BLATを使ったフィルタをスキップするオプションの追加

[athos]

このプルリクエストでは、fusionfusion内部でBLATを使っているフィルタをスキップするオプション --no_blat を追加します。
この変更により、BLATのない環境でもfusionfusionを使用できるようになります。

従来、中間ファイル *.chimeric.clustered.splicing.txt から *.fusion.result.txt を生成する過程で、BLATを利用したものを含むいくつかのフィルタリング処理がされています。この変更では、 *.chimeric.clustered.splicing.txt と *.fusion.result.txt のファイル形式の類似性を利用して、前者から後者を直接生成することでBLATを使ったフィルタをスキップしています。

フィルタリング処理をスキップするため、解析結果としては典型的には偽陽性が3〜4割程度多くなる傾向があります。

--no_blat オプションを指定しない場合の挙動は従来とまったく変わりません。