為了使讀者快速理解書中的內容，這本書中使用到的凡例如下：
-
ls()是在行內中 R 的指令或其他的語言指令，本例中為 R 的 ls 函式 -
灰色框起來的部分代表是 R 的指令範例
# This is the comment
# comment line 2
> a <- b <- 1
> a
[1] 1上面以 # 開頭的就是註解，有 > 開頭的就是 R 指令， 其餘是執行後輸出在 R console 的結果
這本書相關的範例檔案都放在 GitHub 上的 Ecoinformatics 課程檔案庫 examples 中，
你可以直接在網頁上下載，或是用 git 複製一份至你的電腦上學習或操作。