141 s2:i:0 dv:f:0.0026 rl:i:0 | ||
| ERR5069949.885966 79 1 75 + MT192765.1 29829 10230 10304 58 74 29 tp:A:P cm:i:7 s1:i:58 s2:i:0 dv:f:0.0089 rl:i:0 | ||
| ERR5069949.2342766 151 2 149 + MT192765.1 29829 18398 18545 147 147 60 tp:A:P cm:i:29 s1:i:147 s2:i:0 dv:f:0.0023 rl:i:0 | ||
| ERR5069949.3122970 127 8 119 - MT192765.1 29829 27003 27114 111 111 60 tp:A:P cm:i:23 s1:i:111 s2:i:0 dv:f:0.0028 rl:i:0 | ||
| ERR5069949.3279513 72 15 67 + MT192765.1 29829 28427 28479 52 52 18 tp:A:P cm:i:9 s1:i:52 s2:i:0 dv:f:0.0070 rl:i:0 | ||
| ERR5069949.309410 151 9 144 + MT192765.1 29829 3192 3327 135 135 60 tp:A:P cm:i:21 s1:i:135 s2:i:0 dv:f:0.0031 rl:i:0 | ||
| ERR5069949.532979 149 1 145 + MT192765.1 29829 5568 5712 144 144 60 tp:A:P cm:i:26 s1:i:144 s2:i:0 dv:f:0.0025 rl:i:0 | ||
| ERR5069949.2888794 151 8 149 - MT192765.1 29829 24854 24995 141 141 60 tp:A:P cm:i:31 s1:i:141 s2:i:0 dv:f:0.0021 rl:i:0 | ||
| ERR5069949.2205229 150 2 133 + MT192765.1 29829 17477 17608 131 131 60 tp:A:P cm:i:22 s1:i:131 s2:i:0 dv:f:0.0030 rl:i:0 | ||
| ERR5069949.786562 151 4 149 - MT192765.1 29829 9097 9242 145 145 60 tp:A:P cm:i:23 s1:i:145 s2:i:0 dv:f:0.0028 rl:i:0 | ||
| ERR5069949.919671 151 5 142 - MT192765.1 29829 10509 10646 137 137 60 tp:A:P cm:i:25 s1:i:137 s2:i:0 dv:f:0.0026 rl:i:0 | ||
| ERR5069949.1328186 151 4 150 - MT192765.1 29829 12953 13099 146 146 60 tp:A:P cm:i:28 s1:i:146 s2:i:0 dv:f:0.0023 rl:i:0 | ||
| ERR5069949.870926 149 0 146 + MT192765.1 29829 10117 10263 146 146 60 tp:A:P cm:i:25 s1:i:146 s2:i:0 dv:f:0.0026 rl:i:0 | ||
| ERR5069949.2257580 151 1 142 + MT192765.1 29829 17980 18121 141 141 60 tp:A:P cm:i:26 s1:i:141 s2:i:0 dv:f:0.0025 rl:i:0 | ||
| ERR5069949.3249622 77 2 60 - MT192765.1 29829 28388 28446 50 58 15 tp:A:P cm:i:5 s1:i:50 s2:i:0 dv:f:0.0121 rl:i:0 | ||
| ERR5069949.611123 125 9 119 - MT192765.1 29829 6486 6596 110 110 60 tp:A:P cm:i:21 s1:i:110 s2:i:0 dv:f:0.0031 rl:i:0 | ||
| ERR5069949.651338 142 7 138 - MT192765.1 29829 7744 7875 124 131 60 tp:A:P cm:i:20 s1:i:124 s2:i:0 dv:f:0.0032 rl:i:0 | ||
| ERR5069949.169513 92 1 88 + MT192765.1 29829 1098 1185 87 87 60 tp:A:P cm:i:12 s1:i:87 s2:i:0 dv:f:0.0053 rl:i:0 | ||
| ERR5069949.155944 150 7 145 - MT192765.1 29829 1027 1165 134 138 60 tp:A:P cm:i:19 s1:i:134 s2:i:0 dv:f:0.0034 rl:i:0 | ||
| ERR5069949.2033605 150 6 141 - MT192765.1 29829 17109 17244 135 135 60 tp:A:P cm:i:24 s1:i:135 s2:i:0 dv:f:0.0027 rl:i:0 | ||
| ERR5069949.2730382 142 0 142 - MT192765.1 29829 23527 23669 142 142 60 tp:A:P cm:i:19 s1:i:142 s2:i:0 dv:f:0.0034 rl:i:0 | ||
| ERR5069949.2125592 150 8 144 + MT192765.1 29829 17187 17323 136 136 60 tp:A:P cm:i:23 s1:i:136 s2:i:0 dv:f:0.0028 rl:i:0 | ||
| ERR5069949.1062611 151 0 145 - MT192765.1 29829 11459 11604 145 145 60 tp:A:P cm:i:24 s1:i:145 s2:i:0 dv:f:0.0027 rl:i:0 | ||
| ERR5069949.1778133 151 10 146 - MT192765.1 29829 15495 15631 136 136 60 tp:A:P cm:i:22 s1:i:136 s2:i:0 dv:f:0.0030 rl:i:0 | ||
| ERR5069949.3057020 95 2 80 + MT192765.1 29829 26622 26700 78 78 60 tp:A:P cm:i:12 s1:i:78 s2:i:0 dv:f:0.0053 rl:i:0 | ||
| ERR5069949.2972968 141 2 137 - MT192765.1 29829 25522 25657 130 135 60 tp:A:P cm:i:20 s1:i:130 s2:i:0 dv:f:0.0032 rl:i:0 | ||
| ERR5069949.2734474 149 5 148 - MT192765.1 29829 23547 23690 143 143 60 tp:A:P cm:i:21 s1:i:143 s2:i:0 dv:f:0.0031 rl:i:0 | ||
| ERR5069949.856527 151 0 145 + MT192765.1 29829 10117 10263 140 146 60 tp:A:P cm:i:22 s1:i:140 s2:i:0 dv:f:0.0030 rl:i:0 | ||
| ERR5069949.2098070 151 4 143 + MT192765.1 29829 17118 17257 139 139 60 tp:A:P cm:i:27 s1:i:139 s2:i:0 dv:f:0.0024 rl:i:0 | ||
| ERR5069949.1552198 150 8 147 + MT192765.1 29829 13951 14090 139 139 60 tp:A:P cm:i:23 s1:i:139 s2:i:0 dv:f:0.0028 rl:i:0 | ||
| ERR5069949.2385514 150 5 148 + MT192765.1 29829 18607 18750 143 143 60 tp:A:P cm:i:24 s1:i:143 s2:i:0 dv:f:0.0027 rl:i:0 | ||
| ERR5069949.2270078 151 9 147 - MT192765.1 29829 18106 18244 138 138 60 tp:A:P cm:i:26 s1:i:138 s2:i:0 dv:f:0.0025 rl:i:0 | ||
| ERR5069949.114870 150 7 144 + MT192765.1 29829 649 786 137 137 60 tp:A:P cm:i:23 s1:i:137 s2:i:0 dv:f:0.0028 rl:i:0 | ||
| ERR5069949.2668880 147 9 145 + MT192765.1 29829 23133 23269 136 136 60 tp:A:P cm:i:27 s1:i:136 s2:i:0 dv:f:0.0024 rl:i:0 | ||
| ERR5069949.257821 139 5 132 - MT192765.1 29829 2840 2967 127 127 60 tp:A:P cm:i:23 s1:i:127 s2:i:0 dv:f:0.0028 rl:i:0 | ||
| ERR5069949.2243023 150 8 144 - MT192765.1 29829 17859 17995 136 136 60 tp:A:P cm:i:23 s1:i:136 s2:i:0 dv:f:0.0028 rl:i:0 | ||
| ERR5069949.2605155 146 7 141 + MT192765.1 29829 21723 21857 134 134 60 tp:A:P cm:i:23 s1:i:134 s2:i:0 dv:f:0.0028 rl:i:0 | ||
| ERR5069949.1340552 151 6 149 - MT192765.1 29829 13030 13173 143 143 60 tp:A:P cm:i:26 s1:i:143 s2:i:0 dv:f:0.0025 rl:i:0 | ||
| ERR5069949.1561137 150 1 146 - MT192765.1 29829 14084 14229 145 145 60 tp:A:P cm:i:24 s1:i:145 s2:i:0 dv:f:0.0027 rl:i:0 | ||
| ERR5069949.2361683 149 6 147 + MT192765.1 29829 18431 18572 141 141 60 tp:A:P cm:i:28 s1:i:141 s2:i:0 dv:f:0.0023 rl:i:0 | ||
| ERR5069949.2521353 150 7 141 + MT192765.1 29829 19603 19737 99 134 60 tp:A:P cm:i:15 s1:i:99 s2:i:0 dv:f:0.0043 rl:i:0 | ||
| ERR5069949.1261808 149 4 136 + MT192765.1 29829 12596 12728 113 132 60 tp:A:P cm:i:14 s1:i:113 s2:i:0 dv:f:0.0046 rl:i:0 | ||
| ERR5069949.2734873 98 5 90 - MT192765.1 29829 23557 23642 85 85 60 tp:A:P cm:i:12 s1:i:85 s2:i:0 dv:f:0.0053 rl:i:0 | ||
| ERR5069949.3017828 107 4 98 + MT192765.1 29829 26179 26273 94 94 60 tp:A:P cm:i:14 s1:i:94 s2:i:0 dv:f:0.0046 rl:i:0 | ||
| ERR5069949.573706 150 6 147 + MT192765.1 29829 5702 5843 132 141 60 tp:A:P cm:i:24 s1:i:132 s2:i:0 dv:f:0.0027 rl:i:0 | ||
| ERR5069949.1980512 151 1 142 - MT192765.1 29829 16860 17001 141 141 60 tp:A:P cm:i:25 s1:i:141 s2:i:0 dv:f:0.0026 rl:i:0 | ||
| ERR5069949.1014693 150 8 147 + MT192765.1 29829 11222 11361 139 139 60 tp:A:P cm:i:27 s1:i:139 s2:i:0 dv:f:0.0024 rl:i:0 | ||
| ERR5069949.3184655 150 4 145 - MT192765.1 29829 27356 27497 141 141 60 tp:A:P cm:i:28 s1:i:141 s2:i:0 dv:f:0.0023 rl:i:0 | ||
| ERR5069949.29668 89 9 54 - MT192765.1 29829 301 346 45 45 7 tp:A:P cm:i:7 s1:i:45 s2:i:0 dv:f:0.0089 rl:i:0 | ||
| ERR5069949.3258358 151 1 130 - MT192765.1 29829 28480 28609 110 129 60 tp:A:P cm:i:16 s1:i:110 s2:i:0 dv:f:0.0040 rl:i:0 | ||
| ERR5069949.1476386 151 4 150 + MT192765.1 29829 13332 13478 146 146 60 tp:A:P cm:i:27 s1:i:146 s2:i:0 dv:f:0.0024 rl:i:0 | ||
| ERR5069949.2415814 150 6 150 + MT192765.1 29829 18603 18747 144 144 60 tp:A:P cm:i:24 s1:i:144 s2:i:0 dv:f:0.0027 rl:i:0 |