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PARIO data management 🇺🇸 🇪🇸

🇺🇸 This repository contains R scripts to import and analyze PARIO data for particle size distribution analysis. Work in progress.

  • Excel files exported from PARIO software without modification are used as example
  • Naming of files fits with the style of the Soil Biophysics Laboratory.
  • Colaboration? Comments? suggestions are welcome at seaceved@uc.cl.
Script Objetive
pario_data_analysis.R Read all scripts from 00 onwards in order
cute_animation.R Just for fun
scripts/00_librerias.R Load required libraries
scripts/01_importar_excel.R Use readxl to read data
scripts/02_limpiar_datos.R PSD curves (diameter vs cumulative fraction) are in long and fractions (sand, silt and clay) in wide format
scripts/03_analysis_textural_class.R Describe the textural class according to USDA
scripts/04_triangle_texture.R Plot fractions (sand, silt and clay) using the USDA triangle
scripts/05_plot_measured_data.R Plot temperature, pressure and fitting
scripts/06_psd.R Plot PSD (diameter vs cumulative fraction) curves

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  1. Testing the integral suspension pressure method for soil particle size analysis across a range of soil organic matter contents
  2. Website laboratorio
  3. Twitter
  4. Instagram

🇪🇸 Este repositorio contiene R scripts para importar y analizar los datos del equipo PARIO para análisis de distribución de tamaño de partículas.

  • Los datos usados son un ejemplo, siendo los excel que entrega PARIO sin modificación
  • El naming de los archivos es al estilo del Laboratorio de Biofísica de Suelos
  • Colaboración? Comentarios? contactar a seaceved@uc.cl
Script Objetivo
pario_data_analysis.R Lee todos los scripts desde el 00 en orden
cute_animation.R Just for fun
scripts/00_librerias.R Cargar las librerias necesarias
scripts/01_importar_excel.R Usando readxl se leen las columnas con datos
scripts/02_limpiar_datos.R Las curvas PSD (diameter vs cumulative fraction) quedan en formato largo y fracciones (sand, silt and clay) en ancho
scripts/03_analisis_clase_textural.R Define la clase textural según USDA
scripts/04_triangulo_textura.R Grafica las fracciones (sand, silt and clay) en el triangulo USDA
scripts/05_plot_datos_medidos.R Grafica temperatura, presión y ajuste
scripts/06_psd.R Grafica las curvas PSD (diameter vs cumulative fraction)

Figures

Triángulo - Triangle

textural_triangle

Mediciones ISP - ISP measurements

measured_plot

Curvas PSD - PSD curves

psd_plot

❤️ Curvas PSD - PSD curves ❤️

cute_gif

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  1. Testing the integral suspension pressure method for soil particle size analysis across a range of soil organic matter contents
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