DB_INPUT_UniPPIN_ACC

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# Populating database with the content of UniPPN_ACC_noSelfLoop file
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from sqlite3 import connect

DB_name = 'DB_JoRo_PRO'
file_name = 'UniPPIN_ACC_noSelfLoop.txt'

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conn = connect(DB_name)
curs = conn.cursor()

file = open(file_name)
rows = [line.rstrip().split(',') for line in file]
for rec in rows:
    curs.execute('INSERT INTO UP_UniPPIN_ACC (uniprot_1, uniprot_2) VALUES (?,?)', rec)

conn.commit()