2023-06-06-ner_deid_generic_pipeline_ar

docs/_posts/mellahysf/2023-06-06-ner_deid_generic_pipeline_ar.md

@@ -0,0 +1,90 @@
+---
+layout: model
+title: Pipeline for Detect Generic PHI for Deidentification (Arabic)
+author: John Snow Labs
+name: ner_deid_generic_pipeline
+date: 2023-06-06
+tags: [licensed, deidentification, clinical, ar, generic]
+task: Pipeline Healthcare
+language: ar
+edition: Healthcare NLP 4.4.1
+spark_version: 3.0
+supported: true
+annotator: PipelineModel
+article_header:
+  type: cover
+use_language_switcher: "Python-Scala-Java"
+---
+
+## Description
+
+This pretrained pipeline is built on the top of [ner_deid_generic](https://nlp.johnsnowlabs.com/2023/05/30/ner_deid_generic_ar.html) model.
+
+{:.btn-box}
+<button class="button button-orange" disabled>Live Demo</button>
+<button class="button button-orange" disabled>Open in Colab</button>
+[Download](https://s3.amazonaws.com/auxdata.johnsnowlabs.com/clinical/models/ner_deid_generic_pipeline_ar_4.4.1_3.0_1686078043466.zip){:.button.button-orange.button-orange-trans.arr.button-icon.hidden}
+[Copy S3 URI](s3://auxdata.johnsnowlabs.com/clinical/models/ner_deid_generic_pipeline_ar_4.4.1_3.0_1686078043466.zip){:.button.button-orange.button-orange-trans.button-icon.button-copy-s3}
+
+## How to use
+
+
+
+<div class="tabs-box" markdown="1">
+{% include programmingLanguageSelectScalaPythonNLU.html %}
+```python
+from sparknlp.pretrained import PretrainedPipeline
+pipeline = PretrainedPipeline("ner_deid_generic_pipeline", "ar", "clinical/models")
+text = '''ملاحظات سريرية - مريض الربو. التاريخ: 16 أبريل 2000. اسم المريضة: ليلى حسن. العنوان: شارع المعرفة، مبنى رقم 789، حي الأمانة، جدة. الرمز البريدي: 54321. البلد: المملكة العربية السعودية. اسم المستشفى: مستشفى النور. اسم الطبيب: د. أميرة أحمد. تفاصيل الحالة: المريضة ليلى حسن، البالغة من العمر 35 عامًا، تعاني من مرض الربو المزمن. تشكو من ضيق التنفس والسعال المتكرر والشهيق الشديد. تم تشخيصها بمرض الربو بناءً على تاريخها الطبي واختبارات وظائف الرئة. الخطة: تم وصف مضادات الالتهاب غير الستيرويدية والموسعات القصبية لتحسين التنفس وتقليل التهيج. يجب على المريضة حمل معها جهاز الاستنشاق في حالة حدوث نوبة ربو حادة. يتعين على المريضة تجنب التحسس من العوامل المسببة للربو، مثل الدخان والغبار والحيوانات الأليفة. يجب مراقبة وظائف الرئة بانتظام ومتابعة التعليمات الطبية المتعلقة بمرض الربو. تعليم المريضة بشأن كيفية استخدام جهاز الاستنشاق بشكل صحيح وتقنيات التنفس الصحيح.
+''
+result = pipeline.fullAnnotate(text)
+```
+```scala
+import com.johnsnowlabs.nlp.pretrained.PretrainedPipeline
+val pipeline = new PretrainedPipeline("ner_deid_generic_pipeline", "ar", "clinical/models")
+val text = "ملاحظات سريرية - مريض الربو. التاريخ: 16 أبريل 2000. اسم المريضة: ليلى حسن. العنوان: شارع المعرفة، مبنى رقم 789، حي الأمانة، جدة. الرمز البريدي: 54321. البلد: المملكة العربية السعودية. اسم المستشفى: مستشفى النور. اسم الطبيب: د. أميرة أحمد. تفاصيل الحالة: المريضة ليلى حسن، البالغة من العمر 35 عامًا، تعاني من مرض الربو المزمن. تشكو من ضيق التنفس والسعال المتكرر والشهيق الشديد. تم تشخيصها بمرض الربو بناءً على تاريخها الطبي واختبارات وظائف الرئة. الخطة: تم وصف مضادات الالتهاب غير الستيرويدية والموسعات القصبية لتحسين التنفس وتقليل التهيج. يجب على المريضة حمل معها جهاز الاستنشاق في حالة حدوث نوبة ربو حادة. يتعين على المريضة تجنب التحسس من العوامل المسببة للربو، مثل الدخان والغبار والحيوانات الأليفة. يجب مراقبة وظائف الرئة بانتظام ومتابعة التعليمات الطبية المتعلقة بمرض الربو. تعليم المريضة بشأن كيفية استخدام جهاز الاستنشاق بشكل صحيح وتقنيات التنفس الصحيح.
+"
+val result = pipeline.fullAnnotate(text)
+```
+</div>
+
+## Results
+
+```bash
++---------------+----------------------+
+|chunks         |entities          |
++---------------+----------------------+
+|16 أبريل 2000  |DATE          |
+|ليلى حسن            |NAME        |
+|789،                |LOCATION |
+|الأمانة، جدة         |LOCATION |
+|54321            |LOCATION  |
+|المملكة العربية     |LOCATION  |
+|السعودية            |LOCATION  |
+|مستشفى النور     |LOCATION  |
+|أميرة أحمد         |NAME          |
+|ليلى                 |NAME          |
++---------------+---------------------+
+```
+
+{:.model-param}
+## Model Information
+
+{:.table-model}
+|---|---|
+|Model Name:|ner_deid_generic_pipeline|
+|Type:|pipeline|
+|Compatibility:|Healthcare NLP 4.4.1+|
+|License:|Licensed|
+|Edition:|Official|
+|Language:|ar|
+|Size:|1.2 GB|
+
+## Included Models
+
+- DocumentAssembler
+- SentenceDetectorDLModel
+- TokenizerModel
+- WordEmbeddingsModel
+- MedicalNerModel
+- NerConverter