Bienvenue au cours d'introduction à la Bioinformatique. Vous trouverez sur ce dépôt toutes les informations et ressources nécessaires. A noter que la présence physique à ce cours est plus que nécessaire voir obligatoire.
Nous allons échanger via slack qui est un réseau social professionnel. Tous les étudiants devrons s'inscrire à ce canal d'échange ici. Vous devriez fournir juste votre mail, votre nom et prénoms. Les pseudonymes ne seront pas accepter.
- Ezechiel B. TIBIRI, INERA/CNRST,
e.tibiri@wave-share.org(responsable) - Fidèle TIENDREBEOGO, INERA/CNRST,
fidele.tiendrebeogo@wave-center.org(co-responsable)
Dans un premier temps, nous vous suggérons d'apprendre les bases du dogme central de la biologie moléculaire, et de la génomique et séquençage d'ADN.
Temps estimé : 4 heures.
Ensuite, nous vous demandons de lire le cours en ligne qui sera mis à jour au fure et à mésure que le cours progresse.
Temps estimé : 10 heures.
Chapitres à traiter :
- Définitions et Rappels
- Obtention des données
- Alignement
- Phylogénie
Temps estimé : 4 heures.
Si vous avez travaillez avec les systèmes d’exploitations Linux (Ubuntu, Mint, Debian…) ou Mac OS X, vous avez déjà un shell installé sur votre machine. Et donc vous n'aurez pas besoin d'installer un shell Linux
- Pour Windows 7. Nous vous conseillons d’installer Git pour Windows qui en plus du gestionnaire de versions git installera un shell Linux.
- Pour Windows 10. Vous pouvez installer très rapidement un shell Linux. Voici quelques liens pour y arriver :
- Installer le shell Bash Linux sous Windows 10 avec WSL, 2020.
- How to install Windows Subsystem for Linux (WSL) on Windows 10, 2019.
- Everything You Can Do With Windows 10’s New Bash Shell, 2018.
Depuis un shell Linux, votre répertoire utilisateur de Windows est accessible via le chemin /mnt/c/Users/<login-windows> ou <login-windows> est votre login sous Windows. Nous vous conseillons de travailler depuis ce répertoire afin que vos fichiers puissent également être visibles depuis Windows.
Temps estimé : 8 heures.