orca-oniom-accelerator

计算化学程序ORCA从5.0.0开始支持QM/XTB ONIOM计算，但是直到目前版本(5.0.2)为止，仍然有很多BUG，通过使用该脚本可以优化这个计算过程。

部分代码参考ORCA论坛

@arrowyz https://orcaforum.kofo.mpg.de/viewtopic.php?f=8&t=6857&p=29519

功能

• 通过备份xtbrestart文件加速ORCA的ONIOM计算过程
• 给xtb联用提供更多参数
• 备份xtb输出文件，方便出错时查找问题

作者的话

在使用本脚本之前能给嘉然点个关注吗

嘉然今天吃什么

警告

[1]该程序可能会对原来文件进行修改，请注意备份
[2]本程序目前支持GFN2-xTB（即含有下列关键词），其他方法可能会有bug

! QM/XTB

%qmmm
  AutoFF_QM2_Method XTB  # XTB (default)
end

[3]计算中减少时间大约为两次全体系采用GFN2-xTB方法计算单点时间，对于小体系加速效果并不明显（甚至可能降低效率）
[4]最好不要用ORCA算 QM / XTB

安装方法

• 下载并解压源代码
• 用文本编辑器打开otool_xtb，将第10行PATH_TO_XTB="/path/to/xtb"中的/path/to/xtb 修改成xtb可执行程序路径
• 将otool_xtb文件复制到orca目录下面
• 给otool_xtb添加可执行权限chmod +x otool_xtb

如何给xtb调用时添加额外参数

• 在orca工作目录下新建xtb_parameter.txt文件，将需要增加的参数加入到文件当中，如
  --iterations 1000
• 更多参数写法请参考xtb文档